<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL732635.7	1	GAATTCATGTTAAGCGCGAGTAAGCTATCTGTAGGCAACTATGTCTGTTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	26638	GAATTCATGTTAAGCGCGAGTAAGCTATCTGTAGGCAACTATGTCTGTTC	26687

AL732635.7	51	CTCCTGAGTTATGTGTTGTGAATAAAATATAGGATATAGTTATTCCATAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	26688	CTCCTGAGTTATGTGTTGTGAATAAAATATAGGATATAGTTATTCCATAA	26737

AL732635.7	101	AAAAATAAATAAATAAACTGACAGAAATGTAGTTAGAATTGTAGCTTAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	26738	AAAAATAAATAAATAAACTGACAGAAATGTAGTTAGAATTGTAGCTTAAA	26787

AL732635.7	151	GGTGCTGTATGTATGTTTTTGATTCTTCTTAAGCATAAAAATAACTTATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	26788	GGTGCTGTATGTATGTTTTTGATTCTTCTTAAGCATAAAAATAACTTATT	26837

AL732635.7	201	TTGTGGCCATGCATGGCCGTCTGCTTCCTATTGTTCCTTAAGGTCTGTCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	26838	TTGTGGCCATGCATGGCCGTCTGCTTCCTATTGTTCCTTAAGGTCTGTCC	26887

AL732635.7	251	AGTTTTCATAATATGAATTCCACATACTGTACATAGGGAAACTGTGTTTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	26888	AGTTTTCATAATATGAATTCCACATACTGTACATAGGGAAACTGTGTTTT	26937

AL732635.7	301	ATTTAGAAAAGGGGGACAAGATAATTGTTATAATCTCACTGGGAATTCAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	26938	ATTTAGAAAAGGGGGACAAGATAATTGTTATAATCTCACTGGGAATTCAT	26987

AL732635.7	351	GTCCCTAATCAAACGCTGCTAAGGGCATGCATATTGACTATCCTGTGTGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	26988	GTCCCTAATCAAACGCTGCTAAGGGCATGCATATTGACTATCCTGTGTGG	27037

AL732635.7	401	ATTGTCACAGTCTGTGTTTTGTTACACGTTGCCTGTTTTTCACTGGAACT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27038	ATTGTCACAGTCTGTGTTTTGTTACACGTTGCCTGTTTTTCACTGGAACT	27087

AL732635.7	451	GCATATGTATAATGTAGATTTATATCAGAATGAGGAAATTAAAATAAGGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27088	GCATATGTATAATGTAGATTTATATCAGAATGAGGAAATTAAAATAAGGT	27137

AL732635.7	501	GTTTGAGGATCAAAGTAGGTCTATGCCATTTCCATGTAGGCTCCTGAACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27138	GTTTGAGGATCAAAGTAGGTCTATGCCATTTCCATGTAGGCTCCTGAACT	27187

AL732635.7	551	CTCATCATTCAACCTCCAATTTTTTTTTTCTGTGGCACCTATAAAATTCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27188	CTCATCATTCAACCTCCAATTTTTTTTTTCTGTGGCACCTATAAAATTCC	27237

AL732635.7	601	TTTATTATAACTTAAATATAATTTTGCTTGTAATAGAAATATTAGGCAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27238	TTTATTATAACTTAAATATAATTTTGCTTGTAATAGAAATATTAGGCAAA	27287

AL732635.7	651	AAATAGGCTATTCTTGACAAGGAAACATGTAAAAGCAGATGTGAAGTTAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27288	AAATAGGCTATTCTTGACAAGGAAACATGTAAAAGCAGATGTGAAGTTAA	27337

AL732635.7	701	AATTTCCCAAGTCCCATATACAGTTGTATTATGTTATGCACTTGTGATCG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27338	AATTTCCCAAGTCCCATATACAGTTGTATTATGTTATGCACTTGTGATCG	27387

AL732635.7	751	AATACACAAAAACACTTATATGCAGTACCGCCGCTCCCTATACCCAGAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27388	AATACACAAAAACACTTATATGCAGTACCGCCGCTCCCTATACCCAGAGT	27437

AL732635.7	801	ATGCAGGTTGCGTAGGGCCTTAACTCCAGAGGTGGGCACCATCTCGGCTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27438	ATGCAGGTTGCGTAGGGCCTTAACTCCAGAGGTGGGCACCATCTCGGCTA	27487

AL732635.7	851	CTCAAAAAAAAAAAATATATATATATATATTTATTTACTAATATCAACAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27488	CTCAAAAAAAAAAAATATATATATATATATTTATTTACTAATATCAACAT	27537

AL732635.7	901	AAACTGAGTGTAAATAAAACAAATATTGATAATATGTTGTTAAATACATT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27538	AAACTGAGTGTAAATAAAACAAATATTGATAATATGTTGTTAAATACATT	27587

AL732635.7	951	TTAAAAAATCATTTTATAACGAACTTTTGTCACCATAGATTATAGTGCAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27588	TTAAAAAATCATTTTATAACGAACTTTTGTCACCATAGATTATAGTGCAA	27637

AL732635.7	1001	GTTAAATCTACATTTGGGTTGTAGTTTAGACACATTAGTCTTGACTAACC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27638	GTTAAATCTACATTTGGGTTGTAGTTTAGACACATTAGTCTTGACTAACC	27687

AL732635.7	1051	CATTGTTTTAATAGTAGGTCAAGTTTTTCTTTAAATGACTAGTTTCTTCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27688	CATTGTTTTAATAGTAGGTCAAGTTTTTCTTTAAATGACTAGTTTCTTCT	27737

AL732635.7	1101	GTGTTGTACATGGAGGTTTAATGCGGAAATTGGTCACAAAAGAAGATGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27738	GTGTTGTACATGGAGGTTTAATGCGGAAATTGGTCACAAAAGAAGATGAG	27787

AL732635.7	1151	GTGGCATGACCAGCACTGCTCCAGAGAGCTGCACAGGCATGACACAAGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27788	GTGGCATGACCAGCACTGCTCCAGAGAGCTGCACAGGCATGACACAAGAT	27837

AL732635.7	1201	GCAGCACTGAGGACAGTCCTTACAGAGAGAGTTTTATTTCTTACCTCTTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27838	GCAGCACTGAGGACAGTCCTTACAGAGAGAGTTTTATTTCTTACCTCTTG	27887

AL732635.7	1251	TAAATGTTTGAAATTAGGAATGTTTCTGCCGAACACGTCAGTGTTTTTAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27888	TAAATGTTTGAAATTAGGAATGTTTCTGCCGAACACGTCAGTGTTTTTAA	27937

AL732635.7	1301	GGTGAACTATTGTAATGTAAACATTTGAATGTTTAAGTTTAAATTTGAGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27938	GGTGAACTATTGTAATGTAAACATTTGAATGTTTAAGTTTAAATTTGAGT	27987

AL732635.7	1351	GTTTAAATGCAAATCTATGTATATAAATAAATACATGTTTAAATATATGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	27988	GTTTAAATGCAAATCTATGTATATAAATAAATACATGTTTAAATATATGT	28037

AL732635.7	1401	TTGTGTGATTTTGTTCCTCTGTGGGGGCAGCACAGTCAAATTTCGCATAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	28038	TTGTGTGATTTTGTTCCTCTGTGGGGGCAGCACAGTCAAATTTCGCATAG	28087

AL732635.7	1451	GGCACCCTTTTGGCCAGCAGCGGCCCTGCATTTGTAATGATAATCTAATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	28088	GGCACCCTTTTGGCCAGCAGCGGCCCTGCATTTGTAATGATAATCTAATT	28137

AL732635.7	1501	AAAGACAAGGCATATTTTAAAAAATTTTAACATATACAACAGATTTGGAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	28138	AAAGACAAGGCATATTTTAAAAAATTTTAACATATACAACAGATTTGGAC	28187

AL732635.7	1551	AGAAAAACACTTCCAATTGCGCTAACATGTAATTGAGTCATCAGTGTCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	28188	AGAAAAACACTTCCAATTGCGCTAACATGTAATTGAGTCATCAGTGTCTC	28237

AL732635.7	1601	TTTCATGTGGATTGAGTCCTCGCAAATGTCCAAATTTATGTTTACAATAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	28238	TTTCATGTGGATTGAGTCCTCGCAAATGTCCAAATTTATGTTTACAATAC	28287

AL732635.7	1651	ACCACAACATAGGGATTGCAACAGCATTTGTTTCACCGACTTAAACTCTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	28288	ACCACAACATAGGGATTGCAACAGCATTTGTTTCACCGACTTAAACTCTA	28337

AL732635.7	1701	TTGCTACAGATGTGTTACCATGCCAACAAGGTCATCAGTGTTAAAAGCAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	28338	TTGCTACAGATGTGTTACCATGCCAACAAGGTCATCAGTGTTAAAAGCAT	28387

AL732635.7	1751	CCGCGAGCAGCACTTTCATCGTGATTGACAAGTCAGGGTCAAAAAGTCAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	28388	CCGCGAGCAGCACTTTCATCGTGATTGACAAGTCAGGGTCAAAAAGTCAA	28437

AL732635.7	1801	TGTTATTATGTTATCAGGGGGGTTAATATAAATACCTCAACTCGACGGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	28438	TGTTATTATGTTATCAGGGGGGTTAATATAAATACCTCAACTCGACGGTG	28487

AL732635.7	1851	GAGGCAGACAGAACGGAAATCCTAATATCGTGCTGGTGCCACGGAGTGCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	28488	GAGGCAGACAGAACGGAAATCCTAATATCGTGCTGGTGCCACGGAGTGCT	28537

AL732635.7	1901	ATATAAGTTGTCCAAATGCATTTGTATCTTCACTGTTGGTCTATGGAGGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	28538	ATATAAGTTGTCCAAATGCATTTGTATCTTCACTGTTGGTCTATGGAGGT	28587

AL732635.7	1951	GATGCCACAGATGGTAGAATGAGAGAAGAGATAGTGAGAGAGAAAGGTAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855863.9	28588	GATGCCACAGATGGTAGAATGAGAGAAGAGATAGTGAGAGAGAAAGGTAG	28637

Overview

Query
AL732635.7 - 83703 bps
Hit
CR855863.9 - 28637 bps
Total alignments
9
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001934200012000126638286371
298.841833577235854112580126621
398.7736813577535855-112582126621
410037776706467140-112582126581
598.7736814151841598112582126621
610037776706567141112582126581
798.7536804151941598-112583126621
8100316428312894112583126461
9100316428312894-112593126561
Short-link