<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759956.2	1	GGCCAGGATGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCTGCCCACCTCGGCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	26528	GGCCAGGATGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCTGCCCACCTCGGCCT	26577

CR759956.2	51	CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCAGCCACACGAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	26578	CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCAGCCACACGAC	26627

CR759956.2	101	CCTTTCTAAGGAAGTGAAGATGGCACATGGAGACCAAGTACAGAAAGGAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	26628	CCTTTCTAAGGAAGTGAAGATGGCACATGGAGACCAAGTACAGAAAGGAC	26677

CR759956.2	151	TACTGGGGGTCTTGGATGGCCCTCCAATGCTGTTGTCTCTCCAGTTCCTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	26678	TACTGGGGGTCTTGGATGGCCCTCCAATGCTGTTGTCTCTCCAGTTCCTC	26727

CR759956.2	201	TTGGATAATTCTGGTGTCCATGAATTATTATGTTGCCACATTTGGATGCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	26728	TTGGATAATTCTGGTGTCCATGAATTATTATGTTGCCACATTTGGATGCC	26777

CR759956.2	251	CCATAAGGGTCACTTGAGAAAATCATGAAATCTGGGAAAGGAAGGGCAAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	26778	CCATAAGGGTCACTTGAGAAAATCATGAAATCTGGGAAAGGAAGGGCAAG	26827

CR759956.2	301	TCATAGAATCCTGCCACTATAGAATAATGTCTGACAACCAAGTGATACAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	26828	TCATAGAATCCTGCCACTATAGAATAATGTCTGACAACCAAGTGATACAT	26877

CR759956.2	351	TCTGTTTAAGTAGGCACCAAACTGTCGGCAAAAGCCCCATTTTCGAGTTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	26878	TCTGTTTAAGTAGGCACCAAACTGTCGGCAAAAGCCCCATTTTCGAGTTG	26927

CR759956.2	401	GCCAGTTCTGGCAATTTTCTGTGTCCATTCTGCATGCCACTCAACTCCTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	26928	GCCAGTTCTGGCAATTTTCTGTGTCCATTCTGCATGCCACTCAACTCCTC	26977

CR759956.2	451	TAATGAATTCTTATTCCTTTTCAAGCCTTCTGTATTCCTTCTTATCATAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	26978	TAATGAATTCTTATTCCTTTTCAAGCCTTCTGTATTCCTTCTTATCATAC	27027

CR759956.2	501	TGGACACTTTGACCTCTGGTGTCCTAGAACTCCTGCTTCCCATGACTTCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27028	TGGACACTTTGACCTCTGGTGTCCTAGAACTCCTGCTTCCCATGACTTCC	27077

CR759956.2	551	ATCTCCAATTCCAATAAACACCTTCTTTTTAAAAATTTCCTGATATTACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27078	ATCTCCAATTCCAATAAACACCTTCTTTTTAAAAATTTCCTGATATTACC	27127

CR759956.2	601	CAGTAGCTCTCATCCCTATTTCCCTTTGAAGTACTCATGTTTTTTATGAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27128	CAGTAGCTCTCATCCCTATTTCCCTTTGAAGTACTCATGTTTTTTATGAT	27177

CR759956.2	651	CCCTTCTCCCAACACTTTTCTTGCCTTCAATGTATTTTTAATGACTGGTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27178	CCCTTCTCCCAACACTTTTCTTGCCTTCAATGTATTTTTAATGACTGGTG	27227

CR759956.2	701	ACCTCTTACCTCTCCTTCTTTTACTTTAACCTCTAACTTCTCCTAATCAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27228	ACCTCTTACCTCTCCTTCTTTTACTTTAACCTCTAACTTCTCCTAATCAA	27277

CR759956.2	751	TATGCCTTAAAACTCTTTCAGTGAAGGCAAAATGATGAAGAAAGTAGAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27278	TATGCCTTAAAACTCTTTCAGTGAAGGCAAAATGATGAAGAAAGTAGAAA	27327

CR759956.2	801	TATCAGTGGTTTCCAGAGGTTACAGCAGGAGTATGGGGTCAGAGAAGGAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27328	TATCAGTGGTTTCCAGAGGTTACAGCAGGAGTATGGGGTCAGAGAAGGAA	27377

CR759956.2	851	TGATGAATAGAAAGCACAGAGAACCTTGGGGCAGTCACACTATTCTGTAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27378	TGATGAATAGAAAGCACAGAGAACCTTGGGGCAGTCACACTATTCTGTAT	27427

CR759956.2	901	GTACTAGGATTCACTTGTCCAAACACATAGAATATATAGTACCAAGAGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27428	GTACTAGGATTCACTTGTCCAAACACATAGAATATATAGTACCAAGAGTG	27477

CR759956.2	951	AGTCCTGAAGTAAACAATGGACGTTGGGTGATAATGATATGTCAGTGTAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27478	AGTCCTGAAGTAAACAATGGACGTTGGGTGATAATGATATGTCAGTGTAA	27527

CR759956.2	1001	GTTTATCAGTTATAACAAATTACCACTCTAATATGGGATGTTGTTAGTAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27528	GTTTATCAGTTATAACAAATTACCACTCTAATATGGGATGTTGTTAGTAG	27577

CR759956.2	1051	GAGAGTCCACCTAGGGAGGAAGGGCAGGAGGTATACAGAAAACCTCTCTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27578	GAGAGTCCACCTAGGGAGGAAGGGCAGGAGGTATACAGAAAACCTCTCTA	27627

CR759956.2	1101	CTCTCTGTTCAGTTTTACTATTTAAAGAAAAGGAAAGAAGAAGAAAACTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27628	CTCTCTGTTCAGTTTTACTATTTAAAGAAAAGGAAAGAAGAAGAAAACTT	27677

CR759956.2	1151	CAAATACCTCCCTATAATCCTATACTAAATGATACTCTAGCTATCTTGCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27678	CAAATACCTCCCTATAATCCTATACTAAATGATACTCTAGCTATCTTGCC	27727

CR759956.2	1201	CCCTCTTAATTACCAGAAGTTTCTAATCTCTACATATGTTAAGTACTCAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27728	CCCTCTTAATTACCAGAAGTTTCTAATCTCTACATATGTTAAGTACTCAA	27777

CR759956.2	1251	AAAATATTTCAAAAAATCAAATATCAAAAATAAATTACTCAAGCTACGTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27778	AAAATATTTCAAAAAATCAAATATCAAAAATAAATTACTCAAGCTACGTC	27827

CR759956.2	1301	TCACAAAAAAGTATCTTTCTTTCCCAGTTATGATTTTTCTTCCTTCTTCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27828	TCACAAAAAAGTATCTTTCTTTCCCAGTTATGATTTTTCTTCCTTCTTCT	27877

CR759956.2	1351	GATATCCTCACAACTGAACATTTCCTTCGAATACACCCACCCACCCATAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27878	GATATCCTCACAACTGAACATTTCCTTCGAATACACCCACCCACCCATAA	27927

CR759956.2	1401	ATGACCAATCTTTCTCTTTTTTTTGTTGTTTTGGAGATGGAGTCTCGCTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27928	ATGACCAATCTTTCTCTTTTTTTTGTTGTTTTGGAGATGGAGTCTCGCTC	27977

CR759956.2	1451	TGACTCCCAGGCTGGAGTTCAGTGGCATGATCTCGGCTCAATGCAACCTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	27978	TGACTCCCAGGCTGGAGTTCAGTGGCATGATCTCGGCTCAATGCAACCTC	28027

CR759956.2	1501	CACCTCCCAGGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	28028	CACCTCCCAGGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGG	28077

CR759956.2	1551	GACTACAGGCATGCACCACCACGTCCAGCCAATTTTTGTATCTTTAGTAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	28078	GACTACAGGCATGCACCACCACGTCCAGCCAATTTTTGTATCTTTAGTAG	28127

CR759956.2	1601	AGATGGGGTTTTTCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	28128	AGATGGGGTTTTTCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCA	28177

CR759956.2	1651	GGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGTATTACAAGCCTGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	28178	GGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGTATTACAAGCCTGAG	28227

CR759956.2	1701	TCACCGTGCCCGGCCCAAATGACCATCTTTCTTACCACTCATCCACAAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	28228	TCACCGTGCCCGGCCCAAATGACCATCTTTCTTACCACTCATCCACAAAG	28277

CR759956.2	1751	CTCACAAAACGAGAAGCTGCTCAAAACACTGAGATGCCCCTCTAGGCTGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	28278	CTCACAAAACGAGAAGCTGCTCAAAACACTGAGATGCCCCTCTAGGCTGG	28327

CR759956.2	1801	TAACAGCGTGACTTAGAACAAGTCCTCCAACTTTTCTAGCTTTCTCACCG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	28328	TAACAGCGTGACTTAGAACAAGTCCTCCAACTTTTCTAGCTTTCTCACCG	28377

CR759956.2	1851	AAAAATGGGCCTGTGGCAGCACAGTTTTATGAGTAACTAAGATATGGGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	28378	AAAAATGGGCCTGTGGCAGCACAGTTTTATGAGTAACTAAGATATGGGAT	28427

CR759956.2	1901	GTAGAAAGACCCTAGAAGAGGAAAAAAAACACAACAATGGTCATTGTTAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	28428	GTAGAAAGACCCTAGAAGAGGAAAAAAAACACAACAATGGTCATTGTTAA	28477

CR759956.2	1951	AACAGGGGACTACATTTGTCCTTGGTTCCACCACTGTCCCACAGCCCCAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848056.4	28478	AACAGGGGACTACATTTGTCCTTGGTTCCACCACTGTCCCACAGCCCCAG	28527

Overview

Query
CR759956.2 - 81080 bps
Hit
CR848056.4 - 28527 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link