<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CT485613.9	1	GAATTCCACAGGTATGAAAGCCTAATAGACTCCAAAGGACGTAAGATATA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160262	GAATTCCACAGGTATGAAAGCCTAATAGACTCCAAAGGACGTAAGATATA	160311

CT485613.9	51	TTCTCTGAATGTAGCACCCATGAATCGAACAAGAGAACACAATAGGAATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160312	TTCTCTGAATGTAGCACCCATGAATCGAACAAGAGAACACAATAGGAATT	160361

CT485613.9	101	GGGGTGCAGGATAAAACAGTCATGGGAGGAAATAAATGAAAATAGTTAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160362	GGGGTGCAGGATAAAACAGTCATGGGAGGAAATAAATGAAAATAGTTAAA	160411

CT485613.9	151	AGTGAAAAAGAAAGAGAAGGAGAACTTTAGTTGCTGGTCATGTGTAAGGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160412	AGTGAAAAAGAAAGAGAAGGAGAACTTTAGTTGCTGGTCATGTGTAAGGT	160461

CT485613.9	201	GACATCGCACATTGTCATATTGTCAGTATTTCTCCTGCCAGTCTAACCCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160462	GACATCGCACATTGTCATATTGTCAGTATTTCTCCTGCCAGTCTAACCCT	160511

CT485613.9	251	TTCTGTCCCCAAGTGAGCAACATTTCCCTTGCTGACAAGAGAGCAGGTAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160512	TTCTGTCCCCAAGTGAGCAACATTTCCCTTGCTGACAAGAGAGCAGGTAA	160561

CT485613.9	301	ACACCATTCTCACCACACAGTTATGGAACAACTGTCAGAAAGTGTCCCAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160562	ACACCATTCTCACCACACAGTTATGGAACAACTGTCAGAAAGTGTCCCAC	160611

CT485613.9	351	TCCTTCTTAAAGAGGACATCCTTTTAATGAGTAATGTTTAAGCTCCAATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160612	TCCTTCTTAAAGAGGACATCCTTTTAATGAGTAATGTTTAAGCTCCAATT	160661

CT485613.9	401	GCAAAGAAATACGGCCATAAAATCATCCTATATGCAATGTTACTTGCTCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160662	GCAAAGAAATACGGCCATAAAATCATCCTATATGCAATGTTACTTGCTCC	160711

CT485613.9	451	TTTTTTTCCTAGAAATCTCTCATCATACAGAAACTGGAAAATATTCAGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160712	TTTTTTTCCTAGAAATCTCTCATCATACAGAAACTGGAAAATATTCAGAG	160761

CT485613.9	501	GTCACTAATTCCTTCAACAAGTAAAAACAAATGAGCAAACAAACAGGAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160762	GTCACTAATTCCTTCAACAAGTAAAAACAAATGAGCAAACAAACAGGAGG	160811

CT485613.9	551	CAGGACAGTCAAGAACGATATCTGGAGGCAGAGACCTCTAATGATGATCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160812	CAGGACAGTCAAGAACGATATCTGGAGGCAGAGACCTCTAATGATGATCA	160861

CT485613.9	601	AGAGAGATGCAGAGGTGCAGTGGACTTGAGATCTAAGAGCTGCCTCAAGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160862	AGAGAGATGCAGAGGTGCAGTGGACTTGAGATCTAAGAGCTGCCTCAAGT	160911

CT485613.9	651	TAGACATAGCCCCAGAACTGGTGTGATCTAGTGTCTTGTCTTGTCTCCAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160912	TAGACATAGCCCCAGAACTGGTGTGATCTAGTGTCTTGTCTTGTCTCCAG	160961

CT485613.9	701	GATGAAGATGGAAAGGAGCTGTCAGATGAGGACATTAGAGCAGAGGCTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	160962	GATGAAGATGGAAAGGAGCTGTCAGATGAGGACATTAGAGCAGAGGCTGA	161011

CT485613.9	751	CACCTTCATGTTTGAGGGTGAGGCTCCCAGTATGGGACTACAGAGTGAAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161012	CACCTTCATGTTTGAGGGTGAGGCTCCCAGTATGGGACTACAGAGTGAAC	161061

CT485613.9	801	AGAAAACCTTCATTCTGGGCACATATTGAATGGACCCTATTCATTCAACT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161062	AGAAAACCTTCATTCTGGGCACATATTGAATGGACCCTATTCATTCAACT	161111

CT485613.9	851	ATCATCCCCCTATCATCCATTGTCCCCTTTCCCCATCTTTCCTGGGCTTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161112	ATCATCCCCCTATCATCCATTGTCCCCTTTCCCCATCTTTCCTGGGCTTC	161161

CT485613.9	901	TCCCTGCCTGGCTGCTACCCACTTTGTGGTGCTGAAGTAGCTTTGAGACC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161162	TCCCTGCCTGGCTGCTACCCACTTTGTGGTGCTGAAGTAGCTTTGAGACC	161211

CT485613.9	951	TAAGTCCACCTATCTGCCCCACAGGCCATGACACCACAGCCAGCGGGCTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161212	TAAGTCCACCTATCTGCCCCACAGGCCATGACACCACAGCCAGCGGGCTC	161261

CT485613.9	1001	TCCTGGATCCTGTACAATCTGGCAAGGCACCCAGAATACCAGGAGCGCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161262	TCCTGGATCCTGTACAATCTGGCAAGGCACCCAGAATACCAGGAGCGCTG	161311

CT485613.9	1051	CCGGCAGGAGGTGCAGGAGCTGCTGAGGGATCGAGAGTCTACAGAAATTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161312	CCGGCAGGAGGTGCAGGAGCTGCTGAGGGATCGAGAGTCTACAGAAATTG	161361

CT485613.9	1101	AGTGGTGAGCATAGGTCTTGGTGTCTCACCAGGACCCTCTCTTGGCTCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161362	AGTGGTGAGCATAGGTCTTGGTGTCTCACCAGGACCCTCTCTTGGCTCTG	161411

CT485613.9	1151	CTCCTCAGGTAGAGAAGGGGGTCTCTTTTTTATGACTCTTCCATTACTAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161412	CTCCTCAGGTAGAGAAGGGGGTCTCTTTTTTATGACTCTTCCATTACTAC	161461

CT485613.9	1201	TTTATGGGAATAGTATCTGCCTCATTAACAAAAGGAAATTTTATGCATTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161462	TTTATGGGAATAGTATCTGCCTCATTAACAAAAGGAAATTTTATGCATTG	161511

CT485613.9	1251	GGACAGACTGAAAATAAAATAATGTGGAGGGCAAATGATGTCACTTTGCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161512	GGACAGACTGAAAATAAAATAATGTGGAGGGCAAATGATGTCACTTTGCA	161561

CT485613.9	1301	GATTTTATATATATATATATATATATATATATATATACATATATATATAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161562	GATTTTATATATATATATATATATATATATATATATACATATATATATAT	161611

CT485613.9	1351	ATATATATATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161612	ATATATATATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	161661

CT485613.9	1401	GATGGATTCTCATAACATAATGGATTCTCATAACAATTTTATGAGCAGTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161662	GATGGATTCTCATAACATAATGGATTCTCATAACAATTTTATGAGCAGTC	161711

CT485613.9	1451	TATCCTGTGCTAAGGATGCAGCTGAAAGAAGTGTTGTCAGGAGCTCCAAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161712	TATCCTGTGCTAAGGATGCAGCTGAAAGAAGTGTTGTCAGGAGCTCCAAG	161761

CT485613.9	1501	CTTGATGGGAGAACAGTCCTGCATCAGAACACATACCAGAACACACTGGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161762	CTTGATGGGAGAACAGTCCTGCATCAGAACACATACCAGAACACACTGGC	161811

CT485613.9	1551	AGGTGTGAGGTTTAAAGTAAGAAAAGCAAGGCTGGAGCACAGGATATGTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161812	AGGTGTGAGGTTTAAAGTAAGAAAAGCAAGGCTGGAGCACAGGATATGTT	161861

CT485613.9	1601	TCAATTTAGGACCCTGAATGAGTATCAGGAGACATGTGGTTGGGACTAAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161862	TCAATTTAGGACCCTGAATGAGTATCAGGAGACATGTGGTTGGGACTAAG	161911

CT485613.9	1651	GTACAGGGAAGAGGAGGTGGCAGAAAATAATAGAGATAAGGAGAGAGGTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161912	GTACAGGGAAGAGGAGGTGGCAGAAAATAATAGAGATAAGGAGAGAGGTG	161961

CT485613.9	1701	TTTTGTGACTTTTCTTGGAGAAATGTGAGCCAATACCTATTTGCCCTCAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	161962	TTTTGTGACTTTTCTTGGAGAAATGTGAGCCAATACCTATTTGCCCTCAT	162011

CT485613.9	1751	GGATTACAGACTGAAGGAATGATTCCATCAAACTCATTGGCAAAACAATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	162012	GGATTACAGACTGAAGGAATGATTCCATCAAACTCATTGGCAAAACAATG	162061

CT485613.9	1801	AGCTTATTAGGGTTATTCACATGAGTAATGGTAAAGAGCTGATTATAGCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	162062	AGCTTATTAGGGTTATTCACATGAGTAATGGTAAAGAGCTGATTATAGCT	162111

CT485613.9	1851	GTATCACTGAAAATCTCACCCTAATATAGATAAGGGAGTAATGATGAGGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	162112	GTATCACTGAAAATCTCACCCTAATATAGATAAGGGAGTAATGATGAGGG	162161

CT485613.9	1901	GCTATTTATAGCCATATCACTGAAAATCTCACCCTAATATTGATAAGGAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	162162	GCTATTTATAGCCATATCACTGAAAATCTCACCCTAATATTGATAAGGAT	162211

CT485613.9	1951	TCAAAAGAAAAAAGCCATGTTCTTAGAACTCCTACAGAATTTCTCTCTGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033759.32	162212	TCAAAAGAAAAAAGCCATGTTCTTAGAACTCCTACAGAATTTCTCTCTGT	162261

Overview

Query
CT485613.9 - 161949 bps
Hit
CT033759.32 - 162261 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link