<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR762481.6	1	CTTGTACTCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATAAATAAATAAAATTAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63105	CTTGTACTCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATAAATAAATAAAATTAAA	63154

CR762481.6	51	AAGGAAAAAATATATATGTAGAATATATATAATATATGTATTTATTTATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63155	AAGGAAAAAATATATATGTAGAATATATATAATATATGTATTTATTTATT	63204

CR762481.6	101	TATAGAAAGAGAAATTGAAAAAATTCTGAAAATAAATGATAATGGAAATG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63205	TATAGAAAGAGAAATTGAAAAAATTCTGAAAATAAATGATAATGGAAATG	63254

CR762481.6	151	CAACATACCAAAACCTAAGGGATACAGTGAAAGTAATACTAAGAGGGAAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63255	CAACATACCAAAACCTAAGGGATACAGTGAAAGTAATACTAAGAGGGAAG	63304

CR762481.6	201	TTTATAGCTATAAGTAGCTACATCAAAAAAAAAAGAAAAACTTCAAATAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63305	TTTATAGCTATAAGTAGCTACATCAAAAAAAAAAGAAAAACTTCAAATAA	63354

CR762481.6	251	ACAATACAACAATGCATCTTAAATAGCTAGAAAAGCAAGGGAAAACCAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63355	ACAATACAACAATGCATCTTAAATAGCTAGAAAAGCAAGGGAAAACCAAA	63404

CR762481.6	301	CCCAAAATTAGTAGAAGAAAAGAAATATGAAGATCAGAACAAAAGTAAAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63405	CCCAAAATTAGTAGAAGAAAAGAAATATGAAGATCAGAACAAAAGTAAAT	63454

CR762481.6	351	GAGTTTGAAATGAAGAAAACAATACCAAAGATCAATGAAACAAAAAGTAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63455	GAGTTTGAAATGAAGAAAACAATACCAAAGATCAATGAAACAAAAAGTAA	63504

CR762481.6	401	GTTTTTTGAAAAGTTAAACAAAATTGACAAATCATTAGCCAGACTAACAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63505	GTTTTTTGAAAAGTTAAACAAAATTGACAAATCATTAGCCAGACTAACAG	63554

CR762481.6	451	AAAAAGACAGAAGACCCAAATAAATAAAATCAAACATGAAAAAAGAGACA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63555	AAAAAGACAGAAGACCCAAATAAATAAAATCAAACATGAAAAAAGAGACA	63604

CR762481.6	501	TTACAACTGATACTGCAGAAATTCAAAGGATCATCAGTGGCTACTATGGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63605	TTACAACTGATACTGCAGAAATTCAAAGGATCATCAGTGGCTACTATGGG	63654

CR762481.6	551	CAACTACATGCCAATAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGGTAGATTCCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63655	CAACTACATGCCAATAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGGTAGATTCCT	63704

CR762481.6	601	AGATACATATAACCTACCAAGATTGAATGGTGAACAAAATCCAAAACCTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63705	AGATACATATAACCTACCAAGATTGAATGGTGAACAAAATCCAAAACCTG	63754

CR762481.6	651	AACAGACCAATAGCAAGTAATCAGATAAAAGTCATAACAAAAAGTCTCCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63755	AACAGACCAATAGCAAGTAATCAGATAAAAGTCATAACAAAAAGTCTCCC	63804

CR762481.6	701	AGCAAAGAAAAGCCCTGATGGCTTCACTGCTGAATTCTACCAAACATTTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63805	AGCAAAGAAAAGCCCTGATGGCTTCACTGCTGAATTCTACCAAACATTTA	63854

CR762481.6	751	AAGAAAAACTAATACCAATCCTGTTCAAACTGTTCCAAAAAATTCAGGAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63855	AAGAAAAACTAATACCAATCCTGTTCAAACTGTTCCAAAAAATTCAGGAA	63904

CR762481.6	801	GGAATACTTCCAAAATCATCCTACAAGGGCAGTATTACCCTGATACCAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63905	GGAATACTTCCAAAATCATCCTACAAGGGCAGTATTACCCTGATACCAAA	63954

CR762481.6	851	ACCGGACAAAGACACATCAAAAAAAGGAAGCTATAGGCCAATATTACTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	63955	ACCGGACAAAGACACATCAAAAAAAGGAAGCTATAGGCCAATATTACTGA	64004

CR762481.6	901	CAAATATTGTTGCAAAAATCCTCAACAAAATACTAGCAAATAAAAATCGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64005	CAAATATTGTTGCAAAAATCCTCAACAAAATACTAGCAAATAAAAATCGA	64054

CR762481.6	951	CAACACATTAAAAAGATCATTCCTCATGACCAAGTGGGATTTATCCTAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64055	CAACACATTAAAAAGATCATTCCTCATGACCAAGTGGGATTTATCCTAGG	64104

CR762481.6	1001	GATGCAAGGATGGTTCAAAATATGCAAGTCAATCAATGTGATACATCATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64105	GATGCAAGGATGGTTCAAAATATGCAAGTCAATCAATGTGATACATCATA	64154

CR762481.6	1051	TTCAACAGAATGAAAGACAAAAACCATATAATCATTTCAATTGATGCTGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64155	TTCAACAGAATGAAAGACAAAAACCATATAATCATTTCAATTGATGCTGT	64204

CR762481.6	1101	AAAAACAGTCAATAAAATTCAACATTCCTTCATGATAAAGACTGTCAAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64205	AAAAACAGTCAATAAAATTCAACATTCCTTCATGATAAAGACTGTCAAAA	64254

CR762481.6	1151	AACTGAGTATAGAAGGAACATACCTTAACATAATAAGCCATTATGTACAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64255	AACTGAGTATAGAAGGAACATACCTTAACATAATAAGCCATTATGTACAA	64304

CR762481.6	1201	CAAACCCACAGCTAGTATCATACTAAATGAATGGGGAAAAATTGAAGGCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64305	CAAACCCACAGCTAGTATCATACTAAATGAATGGGGAAAAATTGAAGGCC	64354

CR762481.6	1251	TTTCCTCTAAGATCAGTAACACAACAAGGTTGCCTGCTTTCACCACCGTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64355	TTTCCTCTAAGATCAGTAACACAACAAGGTTGCCTGCTTTCACCACCGTT	64404

CR762481.6	1301	ATTGACCATAGTATTGGAAACCCTAGCTAGAGCAATCAGACAAGAGAAAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64405	ATTGACCATAGTATTGGAAACCCTAGCTAGAGCAATCAGACAAGAGAAAG	64454

CR762481.6	1351	AAATAGAAGTCAAATTATCCTTGTTTGCAGATGATATAATCTTATATTTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64455	AAATAGAAGTCAAATTATCCTTGTTTGCAGATGATATAATCTTATATTTG	64504

CR762481.6	1401	GAAAAATCTACAAGACTCCACCAAAGAACTATTAGAACTGATAAACAAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64505	GAAAAATCTACAAGACTCCACCAAAGAACTATTAGAACTGATAAACAAAT	64554

CR762481.6	1451	TCAGTAAAGTTGCATAATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGTAGCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64555	TCAGTAAAGTTGCATAATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGTAGCC	64604

CR762481.6	1501	AGGTACAGTGTCTCATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGATAGAGGAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64605	AGGTACAGTGTCTCATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGATAGAGGAG	64654

CR762481.6	1551	GGTGTATCACTTGAGCCTGGAAGTTTAAGACCAGCCTAGGCAACTTAGGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64655	GGTGTATCACTTGAGCCTGGAAGTTTAAGACCAGCCTAGGCAACTTAGGG	64704

CR762481.6	1601	AGACTGCATCTTTACCAAAAAAAAAAAAAAATTGTAATTAGCTGAGTGTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64705	AGACTGCATCTTTACCAAAAAAAAAAAAAAATTGTAATTAGCTGAGTGTG	64754

CR762481.6	1651	GTGACATGTGCCTGTGGTCCCAACTACTTGGCAGGCTGAGGTTGTAGGTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64755	GTGACATGTGCCTGTGGTCCCAACTACTTGGCAGGCTGAGGTTGTAGGTT	64804

CR762481.6	1701	GAGACTGCAGTAAGTTGTAGTCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGAAATA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64805	GAGACTGCAGTAAGTTGTAGTCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGAAATA	64854

CR762481.6	1751	TGGCAGACCCTGTCTCTTAAAAAAGAAAAATTAATAAGGCGTGATAGTGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64855	TGGCAGACCCTGTCTCTTAAAAAAGAAAAATTAATAAGGCGTGATAGTGC	64904

CR762481.6	1801	ATACCTGTGGTCCCAGCTGCTCAGGAAGCTGAGGCAGGAGGACCACTTGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64905	ATACCTGTGGTCCCAGCTGCTCAGGAAGCTGAGGCAGGAGGACCACTTGA	64954

CR762481.6	1851	GCCCAAGAAGTCAAAGCAGCGGTGAGCTGTGTTCATACCACTGCACTCCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	64955	GCCCAAGAAGTCAAAGCAGCGGTGAGCTGTGTTCATACCACTGCACTCCA	65004

CR762481.6	1901	GACTGGGCGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAGGGAAACCCTGGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	65005	GACTGGGCGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAGGGAAACCCTGGA	65054

CR762481.6	1951	CATTCCTACACCTGAGGCCTCTTCAATGGCTGCTGCCAATGACTTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR812479.6	65055	CATTCCTACACCTGAGGCCTCTTCAATGGCTGCTGCCAATGACTTTGGCC	65104

Overview

Query
CR762481.6 - 70417 bps
Hit
CR812479.6 - 65104 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link