<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 11952 bps / non-identical: 4200 bps

Full alignment

C  CR856018.10	11952	GATTCTGACTGTTTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTC	11903
			||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1	GATTCTGACTGTTTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTC	50

C  CR856018.10	11902	ACTGCAACCCTCACCTCGCAGGTTCAAGTGATTCTGTCGCCTCAGCCTCC	11853
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	51	ACTGCAACCCTCGCCTCGCAGGTTCAAGTGATTCTGTCGCCTCAGCCTCC	100

C  CR856018.10	11852	TGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCCCTACGCCCAGCT-ATTTTTTT	11804
			 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
  CR856017.2	101	CGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCCCCACGCCCAGCTAATTTTTTT	150

C  CR856018.10	11803	TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTTCGCCAAGTTGGCCAGGCT	11754
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	151	TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTTCGCCAAGTTGGCCAGGCT	200

C  CR856018.10	11753	GGTCTCGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCACCCCGTCTCTGCCTCCCAAAG	11704
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	201	GGTCTCGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCACCCCGTCTCTGCCTCCCAAAG	250

C  CR856018.10	11703	TGCCGGGATTAGAGGCGTAAGCCACCACGCCCGGCCGCAGCTGCTCTTCA	11654
			||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	251	TGCCGGGATTACAGGCGTAAGCCACCACGCCCGGCCGCAGCTGCTCTTCA	300

C  CR856018.10	11653	TCATCGTCATAAAGGTAGTTCCAAGTACAGGCTCTGGATGGGGTGACAGG	11604
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	301	TCATCGTCATAAAGGTAGTTCCAAGTACAGGCTCTGGATGGGGTGACAGG	350

C  CR856018.10	11603	ATGTCTCCTATCTCCTAAAGCTGACAATTGATACCGCTGACTGAACAAGC	11554
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	351	ATGTCTCCTATCTCCTAAAGCTGACAATTGATACCGCTGACTGAACAAGC	400

C  CR856018.10	11553	ACTCTGGAAAATGACAGACACCGCATTCCCCAGGCTGACAGATGAGCTGT	11504
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	401	ACTCTGGAAAATGACAGACACCGCATTCCCCAGGCTGACAGATGAGCTGT	450

C  CR856018.10	11503	GAGAGCGATCCGAATGTTGTACGACTCCAGCCTCACACTATTCCTCTGTG	11454
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	451	GAGAGCGATCCGAATGTTGTATGACTCCAGCCTCACACTATTCCTCTGTG	500

C  CR856018.10	11453	TTTCATGGTAACCCTTATGTGACCGTTCCTCCCAGGGAAACCAAGAGCAT	11404
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	501	TTTCATGGTAACCCTTATGTGACCGTTCCTCCCAGGGAAACCAAGAGCAT	550

C  CR856018.10	11403	AATTCTGGAGAAGTTCGCCTGTGTTCCTTGATACCTGATTGTGCCATTTC	11354
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
  CR856017.2	551	AATTCTGGAGAAGTTCGCCTGTGTTCCTTGATACTTGATTGTGCCATTTC	600

C  CR856018.10	11353	CTGGACACTGTGCAATTTCCTGGAGACACTTCCCAGCAGGGGAAACCGCG	11304
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
  CR856017.2	601	CTGGACACTGTGCAATTTCCTGGAGACACTTCCCAGCAGGGGAAACTGCG	650

C  CR856018.10	11303	TGGATTGTTGGGTGAGTAGCATGTGTGCCATTAGAGCTCTGTACGAACCA	11254
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	651	TGGATTGTTGGGTGAGTAGCATGTGTGCCATTAGAGCTCTGTACGAACCA	700

C  CR856018.10	11253	GGAGGAATGAGTTTCTTTTCTTTGGCAAACCTTGATTCAATACTTGGACC	11204
			||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	701	GGAGGAATGAGATTCTTTTCTTTGGCAAACCTTGATTCAATACTTGGACC	750

C  CR856018.10	11203	TAGAGTGCATGGATGTCCCAGTGAAGCTACTCTTTTATGCCCTTCCAGTA	11154
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	751	TAGAGTGCATGGATGTCCCAGTGAAGCTACTCTTTTATGCCCTTCCAGTA	800

C  CR856018.10	11153	GCCATGAATAGGTTTTATTCAGGTCCAGCAATGGATGGGACCATCTCATT	11104
			||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |
  CR856017.2	801	GCCATGAATAGGTTTTATTCAGGTCCAGCAATGTATGGGACCA--TC--T	846

C  CR856018.10	11103	CATTCATTCATCTATCCATCCATCCATGCATCTGTCCATCCATCCATCCA	11054
			||||||||||  | | ||||||||||||||||||        ||||||||
  CR856017.2	847	CATTCATTCA--T-T-CATCCATCCATGCATCTG--------TCCATCCA	884

C  CR856018.10	11053	TCCATCCATTCATCCATCCATCCATTCATCCATGTAGTCATGTTTTCAGT	11004
			||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	885	TCCAT-C---CATCCATCCATCCATTCATCCATGTAGTCATGTTTTCAGT	930

C  CR856018.10	11003	AAATAAGTGTTAAGTGTTATACCCAAATACTGGGACTCGAAGTCGGAAGA	10954
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	931	AAATAAGTGTTAAGTGTTATACCCAAATACTGGGACTCGAAGTCGGAAGA	980

C  CR856018.10	10953	ACAGGGCTTGTGTCCTAAAGGAGCTGGAGGCTGTAGTCAACAGAGGAAGT	10904
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	981	ACAGGGCTTGTGTCCTAAAGGAGCTGGAGGCTGTAGTCAACAGAGGAAGT	1030

C  CR856018.10	10903	CCCCAAAGATAGCAGGTCCTAACAGCCTGGAAACTGGCAGTATTGTCTCA	10854
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1031	CCCCAAAGATAGCAGGTCCTAACAGCCTGGAAACTGGCAGTATTGTCTCA	1080

C  CR856018.10	10853	TGTAGTCACAGGGACTTTTAGCAGGAATGTGTGCGTCAACAAAGACTGGT	10804
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1081	TGTAGTCACAGGGACTTTTAGCAGGAATGTGTGCGTCAACAAAGACTGGT	1130

C  CR856018.10	10803	GTGGGACTTTTAGCAGGAACATGTGCAGTCAGCAAAGGCTGGTGTGTGTC	10754
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1131	GTGGGACTTTTAGCAGGAACATGTGCAGTCAGCAAAGGCTGGTGTGTGTC	1180

C  CR856018.10	10753	TTTTAGCGGGAATGTGTGCAGTCAACAAAGGCTGGTGTGTGGGGAACACA	10704
			|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1181	TTTTAGTGGGAATGTGTGCAGTCAACAAAGGCTGGTGTGTGGGGAACACA	1230

C  CR856018.10	10703	TCACAGTCTAGATGTGTGTCTGGACGCCACCTTGATTTTGAGAGTGTCTT	10654
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
  CR856017.2	1231	TCACAGTCTAGATGTGTGTCTGGACGCCACCTTGATTTTGAGAGTGTC--	1278

C  CR856018.10	10653	TGTCATGAACATGTGGTATCTCTCATCTTGGCTGTTAGGAGAAACTGTCA	10604
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1279	TGTCATGAACATGTGGTATCTCTCATCTTGGCTGTTAGGAGAAACTGTCA	1328

C  CR856018.10	10603	TAGAAGGGACACACCACATTTTCAAAGGCAGGACAGGTTGGGGGGCTGGA	10554
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1329	TAGAAGGGACACGCCACATTTTCAAAGGCAGGACAGGTTGGGGGGCTGGA	1378

C  CR856018.10	10553	CCGCAGACATCAGAACTGATCCCCAGATCACAGAAGGTGCATCATACCCA	10504
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1379	CCGCAGACATCAGAACTGATCCCCAGATCACAGAAGGTGCATCATACCCA	1428

C  CR856018.10	10503	TTTCTCCATTTGGGCTGGAACTGGGGAGGTAGCAAGTCTTGCATCAGGTG	10454
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1429	TTTCTCCATTTGGGCTGGAACTGGGGAGGTAGCAAGTCTTGCATCAGGTG	1478

C  CR856018.10	10453	CCGTAGTTAAGCCATTGCGTCTCTATCTTTCCAACTCCTCATCTCCTCAT	10404
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1479	CCGTAGTTAAGCCATTGCGTCTCTATCTTTCCAACTCCTCATCTCCTCAT	1528

C  CR856018.10	10403	TAGCAACGACCAGGCTAACAGCCGTCCCCTCTGCACCCAGTTTTGCTGAG	10354
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1529	TAGCAACGACCAGGCTAACAGCCGTCCCCTCTGCACCCAGTTTTGCTGAG	1578

C  CR856018.10	10353	AGCAAAGCAAGACTGATGCATTCTGTCAGAGCAGTGCTCAGAACTAAATA	10304
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1579	AGCAAAGCAAGACTGATGCATTCTGTCAGAGCAGTGCTCAGAACTAAATA	1628

C  CR856018.10	10303	GATGCCAGCCATGGTTTGGTGGTGGGGCTCTGGTGTCATTTGTCATTGAA	10254
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1629	GATGCCAGCCATGGTTTGGTGGTGGGGCTCTGGTGTCATTTGTCATTGAA	1678

C  CR856018.10	10253	GCAGAAAACTCGGTTGAGGTTATGTTTTCTGCAGTTCGGGCGCCATTAAC	10204
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1679	GCAGAAAACTCGGTTGAGGTTATGTTTTCTGCAGTTCGGGCGCCATTAAC	1728

C  CR856018.10	10203	CCAGGCATCGGGGAGAATATCTGTACGTAGAAAAAAGCTTTGGAATTGTG	10154
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1729	CCAGGCATCGGGGAGAATATCTGTACGTAGAAAAAAGCTTTGGAATTGTG	1778

C  CR856018.10	10153	GCCTCTGAAGCTGTCTTTGTGAAGCACCGTCTCGGATTCAGGAGTAGACA	10104
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
  CR856017.2	1779	GCCTCTGAAGCTGTCTTTGTGAAGCACCGTCTCGGATTCAGGAATAGACA	1828

C  CR856018.10	10103	TTTTACTCATCATTGTGTTTATCGCTTACTTATCATTTTTAGTTACTGCT	10054
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1829	TTTTACTCATCATTGTGTTTATCGCTTACTTATCATTTTTAGTTACTGCT	1878

C  CR856018.10	10053	GTTTTATCCTCTTATAATTCTTTGCCTTCATTCTGGAATATGTTGTCTAT	10004
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1879	GTTTTATCCTCTTATAATTCTTTGCCTTCATTCTGGAATATGTTGTCTAT	1928

C  CR856018.10	10003	TTTCTTGCCTCGATACATGCCATCTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTCTTCCT	9954
			||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1929	TTTCTTGCCTCGACACATGCCATCTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTCTTCCT	1978

C  CR856018.10	9953	TCTAATCGTAACAAATGTATTGTGAACTCATTTTTTTCCTGACCCCTGGG	9904
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1979	TCTAATCGTAACAAATGTATTGTGAACTCATTTTTTTCCTGACCCCTGGG	2028

C  CR856018.10	9903	GCTGCATTTCATAGACTTAGAATGAAGTCGTTGTTTTCATTTTGCCTGAT	9854
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2029	GCTGCATTTCATAGACTTAGAATGAAGTCGTTGTTTTCATTTTGCCTGAT	2078

C  CR856018.10	9853	TTGACCAATGGATGAAGAGGGTATTTTAATATTTCCAAAGGTGTAGAATT	9804
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2079	TTGACCAATGGATGAAGAGGGTATTTTAATATTTCCAAAGGTGTAGAATT	2128

C  CR856018.10	9803	AAAATTAGTGATTTTTTTTTTGCCTTTTTATTTTTTATTTATTTATTTTT	9754
			||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2129	AAAATTAGTGA-TTTTTTTTTGCCTTTTTATTTTTTATTTATTTATTTTT	2177

C  CR856018.10	9753	TTTGAGACAGAGCCTTGCTCTCTCCCTAAAGCTGGAGAGCAGTGGCACGA	9704
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2178	TTTGAGACAGAGCCTTGCTCTCTCCCTAAAGCTGGAGAGCAGTGGCACGA	2227

C  CR856018.10	9703	TATCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCTGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCT	9654
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2228	TATCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCTGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCT	2277

C  CR856018.10	9653	CACCCTCCCGAGTAGTGGGGACTACAGGCACCTGCCACCATGCCCGGCTA	9604
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2278	CACCCTCCCGAGTAGTGGGGACTACAGGCACCTGCCACCATGCCCGGCTA	2327

C  CR856018.10	9603	ATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGAT	9554
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2328	ATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGAT	2377

C  CR856018.10	9553	GGTCACGATCTCCTGGTTTTACAGACTTATGGTTTTATAGACTTATGTTT	9504
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2378	GGTCACGATCTCCTGGTTTTACAGACTTATGGTTTTATAGACTTATGTTT	2427

C  CR856018.10	9503	CTATAAATTGAAATTTCTATAAATTGAAATTTTAATCATGTTATGAAATG	9454
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2428	CTATAAATTGAAATTTCTATAAATTGAAATTTTAATCATGTTATGAAATG	2477

C  CR856018.10	9453	TAATGTATTTATCCTGTCTTTTGTAGAGAGAGTTCTGGAAATCTCTGTCA	9404
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2478	TAATGTATTTATCCTGTCTTTTGTAGAGAGAGTTCTGGAAATCTCTGTCA	2527

C  CR856018.10	9403	CTCTCTGCTTTAGATATTTTAGGGCTGCAGTACTAGAGACCTACAGGTTC	9354
			|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2528	CTCTCTGCTTTAGATATTTTGGGGCTGCAGTACTAGAGACCTACAGGTTC	2577

C  CR856018.10	9353	ATGATTATACTGTCTTCTTGGTGTAATGCTTCTTTTATTAGTTTGTTATT	9304
			||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
  CR856017.2	2578	ATGATTATACTGTCTTCTTGGTGTAATGCTTCTCTTATTAGTTTGTTATT	2627

C  CR856018.10	9303	TTATTATTATTACTGTAAAAGATTTAGCATCCCAGCTCCTTGGGAGGCTG	9254
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2628	TTATTATTATTACTGTAAAAGATTTAGCATCCCAGCTCCTTGGGAGGCTG	2677

C  CR856018.10	9253	AGGCAGGAGAATCGCATGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCGGTGGGCTGAG	9204
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2678	AGGCAGGAGAATCGCATGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCGGTGGGCTGAG	2727

C  CR856018.10	9203	ATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCTGTCTC-	9155
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
  CR856017.2	2728	ATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCTGTCTCA	2777

C  CR856018.10	9154	AAAAAAAAAAAAATAGATTTAGCTTTGGTTCTTTGATGTTCTATCCTTAA	9105
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2778	AAAAAAAAAAAAATAGATTTAGCTTTGGTTCTTTGATGTTCTATCCTTAA	2827

C  CR856018.10	9104	CTATCTTTTATCTGATATTTACCATCAGATAGTTCACAAATCCACTGACA	9055
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2828	CTATCTTTTATCTGATATTTACCATCAGATAGTTCACAAATCCACTGACA	2877

C  CR856018.10	9054	ATTAGATATTAACATCTTTTTATATCATCTCCTATTTTT-ATTGACTA-T	9007
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
  CR856017.2	2878	ATTAGATATTAACATCTTTTTATATCATCTCCTATTTTTAATTGACTACT	2927

C  CR856018.10	9006	GCTATCGACCGAACATTGGTGTCCTTCCAAATTCTTTTGTAGAAATTGTC	8957
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2928	GCTATCGACCGAACATTGGTGTCCTTCCAAATTCTTTTGTAGAAATTGTC	2977

C  CR856018.10	8956	A--CCCCCCCAAGGGGATGGCGTTAGGAAGTGGAGGCTTTGGGAGGTGAT	8909
			|  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2978	ACCCCCCCCCAAGGGGGTGGCGTTAGGAAGTGGAGGCTTTGGGAGGTGAT	3027

C  CR856018.10	8908	GGTGTCATGAGGGTGGAGCCTAATGAGGGATGGAGCCTCATGCATGAGAT	8859
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3028	GGTGTCATGAGGGTGGAGCCTAATGAGGGATGGAGCCTCATGCATGAGAT	3077

C  CR856018.10	8858	TCCTGCCCTTATAAAAGGATGATGAGCTCAGAGTGAGCTCACTGTCCCAC	8809
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3078	TCCTGCCCTTATAAAAGGATGATGAGCTCAGAGTGAGCTCACTGTCCCAC	3127

C  CR856018.10	8808	TGCCTTGTGAGCACACAGGAAAAAGGCAGCCAACTGTTCACAATAGCAAA	8759
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3128	TGCCTTGTGAGCACACAGGAAAAAGGCAGCCAACTGTTCACAATAGCAAA	3177

C  CR856018.10	8758	GACTTGGGACCAACCCAAATGCCCATCAATGATAGACTGGATAAAGAAAA	8709
			||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3178	GACTTGGAACCAACCGAAATGCCCATCAATGATAGACTGGATAAAGAAAA	3227

C  CR856018.10	8708	TGTGGCACATATGCACTATGGAATACTATGCAGCCAGAAAAAAGAATGAG	8659
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3228	TGTGGCACATATGCACTATGGAATACTATGCAGCCAGAAAAAAGAATGAG	3277

C  CR856018.10	8658	TTCATGTCCTTTGCAGGGACAGGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAG	8609
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3278	TTCATGTCCTTTGCAGGGACAGGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAG	3327

C  CR856018.10	8608	CAAACTAACACAAGAACAGAAAACCAAACACGGCATGTTCTCACTCATCA	8559
			||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
  CR856017.2	3328	CAAACTAACACAAGAACAGAAAACCAAACACTGCATGTTCTCACTCATCA	3377

C  CR856018.10	8558	GTGGAAGTTGAACAATGAGAACACATGGACACAAGGAGGGGAACATCACA	8509
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3378	GTGGAAGTTGAACAATGAGAACACATGGACACAAGGAGGGGAACATCACA	3427

C  CR856018.10	8508	CACCAGGGCCTGTCGGGGGGTGGGGGGATAGGGGAGGGAGAGCATTAGGA	8459
			|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3428	CACCAGGGCCTGTCAGGGGGTGGGGGGATAGGGGAGGGAGAGCATTAGGA	3477

C  CR856018.10	8458	GAAATACCTAATGTAGATGACAGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGG	8409
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3478	GAAATACCTAATGTAGATGACAGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGG	3527

C  CR856018.10	8408	CACGTGTATACCTACGTAACAAACCTGCACGTTCTGCACATGTACCCCAG	8359
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3528	CACGTGTATACCTACGTAACAAACCTGCACGTTCTGCACATGTACCCCAG	3577

C  CR856018.10	8358	AACTTAAAGTATAAT-AAAAAAAAAATTAAAAACAAAGAAAAAGGAGGCC	8310
			||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3578	AACTTAAAGTATAATAAAAAAAAAAATTAAAAACAAAGAAAAAGGAGGCC	3627

C  CR856018.10	8309	AAGAAGAGAGTTCTCACCAGGAACCAACCATACTGGCACCCTTGTCTCAG	8260
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3628	AAGAAGAGAGTTCTCACCAGGAACCAACCATACTGGCACCCTTGTCTCAG	3677

C  CR856018.10	8259	ACCTCCAGCCTCCAGAAGTGGGATACAGGAATGTTAACAGTTTAAGCTTC	8210
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3678	ACCTCCAGCCTCCAGAAGTGGGATACAGGAATGTTAACAGTTTAAGCTTC	3727

C  CR856018.10	8209	CGACTCTATGGTGTTTTATCCCAGCAGCCTGAACTAACACATAAATTGTA	8160
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3728	CGACTCTATGGTGTTTTATCCCAGCAGCCTGAACTAACACATAAATTGTA	3777

C  CR856018.10	8159	TGCAAAGATGTGTAAATTCACATGCAGTTGTAAGAGGTAGTACAGAGTCA	8110
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3778	TGCAAAGATGTGTAAATTCACATGCAGTTGTAAGAGGTAGTACAGAGTCA	3827

C  CR856018.10	8109	TCCCATGTACCTTTACCAACCTTCCTGCAATTAGAACATCTTGCAAAACT	8060
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3828	TCCCATGTACCTTTACCAACCTTCCTGCAATTAGAACATCTTGCAAAACT	3877

C  CR856018.10	8059	CCAGTAAATCGCTCAACCAGATACAGACATTGATACAATCTGACCTGCTT	8010
			|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3878	CCAGTAAATCGCTCAACCAGATACGGACATTGATACAATCTGACCTGCTT	3927

C  CR856018.10	8009	CTTCAGATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTCTTCAGATGGAGTCTCACTCC	7960
			||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3928	CTTCAGATTTTCTTTTC-TTTTTTTTTTTCTTCAGATGGAGTCTCACTCC	3976

C  CR856018.10	7959	ATCACCAAGCTGGAGTGTGGTGGCGAGATCTCGGCTCCCTGCAACCTCCG	7910
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3977	ATCACCAAGCTGGAGTGTGGTGGCGAGATCTCGGCTCCCTGCAACCTCCG	4026

C  CR856018.10	7909	CTTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCTTACCTCAGCCTGCTGAGTAGCTGGGA	7860
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4027	CTTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCTTACCTCAGCCTGCTGAGTAGCTGGGA	4076

C  CR856018.10	7859	CTACAGGTGAGCCCCACCATGCCAGGCTAATTTTCGTATTTTTAGTAGAG	7810
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4077	CTACAGGTGAGCCCCACCATGCCAGGCTAATTTTCGTATTTTTAGTAGAG	4126

C  CR856018.10	7809	ATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGATCTCTTGACATCGTG	7760
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4127	ATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGATCTCTTGACATCGTG	4176

C  CR856018.10	7759	ATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGGAATACAGGCCTGAGCCA	7710
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4177	ATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGGAATACAGGCCTGAGCCA	4226

C  CR856018.10	7709	CCGCACCCGGCCGCCTTTTCAGATTTTCTCTTTTAGTTGTATGTGGGTGT	7660
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4227	CCGCACCCGGCCGCCTTTTCAGATTTTCTCTTTTAGTTGTATGTGGGTGT	4276

C  CR856018.10	7659	GGGTGTGTTTGCAAGTATTTCATCGTATGCAATTAAAAAAAAATTTTTGC	7610
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4277	GGGTGTGTTTGCAAGTATTTCATCGTATGCAATTAAAAAAAAATTTTTGC	4326

C  CR856018.10	7609	ACTTTGGGGAGACCGAGGCAGGCGAATCACAAGGTCTGGAGTTCGAGACC	7560
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4327	ACTTTGGGGAGACCGAGGCAGGCGAATCACAAGGTCTGGAGTTCGAGACC	4376

C  CR856018.10	7559	AGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA	7510
			|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4377	AGCCTGACCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA	4426

C  CR856018.10	7509	GCTGGGCATAGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTATGCGGGAGGCTGAG	7460
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4427	GCTGGGCATAGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTATGCGGGAGGCTGAG	4476

C  CR856018.10	7459	GCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTACAGTGAGCCAAGGT	7410
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4477	GCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTACAGTGAGCCAAGGT	4526

C  CR856018.10	7409	CACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCACAAGACTCAGTTTCAACC	7360
			||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
  CR856017.2	4527	CACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCGCAAGACTCAGTTTCAACC	4576

C  CR856018.10	7359	AAAAAAAAAAATTGAATTATTTTAAAAAATTGTTGTGGGTCCATAGTAGG	7310
			 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4577	-AAAAAAAAAATTGAATTATTTTAAAAAATTGTTGTGGGTCCATAGTAGG	4625

C  CR856018.10	7309	TGTGTATATATTTGTAGCTTACATGAGATGTTTTGATACAGGCATGCAAT	7260
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4626	TGTGTATATATTTGTAGCTTACATGAGATGTTTTGATACAGGCATGCAAT	4675

C  CR856018.10	7259	GTGTAAAAAGCACATCATGGAGAATAGGGTGTCCATCTCCTCAAGCATTT	7210
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4676	GTGTAAAAAGCACATCATGGAGAATAGGGTGTCCATCTCCTCAAGCATTT	4725

C  CR856018.10	7209	ATCCTTGCGGTTACAAAGGGGGTTGGAGTGGGGGAGGTGGGGATGGTTAA	7160
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4726	ATCCTTGCGGTTACAAAGGGGGTTGGAGTGGGGGAGGTGGGGATGGTTAA	4775

C  CR856018.10	7159	TAGGTACAAAAATTGGAAAGAATAAATAAGACATAGCACAATAGGGTGAC	7110
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4776	TAGGTACAAAAATTGGAAAGAATAAATAAGACATAGCACAATAGGGTGAC	4825

C  CR856018.10	7109	TATTGTCAACCAACACACGCACACACACACACACACACGCACACACACAC	7060
			||||||       || || || |||||||||||||||  |||||||||||
  CR856017.2	4826	TATTGT-------CA-AC-CA-ACACACACACACACA--CACACACACAC	4863

C  CR856018.10	7059	ACACACACAGTTCCTGCTTCAATGGATGAAG--TTTTTTTTGTTTTTTTT	7012
			|||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||
  CR856017.2	4864	ACACACACAGTTCCTGCTTCAATGGATGAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	4913

C  CR856018.10	7011	TTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTTCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGTG	6962
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4914	TTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTTCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGTG	4963

C  CR856018.10	6961	ATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCCGGTTCAAACGATTCTCCTGC	6912
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4964	ATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCCGGTTCAAACGATTCTCCTGC	5013

C  CR856018.10	6911	CTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGGACCCGCCACCAGGCCTGGC	6862
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
  CR856017.2	5014	CTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGGACCCGCCATCAGGCCTGGC	5063

C  CR856018.10	6861	TAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGTCAGGCT	6812
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5064	TAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGTCAGGCT	5113

C  CR856018.10	6811	GGCCTCGAACTCCTGACCTCATGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAC	6762
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5114	GGCCTCGAACTCCTGACCTCATGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAC	5163

C  CR856018.10	6761	TGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCGATGTTTTTGTTCC	6712
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5164	TGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCGATGTTTTTGTTCC	5213

C  CR856018.10	6711	ATTTGTTCAGTTTCTCTTCCTGATTGTTCTTTCATCTATTTCCCTTTCCA	6662
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5214	ATTTGTTCAGTTTCTCTTCCTGATTGTTCTTTCATCTATTTCCCTTTCCA	5263

C  CR856018.10	6661	CTGGTTCCCTTTAATTTACTCCCAAACTAACATCCCCCCACCAAGATAAC	6612
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5264	CTGGTTCCCTTTAATTTACTCCCAAACTAACATCCCCCCACCAAGATAAC	5313

C  CR856018.10	6611	CAACATCAACACCATCCTTCCCCACAAGAAAGGACCTTGACTTCTGCCAC	6562
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5314	CAACATCAACACCATCCTTCCCCACAAGAAAGGACCTTGACTTCTGCCAC	5363

C  CR856018.10	6561	TCCCACACCACATAGTTTTGTTTTCTGCAATTTCAGCTCTGGAGTATTTG	6512
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5364	TCCCACACCACATAGTTTTGTTTTCTGCAATTTCAGCTCTGGAGTATTTG	5413

C  CR856018.10	6511	GGAGGAGGTGGCTGACAGAGCACAGCAACAATCCTTACACGGTCTGTATT	6462
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5414	GGAGGAGGTGGCTGACAGAGCACAGCAACAATCCTTACACGGTCTGTATT	5463

C  CR856018.10	6461	CCCTT-CTTCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCC-CTT	6414
			|  || ||||| || || || || || || || || || |||| |  | |
  CR856017.2	5464	CTTTTCCTTCC-TT-CC-TT-CC-TT-CC-TT-CC-TT-CCTTCCTTCCT	5503

C  CR856018.10	6413	TCC--CTTTCCTTTCCTTTCTT--TTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTT	6368
			|||  | |||| |||||| |||  ||| ||||||||| |||| |||||||
  CR856017.2	5504	TCCTTCCTTCC-TTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTTTC-TTTCCTTTCTTT	5551

C  CR856018.10	6367	TCTTTGTTTTTTTGAAGGAGTCTCACCCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAG	6318
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5552	TCTTTGTTTTTTTGAAGGAGTCTCACCCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAG	5601

C  CR856018.10	6317	TGGTGCACTCTCAGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCCGGTTCAAGCGATT	6268
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5602	TGGTGCACTCTCAGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCCGGTTCAAGCGATT	5651

C  CR856018.10	6267	CTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCAC	6218
			|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5652	CTTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCAC	5701

C  CR856018.10	6217	TCCTGGCTAATTTTCGTATTTTTAGTAGAGAGGTGGTTTCCGCATGTTGG	6168
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
  CR856017.2	5702	TCCTGGCTAATTTTCGTATTTTTAGTAGAGAGGTGGTTTCCACATGTTGG	5751

C  CR856018.10	6167	CCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTTATCCACCTGCCTCGGCCT	6118
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5752	CCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTTATCCACCTGCCTCGGCCT	5801

C  CR856018.10	6117	CCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCCACGGGG	6068
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5802	CCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCCACGGGG	5851

C  CR856018.10	6067	TCGGCATTCCGTTTTGCTGTTTCTTTACTGTGATGGTTACTATTGAGTGT	6018
			|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5852	TCTGCATTCCGTTTTGCTGTTTCTTTACTGTGATGGTTACTATTGAGTGT	5901

C  CR856018.10	6017	CAACCTGACTGAATTGAAGCAAAGTATTGATCATAGGTGTTCCTGGGAGG	5968
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5902	CAACTTGACTGAATTGAAGCAAAGTATTGATCATAGGTGTTCCTGGGAGG	5951

C  CR856018.10	5967	TTGTTGATAAAGGAGATTAACATTTGAGTCAGTGGACAGGGCTAGACAGA	5918
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
  CR856017.2	5952	TTGTTGATAAAGGAGATTAACATTTGAGTCAGTGGACAGGGCTAGGCAGA	6001

C  CR856018.10	5917	CCCACCCTCCATCTGGACAGGCATCATTTGATCAGCTGCCAGCACAGCTA	5868
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6002	CCCACCCTCCATCTGGACAGGCATCATTTGATCAGCTGCCAGCACAGCTA	6051

C  CR856018.10	5867	GGATAAAAGCAGACAGAGGGCCGGGCGCGGTAGCTTACACCTGTCATCCC	5818
			|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
  CR856017.2	6052	GGATAAAAGCAGGCAGAGGGCCGGGCGCGGTGGCTTACACCCGTCATCCC	6101

C  CR856018.10	5817	AGCACTTTAGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGA	5768
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6102	AGCACTTTAGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGA	6151

C  CR856018.10	5767	GACCAGCCTGAGCGACATGGTGAAACCTCGTCTCTAGTAAAAATATAAAA	5718
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6152	GACCAGCCTGAGCGACATGGTGAAACCTCGTCTCTAGTAAAAATATAAAA	6201

C  CR856018.10	5717	ATTAGCCAGGTGTGGTGGCACACGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGGGGC	5668
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
  CR856017.2	6202	ATTAGCCAGGTGTGGTGGCACACGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC	6251

C  CR856018.10	5667	TGAGGCAGGAGAATTGCTTTAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTAGTAAACCG	5618
			|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6252	TGAGGCAGGAGAATTGCTTTAACCTGGGGGGCGGAGGTTGTAGTAAACCG	6301

C  CR856018.10	5617	AGGTCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAACAAGACTCCATCTC	5568
			|||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6302	AGGTCGCACCACTGCACTCCAGCCT--G-GACAGAACAAGACTCCATCTC	6348

C  CR856018.10	5567	AAAATAATAATAATAATAAAAGCTGGGCGTGGTGGCTCACACCTGTCATC	5518
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
  CR856017.2	6349	AAAATAATAATAATAATAAAAGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTCATC	6398

C  CR856018.10	5517	CCAGCAGTTTGGAAGGCTGAGGCAGGCAGATCATGAGGTCAGGAGATTGA	5468
			||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
  CR856017.2	6399	CCAGCAGTTTGGAAGGCTGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATTGA	6448

C  CR856018.10	5467	GACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCCACTAAAAAATACAAA	5418
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6449	GACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCCACTAAAAAATACAAA	6498

C  CR856018.10	5417	AAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAG	5368
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6499	AAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAG	6548

C  CR856018.10	5367	GCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCGGGAGGCCGAGGTTGCAGTGAGC	5318
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
  CR856017.2	6549	GCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGC	6598

C  CR856018.10	5317	CGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAACAATCCATC	5268
			|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
  CR856017.2	6599	CGAGATCGCGCCACCGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAACACTCCATC	6648

C  CR856018.10	5267	TCAATAAATAAATAAATAAATAAATAATAACAATAATAAAATAAAAGTCT	5218
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6649	TCAATAAATAAATAAATAAATAAATAATAACAATAATAAAATAAAAGTCT	6698

C  CR856018.10	5217	GTGGCATCGTAGGAGGGACATGTGATTTGTTTAGGAAAATAAAACAACAA	5168
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6699	GTGGCATCGTAGGAGGGACATGTGATTTGTTTAGGAAAATAAAACAACAA	6748

C  CR856018.10	5167	CAGAAGCTTGTCTGTGGCTGACGGCATGATAAAAGTTCTGATATCTGTCC	5118
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6749	CAGAAGCTTGTCTGTGGCTGACGGCATGATAAAAGTTCTGATATCTGTCC	6798

C  CR856018.10	5117	CGGCTCCAATCTCGTGTTCACTTGTCATCCTCAAAGCTGGGAGCCTGGTG	5068
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6799	CGGCTCCAATCTCGTGTTCACTTGTCATCCTCAAAGCTGGGAGCCTGGTG	6848

C  CR856018.10	5067	AGAGATGTTGGATCTGAGAGGCAGATCCCTCATGGTTTGGTGCTGATCTT	5018
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
  CR856017.2	6849	AGAGATGTTGGATCTGAGAGGCAGATCCCTCATGGTTTGGTGCTGGTCTT	6898

C  CR856018.10	5017	GCGGTAGTGAGTCAGTTCTCTCGGGATCTGGTTGTTTAAAGGCTGGGAGC	4968
			|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6899	GCAGTAGTGAGTCAGTTCTCTCGGGATCTGGTTGTTTAAAGGCTGGGAGC	6948

C  CR856018.10	4967	ACGGTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCG	4918
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
  CR856017.2	6949	ACGGTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCG	6998

C  CR856018.10	4917	GATCACCTGAGGTCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC	4868
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6999	GATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC	7048

C  CR856018.10	4867	CCGGTCTCTACT-AAAAATACAAAAATCAGCTGGGCATGGTGGCAGGTGC	4819
			|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
  CR856017.2	7049	CCGGTCTCTACTAAAAAATACAAAAATCAGCTGTGCATGGTGGCAGGTGC	7098

C  CR856018.10	4818	CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTC	4769
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7099	CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTC	7148

C  CR856018.10	4768	AGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCGGTCTCTACTAA	4719
			||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7149	AGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGTTGAAACCCGGTCTCTACTAA	7198

C  CR856018.10	4718	AAATACAAAAATCAGCTGGGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCAC	4669
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7199	AAATACAAAAATCAGCTGGGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCAC	7248

C  CR856018.10	4668	TTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGAGACCA	4619
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
  CR856017.2	7249	TTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCAAGACCA	7298

C  CR856018.10	4618	GCCTGGCCAACATGGTGAAACACCGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAG	4569
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7299	GCCTGGCCAACATGGTGAAACACCGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAG	7348

C  CR856018.10	4568	CCAGGCGTGGTGGCTGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGG	4519
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7349	CCAGGCGTGGTGGCTGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGG	7398

C  CR856018.10	4518	CAGGAGAATCGCTTGAATCCGGGAGTGAGCCAAGATTGCTCCACTGCATT	4469
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7399	CAGGAGAATCGCTTGAATCCGGGAGTGAGCCAAGATTGCTCCACTGCATT	7448

C  CR856018.10	4468	CAAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCATAAATACATAAAAATAA	4419
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7449	CAAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCATAAATACATAAAAATAA	7498

C  CR856018.10	4418	AATAAAGTGTGTAGCACCTCTCCCCCATATCCAGCTCCCACACTCACCAC	4369
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7499	AATAAAGTGTGTAGCACCTCTCCCCCATATCCAGCTCCCACACTCACCAC	7548

C  CR856018.10	4368	GTGACATGCCTTCTCCCACGTTGCCTTCCGCCATGACTGTAAGCTTCCTC	4319
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7549	GTGACATGCCTTCTCCCACGTTGCCTTCCGCCATGACTGTAAGCTTCCTC	7598

C  CR856018.10	4318	ATACCTCACCAGAGGCTGAGCACATGCTGGCACCATGCTTCGTGTATAGC	4269
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7599	ATACCTCACCAGAGGCTGAGCACATGCTGGCACCATGCTTCGTGTATAGC	7648

C  CR856018.10	4268	CTGCAGAACTATCAGCCAAGCCAATGAAACCTCTCTTCTTTATAAATTAG	4219
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7649	CTGCAGAACTATCAGCCAAGCCAATGAAACCTCTCTTCTTTATAAATTAG	7698

C  CR856018.10	4218	CCTCACGGGGTAGATTGCCTGAGCTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACA	4169
			|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7699	CCTCACGGGGTAGATTGCCTGAGCACAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACA	7748

C  CR856018.10	4168	ACATGGTGAAACTATGTCTCTACTAAAAATATGAAAAATTAGCCTGGCGT	4119
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7749	ACATGGTGAAACTATGTCTCTACTAAAAATATGAAAAATTAGCCTGGCGT	7798

C  CR856018.10	4118	GGTGGCGGGCACCTGTAATCGCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA	4069
			|||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7799	GGTGGCAGGCACCTGTAATCGCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA	7848

C  CR856018.10	4068	TCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAAGTTGCAGTGAACTGAGATCGCACCACT	4019
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7849	TCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAAGTTGCAGTGAACTGAGATCGCACCACT	7898

C  CR856018.10	4018	GCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTCCAAAAAATAAAAA	3969
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7899	GCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTCCAAAAAATAAAAA	7948

C  CR856018.10	3968	ACAAATTACCCAGCCTCAGATATTTCTTTATAGCAATGCAAGAATGGCAT	3919
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
  CR856017.2	7949	ACAAATTACCCAGCCTCAGATATTTCTTTATAGCAATGCAAGAAAGGCAT	7998

C  CR856018.10	3918	ATTACACTGCGTAACTTTGTCAAGCTTCTCCAGGAGCCTGAGTCTCTGGT	3869
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7999	ATTACACTGCGTAACTTTGTCAAGCTTCTCCAGGAGCCTGAGTCTCTGGT	8048

C  CR856018.10	3868	TCTGTTCAGTGAATATTCATAGGTTTATAAGACTTGGGCCGGGTGTGGTG	3819
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8049	TCTGTTCAGTGAATATTCATAGGTTTATAAGACTTGGGCCGGGTGTGGTG	8098

C  CR856018.10	3818	GCTCACGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGTGGATCAT	3769
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8099	GCTCACGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGTGGATCAT	8148

C  CR856018.10	3768	CCAAGGTCAGGATTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCAAC	3719
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8149	CCAAGGTCAGGATTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCAAC	8198

C  CR856018.10	3718	TCTAGTAAAAATACCAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTA	3669
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8199	TCTAGTAAAAATACCAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTA	8248

C  CR856018.10	3668	ATTGCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCTGGGAA	3619
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
  CR856017.2	8249	ATTGCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAATCTGGGAA	8298

C  CR856018.10	3618	ACGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTAGGCA	3569
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8299	ACGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTAGGCA	8348

C  CR856018.10	3568	ACAGAGCAAGATTCTCTCTCCAAAAAATTAAAAATAAATTACCTAGCCTC	3519
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8349	ACAGAGCAAGATTCTCTCTCCAAAAAATTAAAAATAAATTACCTAGCCTC	8398

C  CR856018.10	3518	GGATATTTCTTTATAGCAATGCAAGAATGGACTAATGCACTGCGTGACTT	3469
			||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8399	GGATATTTCTTTATAGCAATGCAAGAATGAACTAATGCACTGCGTGACTT	8448

C  CR856018.10	3468	TGTCAAGCTTTTCCGGGAGCCTGAGTCTCTGGTTCTGTTCAATGAATCTT	3419
			||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8449	TGTCAAGCTTTTCCGGGAGCCTGAGTCTCCGGTTCTGTTCAATGAATCTT	8498

C  CR856018.10	3418	TATAGGTTTATAAGACTCAGTGACAGAAAGGTCCTAAAAGGGTTTTCAGG	3369
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
  CR856017.2	8499	TATAGGTTTATAAGACTCAGTGACAGAAAGGTCCTGAAAGGGTTTTCAGG	8548

C  CR856018.10	3368	CTGCAAAGGATGTTTTCTATGTGAGTTTGGCTGCAGTGGGAGGTTTGGTT	3319
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8549	CTGCAAAGGATGTTTTCTATGTGAGTTTGGCTGCAGTGGGAGGTTTGGTT	8598

C  CR856018.10	3318	CCATGAAATTGTCCTGATGATCTGGTGTTTTTTCTCGATATGTGGTGAGG	3269
			|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8599	CCATGAAATTGTCCTGATGATCTGATGTTTTTTCTCGATATGTGGTGAGG	8648

C  CR856018.10	3268	GGGGCTGGCTGTTCTCTGCAGAGCATATGGGAAGTTGGGGGTGGGTGGGT	3219
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8649	GGGGCTGGCTGTTCTCTGCAGAGCATATGGGAAGTTGGGGGTGGGTGGGT	8698

C  CR856018.10	3218	TGCTGGGTGGGCAAAAGAATCAAGTGCCTCCACTGGCATTTGGTTGGGGG	3169
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8699	TGCTGGGTGGGCAAAAGAATCAAGTGCCTCCACTGGCATTTGGTTGGGGG	8748

C  CR856018.10	3168	AAGCCTGGGATTTCGACTCGTCGCAGAGTACAGGGCAATGCTACCTAGCA	3119
			|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8749	AAGCCTGGGATTTCAACTCGTCGCAGAGTACAGGGCAATGCTACCTAGCA	8798

C  CR856018.10	3118	GAGAACACACCCCTGACCCACATGACTCATGAGTGTGGGACCCAGATGGC	3069
			|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8799	GAGAACACACCCCTGACCCACATGACTCGTGAGTGTGGGACCCAGATGGC	8848

C  CR856018.10	3068	CACAAAGACAAAAAACCTGTTTACGATTCACCTGAGCGTAGCACTTAACT	3019
			|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8849	CACAAAGACAGAAAACCTGTTTACGATTCACCTGAGCGTAGCACTTAACT	8898

C  CR856018.10	3018	CGGCTTACACATAAATACAAAGGATTGATTTTCCAGTCAAAAAAAAAAAA	2969
			||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8899	CGGCTTACACATATATACAAAGGATTGATTTTCCAGTCAAAAAAAAAAAA	8948

C  CR856018.10	2968	CACTGCGTTAACAGAGAGACGATTGGACTGGCTGCGTTTCATCACCATTT	2919
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8949	CACTGCGTTAACAGAGAGACGATTGGACTGGCTGCGTTTCATCACCATTT	8998

C  CR856018.10	2918	GGGGAAATCAGAGGACAGGAGAGGACTCATGGTGTTCGAGTTACCAGGAC	2869
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8999	GGGGAAATCAGAGGACAGGAGAGGACTCATGGTGTTCGAGTTACCAGGAC	9048

C  CR856018.10	2868	ACCAGGCCAGGGCGGCCTGTGATTGCCGTCGGCCACCCAGTCGTCTAATG	2819
			|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9049	ACCAGGCCGGGGCGGCCTGTGATTGCCGTCGGCCACCCAGTCGTCTAATG	9098

C  CR856018.10	2818	GGGTAGATGATGATCATATCATCTTGTGGATTCAACACATAGAGGCACGA	2769
			|||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9099	GGGTAGATGAT---CATGTCATCTTGTGGATTCAACACATAGAGGCACGA	9145

C  CR856018.10	2768	CGCATATTACTGCCTCGTTATTTCCAGGGTAGAGGTAAGCCCAAAAGTTG	2719
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9146	CGCATATTACTGCCTCGTTATTTCCAGGGTAGAGGTAAGCCCAAAAGTTG	9195

C  CR856018.10	2718	AGATGTACCAATGCATGTTGCTTTATTATTTATTTATTTATTTATTTTTT	2669
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9196	AGATGTACCAATGCATGTTGCTTTATTATTTATTTATTTATTTATTTTTT	9245

C  CR856018.10	2668	GAGACGGAATTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACAATC	2619
			|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9246	GAGACGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACAATC	9295

C  CR856018.10	2618	TCGGCTCACCGCAACCTACGCTTCCTACGCTTCCTGAGTTCAAGTGATTC	2569
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9296	TCGGCTCACCGCAACCTACGCTTCCTACGCTTCCTGAGTTCAAGTGATTC	9345

C  CR856018.10	2568	TCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACG	2519
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9346	TCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACG	9395

C  CR856018.10	2518	CCTGGCTAATTTTATATACATACATACATACATACATATATATATATATA	2469
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9396	CCTGGCTAATTTTATATACATACATACATACATACATATATATATATATA	9445

C  CR856018.10	2468	CACACACACACATACACATACATACATATGTATACACACATACATATATA	2419
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9446	CACACACACACATACACATACATACATATGTATACACACATACATATATA	9495

C  CR856018.10	2418	TACACACACACATATATATACACATACATACATATATATATACACACACA	2369
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9496	TACACACACACATATATATACACATACATACATATATATATACACACACA	9545

C  CR856018.10	2368	CACATATATATATCTATATATATATTTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTT	2319
			||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| 
  CR856017.2	9546	CACATATATATATCTATATATAT-TTTTTTTT-AGTAGAGACGGGGTTTC	9593

C  CR856018.10	2318	GCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCACAGGTGATCCGCCC	2269
			 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9594	ACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCACAGGTGATCCGCCC	9643

C  CR856018.10	2268	GCCTCGGCCTCCCAAACTTCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCG	2219
			|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9644	GCCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCG	9693

C  CR856018.10	2218	GCCACATATTCCTTTATTATAATTTGCATGATGTGGATATTAGGATATTA	2169
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9694	GCCACATATTCCTTTATTATAATTTGCATGATGTGGATATTAGGATATTA	9743

C  CR856018.10	2168	TTAAATTTTCTTAGGGTGATAGTAAGGATGATTTCATTTTTTAGAAGAGT	2119
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9744	TTAAATTTTCTTAGGGTGATAGTAAGGATGATTTCATTTTTTAGAAGAGT	9793

C  CR856018.10	2118	AAAGCGGGAATTAAAAATACATTTTGGGGCCTTGCACAGTGGCTCACACC	2069
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9794	AAAGCGGGAATTAAAAATACATTTTGGGGCCTTGCACAGTGGCTCACACC	9843

C  CR856018.10	2068	TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGTGGTGGGTGGATCACTGAGTCCAG	2019
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9844	TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGTGGTGGGTGGATCACTGAGTCCAG	9893

C  CR856018.10	2018	GAATTCGAGACCACTCTGGCCAACATGGTGAAACCTCGTCTCTACTGAAA	1969
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9894	GAATTCGAGACCACTCTGGCCAACATGGTGAAACCTCGTCTCTACTGAAA	9943

C  CR856018.10	1968	ATACAAGAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACT	1919
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9944	ATACAAGAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACT	9993

C  CR856018.10	1918	TGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCTGGAGGTGGAGGTTGCA	1869
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9994	TGGGGGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCTGGAGGTGGAGGTTGCA	10043

C  CR856018.10	1868	GTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACAC	1819
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10044	GTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACAC	10093

C  CR856018.10	1818	TGTCTCAAAAAAATATATATCTATCTCTATCTATCTATCTATCTATATCC	1769
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | 
  CR856017.2	10094	TGTCTCAAAAAAATATATATCTATCTCTATCTATCTATCTATCTAT--C-	10140

C  CR856018.10	1768	TATATATCCATATATATATATACACATATATATACATATATATATACACA	1719
			|||    |  |||||       | | ||||||| ||||||||||||||||
  CR856017.2	10141	TAT----C--TATAT-------C-C-TATATATCCATATATATATACACA	10175

C  CR856018.10	1718	CACACATATATATATGCCAGACTCAGTAGCTTACACCTGTAATCCCAGTG	1669
			      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10176	------TATATATATGCCAGACTCAGTAGCTTACACCTGTAATCCCAGTG	10219

C  CR856018.10	1668	CTTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACC	1619
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10220	CTTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACC	10269

C  CR856018.10	1618	AGCCTGGGCAGCATAGCAAGATCCCATCTCTACAAAACATAAAAATAGTT	1569
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10270	AGCCTGGGCAGCATAGCAAGATCCCATCTCTACAAAACATAAAAATAGTT	10319

C  CR856018.10	1568	GGCTGGATGTGAAGATGTGCACCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA	1519
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10320	GGCTGGATGTGAAGATGTGCACCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA	10369

C  CR856018.10	1518	GGTGGGAGGATCGTTTGAGCTCAGGAAGTGGAGGCTGCAGTGAGCTATGA	1469
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10370	GGTGGGAGGATCGTTTGAGCTCAGGAAGTGGAGGCTGCAGTGAGCTATGA	10419

C  CR856018.10	1468	TCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGTCCACAGAGCAAGAACTGGTCTCTAA	1419
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10420	TCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGTCCACAGAGCAAGAACTGGTCTCTAA	10469

C  CR856018.10	1418	AAAAACAATGCATCATTTTACATCCATGCGATGGAATATTACTTAGCCAT	1369
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10470	AAAAACAATGCATCATTTTACATCCATGCGATGGAATATTACTTAGCCAT	10519

C  CR856018.10	1368	AAAAAAGGAATGAAGTGTGGATACATGCCACCACACAGATGAACCTCAAA	1319
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10520	AAAAAAGGAATGAAGTGTGGATACATGCCACCACACAGATGAACCTCAAA	10569

C  CR856018.10	1318	AAGTATTATCGTAAGTGAAAGAAGCCAGACGCAATAGGTCACCTGTATGA	1269
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10570	AAGTATTATCGTAAGTGAAAGAAGCCAGACGCAATAGGTCACCTGTATGA	10619

C  CR856018.10	1268	TTCCAGGTCTGTAAAGTAGCAGAATAGTTCAGTTCAAAGAGACAGAAACT	1219
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10620	TTCCAGGTCTGTAAAGTAGCAGAATAGTTCAGTTCAAAGAGACAGAAACT	10669

C  CR856018.10	1218	AGATTAGTGGTTGCCGTGGAATAGGGCCCGGGGAATGGGAGTGGCTGCTG	1169
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
  CR856017.2	10670	AGATTAGTGGTTGCCGTGGAATAGGGCCCGGGGAATGGTAGTGGCTGCTG	10719

C  CR856018.10	1168	TTGTATATGGCGTTTCTTTTGGGGTGATGAAAATGTTTTGGAACTCAAGA	1119
			|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10720	TTGTATATGGTGTTTCTTTTGGGGTGATGAAAATGTTTTGGAACTCAAGA	10769

C  CR856018.10	1118	GTGATGATGGTTGCCCAACATGGTGAACATCCTGAATGTCACAGAATTGT	1069
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10770	GTGATGATGGTTGCCCAACATGGTGAACATCCTGAATGTCACAGAATTGT	10819

C  CR856018.10	1068	ACACATTAAATGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTG	1019
			||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
  CR856017.2	10820	ACACATTAAATGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCTTG	10867

C  CR856018.10	1018	GTATGTCACCAGGCCTGGAGTGCAGAGGCACGATCTCGGCTCACTGCAAC	969
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10868	GTATGTCACCAGGCCTGGAGTGCAGAGGCACGATCTCGGCTCACTGCAAC	10917

C  CR856018.10	968	CTCCACCTCCCGGATTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGC	919
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10918	CTCCACCTCCCGGATTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGC	10967

C  CR856018.10	918	TGGGATTACAGGCACGCACCACCATTCCCGGCTAATTTTTTTTTTTTGTA	869
			|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10968	TGGGATTACAGGCATGCACCACCATTCCCGGCTAATTTTTTTTTTTTGTA	11017

C  CR856018.10	868	TTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGAACTC	819
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11018	TTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGAACTC	11067

C  CR856018.10	818	CTGGCCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG	769
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11068	CTGGCCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG	11117

C  CR856018.10	768	ACGTCAGCCACCGCGCCCGGCCTAAAATGGTTCATTTTATGTTATGTGAC	719
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11118	ACGTCAGCCACCGCGCCCGGCCTAAAATGGTTCATTTTATGTTATGTGAC	11167

C  CR856018.10	718	TTATATTTCCTTTTTATTTTTTTGAGATAGGGTCTCCCTCTGTTGCCCAA	669
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11168	TTATATTTCCTTTTTATTTTTTTGAGATAGGGTCTCCCTCTGTTGCCCAA	11217

C  CR856018.10	668	GCTGGAATGCAGTGGTGCAATCCCAGCTTACCGCAGCCTCTACCTCCTGG	619
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11218	GCTGGAATGCAGTGGTGCAATCCCAGCTTACCGCAGCCTCTACCTCCTGG	11267

C  CR856018.10	618	GCTCGAGGGATCCTCCCACCTCAGCCTCCATAGTAGGTTGGACTTCAGGT	569
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11268	GCTCGAGGGATCCTCCCACCTCAGCCTCCATAGTAGGTTGGACTTCAGGT	11317

C  CR856018.10	568	ACATGCCACCACATCTAATTGTTTTTTAATAGACATGAGGTCTCACTGTG	519
			||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11318	ACATGCCACCACACCTAATTGTTTTTTAATAGACATGAGGTCTCACTGTG	11367

C  CR856018.10	518	TTGCCCAGGCTTGTCTCAAACTCCTGGACTCAAGCAATCCCCTCTCTTTG	469
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11368	TTGCCCAGGCTTGTCTCAAACTCCTGGACTCAAGCAATCCCCTCTCTTTG	11417

C  CR856018.10	468	GCCTCCCAAAATGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGAATCGGCAATGA	419
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11418	GCCTCCCAAAATGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGAATCGGCAATGA	11467

C  CR856018.10	418	CTTACATTTCAATAAAACATAATAATATATTGATTACGAAGATGCCAATT	369
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11468	CTTACATTTCAATAAAACATAATAATATATTGATTACGAAGATGCCAATT	11517

C  CR856018.10	368	TCCTCAGAGGCCAGGCTCTGCCCAGTGCTGAGTTGGCAAACGTTGGGTGC	319
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11518	TCCTCAGAGGCCAGGCTCTGCCCAGTGCTGAGTTGGCAAACGTTGGGTGC	11567

C  CR856018.10	318	TCACGTGTGTGCCTTTAACTGGATCAAACCAAAAGATGGAACAGGGCGCC	269
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11568	TCACGTGTGTGCCTTTAACTGGATCAAACCAAAAGATGGAACAGGGCGCC	11617

C  CR856018.10	268	TCTCTGCTGACTGTCATTTGTCCTGGATGCAAGAATCACATAGGAAACCA	219
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11618	TCTCTGCTGACTGTCATTTGTCCTGGATGCAAGAATCACATAGGAAACCA	11667

C  CR856018.10	218	CCGCTTTGGGACAGGTTTTTTGCATCGTGATTCCAATGGGGGTAGATGAT	169
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11668	CCGCTTTGGGACAGGTTTTTTGCATCGTGATTCCAATGGGGGTAGATGAT	11717

C  CR856018.10	168	GACTGTGTTTTCAGAAAGGGCTAAGCCGGTGATGATGGCATCGGCATAGC	119
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11718	GACTGTGTTTTCAGAAAGGGCTAAGCCGGTGATGATGGCATCGGCATAGC	11767

C  CR856018.10	118	TGTGATTATGAATCCCAATGGATTCTAAAGATCCTCTAGATTATTCCAAG	69
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11768	TGTGATTATGAATCCCAATGGATTCTAAAGATCCTCTAGATTATTCCAAG	11817

C  CR856018.10	68	AACAGGAATCAATATCCGATTCATCTGCCTATGGATTAACCTTCAGGAGA	19
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11818	AACAGGAATCAATATCCGATTCATCTGCCTATGGATTAACCTTCAGGAGA	11867

C  CR856018.10	18	AGGACCATCCTGGAAGGG	1
			||||||||||||||||||
  CR856017.2	11868	AGGACCATCCTGGAAGGG	11885

Compact alignment

C  CR856018.10	11952	GATTCTGACTGTTTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTC	11903
			||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1	GATTCTGACTGTTTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTC	50

C  CR856018.10	11902	ACTGCAACCCTCACCTCGCAGGTTCAAGTGATTCTGTCGCCTCAGCCTCC	11853
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	51	ACTGCAACCCTCGCCTCGCAGGTTCAAGTGATTCTGTCGCCTCAGCCTCC	100

C  CR856018.10	11852	TGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCCCTACGCCCAGCT-ATTTTTTT	11804
			 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
  CR856017.2	101	CGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCCCCACGCCCAGCTAATTTTTTT	150

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	11703	TGCCGGGATTAGAGGCGTAAGCCACCACGCCCGGCCGCAGCTGCTCTTCA	11654
			||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	251	TGCCGGGATTACAGGCGTAAGCCACCACGCCCGGCCGCAGCTGCTCTTCA	300

skip 150 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	11503	GAGAGCGATCCGAATGTTGTACGACTCCAGCCTCACACTATTCCTCTGTG	11454
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	451	GAGAGCGATCCGAATGTTGTATGACTCCAGCCTCACACTATTCCTCTGTG	500

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	11403	AATTCTGGAGAAGTTCGCCTGTGTTCCTTGATACCTGATTGTGCCATTTC	11354
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
  CR856017.2	551	AATTCTGGAGAAGTTCGCCTGTGTTCCTTGATACTTGATTGTGCCATTTC	600

C  CR856018.10	11353	CTGGACACTGTGCAATTTCCTGGAGACACTTCCCAGCAGGGGAAACCGCG	11304
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
  CR856017.2	601	CTGGACACTGTGCAATTTCCTGGAGACACTTCCCAGCAGGGGAAACTGCG	650

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	11253	GGAGGAATGAGTTTCTTTTCTTTGGCAAACCTTGATTCAATACTTGGACC	11204
			||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	701	GGAGGAATGAGATTCTTTTCTTTGGCAAACCTTGATTCAATACTTGGACC	750

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	11153	GCCATGAATAGGTTTTATTCAGGTCCAGCAATGGATGGGACCATCTCATT	11104
			||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |
  CR856017.2	801	GCCATGAATAGGTTTTATTCAGGTCCAGCAATGTATGGGACCA--TC--T	846

C  CR856018.10	11103	CATTCATTCATCTATCCATCCATCCATGCATCTGTCCATCCATCCATCCA	11054
			||||||||||  | | ||||||||||||||||||        ||||||||
  CR856017.2	847	CATTCATTCA--T-T-CATCCATCCATGCATCTG--------TCCATCCA	884

C  CR856018.10	11053	TCCATCCATTCATCCATCCATCCATTCATCCATGTAGTCATGTTTTCAGT	11004
			||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	885	TCCAT-C---CATCCATCCATCCATTCATCCATGTAGTCATGTTTTCAGT	930

skip 250 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	10753	TTTTAGCGGGAATGTGTGCAGTCAACAAAGGCTGGTGTGTGGGGAACACA	10704
			|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1181	TTTTAGTGGGAATGTGTGCAGTCAACAAAGGCTGGTGTGTGGGGAACACA	1230

C  CR856018.10	10703	TCACAGTCTAGATGTGTGTCTGGACGCCACCTTGATTTTGAGAGTGTCTT	10654
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
  CR856017.2	1231	TCACAGTCTAGATGTGTGTCTGGACGCCACCTTGATTTTGAGAGTGTC--	1278

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	10603	TAGAAGGGACACACCACATTTTCAAAGGCAGGACAGGTTGGGGGGCTGGA	10554
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1329	TAGAAGGGACACGCCACATTTTCAAAGGCAGGACAGGTTGGGGGGCTGGA	1378

skip 400 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	10153	GCCTCTGAAGCTGTCTTTGTGAAGCACCGTCTCGGATTCAGGAGTAGACA	10104
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
  CR856017.2	1779	GCCTCTGAAGCTGTCTTTGTGAAGCACCGTCTCGGATTCAGGAATAGACA	1828

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	10003	TTTCTTGCCTCGATACATGCCATCTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTCTTCCT	9954
			||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	1929	TTTCTTGCCTCGACACATGCCATCTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTCTTCCT	1978

skip 150 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	9803	AAAATTAGTGATTTTTTTTTTGCCTTTTTATTTTTTATTTATTTATTTTT	9754
			||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2129	AAAATTAGTGA-TTTTTTTTTGCCTTTTTATTTTTTATTTATTTATTTTT	2177

skip 350 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	9403	CTCTCTGCTTTAGATATTTTAGGGCTGCAGTACTAGAGACCTACAGGTTC	9354
			|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2528	CTCTCTGCTTTAGATATTTTGGGGCTGCAGTACTAGAGACCTACAGGTTC	2577

C  CR856018.10	9353	ATGATTATACTGTCTTCTTGGTGTAATGCTTCTTTTATTAGTTTGTTATT	9304
			||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
  CR856017.2	2578	ATGATTATACTGTCTTCTTGGTGTAATGCTTCTCTTATTAGTTTGTTATT	2627

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	9203	ATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCTGTCTC-	9155
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
  CR856017.2	2728	ATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCTGTCTCA	2777

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	9054	ATTAGATATTAACATCTTTTTATATCATCTCCTATTTTT-ATTGACTA-T	9007
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
  CR856017.2	2878	ATTAGATATTAACATCTTTTTATATCATCTCCTATTTTTAATTGACTACT	2927

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	8956	A--CCCCCCCAAGGGGATGGCGTTAGGAAGTGGAGGCTTTGGGAGGTGAT	8909
			|  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	2978	ACCCCCCCCCAAGGGGGTGGCGTTAGGAAGTGGAGGCTTTGGGAGGTGAT	3027

skip 150 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	8758	GACTTGGGACCAACCCAAATGCCCATCAATGATAGACTGGATAAAGAAAA	8709
			||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3178	GACTTGGAACCAACCGAAATGCCCATCAATGATAGACTGGATAAAGAAAA	3227

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	8608	CAAACTAACACAAGAACAGAAAACCAAACACGGCATGTTCTCACTCATCA	8559
			||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
  CR856017.2	3328	CAAACTAACACAAGAACAGAAAACCAAACACTGCATGTTCTCACTCATCA	3377

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	8508	CACCAGGGCCTGTCGGGGGGTGGGGGGATAGGGGAGGGAGAGCATTAGGA	8459
			|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3428	CACCAGGGCCTGTCAGGGGGTGGGGGGATAGGGGAGGGAGAGCATTAGGA	3477

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	8358	AACTTAAAGTATAAT-AAAAAAAAAATTAAAAACAAAGAAAAAGGAGGCC	8310
			||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3578	AACTTAAAGTATAATAAAAAAAAAAATTAAAAACAAAGAAAAAGGAGGCC	3627

skip 250 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	8059	CCAGTAAATCGCTCAACCAGATACAGACATTGATACAATCTGACCTGCTT	8010
			|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3878	CCAGTAAATCGCTCAACCAGATACGGACATTGATACAATCTGACCTGCTT	3927

C  CR856018.10	8009	CTTCAGATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTCTTCAGATGGAGTCTCACTCC	7960
			||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	3928	CTTCAGATTTTCTTTTC-TTTTTTTTTTTCTTCAGATGGAGTCTCACTCC	3976

skip 400 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	7559	AGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA	7510
			|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4377	AGCCTGACCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA	4426

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	7459	GCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTACAGTGAGCCAAGGT	7410
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4477	GCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTACAGTGAGCCAAGGT	4526

C  CR856018.10	7409	CACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCACAAGACTCAGTTTCAACC	7360
			||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
  CR856017.2	4527	CACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCGCAAGACTCAGTTTCAACC	4576

C  CR856018.10	7359	AAAAAAAAAAATTGAATTATTTTAAAAAATTGTTGTGGGTCCATAGTAGG	7310
			 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	4577	-AAAAAAAAAATTGAATTATTTTAAAAAATTGTTGTGGGTCCATAGTAGG	4625

skip 200 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	7109	TATTGTCAACCAACACACGCACACACACACACACACACGCACACACACAC	7060
			||||||       || || || |||||||||||||||  |||||||||||
  CR856017.2	4826	TATTGT-------CA-AC-CA-ACACACACACACACA--CACACACACAC	4863

C  CR856018.10	7059	ACACACACAGTTCCTGCTTCAATGGATGAAG--TTTTTTTTGTTTTTTTT	7012
			|||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||
  CR856017.2	4864	ACACACACAGTTCCTGCTTCAATGGATGAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	4913

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	6911	CTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGGACCCGCCACCAGGCCTGGC	6862
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
  CR856017.2	5014	CTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGGACCCGCCATCAGGCCTGGC	5063

skip 400 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	6461	CCCTT-CTTCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCC-CTT	6414
			|  || ||||| || || || || || || || || || |||| |  | |
  CR856017.2	5464	CTTTTCCTTCC-TT-CC-TT-CC-TT-CC-TT-CC-TT-CCTTCCTTCCT	5503

C  CR856018.10	6413	TCC--CTTTCCTTTCCTTTCTT--TTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTT	6368
			|||  | |||| |||||| |||  ||| ||||||||| |||| |||||||
  CR856017.2	5504	TCCTTCCTTCC-TTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTTTC-TTTCCTTTCTTT	5551

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	6267	CTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCAC	6218
			|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5652	CTTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCAC	5701

C  CR856018.10	6217	TCCTGGCTAATTTTCGTATTTTTAGTAGAGAGGTGGTTTCCGCATGTTGG	6168
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
  CR856017.2	5702	TCCTGGCTAATTTTCGTATTTTTAGTAGAGAGGTGGTTTCCACATGTTGG	5751

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	6067	TCGGCATTCCGTTTTGCTGTTTCTTTACTGTGATGGTTACTATTGAGTGT	6018
			|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5852	TCTGCATTCCGTTTTGCTGTTTCTTTACTGTGATGGTTACTATTGAGTGT	5901

C  CR856018.10	6017	CAACCTGACTGAATTGAAGCAAAGTATTGATCATAGGTGTTCCTGGGAGG	5968
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	5902	CAACTTGACTGAATTGAAGCAAAGTATTGATCATAGGTGTTCCTGGGAGG	5951

C  CR856018.10	5967	TTGTTGATAAAGGAGATTAACATTTGAGTCAGTGGACAGGGCTAGACAGA	5918
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
  CR856017.2	5952	TTGTTGATAAAGGAGATTAACATTTGAGTCAGTGGACAGGGCTAGGCAGA	6001

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	5867	GGATAAAAGCAGACAGAGGGCCGGGCGCGGTAGCTTACACCTGTCATCCC	5818
			|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
  CR856017.2	6052	GGATAAAAGCAGGCAGAGGGCCGGGCGCGGTGGCTTACACCCGTCATCCC	6101

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	5717	ATTAGCCAGGTGTGGTGGCACACGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGGGGC	5668
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
  CR856017.2	6202	ATTAGCCAGGTGTGGTGGCACACGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC	6251

C  CR856018.10	5667	TGAGGCAGGAGAATTGCTTTAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTAGTAAACCG	5618
			|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6252	TGAGGCAGGAGAATTGCTTTAACCTGGGGGGCGGAGGTTGTAGTAAACCG	6301

C  CR856018.10	5617	AGGTCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAACAAGACTCCATCTC	5568
			|||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6302	AGGTCGCACCACTGCACTCCAGCCT--G-GACAGAACAAGACTCCATCTC	6348

C  CR856018.10	5567	AAAATAATAATAATAATAAAAGCTGGGCGTGGTGGCTCACACCTGTCATC	5518
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
  CR856017.2	6349	AAAATAATAATAATAATAAAAGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTCATC	6398

C  CR856018.10	5517	CCAGCAGTTTGGAAGGCTGAGGCAGGCAGATCATGAGGTCAGGAGATTGA	5468
			||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
  CR856017.2	6399	CCAGCAGTTTGGAAGGCTGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATTGA	6448

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	5367	GCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCGGGAGGCCGAGGTTGCAGTGAGC	5318
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
  CR856017.2	6549	GCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGC	6598

C  CR856018.10	5317	CGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAACAATCCATC	5268
			|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
  CR856017.2	6599	CGAGATCGCGCCACCGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAACACTCCATC	6648

skip 200 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	5067	AGAGATGTTGGATCTGAGAGGCAGATCCCTCATGGTTTGGTGCTGATCTT	5018
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
  CR856017.2	6849	AGAGATGTTGGATCTGAGAGGCAGATCCCTCATGGTTTGGTGCTGGTCTT	6898

C  CR856018.10	5017	GCGGTAGTGAGTCAGTTCTCTCGGGATCTGGTTGTTTAAAGGCTGGGAGC	4968
			|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6899	GCAGTAGTGAGTCAGTTCTCTCGGGATCTGGTTGTTTAAAGGCTGGGAGC	6948

C  CR856018.10	4967	ACGGTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCG	4918
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
  CR856017.2	6949	ACGGTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCG	6998

C  CR856018.10	4917	GATCACCTGAGGTCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC	4868
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	6999	GATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC	7048

C  CR856018.10	4867	CCGGTCTCTACT-AAAAATACAAAAATCAGCTGGGCATGGTGGCAGGTGC	4819
			|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
  CR856017.2	7049	CCGGTCTCTACTAAAAAATACAAAAATCAGCTGTGCATGGTGGCAGGTGC	7098

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	4768	AGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCGGTCTCTACTAA	4719
			||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7149	AGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGTTGAAACCCGGTCTCTACTAA	7198

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	4668	TTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGAGACCA	4619
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
  CR856017.2	7249	TTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCAAGACCA	7298

skip 400 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	4218	CCTCACGGGGTAGATTGCCTGAGCTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACA	4169
			|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7699	CCTCACGGGGTAGATTGCCTGAGCACAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACA	7748

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	4118	GGTGGCGGGCACCTGTAATCGCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA	4069
			|||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
  CR856017.2	7799	GGTGGCAGGCACCTGTAATCGCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA	7848

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	3968	ACAAATTACCCAGCCTCAGATATTTCTTTATAGCAATGCAAGAATGGCAT	3919
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
  CR856017.2	7949	ACAAATTACCCAGCCTCAGATATTTCTTTATAGCAATGCAAGAAAGGCAT	7998

skip 250 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	3668	ATTGCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCTGGGAA	3619
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
  CR856017.2	8249	ATTGCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAATCTGGGAA	8298

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	3518	GGATATTTCTTTATAGCAATGCAAGAATGGACTAATGCACTGCGTGACTT	3469
			||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8399	GGATATTTCTTTATAGCAATGCAAGAATGAACTAATGCACTGCGTGACTT	8448

C  CR856018.10	3468	TGTCAAGCTTTTCCGGGAGCCTGAGTCTCTGGTTCTGTTCAATGAATCTT	3419
			||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8449	TGTCAAGCTTTTCCGGGAGCCTGAGTCTCCGGTTCTGTTCAATGAATCTT	8498

C  CR856018.10	3418	TATAGGTTTATAAGACTCAGTGACAGAAAGGTCCTAAAAGGGTTTTCAGG	3369
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
  CR856017.2	8499	TATAGGTTTATAAGACTCAGTGACAGAAAGGTCCTGAAAGGGTTTTCAGG	8548

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	3318	CCATGAAATTGTCCTGATGATCTGGTGTTTTTTCTCGATATGTGGTGAGG	3269
			|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8599	CCATGAAATTGTCCTGATGATCTGATGTTTTTTCTCGATATGTGGTGAGG	8648

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	3168	AAGCCTGGGATTTCGACTCGTCGCAGAGTACAGGGCAATGCTACCTAGCA	3119
			|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8749	AAGCCTGGGATTTCAACTCGTCGCAGAGTACAGGGCAATGCTACCTAGCA	8798

C  CR856018.10	3118	GAGAACACACCCCTGACCCACATGACTCATGAGTGTGGGACCCAGATGGC	3069
			|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8799	GAGAACACACCCCTGACCCACATGACTCGTGAGTGTGGGACCCAGATGGC	8848

C  CR856018.10	3068	CACAAAGACAAAAAACCTGTTTACGATTCACCTGAGCGTAGCACTTAACT	3019
			|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8849	CACAAAGACAGAAAACCTGTTTACGATTCACCTGAGCGTAGCACTTAACT	8898

C  CR856018.10	3018	CGGCTTACACATAAATACAAAGGATTGATTTTCCAGTCAAAAAAAAAAAA	2969
			||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	8899	CGGCTTACACATATATACAAAGGATTGATTTTCCAGTCAAAAAAAAAAAA	8948

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	2868	ACCAGGCCAGGGCGGCCTGTGATTGCCGTCGGCCACCCAGTCGTCTAATG	2819
			|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9049	ACCAGGCCGGGGCGGCCTGTGATTGCCGTCGGCCACCCAGTCGTCTAATG	9098

C  CR856018.10	2818	GGGTAGATGATGATCATATCATCTTGTGGATTCAACACATAGAGGCACGA	2769
			|||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9099	GGGTAGATGAT---CATGTCATCTTGTGGATTCAACACATAGAGGCACGA	9145

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	2668	GAGACGGAATTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACAATC	2619
			|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9246	GAGACGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACAATC	9295

skip 250 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	2368	CACATATATATATCTATATATATATTTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTT	2319
			||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| 
  CR856017.2	9546	CACATATATATATCTATATATAT-TTTTTTTT-AGTAGAGACGGGGTTTC	9593

C  CR856018.10	2318	GCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCACAGGTGATCCGCCC	2269
			 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9594	ACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCACAGGTGATCCGCCC	9643

C  CR856018.10	2268	GCCTCGGCCTCCCAAACTTCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCG	2219
			|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9644	GCCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCG	9693

skip 300 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	1918	TGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCTGGAGGTGGAGGTTGCA	1869
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	9994	TGGGGGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCTGGAGGTGGAGGTTGCA	10043

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	1818	TGTCTCAAAAAAATATATATCTATCTCTATCTATCTATCTATCTATATCC	1769
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | 
  CR856017.2	10094	TGTCTCAAAAAAATATATATCTATCTCTATCTATCTATCTATCTAT--C-	10140

C  CR856018.10	1768	TATATATCCATATATATATATACACATATATATACATATATATATACACA	1719
			|||    |  |||||       | | ||||||| ||||||||||||||||
  CR856017.2	10141	TAT----C--TATAT-------C-C-TATATATCCATATATATATACACA	10175

C  CR856018.10	1718	CACACATATATATATGCCAGACTCAGTAGCTTACACCTGTAATCCCAGTG	1669
			      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10176	------TATATATATGCCAGACTCAGTAGCTTACACCTGTAATCCCAGTG	10219

skip 450 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	1218	AGATTAGTGGTTGCCGTGGAATAGGGCCCGGGGAATGGGAGTGGCTGCTG	1169
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
  CR856017.2	10670	AGATTAGTGGTTGCCGTGGAATAGGGCCCGGGGAATGGTAGTGGCTGCTG	10719

C  CR856018.10	1168	TTGTATATGGCGTTTCTTTTGGGGTGATGAAAATGTTTTGGAACTCAAGA	1119
			|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10720	TTGTATATGGTGTTTCTTTTGGGGTGATGAAAATGTTTTGGAACTCAAGA	10769

skip 50 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	1068	ACACATTAAATGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTG	1019
			||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
  CR856017.2	10820	ACACATTAAATGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCTTG	10867

skip 100 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	918	TGGGATTACAGGCACGCACCACCATTCCCGGCTAATTTTTTTTTTTTGTA	869
			|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	10968	TGGGATTACAGGCATGCACCACCATTCCCGGCTAATTTTTTTTTTTTGTA	11017

skip 300 bps 100% identity alignment

C  CR856018.10	568	ACATGCCACCACATCTAATTGTTTTTTAATAGACATGAGGTCTCACTGTG	519
			||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CR856017.2	11318	ACATGCCACCACACCTAATTGTTTTTTAATAGACATGAGGTCTCACTGTG	11367

skip 518 bps 100% identity alignment

Overview

Query
CR856018.10 - 37323 bps
Hit
CR856017.2 - 39781 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 11952 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.3007011952111952-11118851
Short-link