<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR933736.12	1	GAATTCAAGGCCAGCTTGAGCTACAAGTTAGATCCTGTCTCAAAAGAACA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	112511	GAATTCAAGGCCAGCTTGAGCTACAAGTTAGATCCTGTCTCAAAAGAACA	112560

CR933736.12	51	AAACAAATGGGCTGGAAAGCTGGCTCAAACCACTCGCATCTGTAACTCCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	112561	AAACAAATGGGCTGGAAAGCTGGCTCAAACCACTCGCATCTGTAACTCCA	112610

CR933736.12	101	GACCTAGGGTACCAGATCCCCTCTTCTGGCCTTGGTGCACAGACATCCTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	112611	GACCTAGGGTACCAGATCCCCTCTTCTGGCCTTGGTGCACAGACATCCTC	112660

CR933736.12	151	GCAGGCAAAATATCCATACACATAAAATAAAAATAATAAGAAATTTTAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	112661	GCAGGCAAAATATCCATACACATAAAATAAAAATAATAAGAAATTTTAAA	112710

CR933736.12	201	ACAAAACAAGGGCCAGGAAGGTGGCTCACTGGATAAAAGTGCTGACTGCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	112711	ACAAAACAAGGGCCAGGAAGGTGGCTCACTGGATAAAAGTGCTGACTGCA	112760

CR933736.12	251	CAAGCCCGATGACCCATGTTGGATCTCCAGAACTCATGTGAAAAGCCAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	112761	CAAGCCCGATGACCCATGTTGGATCTCCAGAACTCATGTGAAAAGCCAAA	112810

CR933736.12	301	TGCTGTAACTCTCCTGTGATCTCAGCACTCTTACAGTGAGGTAGGAGGTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	112811	TGCTGTAACTCTCCTGTGATCTCAGCACTCTTACAGTGAGGTAGGAGGTA	112860

CR933736.12	351	GAGGCAGGAGATTGCCTAAAAGCACAAGAGCTGGAAGGTGAGAATCCTGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	112861	GAGGCAGGAGATTGCCTAAAAGCACAAGAGCTGGAAGGTGAGAATCCTGA	112910

CR933736.12	401	AGGTTGTCCTTTGACTCGCACCGTGACACAGTCATATGCACACTCACATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	112911	AGGTTGTCCTTTGACTCGCACCGTGACACAGTCATATGCACACTCACATG	112960

CR933736.12	451	CACCCACTCCTGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	112961	CACCCACTCCTGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACA	113010

CR933736.12	501	CACACACACACTAGATAGATAGATAGATGATAGATATATAGATAGATGAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113011	CACACACACACTAGATAGATAGATAGATGATAGATATATAGATAGATGAT	113060

CR933736.12	551	ACATAGTACATAGGTAAATTTAAGACGAAACAAAATCCCTTGAACTTGAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113061	ACATAGTACATAGGTAAATTTAAGACGAAACAAAATCCCTTGAACTTGAC	113110

CR933736.12	601	TAAACCAAATTCAATCAATGATATTTTCCTCTTTTTTTGAAATACTTTTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113111	TAAACCAAATTCAATCAATGATATTTTCCTCTTTTTTTGAAATACTTTTA	113160

CR933736.12	651	TTTATACTTTGACAATTTATCATGATACAACAACATATCTTGCTCATATC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113161	TTTATACTTTGACAATTTATCATGATACAACAACATATCTTGCTCATATC	113210

CR933736.12	701	CACTCCCAATTTCCACTATTTTTCCCAGATCCACACCCAACACATTCTCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113211	CACTCCCAATTTCCACTATTTTTCCCAGATCCACACCCAACACATTCTCT	113260

CR933736.12	751	TTTTTAATGCAACCCACTGAGTCCAACTAGTTCTGCATGCTTGGCATGGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113261	TTTTTAATGCAACCCACTGAGTCCAACTAGTTCTGCATGCTTGGCATGGA	113310

CR933736.12	801	TATGAGGTCATCCCCTAGAGCCAGTAAGGAACAAGGCTTCATGAGCCATC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113311	TATGAGGTCATCCCCTAGAGCCAGTAAGGAACAAGGCTTCATGAGCCATC	113360

CR933736.12	851	CTCCATCGATGCTGCCTGGCTTGGTCCTGAGCAGAGACTGTGCTGATACC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113361	CTCCATCGATGCTGCCTGGCTTGGTCCTGAGCAGAGACTGTGCTGATACC	113410

CR933736.12	901	CAAAGTTGCAGTGGATTCATGAGTACAATGGTCACATCCAGAAGACAGCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113411	CAAAGTTGCAGTGGATTCATGAGTACAATGGTCACATCCAGAAGACAGCA	113460

CR933736.12	951	TGGCATAGCTCTCCTCCCACCTTCTATCTCTTAACATTCTTTCTCCCCCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113461	TGGCATAGCTCTCCTCCCACCTTCTATCTCTTAACATTCTTTCTCCCCCT	113510

CR933736.12	1001	CTGGCTCGACATCCCCTGAGCCTTAGGGAAGTTACTATAAATGTCCTATT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113511	CTGGCTCGACATCCCCTGAGCCTTAGGGAAGTTACTATAAATGTCCTATT	113560

CR933736.12	1051	TAGGACTGATCATTCACAGCCACCTAGTCTCAGCTCTTTGGCCAGTTGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113561	TAGGACTGATCATTCACAGCCACCTAGTCTCAGCTCTTTGGCCAGTTGTG	113610

CR933736.12	1101	AGTCTCTGCATTAACTACTACCTGCTGAAAAAGGAAGTTTCTCTGATCAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113611	AGTCTCTGCATTAACTACTACCTGCTGAAAAAGGAAGTTTCTCTGATCAA	113660

CR933736.12	1151	GATTGAGATCAGCACTACCCTATGGGTACAGATGTAGTTAGAATGCAGTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113661	GATTGAGATCAGCACTACCCTATGGGTACAGATGTAGTTAGAATGCAGTT	113710

CR933736.12	1201	TGATAACATGCCCATTTAACAAAACAGAAGTCCTAGATACCCCTCGAGGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113711	TGATAACATGCCCATTTAACAAAACAGAAGTCCTAGATACCCCTCGAGGG	113760

CR933736.12	1251	CCTGTGACCTCTCTGCAGCCATGCATGGCTGGTTGGTTGGTGGGTTGGGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113761	CCTGTGACCTCTCTGCAGCCATGCATGGCTGGTTGGTTGGTGGGTTGGGT	113810

CR933736.12	1301	TGGTTTTTACCAACTGTTCATTACCAGGCATGAATCCCCTCCTGTGCAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113811	TGGTTTTTACCAACTGTTCATTACCAGGCATGAATCCCCTCCTGTGCAAT	113860

CR933736.12	1351	AAGCCTCAAATCTGGTCAGAAAATAGTTGACTACGCCTATAATGTTCATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113861	AAGCCTCAAATCTGGTCAGAAAATAGTTGACTACGCCTATAATGTTCATG	113910

CR933736.12	1401	ACATTATTTCATGTGCATCTTGTCTGTCAGGTTGATACTGTAGCATGCAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113911	ACATTATTTCATGTGCATCTTGTCTGTCAGGTTGATACTGTAGCATGCAA	113960

CR933736.12	1451	GGTCTACCGCTGAGTAAGACCAATGATAGCTCTTCTTCCCTAGCAGTCTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	113961	GGTCTACCGCTGAGTAAGACCAATGATAGCTCTTCTTCCCTAGCAGTCTA	114010

CR933736.12	1501	CATGACCACTTCCAGCAAGGAGGAAGGTCCCCAGTCAGTGGCAGATTGAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	114011	CATGACCACTTCCAGCAAGGAGGAAGGTCCCCAGTCAGTGGCAGATTGAT	114060

CR933736.12	1551	TTCTCTGTGTCTGGAAACCACAGTGGGTTGTGTCTTCATTAATAGGATCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	114061	TTCTCTGTGTCTGGAAACCACAGTGGGTTGTGTCTTCATTAATAGGATCT	114110

CR933736.12	1601	TACTATCTAGTTACGGTGGGCAGAGCAGGAGCAATAGAATACCAATAGCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	114111	TACTATCTAGTTACGGTGGGCAGAGCAGGAGCAATAGAATACCAATAGCC	114160

CR933736.12	1651	TGTGCTGTTTTGGGAGCCTTGAGGCTTCTCTGATCCATGACTCATAGACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	114161	TGTGCTGTTTTGGGAGCCTTGAGGCTTCTCTGATCCATGACTCATAGACA	114210

CR933736.12	1701	GGTGTCTCATGCACTGAGGTTTTTGCTTAATAGACCATGCCCATCGACTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	114211	GGTGTCTCATGCACTGAGGTTTTTGCTTAATAGACCATGCCCATCGACTA	114260

CR933736.12	1751	TCCATGCCGAGTACCTCTGTCCTAATTCCTTTGTATTTTAATTACATTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	114261	TCCATGCCGAGTACCTCTGTCCTAATTCCTTTGTATTTTAATTACATTGT	114310

CR933736.12	1801	TTTAAATGATTTGTTTATCTTGAGTATATTAGAGCTTTGCTTTCATGTAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	114311	TTTAAATGATTTGTTTATCTTGAGTATATTAGAGCTTTGCTTTCATGTAT	114360

CR933736.12	1851	ATATATGTATCACATGCATGTCTGGTGCCTGCCAAGGCCAGAAGGTGTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	114361	ATATATGTATCACATGCATGTCTGGTGCCTGCCAAGGCCAGAAGGTGTTG	114410

CR933736.12	1901	GAACCCTGAAACCGGAGTTACCACCACACTGAGCTGAGAAACAAATCCAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	114411	GAACCCTGAAACCGGAGTTACCACCACACTGAGCTGAGAAACAAATCCAG	114460

CR933736.12	1951	GCCCTCTCCAAGAGCAGTGAGTGCTCTGAACTAGGAAGCCATCTCGACAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936841.11	114461	GCCCTCTCCAAGAGCAGTGAGTGCTCTGAACTAGGAAGCCATCTCGACAG	114510

Overview

Query
CR933736.12 - 194230 bps
Hit
CR936841.11 - 114510 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link