<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 973 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR855371.13	1	AAGCTTCTTGTTTCATTGGCACAGGATGGAAGCCAAGGCAGTGGGTCCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	111966	AAGCTTCTTGTTTCATTGGCACAGGATGGAAGCCAAGGCAGTGGGTCCCT	112015

CR855371.13	51	GCGCACCCAACCTCCCCCTGATCTGCAGACCACAGCACCTCATTCCCTCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112016	GCGCACCCAACCTCCCCCTGATCTGCAGACCACAGCACCTCATTCCCTCT	112065

CR855371.13	101	CTGAGTGAGGCTACAGGAGGCCGAGGATCACTTTAGAGAAACAGAATGCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112066	CTGAGTGAGGCTACAGGAGGCCGAGGATCACTTTAGAGAAACAGAATGCA	112115

CR855371.13	151	TTACTGAGTTGTTTTTTCCTCTTGTCCTAGATAGCTCACGGCCTTGCAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112116	TTACTGAGTTGTTTTTTCCTCTTGTCCTAGATAGCTCACGGCCTTGCAGG	112165

CR855371.13	201	CAAAATGGAAATGATTCCTTACCATGAGAGAGGAACAAAAAGGCCTTCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112166	CAAAATGGAAATGATTCCTTACCATGAGAGAGGAACAAAAAGGCCTTCTG	112215

CR855371.13	251	CCATAGTTATGTACTCATTGAGAGGTGATAGAGGGTATAACTTACGCGGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112216	CCATAGTTATGTACTCATTGAGAGGTGATAGAGGGTATAACTTACGCGGG	112265

CR855371.13	301	TACCGAGGAAGAATGTGCCAGCACTGAATCAACACCCATCTCCCATGCCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112266	TACCGAGGAAGAATGTGCCAGCACTGAATCAACACCCATCTCCCATGCCA	112315

CR855371.13	351	GCAAAAAACCACTCCCCAATGCCAGCACCCGCAATCCACTCGATATTTCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112316	GCAAAAAACCACTCCCCAATGCCAGCACCCGCAATCCACTCGATATTTCT	112365

CR855371.13	401	TGCTAGGACTCAGATCCAGCTGCCTCTAGGGCTGCAGGCAATTATGAACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112366	TGCTAGGACTCAGATCCAGCTGCCTCTAGGGCTGCAGGCAATTATGAACA	112415

CR855371.13	451	TGGTAGTTCCTCCCCTTTTTCTCTTAGCTGCAGAGATTTATAGATCAAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112416	TGGTAGTTCCTCCCCTTTTTCTCTTAGCTGCAGAGATTTATAGATCAAAA	112465

CR855371.13	501	TCAGTGTCTTTAATGTCTCACTCCATGACATACTGTTCATGTACAACCAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112466	TCAGTGTCTTTAATGTCTCACTCCATGACATACTGTTCATGTACAACCAG	112515

CR855371.13	551	ACGTTTTCTGCATTACTGGAGGTGCCCGGGGGCTTTAAAATTGCATCCCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112516	ACGTTTTCTGCATTACTGGAGGTGCCCGGGGGCTTTAAAATTGCATCCCA	112565

CR855371.13	601	AGTCAAACTCTGGGCAGATATACAGCCTGAAATGGCAGCAGTTGTACTAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112566	AGTCAAACTCTGGGCAGATATACAGCCTGAAATGGCAGCAGTTGTACTAT	112615

CR855371.13	651	GTGTGTGGCAGTGTCCACACACAAAGAGAAGCATTTTGCTCCCTCCTAGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112616	GTGTGTGGCAGTGTCCACACACAAAGAGAAGCATTTTGCTCCCTCCTAGC	112665

CR855371.13	701	CAAGTGCCAAGAAAGCCTTTTTTAATCCTCCTGTTTCAAGAATATCTAGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112666	CAAGTGCCAAGAAAGCCTTTTTTAATCCTCCTGTTTCAAGAATATCTAGT	112715

CR855371.13	751	GATAGCCTTATGTGCTGTAACTATTGCAATAGTAAATAGCAAAGAGCGGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112716	GATAGCCTTATGTGCTGTAACTATTGCAATAGTAAATAGCAAAGAGCGGA	112765

CR855371.13	801	AGAAAAAGATGCTGTTAATGGAAAGAGCCCAAGATTCTTCTGTAAACTCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112766	AGAAAAAGATGCTGTTAATGGAAAGAGCCCAAGATTCTTCTGTAAACTCT	112815

CR855371.13	851	TGTTTTTGCCATGCTCAGTGTAACATAAGAATGGGCAATCAGTGGATGGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112816	TGTTTTTGCCATGCTCAGTGTAACATAAGAATGGGCAATCAGTGGATGGT	112865

CR855371.13	901	GACATGGAGTAGTAAACTGACCAAGGAGATCAGCTACAAGAACCTGTCAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112866	GACATGGAGTAGTAAACTGACCAAGGAGATCAGCTACAAGAACCTGTCAA	112915

CR855371.13	951	TGTGCCCATTTTTTGGCAAGCTT	973
			|||||||||||||||||||||||
CR855369.3	112916	TGTGCCCATTTTTTGGCAAGCTT	112938

Overview

Query
CR855371.13 - 104062 bps
Hit
CR855369.3 - 112938 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 973 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link