<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR753509.3	1	GGCCAATCTTCCCTGGTGAAAGTCAGCCTTGTACATCTAACTTAAAGTGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	32432	GGCCAATCTTCCCTGGTGAAAGTCAGCCTTGTACATCTAACTTAAAGTGT	32481

CR753509.3	51	GCTATGAAATGAAAATGTTTTGGAAGCACTGCCTGTTCTCCCCTATCGCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	32482	GCTATGAAATGAAAATGTTTTGGAAGCACTGCCTGTTCTCCCCTATCGCC	32531

CR753509.3	101	ACGCACACTGCTGGTCTCTCTTGGTTGCCAGGCACTGGTTTAGGTTCTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	32532	ACGCACACTGCTGGTCTCTCTTGGTTGCCAGGCACTGGTTTAGGTTCTGA	32581

CR753509.3	151	GCAGAATACTCCACAGTGTTCTCTACAGTGTGTTGTAGAATAGGAGGGTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	32582	GCAGAATACTCCACAGTGTTCTCTACAGTGTGTTGTAGAATAGGAGGGTC	32631

CR753509.3	201	CTGGCAACCTGAGGCAGAGCTGGTGTTACAGAGTACCTGCCTACTGCTAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	32632	CTGGCAACCTGAGGCAGAGCTGGTGTTACAGAGTACCTGCCTACTGCTAT	32681

CR753509.3	251	AAAGTTTTACTTTATACGAATTCTGGAGAAGCTGAGTGAGGCCATGTCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	32682	AAAGTTTTACTTTATACGAATTCTGGAGAAGCTGAGTGAGGCCATGTCTG	32731

CR753509.3	301	TTACCAGGAGACATGAGACTCACAGCAGATCTCTCTGGCTTAACATGGGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	32732	TTACCAGGAGACATGAGACTCACAGCAGATCTCTCTGGCTTAACATGGGA	32781

CR753509.3	351	GATGGCGGTAAGTGCAGCTATATCTGAATTTTTTTAATAGTTAAAAGCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	32782	GATGGCGGTAAGTGCAGCTATATCTGAATTTTTTTAATAGTTAAAAGCTG	32831

CR753509.3	401	ACTTTATCCAAATAGGGATTAATGTATTTTCCATAAGAAGTTCTGTTCTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	32832	ACTTTATCCAAATAGGGATTAATGTATTTTCCATAAGAAGTTCTGTTCTA	32881

CR753509.3	451	GGTAGAAAAAAAGTGAAGATTTTGGTTAGGTTAAACTGATTTTTAAAGTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	32882	GGTAGAAAAAAAGTGAAGATTTTGGTTAGGTTAAACTGATTTTTAAAGTA	32931

CR753509.3	501	TAGGAAGAGTTACAGATTTTTTTCTTATTGAGTCTAGTCTTGAGAACAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	32932	TAGGAAGAGTTACAGATTTTTTTCTTATTGAGTCTAGTCTTGAGAACAAT	32981

CR753509.3	551	TTATCAAGAACTCCAAATTTAAAGGCAATTAGTTAATTAAAAACTTGAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	32982	TTATCAAGAACTCCAAATTTAAAGGCAATTAGTTAATTAAAAACTTGAAA	33031

CR753509.3	601	GATCTAACTCTTTGAGTTTAAACTGGACTCATTAGAAAACAAATGGAAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33032	GATCTAACTCTTTGAGTTTAAACTGGACTCATTAGAAAACAAATGGAAGA	33081

CR753509.3	651	AAAAGGTATCTAAATGTTCATAATGACTTGTGTCTGACATTAAAACAAGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33082	AAAAGGTATCTAAATGTTCATAATGACTTGTGTCTGACATTAAAACAAGG	33131

CR753509.3	701	ATTCAGTCACTAGAAGATATGTCAAAGTCCATCAGTACCAAATGGATAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33132	ATTCAGTCACTAGAAGATATGTCAAAGTCCATCAGTACCAAATGGATAAA	33181

CR753509.3	751	GCCAAAATAACTTTAAAACTATATCACATGAATGAAGACTTGCCATAGCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33182	GCCAAAATAACTTTAAAACTATATCACATGAATGAAGACTTGCCATAGCA	33231

CR753509.3	801	ATAAAGTAGAGTTTGGATGAAGACGTCCATCTTCGGGAAAACCCAAAATA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33232	ATAAAGTAGAGTTTGGATGAAGACGTCCATCTTCGGGAAAACCCAAAATA	33281

CR753509.3	851	GCTTTTACAAAAAACTGAAGGATGAAATAAAAGATTAAGCCAACAGAAAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33282	GCTTTTACAAAAAACTGAAGGATGAAATAAAAGATTAAGCCAACAGAAAT	33331

CR753509.3	901	AAACATATTGAAAATATCTCAATAAACAGAAATAACTTAGAGTGAGTCAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33332	AAACATATTGAAAATATCTCAATAAACAGAAATAACTTAGAGTGAGTCAG	33381

CR753509.3	951	AACTGAGAACACCTAGAACAAGTTCCAAAGAACAAGAAAAGTCAGAGCAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33382	AACTGAGAACACCTAGAACAAGTTCCAAAGAACAAGAAAAGTCAGAGCAA	33431

CR753509.3	1001	ATCTCTGACACTTGGAGAAGATAAAACAGATGCAGGTATGTTAGAGTGGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33432	ATCTCTGACACTTGGAGAAGATAAAACAGATGCAGGTATGTTAGAGTGGA	33481

CR753509.3	1051	TGTAATAAACAAATCAGAACATGTATATTACTTAGATAGCTCTCAATAAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33482	TGTAATAAACAAATCAGAACATGTATATTACTTAGATAGCTCTCAATAAT	33531

CR753509.3	1101	CTGATTTATGCTTTTGTAAAACCTTTGGAGAGGACACAAACAAAATATAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33532	CTGATTTATGCTTTTGTAAAACCTTTGGAGAGGACACAAACAAAATATAG	33581

CR753509.3	1151	TCTGAATTATCTGAAAAGAATAAAAGGAACACTTAAAATCATATTAAGCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33582	TCTGAATTATCTGAAAAGAATAAAAGGAACACTTAAAATCATATTAAGCA	33631

CR753509.3	1201	TATAAAATAAATCAAGAATCTTTGGACCAGAAAATGCACAGTATGAAAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33632	TATAAAATAAATCAAGAATCTTTGGACCAGAAAATGCACAGTATGAAAAT	33681

CR753509.3	1251	TAGCTTCAAAATCTCCAGGACAGAGATTAAGTAATTACTGATATATATCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33682	TAGCTTCAAAATCTCCAGGACAGAGATTAAGTAATTACTGATATATATCA	33731

CR753509.3	1301	AGAAAATGAAATAAAACTTCAGATCATTTACATATTTATACATCTTAAAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33732	AGAAAATGAAATAAAACTTCAGATCATTTACATATTTATACATCTTAAAG	33781

CR753509.3	1351	TAGAAGAAGATAACCTTCCTCATTGATTCTACCTTCAAATAGACCTGCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33782	TAGAAGAAGATAACCTTCCTCATTGATTCTACCTTCAAATAGACCTGCTT	33831

CR753509.3	1401	ATTATTATTATTTTTTAATGTTTTTGTAGAGATGGAGTCTTGCTATTTTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33832	ATTATTATTATTTTTTAATGTTTTTGTAGAGATGGAGTCTTGCTATTTTG	33881

CR753509.3	1451	CCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGATCTTCCTGCCTCTGCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33882	CCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGATCTTCCTGCCTCTGCC	33931

CR753509.3	1501	TCCCAAGTGCTGGGATTACAGATATGAGCCACCGCAACTGGCCCTGAACC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33932	TCCCAAGTGCTGGGATTACAGATATGAGCCACCGCAACTGGCCCTGAACC	33981

CR753509.3	1551	TACTTTTAACATCCAGGAAAAATAGCCATATCATTGTTGTCCTAAAGTAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	33982	TACTTTTAACATCCAGGAAAAATAGCCATATCATTGTTGTCCTAAAGTAA	34031

CR753509.3	1601	TTAAAAATTCTCTCTATTCTAGTTTCGTTGCTGTTAAATTGTTATACAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	34032	TTAAAAATTCTCTCTATTCTAGTTTCGTTGCTGTTAAATTGTTATACAGG	34081

CR753509.3	1651	AGTTCAAATTGAAGCTTAATAGAATTAAAACTCTTAGGATGGTGTTTTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	34082	AGTTCAAATTGAAGCTTAATAGAATTAAAACTCTTAGGATGGTGTTTTCT	34131

CR753509.3	1701	AAATATATATTACTTAAATGTTGGGGAAGAGAAATAATTTTAATTTCTAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	34132	AAATATATATTACTTAAATGTTGGGGAAGAGAAATAATTTTAATTTCTAG	34181

CR753509.3	1751	ATAGTACATGTACAATATTCTGTTTTTTAAATAAGTTATACTGGGAGATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	34182	ATAGTACATGTACAATATTCTGTTTTTTAAATAAGTTATACTGGGAGATT	34231

CR753509.3	1801	TATAAAGGCAGTTGAACAATCAAAGACATTTGGAACTAAATTTCTGTATA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	34232	TATAAAGGCAGTTGAACAATCAAAGACATTTGGAACTAAATTTCTGTATA	34281

CR753509.3	1851	TCAAGTGCTGTATTTACTATAGTTAAAACACAAGTATGAAAACAATGGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	34282	TCAAGTGCTGTATTTACTATAGTTAAAACACAAGTATGAAAACAATGGAA	34331

CR753509.3	1901	TGTTTATATACAAATGACTTTTATAAATGACTATTTCAATTGATTTAAGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	34332	TGTTTATATACAAATGACTTTTATAAATGACTATTTCAATTGATTTAAGA	34381

CR753509.3	1951	AGTCATTTGATGAAAATGATAAAATAGTTAGAGATATAGTGGGAAAAAAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933537.3	34382	AGTCATTTGATGAAAATGATAAAATAGTTAGAGATATAGTGGGAAAAAAA	34431

Overview

Query
CR753509.3 - 127540 bps
Hit
CR933537.3 - 34431 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link