<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX897719.9	1	GAATTCAAAAAACACTTTTAGTAGAACAAGTCTTTTAAACCATCTTGAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	1995	GAATTCAAAAAACACTTTTAGTAGAACAAGTCTTTTAAACCATCTTGAAA	2044

BX897719.9	51	AACAATACAGCTTATGAATGGGTAATAGATCAAGTAAATCTACTCTATAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2045	AACAATACAGCTTATGAATGGGTAATAGATCAAGTAAATCTACTCTATAG	2094

BX897719.9	101	AGCTGCACTCAATATTTACAGTATAAATAAATACCCAGAGAGAATCAGCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2095	AGCTGCACTCAATATTTACAGTATAAATAAATACCCAGAGAGAATCAGCA	2144

BX897719.9	151	GAGCTTGTTCTCATGTACATGTCATTTTTATTTTGTAAAAGTAATAAACT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2145	GAGCTTGTTCTCATGTACATGTCATTTTTATTTTGTAAAAGTAATAAACT	2194

BX897719.9	201	ATAAATTCAATTGTGGGTCGCTCTTGTTTAGTTCTGAAATTAGCAAGGGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2195	ATAAATTCAATTGTGGGTCGCTCTTGTTTAGTTCTGAAATTAGCAAGGGA	2244

BX897719.9	251	ACTGCTGAATATAGTAGATGAAAAACTGATAATACATATTTGTAAAGTGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2245	ACTGCTGAATATAGTAGATGAAAAACTGATAATACATATTTGTAAAGTGA	2294

BX897719.9	301	CGGCTTCATATTTAACAATGTTTGTTTTGTATTACATAATATGTTTTTGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2295	CGGCTTCATATTTAACAATGTTTGTTTTGTATTACATAATATGTTTTTGA	2344

BX897719.9	351	TAAATGCTAAAACAATACTTTCAACTCCTGAACACAAGCCTTAATGTAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2345	TAAATGCTAAAACAATACTTTCAACTCCTGAACACAAGCCTTAATGTAAT	2394

BX897719.9	401	TGTAATTAACTTACTAATGTTATGTAAAAAAGAGAGAAAAATTAAACAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2395	TGTAATTAACTTACTAATGTTATGTAAAAAAGAGAGAAAAATTAAACAAT	2444

BX897719.9	451	CAAATTTCAGTTTAACAGAAATAAGTGTATTACACCATGCAAAAGTTTTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2445	CAAATTTCAGTTTAACAGAAATAAGTGTATTACACCATGCAAAAGTTTTG	2494

BX897719.9	501	TTGTGTTAATAGTACTCAAAACAGTAATCAACCCAAGCCGTGTAAAGGTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2495	TTGTGTTAATAGTACTCAAAACAGTAATCAACCCAAGCCGTGTAAAGGTA	2544

BX897719.9	551	GAATAAATTCAAAAGTGTAAATATACCAACACATAACAAAATAAGTCTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2545	GAATAAATTCAAAAGTGTAAATATACCAACACATAACAAAATAAGTCTTC	2594

BX897719.9	601	ATAAAAGTGTATTCGCAAAAATAGAATTAATTTGTTAACATTTTTTACAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2595	ATAAAAGTGTATTCGCAAAAATAGAATTAATTTGTTAACATTTTTTACAA	2644

BX897719.9	651	TACCTGACAAAAGTCTTGTCGACTAAGTTTTAGGAACAACAAATAATAAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2645	TACCTGACAAAAGTCTTGTCGACTAAGTTTTAGGAACAACAAATAATAAC	2694

BX897719.9	701	TTGACTTCTTGTTGATCATCTGGTAACAAAAGTGGCTCAAATGAAAGACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2695	TTGACTTCTTGTTGATCATCTGGTAACAAAAGTGGCTCAAATGAAAGACA	2744

BX897719.9	751	AAGGCCTCAAGATTATGCTTATTTTACCAAAATATATATTTTTAATTATT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2745	AAGGCCTCAAGATTATGCTTATTTTACCAAAATATATATTTTTAATTATT	2794

BX897719.9	801	TAATTAGGACAGAAAGATCTGACTTTGCTTAGACAAAAGTCTTGTCATTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2795	TAATTAGGACAGAAAGATCTGACTTTGCTTAGACAAAAGTCTTGTCATTT	2844

BX897719.9	851	AACAGAAATAATGTACAGTACAGAATATGAAGTCATGGTGCAGTGGAAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2845	AACAGAAATAATGTACAGTACAGAATATGAAGTCATGGTGCAGTGGAAAA	2894

BX897719.9	901	AATATATATATAGTGCATGACTCCTATGAGCTTGGAGGACTGCAAATAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2895	AATATATATATAGTGCATGACTCCTATGAGCTTGGAGGACTGCAAATAAA	2944

BX897719.9	951	GTCGTCTGGAAGGCAGAGAAAGTGTTCTTGCAGGACTTAAAGAGTTCAAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2945	GTCGTCTGGAAGGCAGAGAAAGTGTTCTTGCAGGACTTAAAGAGTTCAAC	2994

BX897719.9	1001	AAGATTATTTGGATTAATCTTTAATGCCTTCATCTTACCCCAGACATGCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	2995	AAGATTATTTGGATTAATCTTTAATGCCTTCATCTTACCCCAGACATGCT	3044

BX897719.9	1051	CAATAATGTTTATTTCTGGTGACTGGGCTGGCCAATCCTGGAGCACCCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3045	CAATAATGTTTATTTCTGGTGACTGGGCTGGCCAATCCTGGAGCACCCTG	3094

BX897719.9	1101	ACCTTCTTTCAGAAACTTTGATGTGGCGGCTGAAGTATGAGAAGTAGCGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3095	ACCTTCTTTCAGAAACTTTGATGTGGCGGCTGAAGTATGAGAAGTAGCGC	3144

BX897719.9	1151	TATCCTGCTGTGGAATTTGCCCTCTCCTGTGATTTGTAATATAACGGGCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3145	TATCCTGCTGTGGAATTTGCCCTCTCCTGTGATTTGTAATATAACGGGCA	3194

BX897719.9	1201	GCACAAATGTCTTGATACCTCAGTTTGTTGATGTAGCCATCCTTTCTGCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3195	GCACAAATGTCTTGATACCTCAGTTTGTTGATGTAGCCATCCTTTCTGCA	3244

BX897719.9	1251	GATCTCTTGCATGCCCCCATACTGAATGTGACCCTAAACCATGATTTTTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3245	GATCTCTTGCATGCCCCCATACTGAATGTGACCCTAAACCATGATTTTTC	3294

BX897719.9	1301	CTTCACCAAAATTGACTGATTTCTGTGAGAATCTTGAAAGTCCATGCTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3295	CTTCACCAAAATTGACTGATTTCTGTGAGAATCTTGAAAGTCCATGCTGG	3344

BX897719.9	1351	TTCTAATAGATCTTCAGCGGTATTTGCGTAGATTGGGTTGTAGTTCAACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3345	TTCTAATAGATCTTCAGCGGTATTTGCGTAGATTGGGTTGTAGTTCAACA	3394

BX897719.9	1401	GATGATTCATCTGAAAAATATACCACTTTTCTAAACGATCAACTAGAAGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3395	GATGATTCATCTGAAAAATATACCACTTTTCTAAACGATCAACTAGAAGT	3444

BX897719.9	1451	CAAGTTATTATTTTTTTGCTCTTACAACTGGAATCGACCACAAGACTTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3445	CAAGTTATTATTTTTTTGCTCTTACAACTGGAATCGACCACAAGACTTTT	3494

BX897719.9	1501	GTCAGGTAGTGTGCATTAATCAACATGCACTAAAAATGACATCCTTTTAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3495	GTCAGGTAGTGTGCATTAATCAACATGCACTAAAAATGACATCCTTTTAC	3544

BX897719.9	1551	AGCATTTACTAATTTTAGTTTATGCGTATGTTCAACATTTATAATAGTGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3545	AGCATTTACTAATTTTAGTTTATGCGTATGTTCAACATTTATAATAGTGT	3594

BX897719.9	1601	TATTAACATCCAGAGAGCTTTCTTTTTTAGTTAATAAAGAGTGAACAAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3595	TATTAACATCCAGAGAGCTTTCTTTTTTAGTTAATAAAGAGTGAACAAAA	3644

BX897719.9	1651	ATACAATTTTTAATAACATTAACAAAGACTAATAAATGAAAAAATGCACT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3645	ATACAATTTTTAATAACATTAACAAAGACTAATAAATGAAAAAATGCACT	3694

BX897719.9	1701	GCAAATGGTCCATGTTTGCATTACTGTAGTACTGTAGTGTAACCTTAAGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3695	GCAAATGGTCCATGTTTGCATTACTGTAGTACTGTAGTGTAACCTTAAGG	3744

BX897719.9	1751	TTTCATGTAAAAGTTGTGTAACTTGTATCCACAAAAAAAGAGAACAAAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3745	TTTCATGTAAAAGTTGTGTAACTTGTATCCACAAAAAAAGAGAACAAAGT	3794

BX897719.9	1801	CTCAGGCGACGTGTTTGTTATTAATTTTAAGAACTGTAATAAATATGCAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3795	CTCAGGCGACGTGTTTGTTATTAATTTTAAGAACTGTAATAAATATGCAA	3844

BX897719.9	1851	CTTCAATGCTTGGGGTATGTGGGTCTGTCTTTTAATGATTTATTCAATTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3845	CTTCAATGCTTGGGGTATGTGGGTCTGTCTTTTAATGATTTATTCAATTC	3894

BX897719.9	1901	AATGAAAATAACCCCTCATTCCTGGCAAAGAAAAACAAATAAATTATCGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3895	AATGAAAATAACCCCTCATTCCTGGCAAAGAAAAACAAATAAATTATCGA	3944

BX897719.9	1951	TGCAAATTCAGAACAGTATTTGCAAAGATTTTGTAAATACTGAGGTTTTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762494.6	3945	TGCAAATTCAGAACAGTATTTGCAAAGATTTTGTAAATACTGAGGTTTTC	3994

Overview

Query
BX897719.9 - 216407 bps
Hit
CR762494.6 - 3994 bps
Total alignments
5
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110019022000120001199539941
297.063368193346193413-1121712841
397.0633682056632057301121712841
496.9231651717091717731122212861
510030541139021139551123212851
Short-link