<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 4057 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX321919.10	159439	AAGCTTTTGTAAGAATTGCAACTTCTCATATCATACAACCCTAGAAACAT	159488
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1	AAGCTTTTGTAAGAATTGCAACTTCTCATATCATACAACCCTAGAAACAT	50

BX321919.10	159489	CCAATACACCAAAACTAGGAGATGTCAATCTATTAATCACTTCCATTTAA	159538
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	51	CCAATACACCAAAACTAGGAGATGTCAATCTATTAATCACTTCCATTTAA	100

BX321919.10	159539	ACTGTCCTCCACAGAAATGCCATCATTAGTCTATCGCGGAAAATATCTCA	159588
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	101	ACTGTCCTCCACAGAAATGCCATCATTAGTCTATCGCGGAAAATATCTCA	150

BX321919.10	159589	AAATACCAGCAAGATTCTCTTCAAGCCAAGTTAGATCACATGACAAGCTG	159638
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	151	AAATACCAGCAAGATTCTCTTCAAGCCAAGTTAGATCACATGACAAGCTG	200

BX321919.10	159639	ATGGAAAATGCATGCTAATAAAAGCTGCTAAAAAGGCTTTGCTCCTTGAC	159688
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	201	ATGGAAAATGCATGCTAATAAAAGCTGCTAAAAAGGCTTTGCTCCTTGAC	250

BX321919.10	159689	CGCTGACACTTTCTGGCACCACATTGACACACTCCAGCAACAACGTGTAG	159738
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	251	CGCTGACACTTTCTGGCACCACATTGACACACTCCAGCAACAACGTGTAG	300

BX321919.10	159739	AGTCAGTGGCAGTGGATTTAATGACTTGAGTACAGTGTGCTGACAGTGCA	159788
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	301	AGTCAGTGGCAGTGGATTTAATGACTTGAGTACAGTGTGCTGACAGTGCA	350

BX321919.10	159789	GGTGTTTGGCCAGCTCTGATGTGCAGTGACTCGATTTAGCAATACGGCTC	159838
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	351	GGTGTTTGGCCAGCTCTGATGTGCAGTGACTCGATTTAGCAATACGGCTC	400

BX321919.10	159839	TTATTTCTAACACCCAGTTCAACAGCCAAAAGACTATCAGTTGGCTTATT	159888
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	401	TTATTTCTAACACCCAGTTCAACAGCCAAAAGACTATCAGTTGGCTTATT	450

BX321919.10	159889	TCTAAATGGGTCAGACAGGCTACTGTACCTACTGCCATTTCAATTTGAAC	159938
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	451	TCTAAATGGGTCAGACAGGCTACTGTACCTACTGCCATTTCAATTTGAAC	500

BX321919.10	159939	CATCCGGGTTCACTGATAAACGGTTATGCCAGCCTTTTTCTTATTTTCAA	159988
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	501	CATCCGGGTTCACTGATAAACGGTTATGCCAGCCTTTTTCTTATTTTCAA	550

BX321919.10	159989	ATTCTGTCAGACAGATCAAATAGCTGAAGCAGAGCAACTGTCAACTGACA	160038
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	551	ATTCTGTCAGACAGATCAAATAGCTGAAGCAGAGCAACTGTCAACTGACA	600

BX321919.10	160039	ACAGTAGTTTTCAATGTATATTCTTTATACTTAATAGAATTTACAAAAAA	160088
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	601	ACAGTAGTTTTCAATGTATATTCTTTATACTTAATAGAATTTACAAAAAA	650

BX321919.10	160089	CAAACCAGCTTATTTATGCACTAGCTTGTTTTAAAAGGTACTGGGTTATC	160138
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	651	CAAACCAGCTTATTTATGCACTAGCTTGTTTTAAAAGGTACTGGGTTATC	700

BX321919.10	160139	AGATACATATATTCAAAAAGGTTGCTATTTTAATACTTCCAACTAATTGT	160188
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	701	AGATACATATATTCAAAAAGGTTGCTATTTTAATACTTCCAACTAATTGT	750

BX321919.10	160189	GCAAAGCAATTACAAATTCAAGGAGAAACAGAACAGGTCCATGTCCGAAT	160238
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	751	GCAAAGCAATTACAAATTCAAGGAGAAACAGAACAGGTCCATGTCCGAAT	800

BX321919.10	160239	TAAGAAGTTTGCATCACCTGCAAAACATGTCAGCCTGCTTTTCTTCCCAG	160288
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	801	TAAGAAGTTTGCATCACCTGCAAAACATGTCAGCCTGCTTTTCTTCCCAG	850

BX321919.10	160289	ACTATTGTCTGAGATCTTAAATGGTTTTAACTAACATGTTACATACACGC	160338
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	851	ACTATTGTCTGAGATCTTAAATGGTTTTAACTAACATGTTACATACACGC	900

BX321919.10	160339	AGACAAGCTCTTACATGTTAGAGGTAAAAAGTTTAGCTATGTTTCGAACA	160388
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	901	AGACAAGCTCTTACATGTTAGAGGTAAAAAGTTTAGCTATGTTTCGAACA	950

BX321919.10	160389	GAATTAAATCTAGGTACAAACTGAATTTAGAACCACACTGGATGTAAAAA	160438
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	951	GAATTAAATCTAGGTACAAACTGAATTTAGAACCACACTGGATGTAAAAA	1000

BX321919.10	160439	CCTGACAATTAAACTTTATGTAACTCATATTTAAAGCAAACTATAAATTT	160488
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1001	CCTGACAATTAAACTTTATGTAACTCATATTTAAAGCAAACTATAAATTT	1050

BX321919.10	160489	TGTATTGGAAAAGCTTTGTTTAATAACAAACAAAAAAGACAGAATGGACA	160538
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1051	TGTATTGGAAAAGCTTTGTTTAATAACAAACAAAAAAGACAGAATGGACA	1100

BX321919.10	160539	AAAACAGAATGATAATAGATAAAATTATATATAAAACAATAGAGAGATTG	160588
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1101	AAAACAGAATGATAATAGATAAAATTATATATAAAACAATAGAGAGATTG	1150

BX321919.10	160589	AACATTTGAACAATAGAACAGTAGATAGAATGATAGAGCATTAGATAGAA	160638
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1151	AACATTTGAACAATAGAACAGTAGATAGAATGATAGAGCATTAGATAGAA	1200

BX321919.10	160639	ACATAGACAGAATGATAGAAACAGAGTGATTTACAGAAAGAAAGAACCTA	160688
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1201	ACATAGACAGAATGATAGAAACAGAGTGATTTACAGAAAGAAAGAACCTA	1250

BX321919.10	160689	AAATGAAAAAGAAACATAAAATGATTCACAGAAAGAACCATAGATAGAAA	160738
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1251	AAATGAAAAAGAAACATAAAATGATTCACAGAAAGAACCATAGATAGAAA	1300

BX321919.10	160739	CAACAATTTACAGAAAAATATAATGATAGATAGAAAGATAAACAGGTACA	160788
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1301	CAACAATTTACAGAAAAATATAATGATAGATAGAAAGATAAACAGGTACA	1350

BX321919.10	160789	GAAATAGATAAAACGCTAGATAGAAAGAATAATAGAACACTAGATAGAAA	160838
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1351	GAAATAGATAAAACGCTAGATAGAAAGAATAATAGAACACTAGATAGAAA	1400

BX321919.10	160839	GCAAGAACACTATGGAATGCTAGAACTGTAGATGGAGCGCTAGATAGAAC	160888
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1401	GCAAGAACACTATGGAATGCTAGAACTGTAGATGGAGCGCTAGATAGAAC	1450

BX321919.10	160889	ACTAGATAAAATGCTAGAACCGTACAACACTAGATAGAACACTGGAATGC	160938
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1451	ACTAGATAAAATGCTAGAACCGTACAACACTAGATAGAACACTGGAATGC	1500

BX321919.10	160939	TAGATGGAACGCAGATAGAACATTAGAACGCAAGAACGCTAGATGGAATG	160988
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1501	TAGATGGAACGCAGATAGAACATTAGAACGCAAGAACGCTAGATGGAATG	1550

BX321919.10	160989	CTAGTTAGAATGTTAGATAAAATGCTAGAACGCTAGATGGAACGTTAGAA	161038
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1551	CTAGTTAGAATGTTAGATAAAATGCTAGAACGCTAGATGGAACGTTAGAA	1600

BX321919.10	161039	CACAAGATAGAATGCTCGAACACTAGATAGAATGCTAGAAAGAACGCAAG	161088
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1601	CACAAGATAGAATGCTCGAACACTAGATAGAATGCTAGAAAGAACGCAAG	1650

BX321919.10	161089	ATAAAAAGCTAGATGAAATGCTAGAGCACAGATAGAACGTTAGAATGCTA	161138
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1651	ATAAAAAGCTAGATGAAATGCTAGAGCACAGATAGAACGTTAGAATGCTA	1700

BX321919.10	161139	AATGGAACGCTAGATAAAATGCTAGCTAAAACACTAAAAGACTAGATGGA	161188
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1701	AATGGAACGCTAGATAAAATGCTAGCTAAAACACTAAAAGACTAGATGGA	1750

BX321919.10	161189	ACGTTAGAACACTAGATAGAACACTATAAAGAACGCTAAATAAAAAGCTA	161238
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1751	ACGTTAGAACACTAGATAGAACACTATAAAGAACGCTAAATAAAAAGCTA	1800

BX321919.10	161239	GAACATTAGATGAAACGCTAGATAGAATGCTAGAACTCTAGAATGCTAGA	161288
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1801	GAACATTAGATGAAACGCTAGATAGAATGCTAGAACTCTAGAATGCTAGA	1850

BX321919.10	161289	ACTCTAGATGGAACACTAAAACACTAGATAGAATGCTAGAACGCAGATAT	161338
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1851	ACTCTAGATGGAACACTAAAACACTAGATAGAATGCTAGAACGCAGATAT	1900

BX321919.10	161339	AATGTTAGAAAGCTAAATGGAATGCTAGATAGAATGCTAGAAAGATGGTT	161388
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1901	AATGTTAGAAAGCTAAATGGAATGCTAGATAGAATGCTAGAAAGATGGTT	1950

BX321919.10	161389	AGAATGCTACAAAGAATGCTAGAACGCTAAATGAAACATAAGACTGCTAG	161438
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	1951	AGAATGCTACAAAGAATGCTAGAACGCTAAATGAAACATAAGACTGCTAG	2000

BX321919.10	161439	ATAGAACGCTAGATAGAATGCTAGAACGTTAGACAGACAGACAGACAGAC	161488
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2001	ATAGAACGCTAGATAGAATGCTAGAACGTTAGACAGACAGACAGACAGAC	2050

BX321919.10	161489	AGACAGACAGACAGAAATGCAGATTGAAAAGATGAAAATGGCCATAAAGA	161538
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2051	AGACAGACAGACAGAAATGCAGATTGAAAAGATGAAAATGGCCATAAAGA	2100

BX321919.10	161539	ACAATAGATGGAAATAACTGAAAAAATTAAAACATTAAAAAAAATGACAG	161588
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2101	ACAATAGATGGAAATAACTGAAAAAATTAAAACATTAAAAAAAATGACAG	2150

BX321919.10	161589	AATGAGGAAAAGAATGAATGATTGAATAAAAGATGTGCTAAAAGCCACAA	161638
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2151	AATGAGGAAAAGAATGAATGATTGAATAAAAGATGTGCTAAAAGCCACAA	2200

BX321919.10	161639	AAGGTTAAACTAATTGAGTTTAACTAACTAAAAGCACATTTTTTAACCTG	161688
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2201	AAGGTTAAACTAATTGAGTTTAACTAACTAAAAGCACATTTTTTAACCTG	2250

BX321919.10	161689	TTGAAGGTCCACATGAATCTAAAAGCTAATATTTTTGGGCCCCAGAGTAA	161738
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2251	TTGAAGGTCCACATGAATCTAAAAGCTAATATTTTTGGGCCCCAGAGTAA	2300

BX321919.10	161739	AGCAGGACTCTCTGTGACCATCACACTGTGTTTAGTCTTTCTGAGAGGGG	161788
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2301	AGCAGGACTCTCTGTGACCATCACACTGTGTTTAGTCTTTCTGAGAGGGG	2350

BX321919.10	161789	AGCTTCAGCACTAAATCAACATGCAGGAGGGCCAAAAATATCATGCCTAA	161838
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2351	AGCTTCAGCACTAAATCAACATGCAGGAGGGCCAAAAATATCATGCCTAA	2400

BX321919.10	161839	ATTTGGTAGGATCAAAAAACCTTGCTGCTAAACTTGTTGTTCTGTTATTA	161888
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2401	ATTTGGTAGGATCAAAAAACCTTGCTGCTAAACTTGTTGTTCTGTTATTA	2450

BX321919.10	161889	CTTAGGGTAAGAAATCTGTATATAGTCAAACAAAGAAACTGACCTGCAGC	161938
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2451	CTTAGGGTAAGAAATCTGTATATAGTCAAACAAAGAAACTGACCTGCAGC	2500

BX321919.10	161939	CTGCCACAAATACAGCTTGCAGTCGATATCTATTAACATTAATGAACTCA	161988
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2501	CTGCCACAAATACAGCTTGCAGTCGATATCTATTAACATTAATGAACTCA	2550

BX321919.10	161989	ACTAATCCTGCCTTCGATAATAATGGCTACTTAAAAGCTAATGCACTTAT	162038
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2551	ACTAATCCTGCCTTCGATAATAATGGCTACTTAAAAGCTAATGCACTTAT	2600

BX321919.10	162039	TAAACTGGCCAAACAGGTCTTTGCTATGCATGGCACAGGGCCTTTACATC	162088
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2601	TAAACTGGCCAAACAGGTCTTTGCTATGCATGGCACAGGGCCTTTACATC	2650

BX321919.10	162089	TTGTGAGATCCTGGTAAGAGCTAATGTGGGACAGGAATTGCCCCACCTGA	162138
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2651	TTGTGAGATCCTGGTAAGAGCTAATGTGGGACAGGAATTGCCCCACCTGA	2700

BX321919.10	162139	TCCCGTCTCATCATGTGACAGTAGAGTGAAAAAAAAAACTGCGAGACTGC	162188
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2701	TCCCGTCTCATCATGTGACAGTAGAGTGAAAAAAAAAACTGCGAGACTGC	2750

BX321919.10	162189	AGGAAACAGAGCTGTCTAAGTCTAAAAGGGCATCCTGTACAGCTATTTAA	162238
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2751	AGGAAACAGAGCTGTCTAAGTCTAAAAGGGCATCCTGTACAGCTATTTAA	2800

BX321919.10	162239	ACAAAAAAATACAAGTCTTTCATTAGAACGTTAAAACATTACTGTAAACC	162288
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2801	ACAAAAAAATACAAGTCTTTCATTAGAACGTTAAAACATTACTGTAAACC	2850

BX321919.10	162289	TAATGAGCCATAATGTCAGGTCTATTGTACAGGATTTCCAGGTAAAACAA	162338
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2851	TAATGAGCCATAATGTCAGGTCTATTGTACAGGATTTCCAGGTAAAACAA	2900

BX321919.10	162339	TAAGAGTAGAGAACAAAGAGTTTAGAGCCAAGAAGGCCAAGAACAATATT	162388
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2901	TAAGAGTAGAGAACAAAGAGTTTAGAGCCAAGAAGGCCAAGAACAATATT	2950

BX321919.10	162389	GAAAAATATATTCCATATTTGTGCATTAAATAATAACTTTGGTGCTTAAG	162438
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	2951	GAAAAATATATTCCATATTTGTGCATTAAATAATAACTTTGGTGCTTAAG	3000

BX321919.10	162439	GAACATGGTAACATCAAACACTGATCATAAGAATCATGAATGAAAACACT	162488
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3001	GAACATGGTAACATCAAACACTGATCATAAGAATCATGAATGAAAACACT	3050

BX321919.10	162489	CAAAACTAAATATGGACAATATTAAAAACAGTGCGTCCACAAAATATTAG	162538
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3051	CAAAACTAAATATGGACAATATTAAAAACAGTGCGTCCACAAAATATTAG	3100

BX321919.10	162539	GACCCTACTTAAAAAAAATCACAGCCATTTCATTGTATGAAAAACAGTAT	162588
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3101	GACCCTACTTAAAAAAAATCACAGCCATTTCATTGTATGAAAAACAGTAT	3150

BX321919.10	162589	ATGTCATTCATTCTCTTTTGGCTTAGTCACTCTATTAATGGGGTTGCCAC	162638
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3151	ATGTCATTCATTCTCTTTTGGCTTAGTCACTCTATTAATGGGGTTGCCAC	3200

BX321919.10	162639	AGCGGAATGAACCGCCGACTTGTCCAGCATATGTTTTATACAGCGGAAGT	162688
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3201	AGCGGAATGAACCGCCGACTTGTCCAGCATATGTTTTATACAGCGGAAGT	3250

BX321919.10	162689	ACTTCCAGCTACAACCTAGTACTGGAAAGCACACTCATACATTACGGCCA	162738
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3251	ACTTCCAGCTACAACCTAGTACTGGAAAGCACACTCATACATTACGGCCA	3300

BX321919.10	162739	ATTTAGTTTAATCAATTCACCTGTATCGCATGTCTTTGGACTGTGGGGGA	162788
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3301	ATTTAGTTTAATCAATTCACCTGTATCGCATGTCTTTGGACTGTGGGGGA	3350

BX321919.10	162789	ATCCGCAGAACAAAAGGAAACCCATGTGAACACAGTGAGAACATGCAAAC	162838
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3351	ATCCGCAGAACAAAAGGAAACCCATGTGAACACAGTGAGAACATGCAAAC	3400

BX321919.10	162839	TCCACAAAAAATGTCAACTGACCCAGTCAGGACTTGGACCAGTGACCCTC	162888
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3401	TCCACAAAAAATGTCAACTGACCCAGTCAGGACTTGGACCAGTGACCCTC	3450

BX321919.10	162889	TTGCTTTGAGGTGACAGTGCTAACCACTGAGCCACCATGTCGCACTAAAA	162938
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3451	TTGCTTTGAGGTGACAGTGCTAACCACTGAGCCACCATGTCGCACTAAAA	3500

BX321919.10	162939	AATATACAGTAGCACAAAAAATATATATAAGGTATAAATTTGAAATTAAA	162988
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3501	AATATACAGTAGCACAAAAAATATATATAAGGTATAAATTTGAAATTAAA	3550

BX321919.10	162989	CAAAATTACATGTATGAGATTAAAATTGATCAACAAATACATATATACAG	163038
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3551	CAAAATTACATGTATGAGATTAAAATTGATCAACAAATACATATATACAG	3600

BX321919.10	163039	TTAAATTTTCCAATAAATTTCAAAACTAGACTGGAAAAAAATGTTTCTAA	163088
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3601	TTAAATTTTCCAATAAATTTCAAAACTAGACTGGAAAAAAATGTTTCTAA	3650

BX321919.10	163089	GAAATGTATAGCATATGTATAGCATATTTTATTTTATTTATTTTTATTTA	163138
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3651	GAAATGTATAGCATATGTATAGCATATTTTATTTTATTTATTTTTATTTA	3700

BX321919.10	163139	TTTTATTTCCTATAATAATTTTTTTTATTTTATTCAGTGATTCACACGGA	163188
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3701	TTTTATTTCCTATAATAATTTTTTTTATTTTATTCAGTGATTCACACGGA	3750

BX321919.10	163189	CATTTTAACATATAGTGAAACTTGGTTCCTTTGCAAGACGTGTGAAACTA	163238
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3751	CATTTTAACATATAGTGAAACTTGGTTCCTTTGCAAGACGTGTGAAACTA	3800

BX321919.10	163239	TTAGCTTGCAATGACATAAAAGGCTGGCTTCATTACATAACCTCTAAATA	163288
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3801	TTAGCTTGCAATGACATAAAAGGCTGGCTTCATTACATAACCTCTAAATA	3850

BX321919.10	163289	GCCTTTGACTGTTATTTGTCAAAAATGCGCATGGTGTGTTTAGTGAGGTA	163338
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3851	GCCTTTGACTGTTATTTGTCAAAAATGCGCATGGTGTGTTTAGTGAGGTA	3900

BX321919.10	163339	TGTCTCCTACACACGCCAACACCACTTTATTTTTAAAATAACACCCAATG	163388
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3901	TGTCTCCTACACACGCCAACACCACTTTATTTTTAAAATAACACCCAATG	3950

BX321919.10	163389	TGCCTATTTTAACACTGGGGATAAGCACAAATTACAAAGAACATAAATAT	163438
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	3951	TGCCTATTTTAACACTGGGGATAAGCACAAATTACAAAGAACATAAATAT	4000

BX321919.10	163439	CTCTCAGTGCGATTCCAAAAGCTATGAATAACTCATAATTTGCCAGTAAA	163488
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848041.4	4001	CTCTCAGTGCGATTCCAAAAGCTATGAATAACTCATAATTTGCCAGTAAA	4050

BX321919.10	163489	AGAATTC	163495
			|||||||
CR848041.4	4051	AGAATTC	4057

Overview

Query
BX321919.10 - 163495 bps
Hit
CR848041.4 - 177962 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 4057 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100387640571594391634951140571
285.71641591426961428541485250051
399.08561093510435212-1519152991
499.075310835107352141519953061
51005110562498626021519953031
6100511056249862602-1520053041
784.63338741101035101775111971127381
880.66122405141641142045-112314127371
980.645143104215104357-128520286531
1090.455188023846439265135110359051
1196.8483953926239356135939360331
1290.81061643940439567136187363491
1393.041171585191352070162169623261
1493.28105135154433154567196502966351
1592.63589311663411672611012031012971
1689.44991625192652087-11056481058081
1784.94258551101127101677-11199461205161
1891.7387120312211202481203681
1986.69818113441013459011504361506291
2079.9772215954259762-11515121517301
2192.2346103979199802111661431662451
Short-link