<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR974447.12	1	TCATAAACATTTTTATTTTCTAGCTGTTACCACAAATTTATTTGCAAAAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197121	TCATAAACATTTTTATTTTCTAGCTGTTACCACAAATTTATTTGCAAAAT	197170

CR974447.12	51	GACTGCAAGAAACATGACAACAATGAGTGGATTCCTCCTCATGGGGTTCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197171	GACTGCAAGAAACATGACAACAATGAGTGGATTCCTCCTCATGGGGTTCT	197220

CR974447.12	101	CTGACAACCATGAATTGCAGATCTTACAGGCTTTGCTGTTTTTGCTGACA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197221	CTGACAACCATGAATTGCAGATCTTACAGGCTTTGCTGTTTTTGCTGACA	197270

CR974447.12	151	TACCTATTGGGCTCAGCAGGGAACTTCATCATTATCACCATCACAACACT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197271	TACCTATTGGGCTCAGCAGGGAACTTCATCATTATCACCATCACAACACT	197320

CR974447.12	201	GGACCCACAGCTCCAGTCTCCAATGTATTATTTTCTGAAGCAACTTTCCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197321	GGACCCACAGCTCCAGTCTCCAATGTATTATTTTCTGAAGCAACTTTCCA	197370

CR974447.12	251	CTCTGGACCTCTCATCCCTCTCTGTCACAGTTCCTCAGTATGTTGCCAGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197371	CTCTGGACCTCTCATCCCTCTCTGTCACAGTTCCTCAGTATGTTGCCAGT	197420

CR974447.12	301	TCCCTGGCACGAAGTGGCTACATTTCATATGGGCAATGCATGCTGCAGAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197421	TCCCTGGCACGAAGTGGCTACATTTCATATGGGCAATGCATGCTGCAGAT	197470

CR974447.12	351	ATTTTTCTTCACAGGTTTGGCCTGGAGTGAAATGGCCACTCTCACAGTGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197471	ATTTTTCTTCACAGGTTTGGCCTGGAGTGAAATGGCCACTCTCACAGTGA	197520

CR974447.12	401	TGTCTTATGATCGCTATGTGGCCATCTGCCTCCCACTGCACTATGAGGTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197521	TGTCTTATGATCGCTATGTGGCCATCTGCCTCCCACTGCACTATGAGGTC	197570

CR974447.12	451	ATAATGAGTCCCAGAAAGTGCACTTGGGCTGTGGCAGCTGTGTGGCTAAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197571	ATAATGAGTCCCAGAAAGTGCACTTGGGCTGTGGCAGCTGTGTGGCTAAG	197620

CR974447.12	501	TGGAGGTATCTCAGGAACATTATTCACAGCAAGTACACTCTCTATCAGAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197621	TGGAGGTATCTCAGGAACATTATTCACAGCAAGTACACTCTCTATCAGAT	197670

CR974447.12	551	TCTGTGGGGATAAAATTATTCACCAGTTCTTCTGTGATATCCCGCAATTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197671	TCTGTGGGGATAAAATTATTCACCAGTTCTTCTGTGATATCCCGCAATTG	197720

CR974447.12	601	CTCAAGCTCTCCTGCTCTAATGATTACTTTGGAGTACTGGAAGTGTCTAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197721	CTCAAGCTCTCCTGCTCTAATGATTACTTTGGAGTACTGGAAGTGTCTAC	197770

CR974447.12	651	TTTCATGTCTGTAATGGCCTTTGCCTGCTTTGTGGGGATTGCCTTCTCCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197771	TTTCATGTCTGTAATGGCCTTTGCCTGCTTTGTGGGGATTGCCTTCTCCT	197820

CR974447.12	701	ATGGCCAGATATTCTCTACAGTTCTCAGGATGCCCTCTGCTGAAGGCCGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197821	ATGGCCAGATATTCTCTACAGTTCTCAGGATGCCCTCTGCTGAAGGCCGA	197870

CR974447.12	751	TCTAAGGTCTTCTCCACCTGCCTGCCCCATCTCTTCGTTGTTTCATTTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197871	TCTAAGGTCTTCTCCACCTGCCTGCCCCATCTCTTCGTTGTTTCATTTTT	197920

CR974447.12	801	TCTCTCAACAGGCATTTGTGCCTATCTAAAGCCAACCTCAGACTCACCAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197921	TCTCTCAACAGGCATTTGTGCCTATCTAAAGCCAACCTCAGACTCACCAA	197970

CR974447.12	851	CTGCTTTAGACCTCATGCTCTCTATCTTTTACACACTACTACCCCCAACC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	197971	CTGCTTTAGACCTCATGCTCTCTATCTTTTACACACTACTACCCCCAACC	198020

CR974447.12	901	CTCAACCCTGTTATCTATAGTCTGAGAAATGAGTCCTTGAAAAGAGCACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198021	CTCAACCCTGTTATCTATAGTCTGAGAAATGAGTCCTTGAAAAGAGCACT	198070

CR974447.12	951	AAAGAAGTTACTGCTAAGTGAAGAATTCATTAGGAAAAAATGTTTGTTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198071	AAAGAAGTTACTGCTAAGTGAAGAATTCATTAGGAAAAAATGTTTGTTCT	198120

CR974447.12	1001	ATTTTTAGTGTCTGCTAACACTGAACAGAATGTTTTTTGTATATTGAATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198121	ATTTTTAGTGTCTGCTAACACTGAACAGAATGTTTTTTGTATATTGAATA	198170

CR974447.12	1051	TGTTAGATATGTAATGTTCAGAATAACAAGATATTTTCTAAAAAATACAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198171	TGTTAGATATGTAATGTTCAGAATAACAAGATATTTTCTAAAAAATACAT	198220

CR974447.12	1101	ATTATAAACCTAATGCATAGCAAGTTGTGATGTGATTCTTTGAACCTATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198221	ATTATAAACCTAATGCATAGCAAGTTGTGATGTGATTCTTTGAACCTATT	198270

CR974447.12	1151	TCATCAAACTTACTTCTTTTTTCTTTCTTTCTTTTTGTTTTTCTTTGTTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198271	TCATCAAACTTACTTCTTTTTTCTTTCTTTCTTTTTGTTTTTCTTTGTTG	198320

CR974447.12	1201	TTGTTGATTTTCAAGACATGGTTACTCTATGTAACCCTGGCTGTCCTGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198321	TTGTTGATTTTCAAGACATGGTTACTCTATGTAACCCTGGCTGTCCTGGA	198370

CR974447.12	1251	ACTCACTCTGTAGACCAAATTGGCCTGGGACTCAGAAATCTTCCTGCCTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198371	ACTCACTCTGTAGACCAAATTGGCCTGGGACTCAGAAATCTTCCTGCCTT	198420

CR974447.12	1301	TGTCTCCCAAGTACTGGGATTAAAGGCATGGACCACTACTGCTCAGCTAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198421	TGTCTCCCAAGTACTGGGATTAAAGGCATGGACCACTACTGCTCAGCTAC	198470

CR974447.12	1351	TTATTCTTTTTAAGTTGGTAAAAATATATGATTATAATCTAGTAATGTAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198471	TTATTCTTTTTAAGTTGGTAAAAATATATGATTATAATCTAGTAATGTAG	198520

CR974447.12	1401	ACCCGATTCTTCCTAACTCTTCAAACCCATTGCCACACAGGTACATATGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198521	ACCCGATTCTTCCTAACTCTTCAAACCCATTGCCACACAGGTACATATGT	198570

CR974447.12	1451	GAATTTACCAACAATACTAACATGGATTTACCAAATATGTTTATGGCAAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198571	GAATTTACCAACAATACTAACATGGATTTACCAAATATGTTTATGGCAAT	198620

CR974447.12	1501	ATAGTAATAAAAATAATAAGCATGAAGGATATTCACAGTTATTGGTTACT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198621	ATAGTAATAAAAATAATAAGCATGAAGGATATTCACAGTTATTGGTTACT	198670

CR974447.12	1551	CAGTTCACCAAAAGGGTCATAATTATAATATTTATCACTTATTTCAAAGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198671	CAGTTCACCAAAAGGGTCATAATTATAATATTTATCACTTATTTCAAAGT	198720

CR974447.12	1601	TTCATGTCACTTTCTATCTTTCCATATACAAATTTTAAATGTCATTTTTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198721	TTCATGTCACTTTCTATCTTTCCATATACAAATTTTAAATGTCATTTTTA	198770

CR974447.12	1651	TGCGTATCTATATAAAGTAATACTATAGTTCTCTTGAGTAGGAAGTATTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198771	TGCGTATCTATATAAAGTAATACTATAGTTCTCTTGAGTAGGAAGTATTC	198820

CR974447.12	1701	AATGTAATTAATATACAAATAAGCCTCAGTTATTTAGTTTGTATCATTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198821	AATGTAATTAATATACAAATAAGCCTCAGTTATTTAGTTTGTATCATTTA	198870

CR974447.12	1751	CTGTTATTTTTGCTTACAAATAAGTCACTTTTATAATAATCCAAGTAGTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198871	CTGTTATTTTTGCTTACAAATAAGTCACTTTTATAATAATCCAAGTAGTC	198920

CR974447.12	1801	AGGAGGCAGAGGCAGGAAGTCATCTGTGATGTTTTTAGCCCAGCCTAATC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198921	AGGAGGCAGAGGCAGGAAGTCATCTGTGATGTTTTTAGCCCAGCCTAATC	198970

CR974447.12	1851	TATGTAGTAATGATGATAACTGCTATAAAGTCCTAAATACTTTCTTGCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	198971	TATGTAGTAATGATGATAACTGCTATAAAGTCCTAAATACTTTCTTGCTC	199020

CR974447.12	1901	ATTCTGAGGGTTAAAAGTCCCTGGTTTAGGTGATTAACTCCTGTAGCCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	199021	ATTCTGAGGGTTAAAAGTCCCTGGTTTAGGTGATTAACTCCTGTAGCCTA	199070

CR974447.12	1951	ACAGAAGGGAATTAAGTAATGCAGCCTTTGTTCTATCTCTACAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974430.11	199071	ACAGAAGGGAATTAAGTAATGCAGCCTTTGTTCTATCTCTACAGGAATTC	199120

Overview

Query
CR974447.12 - 139010 bps
Hit
CR974430.11 - 199120 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link