<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1995 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CT010586.5	1	CCCACAGAGAGGAACAAAGAGGGGATGTGAAAGCCAGGTACCCCAGGACC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12349	CCCACAGAGAGGAACAAAGAGGGGATGTGAAAGCCAGGTACCCCAGGACC	12398

CT010586.5	51	TGTCTTTCACTGGTCCTGCAAACCTCATCCATGTCTGAAGTCCTGATGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12399	TGTCTTTCACTGGTCCTGCAAACCTCATCCATGTCTGAAGTCCTGATGGC	12448

CT010586.5	101	TGTGGAGCCCCCTGCCCCAAGGAGCCTTCACCCCCAGCAGAAACTGGCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12449	TGTGGAGCCCCCTGCCCCAAGGAGCCTTCACCCCCAGCAGAAACTGGCTG	12498

CT010586.5	151	ATGGGACCATGGACTGCTGTCCACTGCAAACCAGGCTCCCAGGGACGAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12499	ATGGGACCATGGACTGCTGTCCACTGCAAACCAGGCTCCCAGGGACGAGG	12548

CT010586.5	201	TATTGGGGGCTGAGGGTCAGTGTCCAGAGGCCTTCCCATGCCCACCCTGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12549	TATTGGGGGCTGAGGGTCAGTGTCCAGAGGCCTTCCCATGCCCACCCTGA	12598

CT010586.5	251	AAGATTTATAGGGCAGGGAAGGGCAGAGGAGCAACCGAAGAGTGGGGGCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12599	AAGATTTATAGGGCAGGGAAGGGCAGAGGAGCAACCGAAGAGTGGGGGCA	12648

CT010586.5	301	GGGGACAGGGCAAGGAAAGCTGCAGGTGGAGGGCCAGGGACCTTCAGCCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12649	GGGGACAGGGCAAGGAAAGCTGCAGGTGGAGGGCCAGGGACCTTCAGCCT	12698

CT010586.5	351	CTCTCCTGGAATCTCTGTCCCACCCTCGGCCTTTTTACCTCTGCCTCTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12699	CTCTCCTGGAATCTCTGTCCCACCCTCGGCCTTTTTACCTCTGCCTCTTT	12748

CT010586.5	401	CCCCTCTCCCCACCCATCCTTATCATTGTTTTAAGATCCCCCTCGATCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12749	CCCCTCTCCCCACCCATCCTTATCATTGTTTTAAGATCCCCCTCGATCCA	12798

CT010586.5	451	TCTTCCTGCTGAACCTGCAATTCCTTTTCTCTCCTTTTCTCCTCTATCCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12799	TCTTCCTGCTGAACCTGCAATTCCTTTTCTCTCCTTTTCTCCTCTATCCA	12848

CT010586.5	501	GCCCCAAACATCAGCCCTGCCCTTCACTGGCCCCTCAATATCCATCCTAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12849	GCCCCAAACATCAGCCCTGCCCTTCACTGGCCCCTCAATATCCATCCTAC	12898

CT010586.5	551	CTCTGAAGTCCCAATAACCCCAGCTCCTCCCCCAATCTCAGGATATTGAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12899	CTCTGAAGTCCCAATAACCCCAGCTCCTCCCCCAATCTCAGGATATTGAT	12948

CT010586.5	601	CTGAGCAGAGTCCAAGATGTACCCATAATGCCTTGGTAGATGATGGGGTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12949	CTGAGCAGAGTCCAAGATGTACCCATAATGCCTTGGTAGATGATGGGGTC	12998

CT010586.5	651	AGAGGGCTTGCCCCCAGGAGGGACCCCATGAAGTGACAGCTCATACGGGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	12999	AGAGGGCTTGCCCCCAGGAGGGACCCCATGAAGTGACAGCTCATACGGGG	13048

CT010586.5	701	TTCCAGGAGGGGGTGGAGGCACCAGAGCCTGGCGGACGTCCCCTGGCAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13049	TTCCAGGAGGGGGTGGAGGCACCAGAGCCTGGCGGACGTCCCCTGGCAGC	13098

CT010586.5	751	ACTTCCTCATGTGCCCCCGGCCCCTCGGGCACCCGCATGCGCAGTTGGAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13099	ACTTCCTCATGTGCCCCCGGCCCCTCGGGCACCCGCATGCGCAGTTGGAA	13148

CT010586.5	801	GTAGGCAAAGGTGTCAGGCTGGGCGGTCCAGACCACACGGAGGCGCCCTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13149	GTAGGCAAAGGTGTCAGGCTGGGCGGTCCAGACCACACGGAGGCGCCCTG	13198

CT010586.5	851	TCTCATCTCTGCCCAGCACCCTCAACTCTCCCAGCTCCTGGGGGCGCTGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13199	TCTCATCTCTGCCCAGCACCCTCAACTCTCCCAGCTCCTGGGGGCGCTGC	13248

CT010586.5	901	TGCAGGAGAGGAGCCTGGGCCCCTTGCGTCGTCGAGGGGCCTGAGGGAGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13249	TGCAGGAGAGGAGCCTGGGCCCCTTGCGTCGTCGAGGGGCCTGAGGGAGG	13298

CT010586.5	951	AGGCTCATCGGTAGTCCCCAAGAGGCCCAAGGGTGAGGACCCTGGGAAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13299	AGGCTCATCGGTAGTCCCCAAGAGGCCCAAGGGTGAGGACCCTGGGAAGG	13348

CT010586.5	1001	GGCAGGGTGAGAAAAAGAGGAGAGTCCAGTATGAGAACTAGAAAGGAATC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13349	GGCAGGGTGAGAAAAAGAGGAGAGTCCAGTATGAGAACTAGAAAGGAATC	13398

CT010586.5	1051	CCCAGTCCCCAGGTTCTGCCCTCCAGCCTCTAAGAGCCTTGTTCTACTTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13399	CCCAGTCCCCAGGTTCTGCCCTCCAGCCTCTAAGAGCCTTGTTCTACTTC	13448

CT010586.5	1101	TACTTCTGGTTCCCTCACCTGGGCCACTCCCTCCTCCCAAAGGTCAGCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13449	TACTTCTGGTTCCCTCACCTGGGCCACTCCCTCCTCCCAAAGGTCAGCCA	13498

CT010586.5	1151	ATCCTCCAAACACCCCCATCTACCACATTCCTGAGCAGACGGGCCTGTGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13499	ATCCTCCAAACACCCCCATCTACCACATTCCTGAGCAGACGGGCCTGTGC	13548

CT010586.5	1201	TTCAGGCAGGTAATAGGTAAAATAAAGCCTGCTATCCTTCACCCCACAAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13549	TTCAGGCAGGTAATAGGTAAAATAAAGCCTGCTATCCTTCACCCCACAAG	13598

CT010586.5	1251	GCTTCCATGACCTCCAGCCCCCGGAGACTTCCATGTCCCTCCCCACATAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13599	GCTTCCATGACCTCCAGCCCCCGGAGACTTCCATGTCCCTCCCCACATAC	13648

CT010586.5	1301	ATCCCCCCCACTGGGTGGTGGTCAGGTGGCTTCCATTAGTGCTGCAGTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13649	ATCCCCCCCACTGGGTGGTGGTCAGGTGGCTTCCATTAGTGCTGCAGTGA	13698

CT010586.5	1351	GAAGCCTGGAAGAAAGACAGTGGTGTTAGAGAGGGAGGATGCAAGAGGAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13699	GAAGCCTGGAAGAAAGACAGTGGTGTTAGAGAGGGAGGATGCAAGAGGAG	13748

CT010586.5	1401	AGTGGGCAGTGGGAAGAGAGAGAGGGTGTGGGGGTGGACATCCAGGTCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13749	AGTGGGCAGTGGGAAGAGAGAGAGGGTGTGGGGGTGGACATCCAGGTCAG	13798

CT010586.5	1451	GTGGCATCTGGGCCCTATGGGGGAAGAAGAGGTCCACCACCCTCCCCACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13799	GTGGCATCTGGGCCCTATGGGGGAAGAAGAGGTCCACCACCCTCCCCACA	13848

CT010586.5	1501	GCAGCCACAGGGTGCCCTTTCCCCAAGCCCAGACATCGTTCCTGTGGGAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13849	GCAGCCACAGGGTGCCCTTTCCCCAAGCCCAGACATCGTTCCTGTGGGAG	13898

CT010586.5	1551	AGACCAGCATAAAGTGAGCCAGGGGGTCTGAAAAGCCAGCTTAAGAAGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13899	AGACCAGCATAAAGTGAGCCAGGGGGTCTGAAAAGCCAGCTTAAGAAGCA	13948

CT010586.5	1601	GTGGTTTCACCTCCCCAATATACAGTTGCTGCCTGATGGCACCCAGGCCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13949	GTGGTTTCACCTCCCCAATATACAGTTGCTGCCTGATGGCACCCAGGCCA	13998

CT010586.5	1651	CCCCCACGCAGTTCTGATGTGTCCCTTCAAGGTCAAGGCCAAATTGTGGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	13999	CCCCCACGCAGTTCTGATGTGTCCCTTCAAGGTCAAGGCCAAATTGTGGA	14048

CT010586.5	1701	AAACAGTAACCACTAACCACAGTCTTCAGCCACTCTCACCACAGTGAGTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	14049	AAACAGTAACCACTAACCACAGTCTTCAGCCACTCTCACCACAGTGAGTC	14098

CT010586.5	1751	AGAACGGGAATCACTGTTTTCAATTCCCAGCCCACTCAAACTGCTCCAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	14099	AGAACGGGAATCACTGTTTTCAATTCCCAGCCCACTCAAACTGCTCCAGT	14148

CT010586.5	1801	GAATCTTTGCAGGTGCCCCAACCACATCACCCTCTATTGCCTAAAATAAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	14149	GAATCTTTGCAGGTGCCCCAACCACATCACCCTCTATTGCCTAAAATAAC	14198

CT010586.5	1851	AATCCTGGAAGTGTCCCGGGAAACCCCAAAGAAGGCGCTGCCTTGACCTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	14199	AATCCTGGAAGTGTCCCGGGAAACCCCAAAGAAGGCGCTGCCTTGACCTT	14248

CT010586.5	1901	AGGCATCCACAGGATGGATGCCAGGACCCTGGGGTGGGGACGTCTTCTAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	14249	AGGCATCCACAGGATGGATGCCAGGACCCTGGGGTGGGGACGTCTTCTAG	14298

CT010586.5	1951	GGACAATGGACTCGTGCTTTGTCCTGGGGGCCCCCTGGAGCCCCG	1995
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936919.4	14299	GGACAATGGACTCGTGCTTTGTCCTGGGGGCCCCCTGGAGCCCCG	14343

Overview

Query
CT010586.5 - 2536 bps
Hit
CR936919.4 - 14343 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1995 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link