<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR925765.2	1	GGCCAATAAGTATACAGGGATACCCGGAATTAGACAAACACAGATGAGAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	41382	GGCCAATAAGTATACAGGGATACCCGGAATTAGACAAACACAGATGAGAC	41431

CR925765.2	51	ATTTATTTCTGTATATGAATTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	41432	ATTTATTTCTGTATATGAATTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGA	41481

CR925765.2	101	CAGAGTCTCACTCTGTCACCCATCCTGGAGTGCAGTGGCCTGGCTCATTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	41482	CAGAGTCTCACTCTGTCACCCATCCTGGAGTGCAGTGGCCTGGCTCATTG	41531

CR925765.2	151	CAAGCTCCACCTCCCGGGTTTACACCATTCTGCCTCACCCTCCCGAGTAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	41532	CAAGCTCCACCTCCCGGGTTTACACCATTCTGCCTCACCCTCCCGAGTAG	41581

CR925765.2	201	CTGGGACTATAGGTGCCCGCCAACACGCCCGGCTAATTTTGTTGTGTTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	41582	CTGGGACTATAGGTGCCCGCCAACACGCCCGGCTAATTTTGTTGTGTTTT	41631

CR925765.2	251	TAGTAGAGACGGGGTTTCACCGCGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	41632	TAGTAGAGACGGGGTTTCACCGCGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTG	41681

CR925765.2	301	ACCTCGTGACCCGCCCTCCTTGGCCTGCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	41682	ACCTCGTGACCCGCCCTCCTTGGCCTGCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCG	41731

CR925765.2	351	TGAGCCACCGCACCTGGCCTGAATTTATTTTCATTTATTAGGAAATACCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	41732	TGAGCCACCGCACCTGGCCTGAATTTATTTTCATTTATTAGGAAATACCT	41781

CR925765.2	401	CCAACACACAAAAAGATGTAAATAATTAGCCGGGCGTGGTGGCTCATGAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	41782	CCAACACACAAAAAGATGTAAATAATTAGCCGGGCGTGGTGGCTCATGAC	41831

CR925765.2	451	TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGAACACCAGAGGTCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	41832	TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGAACACCAGAGGTCC	41881

CR925765.2	501	GGAGTTTGAGACCAGGCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	41882	GGAGTTTGAGACCAGGCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAA	41931

CR925765.2	551	AATACAAAAATTAGCCGGGAGTGGTGGTGCACCCCTGTAATCCCAGCTAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	41932	AATACAAAAATTAGCCGGGAGTGGTGGTGCACCCCTGTAATCCCAGCTAC	41981

CR925765.2	601	TCCAGAGGCTGAGACACGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	41982	TCCAGAGGCTGAGACACGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGC	42031

CR925765.2	651	AGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCAAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42032	AGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCAAGA	42081

CR925765.2	701	CTCTGTCTCAGAAAAAAAAAAAAAGATGTAAATAATAATACTATCGGGCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42082	CTCTGTCTCAGAAAAAAAAAAAAAGATGTAAATAATAATACTATCGGGCC	42131

CR925765.2	751	AGGTGCAGTGGCTTATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCATGGCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42132	AGGTGCAGTGGCTTATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCATGGCA	42181

CR925765.2	801	GGAGGACTGCTTGAGGCCAGGAGCTTGAGAACAGCCTGGGCAACATAGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42182	GGAGGACTGCTTGAGGCCAGGAGCTTGAGAACAGCCTGGGCAACATAGCA	42231

CR925765.2	851	AGACCTCGTCTCTATAAAAACTATTAATAGTAATACAAATGGCCAGGCGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42232	AGACCTCGTCTCTATAAAAACTATTAATAGTAATACAAATGGCCAGGCGC	42281

CR925765.2	901	AGTAGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGCAGGCAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42282	AGTAGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGCAGGCAGA	42331

CR925765.2	951	TCACCTGAGGTCACGATTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGCGAAACCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42332	TCACCTGAGGTCACGATTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGCGAAACCC	42381

CR925765.2	1001	TATCTCTACTAAAAATACAAAATTTAGCTGGGCATGGTGGCACACACCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42382	TATCTCTACTAAAAATACAAAATTTAGCTGGGCATGGTGGCACACACCTG	42431

CR925765.2	1051	TAGTTCCAGCTGCTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTAAGCCTGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42432	TAGTTCCAGCTGCTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTAAGCCTGTG	42481

CR925765.2	1101	AGGCAGAGGTTGCAGTGACCCGAGATCCCGCCACTGTACCCTAGCCTGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42482	AGGCAGAGGTTGCAGTGACCCGAGATCCCGCCACTGTACCCTAGCCTGGG	42531

CR925765.2	1151	CGACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAATAATAATAATAATACAAATATCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42532	CGACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAATAATAATAATAATACAAATATCT	42581

CR925765.2	1201	ATATATCCATCAGCCAATTTAAGAATAAGACATGCCGGGCGCGGTGGCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42582	ATATATCCATCAGCCAATTTAAGAATAAGACATGCCGGGCGCGGTGGCTC	42631

CR925765.2	1251	ATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACAAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42632	ATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACAAGG	42681

CR925765.2	1301	TCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42682	TCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACT	42731

CR925765.2	1351	AAAAATACAAAAATTAGCTGAGCACAGTGGCGGGTGCCTGTAATTCCAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42732	AAAAATACAAAAATTAGCTGAGCACAGTGGCGGGTGCCTGTAATTCCAGA	42781

CR925765.2	1401	ACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGATTGTGCTACTGCACTCTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42782	ACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGATTGTGCTACTGCACTCTA	42831

CR925765.2	1451	GCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTATATAAAAAATAAAATAAAAAAAAAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42832	GCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTATATAAAAAATAAAATAAAAAAAAAG	42881

CR925765.2	1501	AATAAGACACTATTGGCCGGGTATGGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42882	AATAAGACACTATTGGCCGGGTATGGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGCA	42931

CR925765.2	1551	CTTTGGGAGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCGAGATCATT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42932	CTTTGGGAGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCGAGATCATT	42981

CR925765.2	1601	CTGGCCAACATAGTGAAACCCTGACTCTACTAAAAATACAACAATTAGCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	42982	CTGGCCAACATAGTGAAACCCTGACTCTACTAAAAATACAACAATTAGCT	43031

CR925765.2	1651	GGGCATGGTGGCGCATACCTGCAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	43032	GGGCATGGTGGCGCATACCTGCAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA	43081

CR925765.2	1701	CGAAAATCACTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	43082	CGAAAATCACTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGC	43131

CR925765.2	1751	ATCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAAAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	43132	ATCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAAAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAA	43181

CR925765.2	1801	AAAAAAACGAAAGAATAAGACGTTGTTGAAGCCCCTTAAATGTCCCTCCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	43182	AAAAAAACGAAAGAATAAGACGTTGTTGAAGCCCCTTAAATGTCCCTCCC	43231

CR925765.2	1851	CAATCCTTTTTTCTCTGCAGTGTTGACCATTATTATGAATTAAAGCTTAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	43232	CAATCCTTTTTTCTCTGCAGTGTTGACCATTATTATGAATTAAAGCTTAT	43281

CR925765.2	1901	CATCCCTAATGGGACAGTTATGTTTTCACAGGAAGAATATGAAAAGATGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	43282	CATCCCTAATGGGACAGTTATGTTTTCACAGGAAGAATATGAAAAGATGA	43331

CR925765.2	1951	ATGTCTGTTGCTGTTACCCAGAGACACTTTCACAGCTAAAAAGACATACA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936239.2	43332	ATGTCTGTTGCTGTTACCCAGAGACACTTTCACAGCTAAAAAGACATACA	43381

Overview

Query
CR925765.2 - 57997 bps
Hit
CR936239.2 - 43381 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link