<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR974422.14	1	ACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACAAACAAACAAACAAATCCCACAGTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226058	ACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACAAACAAACAAACAAATCCCACAGTG	226107

CR974422.14	51	TCTATCACACAGGGAAAGCCTGGTCTTCAGGATAGGCCTATCAGTAGGAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226108	TCTATCACACAGGGAAAGCCTGGTCTTCAGGATAGGCCTATCAGTAGGAT	226157

CR974422.14	101	TTCTGGTAGCAAGCATGGACTTCCAAACCCTTTGGATTTGCAGTCACACA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226158	TTCTGGTAGCAAGCATGGACTTCCAAACCCTTTGGATTTGCAGTCACACA	226207

CR974422.14	151	CTGGCTACTAAGAGAGTCCTCTCATTCAGCATGAGGGTGTCTCTTTAATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226208	CTGGCTACTAAGAGAGTCCTCTCATTCAGCATGAGGGTGTCTCTTTAATT	226257

CR974422.14	201	TTACCATGTGGGCATGGGCGTGAGTGTGGGTGTAGTGTTTTTCCCACATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226258	TTACCATGTGGGCATGGGCGTGAGTGTGGGTGTAGTGTTTTTCCCACATG	226307

CR974422.14	251	CTTGTGCACCTTGTTTGTACTTGGTGTCTAAGGAGGCCAGAAGAGGACGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226308	CTTGTGCACCTTGTTTGTACTTGGTGTCTAAGGAGGCCAGAAGAGGACGT	226357

CR974422.14	301	TAAATCCCCTGGAGCTAGTAGTGTTAAGAGCCACTATGAACCAGTATGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226358	TAAATCCCCTGGAGCTAGTAGTGTTAAGAGCCACTATGAACCAGTATGTG	226407

CR974422.14	351	AGTGCTGGGAATTGAACTCCGGTCTTGTAGAAGGGCAGCCAGTGCTATTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226408	AGTGCTGGGAATTGAACTCCGGTCTTGTAGAAGGGCAGCCAGTGCTATTA	226457

CR974422.14	401	ACAGCTGAGTCTCCTCTCCACCTCAAAGATGTTGATCGTCTTTGAATCCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226458	ACAGCTGAGTCTCCTCTCCACCTCAAAGATGTTGATCGTCTTTGAATCCT	226507

CR974422.14	451	CGTTTACATTTTTCTGGTATTAGGCCACCAGGGCATTGGATACGGACTGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226508	CGTTTACATTTTTCTGGTATTAGGCCACCAGGGCATTGGATACGGACTGT	226557

CR974422.14	501	TGGACAGCATGAATCTGAGCCACATGACCACCACCCTGGATGTCCTCACC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226558	TGGACAGCATGAATCTGAGCCACATGACCACCACCCTGGATGTCCTCACC	226607

CR974422.14	551	AGCAAACCACTCCCTGTCCAGAAGTTGACCAACTCCAGTAATGTATTTCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226608	AGCAAACCACTCCCTGTCCAGAAGTTGACCAACTCCAGTAATGTATTTCA	226657

CR974422.14	601	GTGTGTGGTTCCATCACCACCAGGGGCGCCTGTTCATCTCGATAAAGCTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226658	GTGTGTGGTTCCATCACCACCAGGGGCGCCTGTTCATCTCGATAAAGCTG	226707

CR974422.14	651	TTTGCAGGTTGCACTGTACCATGATTGCGGTCTTCTGAAGATCTGCATGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226708	TTTGCAGGTTGCACTGTACCATGATTGCGGTCTTCTGAAGATCTGCATGC	226757

CR974422.14	701	ACTGTAGAGGACGCTTGGACACTTGGACGGCCTGGCTCTGACAGCAGACC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226758	ACTGTAGAGGACGCTTGGACACTTGGACGGCCTGGCTCTGACAGCAGACC	226807

CR974422.14	751	CGAGCCCTCACCACACTCAGTTGCCGTTGGTAGTTTAAGCGACTTGTCAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226808	CGAGCCCTCACCACACTCAGTTGCCGTTGGTAGTTTAAGCGACTTGTCAG	226857

CR974422.14	801	TGTGCCTGGGTTTAGAATCACCAGGAAGATACATGGGTGCACCTATAAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226858	TGTGCCTGGGTTTAGAATCACCAGGAAGATACATGGGTGCACCTATAAAG	226907

CR974422.14	851	GTGTTTTCAGAAAAGTTTAAGTCGAGAAGAATGACCTGCTCTAAGTATGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226908	GTGTTTTCAGAAAAGTTTAAGTCGAGAAGAATGACCTGCTCTAAGTATGG	226957

CR974422.14	901	GCTGGACTCCCTGATTGGATAAAAGGGAGAAATACCTTCTTGGGGTGTTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	226958	GCTGGACTCCCTGATTGGATAAAAGGGAGAAATACCTTCTTGGGGTGTTG	227007

CR974422.14	951	GAGGAAGAAATGGGGTTTGAGAGCCAGGAGCAACTTTACCCCACCAGTGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227008	GAGGAAGAAATGGGGTTTGAGAGCCAGGAGCAACTTTACCCCACCAGTGT	227057

CR974422.14	1001	TTAGCTAGCAGGTGGCAGGCCTGCTCTCTGCTTGCTGACTCAATGTGACC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227058	TTAGCTAGCAGGTGGCAGGCCTGCTCTCTGCTTGCTGACTCAATGTGACC	227107

CR974422.14	1051	CGCGGCCTCATGCCTTCCTTGTGTACATGTACACACATGTACTGTGTTTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227108	CGCGGCCTCATGCCTTCCTTGTGTACATGTACACACATGTACTGTGTTTC	227157

CR974422.14	1101	ATATATGTGATAAAGCGTTAATAAATAAGAACACCAATAACAGCAACAAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227158	ATATATGTGATAAAGCGTTAATAAATAAGAACACCAATAACAGCAACAAC	227207

CR974422.14	1151	AACACGTTATAACAGTTAAGATAGGGGCCAGCAAAGTGGCTCAGCAGATC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227208	AACACGTTATAACAGTTAAGATAGGGGCCAGCAAAGTGGCTCAGCAGATC	227257

CR974422.14	1201	TGAGTGTTCAAAGTGCATGCTGGGTAAAGCTTGCTAAGCTGTTTGACTCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227258	TGAGTGTTCAAAGTGCATGCTGGGTAAAGCTTGCTAAGCTGTTTGACTCC	227307

CR974422.14	1251	CAGAACCCACAACGAAAGGAGACAACCAATGTCTGTCTGTCTGTCCTCCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227308	CAGAACCCACAACGAAAGGAGACAACCAATGTCTGTCTGTCTGTCCTCCC	227357

CR974422.14	1301	CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAGAGACAGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227358	CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAGAGACAGA	227407

CR974422.14	1351	CAGAGACAGACAGACATACATTGTGAGCTGCCATGTGGGTGCTGGGAATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227408	CAGAGACAGACAGACATACATTGTGAGCTGCCATGTGGGTGCTGGGAATT	227457

CR974422.14	1401	GAACCCTGGTCCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGTTCTTAACCACTCCACTGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227458	GAACCCTGGTCCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGTTCTTAACCACTCCACTGA	227507

CR974422.14	1451	GCCACCTCTCCAACCCCACATCTCCCTTACTTTACTAAGCTACAGCTCTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227508	GCCACCTCTCCAACCCCACATCTCCCTTACTTTACTAAGCTACAGCTCTC	227557

CR974422.14	1501	ACCTTTTCACTTACAGGAAGCCCTTTAAAGCTCCACCATCGGTGTTTCCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227558	ACCTTTTCACTTACAGGAAGCCCTTTAAAGCTCCACCATCGGTGTTTCCA	227607

CR974422.14	1551	AGTCTCCTCCTCTTGCCCTTTGGGGCCACTCTTAGTAAAACAAGGGTCAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227608	AGTCTCCTCCTCTTGCCCTTTGGGGCCACTCTTAGTAAAACAAGGGTCAC	227657

CR974422.14	1601	TAGAACACAAACACTCAGTGCAGTGACAGTCAAGCCCAGGTAGTAGCTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227658	TAGAACACAAACACTCAGTGCAGTGACAGTCAAGCCCAGGTAGTAGCTCA	227707

CR974422.14	1651	GTGACTACACAAGCGGGTGGCAAGTATGGCATGAGACACCAGGCAAATAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227708	GTGACTACACAAGCGGGTGGCAAGTATGGCATGAGACACCAGGCAAATAG	227757

CR974422.14	1701	ATGACTCACATCTGGGGCAGGAGATGTCATGAGGCAAGATGAGCCCTAGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227758	ATGACTCACATCTGGGGCAGGAGATGTCATGAGGCAAGATGAGCCCTAGG	227807

CR974422.14	1751	AGGCTCATAACAGTGCAAAATCCAAAACTTGCTATCCTGGGTGTGGTAAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227808	AGGCTCATAACAGTGCAAAATCCAAAACTTGCTATCCTGGGTGTGGTAAC	227857

CR974422.14	1801	CCATGCCTGTAGCCCCAGCTTCAGGAATGTGAGACAGGAGGATCACTGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227858	CCATGCCTGTAGCCCCAGCTTCAGGAATGTGAGACAGGAGGATCACTGAA	227907

CR974422.14	1851	TCCGAGGCCCTACTTGTCCACATAGTGAGACCATGTCTGCCCTCCTCAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227908	TCCGAGGCCCTACTTGTCCACATAGTGAGACCATGTCTGCCCTCCTCAAG	227957

CR974422.14	1901	CCTTGGGTTAAATTCCCAGCACCAACTGAACCAGGCACGATGGTGCTTGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	227958	CCTTGGGTTAAATTCCCAGCACCAACTGAACCAGGCACGATGGTGCTTGT	228007

CR974422.14	1951	CTGTAATCCAAGCACTATGGTTGTGAAGGCTTGAAGATCACAGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974462.5	228008	CTGTAATCCAAGCACTATGGTTGTGAAGGCTTGAAGATCACAGTGAATTC	228057

Overview

Query
CR974422.14 - 189049 bps
Hit
CR974462.5 - 228057 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link