<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1834 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR936237.6	1	GGCCAGGCTGGTCTAGAACCCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCGGCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	2938	GGCCAGGCTGGTCTAGAACCCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCGGCCT	2987

CR936237.6	51	CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCTGACCCTTCCCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	2988	CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCTGACCCTTCCCT	3037

CR936237.6	101	GTGTATTAAAAGAAAAAAAAAAAGCTGGAAAAAAAAGGTTCTTTAACTAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3038	GTGTATTAAAAGAAAAAAAAAAAGCTGGAAAAAAAAGGTTCTTTAACTAT	3087

CR936237.6	151	TTCTGCAACTTTGACGTACATATAATTCATTTTAGCTGGACACTTGCACT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3088	TTCTGCAACTTTGACGTACATATAATTCATTTTAGCTGGACACTTGCACT	3137

CR936237.6	201	TGTTTAAAAGTTCTGACCCTGGTTTTCAAACTTAAACGTATTACGAATCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3138	TGTTTAAAAGTTCTGACCCTGGTTTTCAAACTTAAACGTATTACGAATCA	3187

CR936237.6	251	CCCAGAAGGCTTGTTAATGCCTGGTGGCTCCAACACCAGAGCTTCAGATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3188	CCCAGAAGGCTTGTTAATGCCTGGTGGCTCCAACACCAGAGCTTCAGATT	3237

CR936237.6	301	CCATGGGTCTGTAAAGAGTGAGGGAGGGAAGGTCAAGCTTTTTTTCTTTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3238	CCATGGGTCTGTAAAGAGTGAGGGAGGGAAGGTCAAGCTTTTTTTCTTTC	3287

CR936237.6	351	TTGAAGGTTTTTTGTTTTGGTTTGGTTTTTTGGAGATGAGGTCTCACTCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3288	TTGAAGGTTTTTTGTTTTGGTTTGGTTTTTTGGAGATGAGGTCTCACTCT	3337

CR936237.6	401	GTCACCTAGGTTGGTGTGCAGTGGTGCAATCATAGCTCACTACTGCCTCG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3338	GTCACCTAGGTTGGTGTGCAGTGGTGCAATCATAGCTCACTACTGCCTCG	3387

CR936237.6	451	AACTCCTGGGGTCAAAGAGATCAAGCCATCCTCCCATGTAGCTAGGACTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3388	AACTCCTGGGGTCAAAGAGATCAAGCCATCCTCCCATGTAGCTAGGACTA	3437

CR936237.6	501	TAGGTGTGCGTTACCATGCTTGGCTAATTTTTAAATTTTTTAGACATGGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3438	TAGGTGTGCGTTACCATGCTTGGCTAATTTTTAAATTTTTTAGACATGGG	3487

CR936237.6	551	GTATTGCCATGTTGCCCAGGATGCCCTTTAATTTGATCATCCTGCCTTGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3488	GTATTGCCATGTTGCCCAGGATGCCCTTTAATTTGATCATCCTGCCTTGG	3537

CR936237.6	601	TCTCCCGAAGTGCTAGCATTACAGATCTGAGCCACCACACCTAGCCAGGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3538	TCTCCCGAAGTGCTAGCATTACAGATCTGAGCCACCACACCTAGCCAGGA	3587

CR936237.6	651	AGGTAGTGTCTGTCTCTCAAGCCTCCCAGCACTTCTGTTTCTAACAGGTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3588	AGGTAGTGTCTGTCTCTCAAGCCTCCCAGCACTTCTGTTTCTAACAGGTA	3637

CR936237.6	701	GTAGTTCATGGGTCAGACATTCATAGTGTCCTTTCCTTTTTGTCTTCCAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3638	GTAGTTCATGGGTCAGACATTCATAGTGTCCTTTCCTTTTTGTCTTCCAC	3687

CR936237.6	751	TATTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTGAGCAAGGGCTCTCCCACTTACCTGCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3688	TATTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTGAGCAAGGGCTCTCCCACTTACCTGCA	3737

CR936237.6	801	GGCTGAACAGATTCTTTTCATAAGCATCTGCCTGGGGAATATTTTCTTAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3738	GGCTGAACAGATTCTTTTCATAAGCATCTGCCTGGGGAATATTTTCTTAC	3787

CR936237.6	851	ATAATTTGCCATAGGAAGTGCTCACTTCTCTGTCAGGCTAGCTGGGACAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3788	ATAATTTGCCATAGGAAGTGCTCACTTCTCTGTCAGGCTAGCTGGGACAG	3837

CR936237.6	901	GATTCCCATCTGCATTTCACACACTTGCACCCTATTTCATGGAGGATGGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3838	GATTCCCATCTGCATTTCACACACTTGCACCCTATTTCATGGAGGATGGT	3887

CR936237.6	951	ATCCTACCCCATGTTAGAAATATAAAACAGCGTGGATTTTTTTTTTTTCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3888	ATCCTACCCCATGTTAGAAATATAAAACAGCGTGGATTTTTTTTTTTTCA	3937

CR936237.6	1001	GACGGAGTCTCACTCTGTTGCCGAGGCTGGTGTGCAGTGCTGTGATCTCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3938	GACGGAGTCTCACTCTGTTGCCGAGGCTGGTGTGCAGTGCTGTGATCTCA	3987

CR936237.6	1051	GCTCACTGCAAACTCCGCCTCCTGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	3988	GCTCACTGCAAACTCCGCCTCCTGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCC	4037

CR936237.6	1101	ACCTGAGTAGCTGGGACTATAAGTGTAAGCCAACACGCCTGGCTAGTTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4038	ACCTGAGTAGCTGGGACTATAAGTGTAAGCCAACACGCCTGGCTAGTTTT	4087

CR936237.6	1151	TGTATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTCG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4088	TGTATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTCG	4137

CR936237.6	1201	AACTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4138	AACTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT	4187

CR936237.6	1251	TATATGTGTGAGCCACCACGCTTGGCCAAGTGTGGATTTTAAAATATCTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4188	TATATGTGTGAGCCACCACGCTTGGCCAAGTGTGGATTTTAAAATATCTT	4237

CR936237.6	1301	ACAGGCTGGGTGCAGGGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4238	ACAGGCTGGGTGCAGGGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGAA	4287

CR936237.6	1351	CATGGCCGGCAGATTGCTTGAGCTCAGCAGTTTGAGACCAACCTAGGCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4288	CATGGCCGGCAGATTGCTTGAGCTCAGCAGTTTGAGACCAACCTAGGCAA	4337

CR936237.6	1401	TATAGTGAGACTTTGTCTCTACTAAAAATTAAAAAAATCAGCCCGCCGGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4338	TATAGTGAGACTTTGTCTCTACTAAAAATTAAAAAAATCAGCCCGCCGGC	4387

CR936237.6	1451	ACCATGGCTCATGCTTGTAATCACAACACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4388	ACCATGGCTCATGCTTGTAATCACAACACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTG	4437

CR936237.6	1501	GATCACCTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4438	GATCACCTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC	4487

CR936237.6	1551	TCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGGGCACC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4488	TCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGGGCACC	4537

CR936237.6	1601	TGTAATCCCAGCTATTCGGGAAGCTGAGGCAGAAGAATCGCTTGAACCTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4538	TGTAATCCCAGCTATTCGGGAAGCTGAGGCAGAAGAATCGCTTGAACCTG	4587

CR936237.6	1651	GGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCTAGCCTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4588	GGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCTAGCCTG	4637

CR936237.6	1701	GGTGCCAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTAAATTAAAAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4638	GGTGCCAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTAAATTAAAAAA	4687

CR936237.6	1751	TGAATAAATAAAAAATAAAAAATATCTTATGGCACTCCCTTCATACTCAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4688	TGAATAAATAAAAAATAAAAAATATCTTATGGCACTCCCTTCATACTCAT	4737

CR936237.6	1801	TACACCTGTGAAGATCAACCTGTTTCTCGGTGAT	1834
			||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942273.7	4738	TACACCTGTGAAGATCAACCTGTTTCTCGGTGAT	4771

Overview

Query
CR936237.6 - 40906 bps
Hit
CR942273.7 - 4771 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1834 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link