<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR753835.3	1	GGCCAAAAACCAAACACGCAAGAGCTTAGACAGGGATGAGAAATGTCAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	35431	GGCCAAAAACCAAACACGCAAGAGCTTAGACAGGGATGAGAAATGTCAGA	35480

CR753835.3	51	AGTGTGGACTTCTAGAACAGAGGATAATAGGATGATCTCAATTACACTAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	35481	AGTGTGGACTTCTAGAACAGAGGATAATAGGATGATCTCAATTACACTAG	35530

CR753835.3	101	GGTGCCACAGAAGGACCCTCTGAAGAGTGTCAGTTCAGATGTGACTTGAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	35531	GGTGCCACAGAAGGACCCTCTGAAGAGTGTCAGTTCAGATGTGACTTGAC	35580

CR753835.3	151	AGGTTAAGCAGGTGTGAGCCAGGGGGCAGAGTGGAGCCTGTGTTGTCTGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	35581	AGGTTAAGCAGGTGTGAGCCAGGGGGCAGAGTGGAGCCTGTGTTGTCTGT	35630

CR753835.3	201	TGGGACAAAACGGGAGGCACTTTTCAGGTTTAGGAAATCCCATGTACAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	35631	TGGGACAAAACGGGAGGCACTTTTCAGGTTTAGGAAATCCCATGTACAAA	35680

CR753835.3	251	AGCTTGAATTGATGAACTTCTTCAGGAAACTAGAACAAAGCTCACTAAAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	35681	AGCTTGAATTGATGAACTTCTTCAGGAAACTAGAACAAAGCTCACTAAAG	35730

CR753835.3	301	CAGAGAGGCTGAGGGGAAGGAGGGTAAAATATTAGATTGGAGAAATCACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	35731	CAGAGAGGCTGAGGGGAAGGAGGGTAAAATATTAGATTGGAGAAATCACA	35780

CR753835.3	351	GGAGCCAGGTATTTAAAAGCCTCACTGATGGTGTTAGGATTTTGGATTTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	35781	GGAGCCAGGTATTTAAAAGCCTCACTGATGGTGTTAGGATTTTGGATTTA	35830

CR753835.3	401	ACTAAAGACAATGGGAAAGTATTGAAGAGTTTTAAGGAGAATAAAACCAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	35831	ACTAAAGACAATGGGAAAGTATTGAAGAGTTTTAAGGAGAATAAAACCAT	35880

CR753835.3	451	GATCCCCATAAATGAAATGTCCACAAGCCTGCCTTTGCATTTCTTTTTCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	35881	GATCCCCATAAATGAAATGTCCACAAGCCTGCCTTTGCATTTCTTTTTCT	35930

CR753835.3	501	TTTTTTTTTTTTTTTGCTACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	35931	TTTTTTTTTTTTTTTGCTACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGT	35980

CR753835.3	551	GCAGTGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	35981	GCAGTGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGC	36030

CR753835.3	601	AATTCTCCTGCCTCAGCTCCCAAGCAGCTGTAGTTACAGGCATGTGCCAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36031	AATTCTCCTGCCTCAGCTCCCAAGCAGCTGTAGTTACAGGCATGTGCCAC	36080

CR753835.3	651	CACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36081	CACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT	36130

CR753835.3	701	TGACAGGCTGGTCTTGAACCCCTGACCTCAGGTGATTTGCCTGCTTTGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36131	TGACAGGCTGGTCTTGAACCCCTGACCTCAGGTGATTTGCCTGCTTTGGC	36180

CR753835.3	751	CTCCCAGAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCCCTTCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36181	CTCCCAGAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCCCTTCT	36230

CR753835.3	801	TTTGCATTTCTAAGTCAACAAAGCTCAGAAATTAAGTTAAAAGAAATTTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36231	TTTGCATTTCTAAGTCAACAAAGCTCAGAAATTAAGTTAAAAGAAATTTG	36280

CR753835.3	851	CAGCACTTTGGGTGGCTGAGGCAGGTGGCTCACGAGGTCAAGAGATCGAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36281	CAGCACTTTGGGTGGCTGAGGCAGGTGGCTCACGAGGTCAAGAGATCGAG	36330

CR753835.3	901	ACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36331	ACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAA	36380

CR753835.3	951	TTAGCTGGGGGTGGTGGCACACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCTGGAGGCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36381	TTAGCTGGGGGTGGTGGCACACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCTGGAGGCT	36430

CR753835.3	1001	AAGGTAGGAGAATTGCTTGAACGCTGGATGCGGAGGTTGCAGTTAGCCAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36431	AAGGTAGGAGAATTGCTTGAACGCTGGATGCGGAGGTTGCAGTTAGCCAA	36480

CR753835.3	1051	GACTGAGTCACTGAACTCCAGCCTGGCGACAGAGCGAGACTCTCTCAAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36481	GACTGAGTCACTGAACTCCAGCCTGGCGACAGAGCGAGACTCTCTCAAAA	36530

CR753835.3	1101	AAAGAAAAAAAAATTGTTCCCAAAACTCATTTGGTAAATCTTATAAGGGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36531	AAAGAAAAAAAAATTGTTCCCAAAACTCATTTGGTAAATCTTATAAGGGA	36580

CR753835.3	1151	AAATGGTCAAAGGTGTCTCAGAGCTCTTATTGGTGACATGTGCTTCTGTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36581	AAATGGTCAAAGGTGTCTCAGAGCTCTTATTGGTGACATGTGCTTCTGTA	36630

CR753835.3	1201	GTTTCAATACATATGAACATACATACATATATGTGTGTAAATATACACAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36631	GTTTCAATACATATGAACATACATACATATATGTGTGTAAATATACACAT	36680

CR753835.3	1251	ATGTAAAACACTATGTATATTTTTTGATGTTTTTGTCTTTATGTTTGACT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36681	ATGTAAAACACTATGTATATTTTTTGATGTTTTTGTCTTTATGTTTGACT	36730

CR753835.3	1301	GAAGTGTGAAAATGACTAAAATAACTTAAAAATAATCTTGTGGTTAAAAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36731	GAAGTGTGAAAATGACTAAAATAACTTAAAAATAATCTTGTGGTTAAAAG	36780

CR753835.3	1351	TGAAATGAATACATAGAAGCATTTTACATTGTGAATAATATCAAATGTAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36781	TGAAATGAATACATAGAAGCATTTTACATTGTGAATAATATCAAATGTAG	36830

CR753835.3	1401	AATTACTACAGAAATCTGAGGTATGTTACTGAAAAACAATTGCAGCAGCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36831	AATTACTACAGAAATCTGAGGTATGTTACTGAAAAACAATTGCAGCAGCA	36880

CR753835.3	1451	TCACTATTTGTGACTTATACAGACAGGCTGTTGAAAGTTAATAGAAATAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36881	TCACTATTTGTGACTTATACAGACAGGCTGTTGAAAGTTAATAGAAATAG	36930

CR753835.3	1501	TGATGACTCATGAAAATGTTGAAAAATATTGCATAAGGCAAAAAATAAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36931	TGATGACTCATGAAAATGTTGAAAAATATTGCATAAGGCAAAAAATAAAT	36980

CR753835.3	1551	ATGAAGGTATTGAACTTGCATTGACTAAATGGATTCAACAACAAAGGTTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	36981	ATGAAGGTATTGAACTTGCATTGACTAAATGGATTCAACAACAAAGGTTG	37030

CR753835.3	1601	TTGAATTTATGCAACTGTCAAGTTTTTTACAATAAAACAAGCAAAAATAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	37031	TTGAATTTATGCAACTGTCAAGTTTTTTACAATAAAACAAGCAAAAATAA	37080

CR753835.3	1651	ACCATAAAGAGCTGAAGTGGATGGTGAGTGTATAAAAGATCTGAGTGTAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	37081	ACCATAAAGAGCTGAAGTGGATGGTGAGTGTATAAAAGATCTGAGTGTAG	37130

CR753835.3	1701	AATTTTCAGAAAGAGAACAGTGTGAACTGGTGCTCTCAGCCTCAGCACTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	37131	AATTTTCAGAAAGAGAACAGTGTGAACTGGTGCTCTCAGCCTCAGCACTA	37180

CR753835.3	1751	TTAACATTTTGGACTAGGTAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	37181	TTAACATTTTGGACTAGGTAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	37230

CR753835.3	1801	TTTTTTGAGACAGAGTCTCGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	37231	TTTTTTGAGACAGAGTCTCGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTG	37280

CR753835.3	1851	CCATCTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCGGGTTCACGCCATTCTCCTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	37281	CCATCTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCGGGTTCACGCCATTCTCCTG	37330

CR753835.3	1901	CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACGCCCGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	37331	CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACGCCCGG	37380

CR753835.3	1951	CTAATTTTTTGTATTTTTCGTAGAGACAGGGAGTCACCATGTTAGCCAGG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933540.9	37381	CTAATTTTTTGTATTTTTCGTAGAGACAGGGAGTCACCATGTTAGCCAGG	37430

Overview

Query
CR753835.3 - 101064 bps
Hit
CR933540.9 - 37430 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link