<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX072582.6	1	AAGCTTCACTGAAAATACAGCTTCATCTTCACATACTCACGCCTTAACAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90115	AAGCTTCACTGAAAATACAGCTTCATCTTCACATACTCACGCCTTAACAC	90164

BX072582.6	51	TTTAAGGGGCCCTGTGGCTGTTATCAGCATGTCAGCAATATTTCACACGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90165	TTTAAGGGGCCCTGTGGCTGTTATCAGCATGTCAGCAATATTTCACACGT	90214

BX072582.6	101	GCAGGCCCGTTTTCTGATATGGGCGGTGACCTTAAAAGAGCACAACACTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90215	GCAGGCCCGTTTTCTGATATGGGCGGTGACCTTAAAAGAGCACAACACTG	90264

BX072582.6	151	AGCAGAGCTACAGCCTTTCCAAGAATGGACGGACAGACAGAAAAACCACC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90265	AGCAGAGCTACAGCCTTTCCAAGAATGGACGGACAGACAGAAAAACCACC	90314

BX072582.6	201	CGGCTTAAAAGAATAGTTCACCAAAAAAAGTGATAATTTACTAGTTGTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90315	CGGCTTAAAAGAATAGTTCACCAAAAAAAGTGATAATTTACTAGTTGTTT	90364

BX072582.6	251	ACTCTCCTCAAGTGGTTATAACACTTTATGAGTTTCATTCTTTTATTAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90365	ACTCTCCTCAAGTGGTTATAACACTTTATGAGTTTCATTCTTTTATTAAA	90414

BX072582.6	301	CACTAAATAGGATATTTTGGTCATTTTATAATAAGGTTCATTAGTTAATG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90415	CACTAAATAGGATATTTTGGTCATTTTATAATAAGGTTCATTAGTTAATG	90464

BX072582.6	351	TTACTTAATGCATTTACTAACATGAACAAACATTGAACAATACATTTACT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90465	TTACTTAATGCATTTACTAACATGAACAAACATTGAACAATACATTTACT	90514

BX072582.6	401	GCAGTATTTGTTCATGTTAGTTAACGTTAGTTAATGAAAATACAGTTGTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90515	GCAGTATTTGTTCATGTTAGTTAACGTTAGTTAATGAAAATACAGTTGTT	90564

BX072582.6	451	TTAACTCACGGTGCATTAACTAATGTTAAGAAGCATGAGTTTGGATGTTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90565	TTAACTCACGGTGCATTAACTAATGTTAAGAAGCATGAGTTTGGATGTTA	90614

BX072582.6	501	ATAATGCCTTAGTAAATGTTCAATTATGATTAATAAATGCTGTACAAGTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90615	ATAATGCCTTAGTAAATGTTCAATTATGATTAATAAATGCTGTACAAGTG	90664

BX072582.6	551	TTGTTCATGATTAGTTCATGTTAGTAAATGCATTAACTAATGAACCTTAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90665	TTGTTCATGATTAGTTCATGTTAGTAAATGCATTAACTAATGAACCTTAT	90714

BX072582.6	601	TGTAAAGTGTTACCGATATTTTGATGAAAGCTGGAAACCTGTAACCAATG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90715	TGTAAAGTGTTACCGATATTTTGATGAAAGCTGGAAACCTGTAACCAATG	90764

BX072582.6	651	ATTTCCAAAGTAGAATTCACAAATACTCGATGGTTACAGGTTTCCAGCTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90765	ATTTCCAAAGTAGAATTCACAAATACTCGATGGTTACAGGTTTCCAGCTT	90814

BX072582.6	701	TGTTCAAATTATCTTCCTTTGTGTTATATTAGAGATGTCAAATGTAGGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90815	TGTTCAAATTATCTTCCTTTGTGTTATATTAGAGATGTCAAATGTAGGGC	90864

BX072582.6	751	CTGCGGCCGAAGTTGGCCCGACCTTTGATTTGGCCCACTATCCCATTTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90865	CTGCGGCCGAAGTTGGCCCGACCTTTGATTTGGCCCACTATCCCATTTTT	90914

BX072582.6	801	TTTTAAAAAAGATACGGAGAATGATGAGGATGTGATTGGGGCGAATGCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90915	TTTTAAAAAAGATACGGAGAATGATGAGGATGTGATTGGGGCGAATGCCT	90964

BX072582.6	851	TGGACAATGACCTTCATTCTGAATTTAACATAACCTTTTGTTTCTTTGTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	90965	TGGACAATGACCTTCATTCTGAATTTAACATAACCTTTTGTTTCTTTGTT	91014

BX072582.6	901	TTATTGATGAGATACAAAAAAAAGAAATTTAATTATTATAATTAAATGTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91015	TTATTGATGAGATACAAAAAAAAGAAATTTAATTATTATAATTAAATGTT	91064

BX072582.6	951	ATTAATGAATCAGACTTTTTAAAAATGTAAATACTATCACTTGACAGACA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91065	ATTAATGAATCAGACTTTTTAAAAATGTAAATACTATCACTTGACAGACA	91114

BX072582.6	1001	GAGGAGTGCACAAGTCATCTGCAAGTAAATCAAGGTGAAGGCAGACGCAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91115	GAGGAGTGCACAAGTCATCTGCAAGTAAATCAAGGTGAAGGCAGACGCAG	91164

BX072582.6	1051	CTTAAGTAGTGTATTCAGCAATGAACTTTATTGTGTTATAAATGGGATTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91165	CTTAAGTAGTGTATTCAGCAATGAACTTTATTGTGTTATAAATGGGATTT	91214

BX072582.6	1101	GTTTATGCTTCTACAGTAATAAGTTCATTATGAAATGTTAAAAATGAAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91215	GTTTATGCTTCTACAGTAATAAGTTCATTATGAAATGTTAAAAATGAAAA	91264

BX072582.6	1151	TGGGTTAAATTAAATGTTGTAAAATGAATCAGACTTTTAACATTTAAATA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91265	TGGGTTAAATTAAATGTTGTAAAATGAATCAGACTTTTAACATTTAAATA	91314

BX072582.6	1201	CTGTCATCTGACCTCATTATAAAATATTCTGGGTAAGTTAATCGGATTTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91315	CTGTCATCTGACCTCATTATAAAATATTCTGGGTAAGTTAATCGGATTTA	91364

BX072582.6	1251	AAGCAACATTTTTTTTAAATATTATTGAATAAATTAGCAAATTCCCCTTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91365	AAGCAACATTTTTTTTAAATATTATTGAATAAATTAGCAAATTCCCCTTG	91414

BX072582.6	1301	GAAAATCTATTGCATTACGGTTTGCTGTATATTCAGCCCACAGCCCTCAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91415	GAAAATCTATTGCATTACGGTTTGCTGTATATTCAGCCCACAGCCCTCAA	91464

BX072582.6	1351	AAAAGATTGGTTTTTGGCCCTTTATAGGAAAAATTTGGGCACCCCTGTTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91465	AAAAGATTGGTTTTTGGCCCTTTATAGGAAAAATTTGGGCACCCCTGTTA	91514

BX072582.6	1401	TATATTATGAAGAAACACAATTAAAGTGAAGGGTGAGTAAATGATGACAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91515	TATATTATGAAGAAACACAATTAAAGTGAAGGGTGAGTAAATGATGACAG	91564

BX072582.6	1451	AATCTTTATTTTTTGAGCGACCTGTCCCTTTTATTATGGTTCAAACTTAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91565	AATCTTTATTTTTTGAGCGACCTGTCCCTTTTATTATGGTTCAAACTTAA	91614

BX072582.6	1501	TTGCAGCTGTGTGTGTCTGTCTGCCTGTGGTGTCTGTACATGTGTTTGTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91615	TTGCAGCTGTGTGTGTCTGTCTGCCTGTGGTGTCTGTACATGTGTTTGTG	91664

BX072582.6	1551	TGCATCTGTGTTGTGTGGGTAAATGCAATAGTGTTAAACTGTGACATCAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91665	TGCATCTGTGTTGTGTGGGTAAATGCAATAGTGTTAAACTGTGACATCAT	91714

BX072582.6	1601	TTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91715	TTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAT	91764

BX072582.6	1651	TTATTTATTTATTGTTTCCTCATAGATAAAAACAGCTTTTAAATAATACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91765	TTATTTATTTATTGTTTCCTCATAGATAAAAACAGCTTTTAAATAATACA	91814

BX072582.6	1701	GAATTAAGTGTTTGGAAATTCCGTATGTTTAAATGAAAGTTGTGTTTGGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91815	GAATTAAGTGTTTGGAAATTCCGTATGTTTAAATGAAAGTTGTGTTTGGG	91864

BX072582.6	1751	GATGGGGGTCAGGGTAGATGGACATAATATACAAAATATCTGTGTGATAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91865	GATGGGGGTCAGGGTAGATGGACATAATATACAAAATATCTGTGTGATAA	91914

BX072582.6	1801	TTGGTTCAACCCGTTGCAAACATTCTATTTTAATGCTTTCTTTTATTGTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91915	TTGGTTCAACCCGTTGCAAACATTCTATTTTAATGCTTTCTTTTATTGTA	91964

BX072582.6	1851	CTTTGTACTGTATATGACATACACTACAAAAAAACTTCCTGCCTTACATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	91965	CTTTGTACTGTATATGACATACACTACAAAAAAACTTCCTGCCTTACATT	92014

BX072582.6	1901	TTTTTGTTGAATCAAGTGAAGTTTTCTAGTCATTTCAACTTAAATCAGTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	92015	TTTTTGTTGAATCAAGTGAAGTTTTCTAGTCATTTCAACTTAAATCAGTC	92064

BX072582.6	1951	AAACTGACTAAAAATATTACCTTAAACTTTGAATAACTAAAAACATATTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848830.7	92065	AAACTGACTAAAAATATTACCTTAAACTTTGAATAACTAAAAACATATTT	92114

Overview

Query
BX072582.6 - 194918 bps
Hit
CR848830.7 - 92114 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001895200012000190115921141
279.2761193163729163921112487126791
395.9647987457574672131598316961
498.975198132290132387131598316941
597.844694173891173984131603316951
688.042023468289483239-145285456351
785.79178357106236106592-145286456371
888.818514670837228145286454281
981.321323472861028956145288456351
1090.831582326947869709-145290455181
1184.8992019143991639145294454971
1288.891292049551995722145294455001
1387.471923444781448157145301456351
1493.966826933369414-145553456341
1594.126985136390136474-145553456371
1693.516077194096194172-145561456371
178847759171491788145561456351
1892.1946648583285895-158751588141
1983.38293773161534162306-178062788131
2088.89263442158343158784-179136795671
2191.49518737190857191593181026817421
2293.26375478191626192103181740822141
Short-link