<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1999 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR956414.4	1	CAGTTCTTTGTCTTTTTCCCTTTCTGCTTACCCGTTCCAGACCCTCTCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	205436	CAGTTCTTTGTCTTTTTCCCTTTCTGCTTACCCGTTCCAGACCCTCTCCT	205485

CR956414.4	51	TCATGGATTAGAATTTGAAATGATGGACTACTGGACGATCCTGTATAAGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	205486	TCATGGATTAGAATTTGAAATGATGGACTACTGGACGATCCTGTATAAGC	205535

CR956414.4	101	AACAATATGGATCAGGACCTTCAAAGTGAAAACAGACTCCAGTTCACCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	205536	AACAATATGGATCAGGACCTTCAAAGTGAAAACAGACTCCAGTTCACCTG	205585

CR956414.4	151	CTGGTCCCTACAGGTTTGGAAGTTCCTAAACTATAAAGGAATGTAATCCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	205586	CTGGTCCCTACAGGTTTGGAAGTTCCTAAACTATAAAGGAATGTAATCCA	205635

CR956414.4	201	AGAATAGGAATTCTAAGCTTCTAGTCCCAGGGCAGGGTATGTGGCTGGCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	205636	AGAATAGGAATTCTAAGCTTCTAGTCCCAGGGCAGGGTATGTGGCTGGCC	205685

CR956414.4	251	AGGGCTGGTCAGTCATTTTACCTACTCTTGAGAAAAGTAAGTTTCCAATC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	205686	AGGGCTGGTCAGTCATTTTACCTACTCTTGAGAAAAGTAAGTTTCCAATC	205735

CR956414.4	301	CTTTTCAGGTGACAATGAAATCACTCAGACCAACTGTCCTTTTCAGGTTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	205736	CTTTTCAGGTGACAATGAAATCACTCAGACCAACTGTCCTTTTCAGGTTC	205785

CR956414.4	351	TTTTTGGGTTCCCATATCTTATGAGAGTCTTCTTAACTCCGACATTTTCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	205786	TTTTTGGGTTCCCATATCTTATGAGAGTCTTCTTAACTCCGACATTTTCC	205835

CR956414.4	401	ACTAGGGCTTATTCTAGAACCAGTCATTAGTTTACCAAACATTAATTGGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	205836	ACTAGGGCTTATTCTAGAACCAGTCATTAGTTTACCAAACATTAATTGGG	205885

CR956414.4	451	TTCCAGCTGGGTGCATTGCTATGCCAACCTCTAGGAATGCAACAGTAAGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	205886	TTCCAGCTGGGTGCATTGCTATGCCAACCTCTAGGAATGCAACAGTAAGC	205935

CR956414.4	501	CTTGAAGGAAGTCACGGAATAATCAAGAGAAAAAATAATGAACAGGCAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	205936	CTTGAAGGAAGTCACGGAATAATCAAGAGAAAAAATAATGAACAGGCAGT	205985

CR956414.4	551	TACAATACAGTGTGATAAAGATTCATACAGTGGTCAGGCCAAACTTCCTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	205986	TACAATACAGTGTGATAAAGATTCATACAGTGGTCAGGCCAAACTTCCTG	206035

CR956414.4	601	CAAGAGGCAAATTCATAACCTAGATGTGTAGGAAGAGCAGGCCTTGGGCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206036	CAAGAGGCAAATTCATAACCTAGATGTGTAGGAAGAGCAGGCCTTGGGCA	206085

CR956414.4	651	GACAGAGACGTGAGACAGAGAGGGTTCCAGGCAGAGGGAATAGCTTGTGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206086	GACAGAGACGTGAGACAGAGAGGGTTCCAGGCAGAGGGAATAGCTTGTGC	206135

CR956414.4	701	AAAGAGGAGCTACAGCAGTCTTGAGGAACCTCAGTCTGGCTAGAGGTGGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206136	AAAGAGGAGCTACAGCAGTCTTGAGGAACCTCAGTCTGGCTAGAGGTGGG	206185

CR956414.4	751	CAGAACACTGGAGACAGGAGATGGGTAGGGAGGAGATGCAATGGCTTTGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206186	CAGAACACTGGAGACAGGAGATGGGTAGGGAGGAGATGCAATGGCTTTGT	206235

CR956414.4	801	ATGGCAAGCAGGGTATACCTAAACCATGCCCTATTTTTCCTTTAGCCCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206236	ATGGCAAGCAGGGTATACCTAAACCATGCCCTATTTTTCCTTTAGCCCCT	206285

CR956414.4	851	CTCCCTATTAAACCTTGAACACACCCAAAGGCATATCCTAGGTTACTTAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206286	CTCCCTATTAAACCTTGAACACACCCAAAGGCATATCCTAGGTTACTTAG	206335

CR956414.4	901	CTTCTCCTCATCTTCGAAGCAACACTGGTGGTGATGATGACTATGACAGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206336	CTTCTCCTCATCTTCGAAGCAACACTGGTGGTGATGATGACTATGACAGT	206385

CR956414.4	951	GACAAAAATGAGTATTCACGGAGACTCACCATGTGCTAGGTACCTTTTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206386	GACAAAAATGAGTATTCACGGAGACTCACCATGTGCTAGGTACCTTTTTT	206435

CR956414.4	1001	TTCTTTTTTCTTTTTTAGGGCCACACCTGCAGCATATGGAAGTTCTTGGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206436	TTCTTTTTTCTTTTTTAGGGCCACACCTGCAGCATATGGAAGTTCTTGGG	206485

CR956414.4	1051	CTAGGGGTCAAATTGGAGCTACACCTGCCAGCCTATGCCACAGCCACAGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206486	CTAGGGGTCAAATTGGAGCTACACCTGCCAGCCTATGCCACAGCCACAGC	206535

CR956414.4	1101	AATACAGGATCCAGGCTGCATCTGCAACCTGTGCTGCAGCTTGTGGCAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206536	AATACAGGATCCAGGCTGCATCTGCAACCTGTGCTGCAGCTTGTGGCAAT	206585

CR956414.4	1151	GCTGCATCCTTAACCCCCTGAGCAAGGCCAAGAACTGAACCCATATTCTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206586	GCTGCATCCTTAACCCCCTGAGCAAGGCCAAGAACTGAACCCATATTCTC	206635

CR956414.4	1201	ATGGATACTAGTCAGGTTCTTAACCTGCCGAGCCACAATGGGAACTCCCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206636	ATGGATACTAGTCAGGTTCTTAACCTGCCGAGCCACAATGGGAACTCCCA	206685

CR956414.4	1251	GATAGCATTTTAGAAAACAATTTACGGGTATTGTCTCACCAGAGACCAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206686	GATAGCATTTTAGAAAACAATTTACGGGTATTGTCTCACCAGAGACCAGC	206735

CR956414.4	1301	TCTTCACAAGTAAGTGATTTTGAACACGTCTCTCAACCTCCTTGAGCCTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206736	TCTTCACAAGTAAGTGATTTTGAACACGTCTCTCAACCTCCTTGAGCCTC	206785

CR956414.4	1351	CTCTGTGTCCTCATCTGCAAAATAAGGACCATAATTCTATCTACCTTGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206786	CTCTGTGTCCTCATCTGCAAAATAAGGACCATAATTCTATCTACCTTGAA	206835

CR956414.4	1401	TGGTTTTCTGAGCATTAAAAGAGAAATATACGTAAAGGGACTGACAAACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206836	TGGTTTTCTGAGCATTAAAAGAGAAATATACGTAAAGGGACTGACAAACA	206885

CR956414.4	1451	GTAAAGAATCAAGCATTTTAGTTTTATTATTGTTGCGGGCTGTCATCTAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206886	GTAAAGAATCAAGCATTTTAGTTTTATTATTGTTGCGGGCTGTCATCTAC	206935

CR956414.4	1501	CTATTATCCTTATACTCTAACTTTTAACACTATTTTACAATATAATAACC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206936	CTATTATCCTTATACTCTAACTTTTAACACTATTTTACAATATAATAACC	206985

CR956414.4	1551	ATTATTCTCTATTTTATTTTATTGAATACCTACCTTGTGCCTGACTGGCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	206986	ATTATTCTCTATTTTATTTTATTGAATACCTACCTTGTGCCTGACTGGCT	207035

CR956414.4	1601	TGCCTTGAGTCAGATGCCCATCCTTTAGACCAGGAGTTGGCAAACTATGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	207036	TGCCTTGAGTCAGATGCCCATCCTTTAGACCAGGAGTTGGCAAACTATGG	207085

CR956414.4	1651	CCTGTAGACCAAATCTGGTCCACTGCCTGCTTCTGCAAATAAGGTTTTAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	207086	CCTGTAGACCAAATCTGGTCCACTGCCTGCTTCTGCAAATAAGGTTTTAT	207135

CR956414.4	1701	TGGAACATGACCTCATTCATTTACACATTGTCTATGCTGCTTTTGTGCTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	207136	TGGAACATGACCTCATTCATTTACACATTGTCTATGCTGCTTTTGTGCTA	207185

CR956414.4	1751	GAAATGCAGAACTGTGTGGCTACAACAGAGATGATAAATATTTACAATCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	207186	GAAATGCAGAACTGTGTGGCTACAACAGAGATGATAAATATTTACAATCA	207235

CR956414.4	1801	ATGATTTCTGTTGAAACTAGCAACTATTTCTGCTGCTTTACAGAATAAGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	207236	ATGATTTCTGTTGAAACTAGCAACTATTTCTGCTGCTTTACAGAATAAGC	207285

CR956414.4	1851	TTGCTAACCCTTGCTTTGAACTAATAACTTTGACCAAGGTCACGGGGTCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	207286	TTGCTAACCCTTGCTTTGAACTAATAACTTTGACCAAGGTCACGGGGTCC	207335

CR956414.4	1901	TATGATTGGCCACACATGAGACACACACCCTCCTCTCATCAAGGGGGTAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	207336	TATGATTGGCCACACATGAGACACACACCCTCCTCTCATCAAGGGGGTAT	207385

CR956414.4	1951	GTCAGCCCCATTTGGAGCATATAGGCTGAAAGAGGGGGTGGAGTGGATC	1999
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974431.11	207386	GTCAGCCCCATTTGGAGCATATAGGCTGAAAGAGGGGGTGGAGTGGATC	207434

Overview

Query
CR956414.4 - 35096 bps
Hit
CR974431.11 - 207434 bps
Total alignments
23
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1999 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100198619991199912054362074341
290.581952751564115915-113023132981
391.672042752300823282-113024132991
495.85206241137961403611026591028991
590.851922711379614066-11162611165331
691.32191265137951405911294731297371
790.6188265156411590511294741297391
895.78244283137961407811334831337661
993.732352961379514090-11347441350461
1094.962332791379514073-11623361626131
1190.441912712300723277-11623431626141
1294.082342871379614082-11685051687911
1389.051862822842628707-11685091687911
1489.51862752300923283-11685161687911
1582.8201468257932626011760661765241
1693.2208264137961405911833821836461
1793.12853822436281711867391871151
1894.292382951379614090-11928871931841
1990.981962742300723280-11995361998121
2093.282092661379514060-11995441998111
2192.362102752300923283-12017902020641
2291.232082851378214066-12017942020781
2391.761992672842628692-12017982020641
Short-link