<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CT033755.6	1	GTGACATCAGAATCAGCACACCAGATGCAGAGGCAGGTGGACTTCTGAGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175127	GTGACATCAGAATCAGCACACCAGATGCAGAGGCAGGTGGACTTCTGAGT	175176

CT033755.6	51	TCACGGCCAGCCTGGGCTACAAAGAGCAATCCTGTCTCAAAACAACTAAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175177	TCACGGCCAGCCTGGGCTACAAAGAGCAATCCTGTCTCAAAACAACTAAC	175226

CT033755.6	101	CACACCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175227	CACACCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAA	175276

CT033755.6	151	TAATAAAGTGCTTCTGGGGAAGTCACCCAGGGGGCCATTGGATAGAGGCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175277	TAATAAAGTGCTTCTGGGGAAGTCACCCAGGGGGCCATTGGATAGAGGCA	175326

CT033755.6	201	CCGTCTGCCACCCTCCGGTCCTGTTCTGTCTCCCTGTTGGAAGTACTCAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175327	CCGTCTGCCACCCTCCGGTCCTGTTCTGTCTCCCTGTTGGAAGTACTCAG	175376

CT033755.6	251	CCAAGAGCCACTACTTTGCAGGGAAGTGAGCTCCGGAGTCACAGCCATAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175377	CCAAGAGCCACTACTTTGCAGGGAAGTGAGCTCCGGAGTCACAGCCATAG	175426

CT033755.6	301	CCTCTCAGAGGATGGAGTGGTGCAAAGAGAAAGAAAGAGTCGTCACCTGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175427	CCTCTCAGAGGATGGAGTGGTGCAAAGAGAAAGAAAGAGTCGTCACCTGA	175476

CT033755.6	351	AGCAAGGCCCCGCCCTTGCCTTCTCGGCTGAGGATGGCTGCACTTTGTAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175477	AGCAAGGCCCCGCCCTTGCCTTCTCGGCTGAGGATGGCTGCACTTTGTAT	175526

CT033755.6	401	GTGCACTTGGGGAGGCGGATTCTGGAAATGTTGAAACTAACGAAATACTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175527	GTGCACTTGGGGAGGCGGATTCTGGAAATGTTGAAACTAACGAAATACTG	175576

CT033755.6	451	ATTAATGCACCACTTTTGACAGTCAGATTTGAAATGGAAAAGCTGCCGTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175577	ATTAATGCACCACTTTTGACAGTCAGATTTGAAATGGAAAAGCTGCCGTA	175626

CT033755.6	501	GTGGCTCAGAGCCATCATTCAGAAGCGGAAAATAGCCAATTTCTCACATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175627	GTGGCTCAGAGCCATCATTCAGAAGCGGAAAATAGCCAATTTCTCACATT	175676

CT033755.6	551	CGTGCGCCCGCTCCGAAGGATTAATTATCAACACACGCAGAAGCAGCGGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175677	CGTGCGCCCGCTCCGAAGGATTAATTATCAACACACGCAGAAGCAGCGGT	175726

CT033755.6	601	ACAGGACAGCTTGGCAGGGTTTCCAGGACGCGTGTCATCGCTGCTTCCAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175727	ACAGGACAGCTTGGCAGGGTTTCCAGGACGCGTGTCATCGCTGCTTCCAG	175776

CT033755.6	651	CCTGGCCCATCACAGTTGATTAGAATTTTAAGGGATTTGAGACCCTGGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175777	CCTGGCCCATCACAGTTGATTAGAATTTTAAGGGATTTGAGACCCTGGAA	175826

CT033755.6	701	CCTATATCAGTGCACAGAAGTCTAGAATAGATAGGTGAGCAAAAAAAGTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175827	CCTATATCAGTGCACAGAAGTCTAGAATAGATAGGTGAGCAAAAAAAGTG	175876

CT033755.6	751	CCGTTTTTATATTTCTGGATTCAAACCACTGCTGATTTCCATCACATTGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175877	CCGTTTTTATATTTCTGGATTCAAACCACTGCTGATTTCCATCACATTGC	175926

CT033755.6	801	TCTGGGGGTAATACTGGCTCAACTGGATGAGTTTCTGGATGCAAACCGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175927	TCTGGGGGTAATACTGGCTCAACTGGATGAGTTTCTGGATGCAAACCGCA	175976

CT033755.6	851	AGCACTTGAGCTCAGTGGCTTAGCACAAAGCAAACACCAGCACACAGAGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	175977	AGCACTTGAGCTCAGTGGCTTAGCACAAAGCAAACACCAGCACACAGAGT	176026

CT033755.6	901	GTGTGTGTGTGGCGTGTTCCCAGCACCCAGTACTCCACCTTCTCCCCTCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176027	GTGTGTGTGTGGCGTGTTCCCAGCACCCAGTACTCCACCTTCTCCCCTCC	176076

CT033755.6	951	AGGGCAATCATTCTCTGGTGGCGCCTAGGGGTTTGTCTCTTCTGTCTGTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176077	AGGGCAATCATTCTCTGGTGGCGCCTAGGGGTTTGTCTCTTCTGTCTGTT	176126

CT033755.6	1001	GCTCTCTCTCCTGGGCTCTCATTCTTTGTGCCCTGTTTTGCTGTCCCATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176127	GCTCTCTCTCCTGGGCTCTCATTCTTTGTGCCCTGTTTTGCTGTCCCATA	176176

CT033755.6	1051	GGCTGTCTTGCCTTGTTCGGGCAGTTCTGCAGGTGAGCCAGGCCTGCTTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176177	GGCTGTCTTGCCTTGTTCGGGCAGTTCTGCAGGTGAGCCAGGCCTGCTTC	176226

CT033755.6	1101	CTGTGTACTGGGTTTGGTGTTATTTTGTGTGTTTTCTTTTGTGAGTTCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176227	CTGTGTACTGGGTTTGGTGTTATTTTGTGTGTTTTCTTTTGTGAGTTCCA	176276

CT033755.6	1151	GGACAACTAAGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACAAACAAACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176277	GGACAACTAAGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACAAACAAACA	176326

CT033755.6	1201	AAAAAAAACAACAACAATGATAATAATAATAATAAAATTTTTAAAGAAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176327	AAAAAAAACAACAACAATGATAATAATAATAATAAAATTTTTAAAGAAAA	176376

CT033755.6	1251	AAGTAAGTTCTCAAAATAACACTATTGAGTTTTGTAGGTTTTTTTTTTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176377	AAGTAAGTTCTCAAAATAACACTATTGAGTTTTGTAGGTTTTTTTTTTTT	176426

CT033755.6	1301	CCTTTTGGTTTGTTTGCCTGTTTTTGTTTTGAGTCCCTTTATTGGTTCCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176427	CCTTTTGGTTTGTTTGCCTGTTTTTGTTTTGAGTCCCTTTATTGGTTCCA	176476

CT033755.6	1351	ACCCAAGATTCAAAAATTGAAACCACCTGATATGATGATCAGTTTTGTCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176477	ACCCAAGATTCAAAAATTGAAACCACCTGATATGATGATCAGTTTTGTCA	176526

CT033755.6	1401	CAATGACAGAACTTACAAATCACCTGGGAACAGAAGTTGTCTACATCGAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176527	CAATGACAGAACTTACAAATCACCTGGGAACAGAAGTTGTCTACATCGAG	176576

CT033755.6	1451	TTGACCTGAAAGAATGTCTTTAGGAGATTGTCGTAATTAAGTCAAATTAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176577	TTGACCTGAAAGAATGTCTTTAGGAGATTGTCGTAATTAAGTCAAATTAA	176626

CT033755.6	1501	TGTGGGAAGACACTGCCTACTGTGGGTGGCATCATTCCCCAAACAAGGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176627	TGTGGGAAGACACTGCCTACTGTGGGTGGCATCATTCCCCAAACAAGGGT	176676

CT033755.6	1551	TTCTAAACTGTTTAAGAGTGTAATGATTCAGCCCGACACAAGGAAGCAAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176677	TTCTAAACTGTTTAAGAGTGTAATGATTCAGCCCGACACAAGGAAGCAAG	176726

CT033755.6	1601	CATGCATCCACTCACTTCTTTCTCTCTGCTCTTGACTGTGGTGTGATGTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176727	CATGCATCCACTCACTTCTTTCTCTCTGCTCTTGACTGTGGTGTGATGTG	176776

CT033755.6	1651	GTGAACTATTTTAAGTTCCTGCCTCTTCTTCACAATGTTGGACTGTAACC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176777	GTGAACTATTTTAAGTTCCTGCCTCTTCTTCACAATGTTGGACTGTAACC	176826

CT033755.6	1701	TGGAATATTTAGTTAGGAAAAAGTCCCTCTGTCCCTTAAGTTTCTTTTCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176827	TGGAATATTTAGTTAGGAAAAAGTCCCTCTGTCCCTTAAGTTTCTTTTCT	176876

CT033755.6	1751	GTTAGGTATTTGCTTAAAGCAACAGAAATGAAGCTAGATACCTGACCAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176877	GTTAGGTATTTGCTTAAAGCAACAGAAATGAAGCTAGATACCTGACCAAA	176926

CT033755.6	1801	AAGGAGTCAAAGGTGGACTGACAAAGCACATGGCTCTGCCCCAAGATGGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176927	AAGGAGTCAAAGGTGGACTGACAAAGCACATGGCTCTGCCCCAAGATGGG	176976

CT033755.6	1851	AGTTCAAGTTAGCCCTGTGGAGGAAGAGGCCCAGAAACCCCCACTTTGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	176977	AGTTCAAGTTAGCCCTGTGGAGGAAGAGGCCCAGAAACCCCCACTTTGGA	177026

CT033755.6	1901	CCTTGCACAGAAACCAGACACTTGGGTATTAACTATTCCTTTATTAGGTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	177027	CCTTGCACAGAAACCAGACACTTGGGTATTAACTATTCCTTTATTAGGTG	177076

CT033755.6	1951	GTAAGGGAACTGAGAAGGTGAGGGTTGTACAGTGCAGGACCTGGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033797.5	177077	GTAAGGGAACTGAGAAGGTGAGGGTTGTACAGTGCAGGACCTGGGAATTC	177126

Overview

Query
CT033755.6 - 91439 bps
Hit
CT033797.5 - 177126 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link