<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR855866.2	1	TGGGTGTGCATCCTTCCATCCAAAGGCAGATTTTGGGCAGGTCAGGTGAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102063	TGGGTGTGCATCCTTCCATCCAAAGGCAGATTTTGGGCAGGTCAGGTGAG	102112

CR855866.2	51	GACACTGCAGAACTGACCACTTCCCCACTATCTCACCCATCCCCAAAGCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102113	GACACTGCAGAACTGACCACTTCCCCACTATCTCACCCATCCCCAAAGCC	102162

CR855866.2	101	TTCAGCGTGAGTTTTATCTTTTGTAGGGTTTCACTGAAAAAGTGCGTTTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102163	TTCAGCGTGAGTTTTATCTTTTGTAGGGTTTCACTGAAAAAGTGCGTTTC	102212

CR855866.2	151	CTGTCCAAATGGGCCCTATAAGGAAAACAGGTTGCATTGTCTGCCCGCAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102213	CTGTCCAAATGGGCCCTATAAGGAAAACAGGTTGCATTGTCTGCCCGCAG	102262

CR855866.2	201	TGGGTGGATGTGGTTGTGCTTGGGGTGAATGCAGCACACTGCAGTCAGCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102263	TGGGTGGATGTGGTTGTGCTTGGGGTGAATGCAGCACACTGCAGTCAGCA	102312

CR855866.2	251	ATTAGGGATGGTTCTCCCCACACTTCCGGGAAATGCGGGTGAGAGCCTTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102313	ATTAGGGATGGTTCTCCCCACACTTCCGGGAAATGCGGGTGAGAGCCTTC	102362

CR855866.2	301	CTGTGGTGCGGGCTGGTGACTCACCTAGCCAGGCCACAGGCTGCTCTCGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102363	CTGTGGTGCGGGCTGGTGACTCACCTAGCCAGGCCACAGGCTGCTCTCGG	102412

CR855866.2	351	TCCTCACTCCTTTCCTCCTGTGCTCTTCTGTCATTAAGGAGAGGACTGCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102413	TCCTCACTCCTTTCCTCCTGTGCTCTTCTGTCATTAAGGAGAGGACTGCA	102462

CR855866.2	401	GCTCCCAGCTCACCAGGTCTGTGCACCTCGGAGGGCCCTCCAAAGCAGGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102463	GCTCCCAGCTCACCAGGTCTGTGCACCTCGGAGGGCCCTCCAAAGCAGGG	102512

CR855866.2	451	CAGGAGTGGACCCCTGCAGGTCATCTACTCTTTCCTCCTCTCCCAGCAGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102513	CAGGAGTGGACCCCTGCAGGTCATCTACTCTTTCCTCCTCTCCCAGCAGC	102562

CR855866.2	501	ATCAGATTGTCAGCACTGGGGATGCTGACACACAGAGTCCAATTTCCTGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102563	ATCAGATTGTCAGCACTGGGGATGCTGACACACAGAGTCCAATTTCCTGC	102612

CR855866.2	551	TGTCTTTGTCCACCTGAAGTGTGTTGGGAGAGGCAGCAGGTGCATACTGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102613	TGTCTTTGTCCACCTGAAGTGTGTTGGGAGAGGCAGCAGGTGCATACTGC	102662

CR855866.2	601	AAACCCATTCTTCAGTGAGCAATGTTCTGTCCCAGTAGTGGACGTGGTGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102663	AAACCCATTCTTCAGTGAGCAATGTTCTGTCCCAGTAGTGGACGTGGTGG	102712

CR855866.2	651	GGATGGGTAGATGGTTGGACTAGGCGATCTTAGTGGCCTTTTCCAATCCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102713	GGATGGGTAGATGGTTGGACTAGGCGATCTTAGTGGCCTTTTCCAATCCT	102762

CR855866.2	701	TCTGATTCTATGAATGTTTGTAATTTGGTGGCTTGTTGTGTGTAATGGAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102763	TCTGATTCTATGAATGTTTGTAATTTGGTGGCTTGTTGTGTGTAATGGAG	102812

CR855866.2	751	TGTACAGACACATGTCTGTGTTTGTGTATGTTAGGTGCCGTGGGAAATGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102813	TGTACAGACACATGTCTGTGTTTGTGTATGTTAGGTGCCGTGGGAAATGC	102862

CR855866.2	801	ACCCAACTGCATTTTTAGGTAGGACTGAGTGGGCATTTTCCAGGAACTGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102863	ACCCAACTGCATTTTTAGGTAGGACTGAGTGGGCATTTTCCAGGAACTGC	102912

CR855866.2	851	CTTAATAGATGAGCGCACCTCGTGCCTGCTGTTCCTGTCCGTACTTCCCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102913	CTTAATAGATGAGCGCACCTCGTGCCTGCTGTTCCTGTCCGTACTTCCCC	102962

CR855866.2	901	GACTGTTTCTGTTGACACCACTCTCAAGCCATGGGAGAGGTTTCACATGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	102963	GACTGTTTCTGTTGACACCACTCTCAAGCCATGGGAGAGGTTTCACATGG	103012

CR855866.2	951	GGCTGAAATTGCTGCTGGGGTGTGCAGTGAAACCTTTCTGTTTAGTCTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103013	GGCTGAAATTGCTGCTGGGGTGTGCAGTGAAACCTTTCTGTTTAGTCTGA	103062

CR855866.2	1001	TGTCACCGGGTTGTTTCCCAGGCAGCGTTCCCAATGGTGGAAAGCTAAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103063	TGTCACCGGGTTGTTTCCCAGGCAGCGTTCCCAATGGTGGAAAGCTAAAG	103112

CR855866.2	1051	CTAGGCAAAAGGGAGGAGGAATCCAATCAGATTATTCTATGGTTACAGTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103113	CTAGGCAAAAGGGAGGAGGAATCCAATCAGATTATTCTATGGTTACAGTC	103162

CR855866.2	1101	TTGTCTGAACAAATGTTTTCTTGCTGCCTTAATGCTTAGTCTGCCGTGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103163	TTGTCTGAACAAATGTTTTCTTGCTGCCTTAATGCTTAGTCTGCCGTGGG	103212

CR855866.2	1151	TGATAAAAATATTTACTAGTTTATTATAAACAGCTGAACCTACAGCCTAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103213	TGATAAAAATATTTACTAGTTTATTATAAACAGCTGAACCTACAGCCTAC	103262

CR855866.2	1201	ATAGTCACATTATTTAAAGATGAAAGCAAAGGGGATAAAAAAGTGAACAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103263	ATAGTCACATTATTTAAAGATGAAAGCAAAGGGGATAAAAAAGTGAACAT	103312

CR855866.2	1251	TTAAAGACTAAATTGCAGTTCTGGCTTCGAGGAGGATTCTGCTCCTATTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103313	TTAAAGACTAAATTGCAGTTCTGGCTTCGAGGAGGATTCTGCTCCTATTT	103362

CR855866.2	1301	ATATCCAGTACCTATAAACCCAGGGAGAGCTCCTGACTCACGCTGGGAGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103363	ATATCCAGTACCTATAAACCCAGGGAGAGCTCCTGACTCACGCTGGGAGC	103412

CR855866.2	1351	CGGGGCTGGGCCAGTGCAGCACTGAGGGCATACTGATGTGTACTTCTCAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103413	CGGGGCTGGGCCAGTGCAGCACTGAGGGCATACTGATGTGTACTTCTCAT	103462

CR855866.2	1401	TAACCCTCCCTCTAGGTTTGTTCCTGATTATGTTTTCCATCATCTCGATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103463	TAACCCTCCCTCTAGGTTTGTTCCTGATTATGTTTTCCATCATCTCGATT	103512

CR855866.2	1451	GAGTTCTTTGGATTGGAAGCAGTGGAGTCTGGATACCTGATGTCATATTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103513	GAGTTCTTTGGATTGGAAGCAGTGGAGTCTGGATACCTGATGTCATATTT	103562

CR855866.2	1501	TGGTGTCCTTCAGATGGTAAGTGAAGTGCCAAACTGCCGTCTGATGTGCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103563	TGGTGTCCTTCAGATGGTAAGTGAAGTGCCAAACTGCCGTCTGATGTGCA	103612

CR855866.2	1551	CCTTGCTACGTTTTTTACACATATTCTCCTAAATCCAGGCATCGTATTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103613	CCTTGCTACGTTTTTTACACATATTCTCCTAAATCCAGGCATCGTATTGA	103662

CR855866.2	1601	CACGCAGATCATAAACACACTCATAGCTCTGCTATGTGTAATTCAGCTTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103663	CACGCAGATCATAAACACACTCATAGCTCTGCTATGTGTAATTCAGCTTC	103712

CR855866.2	1651	AAAAAATTAAAGTGCCTCCAAATTAATTCTGTTCCTTGGAATGGAAAGCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103713	AAAAAATTAAAGTGCCTCCAAATTAATTCTGTTCCTTGGAATGGAAAGCA	103762

CR855866.2	1701	AGCAAAGTGAGCAGCATCTTGGAGACCTTCTCCCCTTATCCCCTCTTGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103763	AGCAAAGTGAGCAGCATCTTGGAGACCTTCTCCCCTTATCCCCTCTTGTG	103812

CR855866.2	1751	GATCTTAAAGCTGTGGAGCTAAGATTTCCAATGACTGGCATGTCATCCTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103813	GATCTTAAAGCTGTGGAGCTAAGATTTCCAATGACTGGCATGTCATCCTG	103862

CR855866.2	1801	ATTCCTGTAACAAAACTTACATTGAAGTTAACAGGCCTCAATTACAGGGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103863	ATTCCTGTAACAAAACTTACATTGAAGTTAACAGGCCTCAATTACAGGGT	103912

CR855866.2	1851	TTTCAGTTCTGTAGGTTAGCTCGTTTACATTTAGCTTAGTAGCACCTGTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103913	TTTCAGTTCTGTAGGTTAGCTCGTTTACATTTAGCTTAGTAGCACCTGTG	103962

CR855866.2	1901	CATTTGTGTAGGTAGATGCGCTTACTGGCATTTTTTGCAGATGCCCTGAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	103963	CATTTGTGTAGGTAGATGCGCTTACTGGCATTTTTTGCAGATGCCCTGAG	104012

CR855866.2	1951	TGTAGAGGAAGGACTCATTCCTTCTGTGGGGAAACTAGTGCAGCAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855371.13	104013	TGTAGAGGAAGGACTCATTCCTTCTGTGGGGAAACTAGTGCAGCAAGCTT	104062

Overview

Query
CR855866.2 - 3994 bps
Hit
CR855371.13 - 104062 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100199220001200011020631040621
Short-link