<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CR388372.6 1 GGCCAATTATCAGGTTTTTAATTAAATTTTAGAAATGTGAATTATTGTTT 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 68418 GGCCAATTATCAGGTTTTTAATTAAATTTTAGAAATGTGAATTATTGTTT 68467 CR388372.6 51 CCTTTGAACTGAATCTTATGCAATACTGAAAGCATTCCCACCTGCCATAA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 68468 CCTTTGAACTGAATCTTATGCAATACTGAAAGCATTCCCACCTGCCATAA 68517 CR388372.6 101 TCTTTGCATATCAGTTGTTCCAGGCTGTGATTCAATATTAATACCATTGG 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 68518 TCTTTGCATATCAGTTGTTCCAGGCTGTGATTCAATATTAATACCATTGG 68567 CR388372.6 151 TTTCATGATTTGTCTCAGATTCAGAAGAGTCATGTTTACAGTATCTAAAA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 68568 TTTCATGATTTGTCTCAGATTCAGAAGAGTCATGTTTACAGTATCTAAAA 68617 CR388372.6 201 GCAATGTTTAAAATGTATGTAGGCCTGGCACTGTGGCTTATGCCTGTAAT 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 68618 GCAATGTTTAAAATGTATGTAGGCCTGGCACTGTGGCTTATGCCTGTAAT 68667 CR388372.6 251 CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCTGATGGATCACCTGAGGTCAGGAGTT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 68668 CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCTGATGGATCACCTGAGGTCAGGAGTT 68717 CR388372.6 301 TGAAACCAGCTTGGCCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 68718 TGAAACCAGCTTGGCCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 68767 CR388372.6 351 AAAATCGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 68768 AAAATCGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 68817 CR388372.6 401 GGCCAAGGCAGGTGGCTCACCTGAAGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGAC 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 68818 GGCCAAGGCAGGTGGCTCACCTGAAGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGAC 68867 CR388372.6 451 CAACATCGTGAAACTCCGTCTCCACTAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 68868 CAACATCGTGAAACTCCGTCTCCACTAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCA 68917 CR388372.6 501 TGGTGGTACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 68918 TGGTGGTACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 68967 CR388372.6 551 ATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTTCGCCAT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 68968 ATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTTCGCCAT 69017 CR388372.6 601 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69018 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAA 69067 CR388372.6 651 AAAAAAAAACCCTTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAACAAAAACCCTTCTGT 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69068 AAAAAAAAACCCTTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAACAAAAACCCTTCTGT 69117 CR388372.6 701 CTCAAAAAAAATAAAATAAAACAAAAATATAAAAATTTGGTGGGTGTGGT 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69118 CTCAAAAAAAATAAAATAAAACAAAAATATAAAAATTTGGTGGGTGTGGT 69167 CR388372.6 751 GGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGACTGAGGCAGGAAGATCG 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69168 GGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGACTGAGGCAGGAAGATCG 69217 CR388372.6 801 CTTGAACCTGGGAGACAGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCA 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69218 CTTGAACCTGGGAGACAGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCA 69267 CR388372.6 851 CTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTCTTATCTCAGAAAATAAGTAAAT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69268 CTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTCTTATCTCAGAAAATAAGTAAAT 69317 CR388372.6 901 AGATAAATAAATAAAATGTATTTAAACTTTGTCACTTCACTCTTACTGTT 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69318 AGATAAATAAATAAAATGTATTTAAACTTTGTCACTTCACTCTTACTGTT 69367 CR388372.6 951 TACTATTCTAAGTTCTTGAATTTATAGATATCAAAACACTGCACAGTTAT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69368 TACTATTCTAAGTTCTTGAATTTATAGATATCAAAACACTGCACAGTTAT 69417 CR388372.6 1001 TATTTCCAGATGAATAATAACACAATAACAATAGAAACAAGGAAAAGCCA 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69418 TATTTCCAGATGAATAATAACACAATAACAATAGAAACAAGGAAAAGCCA 69467 CR388372.6 1051 AACAAATATACTATTTATAAGTTACAGCATGTGAGGATAACAATTAACTG 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69468 AACAAATATACTATTTATAAGTTACAGCATGTGAGGATAACAATTAACTG 69517 CR388372.6 1101 ATGATTTTCCTAAACCACAAAACAATGAATGTACAATGGTGACATGGCTG 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69518 ATGATTTTCCTAAACCACAAAACAATGAATGTACAATGGTGACATGGCTG 69567 CR388372.6 1151 AACCAGCCGGTGGTGCCATAAATGATTCTCAGATGCTGCAGTGCAGGAGA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69568 AACCAGCCGGTGGTGCCATAAATGATTCTCAGATGCTGCAGTGCAGGAGA 69617 CR388372.6 1201 CCCATCCATTGATGATCACTGTGATAGACTAAGACAAATAGTTAATTAGT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69618 CCCATCCATTGATGATCACTGTGATAGACTAAGACAAATAGTTAATTAGT 69667 CR388372.6 1251 TAATGAGATATTAGAATTTCTAGTACTTATTAATTTTACCACCTATCACG 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69668 TAATGAGATATTAGAATTTCTAGTACTTATTAATTTTACCACCTATCACG 69717 CR388372.6 1301 ATAACCATTCTATTTTCTGTAACAATCAGTATTGGCTGTACTAGTGCACA 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69718 ATAACCATTCTATTTTCTGTAACAATCAGTATTGGCTGTACTAGTGCACA 69767 CR388372.6 1351 CTGGCTGGATGCCAGTGTGTAAGACAATGCCATAAAGGGCTATATGAGCA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69768 CTGGCTGGATGCCAGTGTGTAAGACAATGCCATAAAGGGCTATATGAGCA 69817 CR388372.6 1401 TTAGCTACTATGCTATGACTTTTAACATTGAGTTGATTAGGTTCAAGGGT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69818 TTAGCTACTATGCTATGACTTTTAACATTGAGTTGATTAGGTTCAAGGGT 69867 CR388372.6 1451 CAGGTGGGGCACTTTTAGAAATTACAGTAACAGAGGCCCTCAGGAGGTAG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69868 CAGGTGGGGCACTTTTAGAAATTACAGTAACAGAGGCCCTCAGGAGGTAG 69917 CR388372.6 1501 GATTCCCTTTTCTTTTTGGAGACAGAGTCTTACGCTGTCACCCAGGCTGG 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69918 GATTCCCTTTTCTTTTTGGAGACAGAGTCTTACGCTGTCACCCAGGCTGG 69967 CR388372.6 1551 AGTGCAATGGCGGGATATCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAAGTTCA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 69968 AGTGCAATGGCGGGATATCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAAGTTCA 70017 CR388372.6 1601 AGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCTTGAGTAGCAGGGATTACAGGCATCTG 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 70018 AGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCTTGAGTAGCAGGGATTACAGGCATCTG 70067 CR388372.6 1651 CCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTATTTTTATTTTTGTTTTGAG 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 70068 CCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTATTTTTATTTTTGTTTTGAG 70117 CR388372.6 1701 ATGGAGTTTCATTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCGCAATCTTG 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 70118 ATGGAGTTTCATTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCGCAATCTTG 70167 CR388372.6 1751 GTTCACCGCAACCTCCACCTCCGAGGTTCAAGCAATTCCTGCCTCAGCCT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 70168 GTTCACCGCAACCTCCACCTCCGAGGTTCAAGCAATTCCTGCCTCAGCCT 70217 CR388372.6 1801 CCTAGGTAGCTGGGATTACAGGGATGTGCCACCACACCTCGCTAATTTTG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 70218 CCTAGGTAGCTGGGATTACAGGGATGTGCCACCACACCTCGCTAATTTTG 70267 CR388372.6 1851 TATTTTTAGTAGAGACGGGTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGGG 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 70268 TATTTTTAGTAGAGACGGGTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGGG 70317 CR388372.6 1901 ATGGAGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 70318 ATGGAGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGT 70367 CR388372.6 1951 GAGGATGGCTCACTGCAAACTCCATCACCCGGGTTCAAGGGATTCTTCTG 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR762481.6 70368 GAGGATGGCTCACTGCAAACTCCATCACCCGGGTTCAAGGGATTCTTCTG 70417