<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2001 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR751564.10	1	CTCCTCATTTCTTCGCTTACATACTGCTGTTTACATCAAGCCGCAGGGAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187157	CTCCTCATTTCTTCGCTTACATACTGCTGTTTACATCAAGCCGCAGGGAT	187206

CR751564.10	51	CTCACCGTGCAGGCTTTGTTTTACTTTGTTTCTCATTTCATTTGGACATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187207	CTCACCGTGCAGGCTTTGTTTTACTTTGTTTCTCATTTCATTTGGACATT	187256

CR751564.10	101	TCTTACTGACAAACATGGTTTGCATTATCTCAGGGCTGAGGGACAGAATG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187257	TCTTACTGACAAACATGGTTTGCATTATCTCAGGGCTGAGGGACAGAATG	187306

CR751564.10	151	CTGGGATTTTCTTTAAACCCAAGGCATTTGGGTATTTAGATGTTGCAAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187307	CTGGGATTTTCTTTAAACCCAAGGCATTTGGGTATTTAGATGTTGCAAAC	187356

CR751564.10	201	CACCTTCTGGACCGGTGTTTAAAGACTGTTTGTGTAAACACCTGCTGATA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187357	CACCTTCTGGACCGGTGTTTAAAGACTGTTTGTGTAAACACCTGCTGATA	187406

CR751564.10	251	TAGACATTTTAAGAGTTTTAAAGAGATTTGTTGCTTAATTAAGCTTGAAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187407	TAGACATTTTAAGAGTTTTAAAGAGATTTGTTGCTTAATTAAGCTTGAAT	187456

CR751564.10	301	TAGTTCTTTCAGAATTTAGTTAAGCTCCTATGGTGTGTTCACACTTGGCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187457	TAGTTCTTTCAGAATTTAGTTAAGCTCCTATGGTGTGTTCACACTTGGCA	187506

CR751564.10	351	GGCTTTGTTTAAACTTGGTCAAGTTTGTTTGAATAAGTGTGATTTCTGTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187507	GGCTTTGTTTAAACTTGGTCAAGTTTGTTTGAATAAGTGTGATTTCTGTC	187556

CR751564.10	401	ATTTAAACCTTGGTGCACACAAACTAGCATACTGATGCCACTAAAAGATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187557	ATTTAAACCTTGGTGCACACAAACTAGCATACTGATGCCACTAAAAGATG	187606

CR751564.10	451	GGTTTCAATCCATTTCCAAACAAAGCATAGTGCGGTTCAGCTAAAACAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187607	GGTTTCAATCCATTTCCAAACAAAGCATAGTGCGGTTCAGCTAAAACAAT	187656

CR751564.10	501	GCAGCATGAACCAACGAGATCTAAAAAAACAAACAAAACTGAATATGATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187657	GCAGCATGAACCAACGAGATCTAAAAAAACAAACAAAACTGAATATGATG	187706

CR751564.10	551	TCACAAGATGCAACCGTTTAAAATCTTAACATAGACAGACAATGAATAGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187707	TCACAAGATGCAACCGTTTAAAATCTTAACATAGACAGACAATGAATAGC	187756

CR751564.10	601	AACCAAGGCTCATTGTTAAAACGAACCAATATATACACTTCTGGAGAGAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187757	AACCAAGGCTCATTGTTAAAACGAACCAATATATACACTTCTGGAGAGAG	187806

CR751564.10	651	CCATAGATGTCCCATGAGGTACGTTTTTTGCAGTTTTTGTTATCGTGAAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187807	CCATAGATGTCCCATGAGGTACGTTTTTTGCAGTTTTTGTTATCGTGAAT	187856

CR751564.10	701	CTACTGAAGCTTGCGGTGTATGCTTTTGAGATCTCTAATTTTTCTTGCTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187857	CTACTGAAGCTTGCGGTGTATGCTTTTGAGATCTCTAATTTTTCTTGCTA	187906

CR751564.10	751	GTGGCATTACCGCTTGCTGTTCTCATATAAATCCACTAGAGGTTGCTGTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187907	GTGGCATTACCGCTTGCTGTTCTCATATAAATCCACTAGAGGTTGCTGTC	187956

CR751564.10	801	AACTGACTGACTGACAGATTGACCGACCTACCCTCCTCTTTCTCTTCTTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	187957	AACTGACTGACTGACAGATTGACCGACCTACCCTCCTCTTTCTCTTCTTA	188006

CR751564.10	851	TTTCCACCCACTTCCCTAGACCCAACAGACAGTTTAAAAAAAGCAATCTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188007	TTTCCACCCACTTCCCTAGACCCAACAGACAGTTTAAAAAAAGCAATCTT	188056

CR751564.10	901	TTTTAAAAAGCAATTGTCAGATTTTTATTTTTATTATTTTTTTTAACTGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188057	TTTTAAAAAGCAATTGTCAGATTTTTATTTTTATTATTTTTTTTAACTGT	188106

CR751564.10	951	TTACTGCTTTTGTCTTACCCACCTTTTGGAACCATTCTTTGCCAGACTCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188107	TTACTGCTTTTGTCTTACCCACCTTTTGGAACCATTCTTTGCCAGACTCA	188156

CR751564.10	1001	AACCCTGTCGTCGTGGTCAGCTCCTCTCTGCCTCTAAAGTCCACTGACAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188157	AACCCTGTCGTCGTGGTCAGCTCCTCTCTGCCTCTAAAGTCCACTGACAT	188206

CR751564.10	1051	ACATGGCGAGCTAACTGAACAAACTGGTAACAGCGGGAAAGCCGTCCACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188207	ACATGGCGAGCTAACTGAACAAACTGGTAACAGCGGGAAAGCCGTCCACA	188256

CR751564.10	1101	TGGAGGTAAGCGGTCAGCTCGTAACCGTGAAAAGGAACGACGTCATACCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188257	TGGAGGTAAGCGGTCAGCTCGTAACCGTGAAAAGGAACGACGTCATACCA	188306

CR751564.10	1151	CCCCATAGTGTTCATTTTAAAGACAAAATGCAGCCATACGTACTTCTGGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188307	CCCCATAGTGTTCATTTTAAAGACAAAATGCAGCCATACGTACTTCTGGC	188356

CR751564.10	1201	TACATAATTTGCGATCTCCAGAAACATACATAGGGCTACGTCTTCAGAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188357	TACATAATTTGCGATCTCCAGAAACATACATAGGGCTACGTCTTCAGAAT	188406

CR751564.10	1251	GAGCCTATGTTGATGAATAGCATATTTTGCACATTATGCAAAATTATAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188407	GAGCCTATGTTGATGAATAGCATATTTTGCACATTATGCAAAATTATAGA	188456

CR751564.10	1301	GCTACATAGTTCAGTTACATAAGTAAAATTTGACTCATGTTAGCCGTTCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188457	GCTACATAGTTCAGTTACATAAGTAAAATTTGACTCATGTTAGCCGTTCT	188506

CR751564.10	1351	TTAAGACAATAAATGCATTGTACATTCTCTTTATTCTTTAAAACATTGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188507	TTAAGACAATAAATGCATTGTACATTCTCTTTATTCTTTAAAACATTGAA	188556

CR751564.10	1401	GTTCTTTTACTTTTGCAAACCACTACACACTGCATGAAAGGTAATATTTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188557	GTTCTTTTACTTTTGCAAACCACTACACACTGCATGAAAGGTAATATTTC	188606

CR751564.10	1451	AAAAATCATAATACAGGCGCTTTAATGAATATTGAATAATGAATTTGAGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188607	AAAAATCATAATACAGGCGCTTTAATGAATATTGAATAATGAATTTGAGT	188656

CR751564.10	1501	GTCTTTTCTTTGTCTGGTACTGTACAAGTGTCGGTTTGTCATTTCACACA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188657	GTCTTTTCTTTGTCTGGTACTGTACAAGTGTCGGTTTGTCATTTCACACA	188706

CR751564.10	1551	AGTATACAACCAGACCCAAATGTTTAGAAGCACAGGATCCCACACAGCAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188707	AGTATACAACCAGACCCAAATGTTTAGAAGCACAGGATCCCACACAGCAG	188756

CR751564.10	1601	CATCTGCGTAAGAGCGAATAAGGGATCAATCAGAACAAAATGCAGCAATA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188757	CATCTGCGTAAGAGCGAATAAGGGATCAATCAGAACAAAATGCAGCAATA	188806

CR751564.10	1651	AACTCTGAATTAAATTGATATTGAATTTGTCATTCAATCTAGTTGCTGGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188807	AACTCTGAATTAAATTGATATTGAATTTGTCATTCAATCTAGTTGCTGGA	188856

CR751564.10	1701	GTTTGCATCATGTCCTCCTGGGATTTCTCAGCTATTCTTTTTCCTTCCAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188857	GTTTGCATCATGTCCTCCTGGGATTTCTCAGCTATTCTTTTTCCTTCCAT	188906

CR751564.10	1751	TTTCTTTTCTTCTGCATTCCTGGATATTTTAATACAAACATTCATTGGGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188907	TTTCTTTTCTTCTGCATTCCTGGATATTTTAATACAAACATTCATTGGGT	188956

CR751564.10	1801	TTCAAACTAATAGGGCGTGAGGTTGAAATTTTAGATCTATAGTCGGTTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	188957	TTCAAACTAATAGGGCGTGAGGTTGAAATTTTAGATCTATAGTCGGTTTT	189006

CR751564.10	1851	CTTTCTCTTTTTTTAATAGCTGTCTAGCTGTCTGTGTCTCTCTGCGCTCG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	189007	CTTTCTCTTTTTTTAATAGCTGTCTAGCTGTCTGTGTCTCTCTGCGCTCG	189056

CR751564.10	1901	GTTAACCAAGATGCTAAGTTTTAGCTCAGATGTACAGTATTCAAACCAAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	189057	GTTAACCAAGATGCTAAGTTTTAGCTCAGATGTACAGTATTCAAACCAAT	189106

CR751564.10	1951	GTATCATATCTTGCTATAGCTTAATGAAACGAATTTAATCTAAAAAAGCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847789.8	189107	GTATCATATCTTGCTATAGCTTAATGAAACGAATTTAATCTAAAAAAGCT	189156

CR751564.10	2001	T	2001
			|
CR847789.8	189157	T	189157

Overview

Query
CR751564.10 - 197436 bps
Hit
CR847789.8 - 189157 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2001 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100195020011200111871571891571
281.7423358986319869071226628731
380.3921958236002365831289034551
485.67162298162277162574112095123941
583.951342719902599295112097123701
682.21154362125127125488124402247551
782.66155356152288152643124405247501
883.34158360102151102510135845361981
985.061753461600116346-135851361981
1089.05212332185102185433135854362001
1189.491813096073061038-139794401071
1292.2354503181912182414-147765482641
1392.8327835861086465164369647311
1491.892683793840838786173161735551
1582.821373251600116325180234805531
1681.91215539863198685711025181030591
1788.3515424615239815264311165491167971
1884.8195381181509181889-11222861226601
1994.5610091247484384968411514991527301
2089.2715323316234216257411628461630781
2181.092717013552336223-11807911815041
Short-link