<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR388372.6	1	GGCCAATTATCAGGTTTTTAATTAAATTTTAGAAATGTGAATTATTGTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	68418	GGCCAATTATCAGGTTTTTAATTAAATTTTAGAAATGTGAATTATTGTTT	68467

CR388372.6	51	CCTTTGAACTGAATCTTATGCAATACTGAAAGCATTCCCACCTGCCATAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	68468	CCTTTGAACTGAATCTTATGCAATACTGAAAGCATTCCCACCTGCCATAA	68517

CR388372.6	101	TCTTTGCATATCAGTTGTTCCAGGCTGTGATTCAATATTAATACCATTGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	68518	TCTTTGCATATCAGTTGTTCCAGGCTGTGATTCAATATTAATACCATTGG	68567

CR388372.6	151	TTTCATGATTTGTCTCAGATTCAGAAGAGTCATGTTTACAGTATCTAAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	68568	TTTCATGATTTGTCTCAGATTCAGAAGAGTCATGTTTACAGTATCTAAAA	68617

CR388372.6	201	GCAATGTTTAAAATGTATGTAGGCCTGGCACTGTGGCTTATGCCTGTAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	68618	GCAATGTTTAAAATGTATGTAGGCCTGGCACTGTGGCTTATGCCTGTAAT	68667

CR388372.6	251	CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCTGATGGATCACCTGAGGTCAGGAGTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	68668	CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCTGATGGATCACCTGAGGTCAGGAGTT	68717

CR388372.6	301	TGAAACCAGCTTGGCCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	68718	TGAAACCAGCTTGGCCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA	68767

CR388372.6	351	AAAATCGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	68768	AAAATCGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA	68817

CR388372.6	401	GGCCAAGGCAGGTGGCTCACCTGAAGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	68818	GGCCAAGGCAGGTGGCTCACCTGAAGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGAC	68867

CR388372.6	451	CAACATCGTGAAACTCCGTCTCCACTAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	68868	CAACATCGTGAAACTCCGTCTCCACTAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCA	68917

CR388372.6	501	TGGTGGTACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	68918	TGGTGGTACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGA	68967

CR388372.6	551	ATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTTCGCCAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	68968	ATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTTCGCCAT	69017

CR388372.6	601	TGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69018	TGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAA	69067

CR388372.6	651	AAAAAAAAACCCTTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAACAAAAACCCTTCTGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69068	AAAAAAAAACCCTTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAACAAAAACCCTTCTGT	69117

CR388372.6	701	CTCAAAAAAAATAAAATAAAACAAAAATATAAAAATTTGGTGGGTGTGGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69118	CTCAAAAAAAATAAAATAAAACAAAAATATAAAAATTTGGTGGGTGTGGT	69167

CR388372.6	751	GGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGACTGAGGCAGGAAGATCG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69168	GGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGACTGAGGCAGGAAGATCG	69217

CR388372.6	801	CTTGAACCTGGGAGACAGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69218	CTTGAACCTGGGAGACAGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCA	69267

CR388372.6	851	CTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTCTTATCTCAGAAAATAAGTAAAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69268	CTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTCTTATCTCAGAAAATAAGTAAAT	69317

CR388372.6	901	AGATAAATAAATAAAATGTATTTAAACTTTGTCACTTCACTCTTACTGTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69318	AGATAAATAAATAAAATGTATTTAAACTTTGTCACTTCACTCTTACTGTT	69367

CR388372.6	951	TACTATTCTAAGTTCTTGAATTTATAGATATCAAAACACTGCACAGTTAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69368	TACTATTCTAAGTTCTTGAATTTATAGATATCAAAACACTGCACAGTTAT	69417

CR388372.6	1001	TATTTCCAGATGAATAATAACACAATAACAATAGAAACAAGGAAAAGCCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69418	TATTTCCAGATGAATAATAACACAATAACAATAGAAACAAGGAAAAGCCA	69467

CR388372.6	1051	AACAAATATACTATTTATAAGTTACAGCATGTGAGGATAACAATTAACTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69468	AACAAATATACTATTTATAAGTTACAGCATGTGAGGATAACAATTAACTG	69517

CR388372.6	1101	ATGATTTTCCTAAACCACAAAACAATGAATGTACAATGGTGACATGGCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69518	ATGATTTTCCTAAACCACAAAACAATGAATGTACAATGGTGACATGGCTG	69567

CR388372.6	1151	AACCAGCCGGTGGTGCCATAAATGATTCTCAGATGCTGCAGTGCAGGAGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69568	AACCAGCCGGTGGTGCCATAAATGATTCTCAGATGCTGCAGTGCAGGAGA	69617

CR388372.6	1201	CCCATCCATTGATGATCACTGTGATAGACTAAGACAAATAGTTAATTAGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69618	CCCATCCATTGATGATCACTGTGATAGACTAAGACAAATAGTTAATTAGT	69667

CR388372.6	1251	TAATGAGATATTAGAATTTCTAGTACTTATTAATTTTACCACCTATCACG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69668	TAATGAGATATTAGAATTTCTAGTACTTATTAATTTTACCACCTATCACG	69717

CR388372.6	1301	ATAACCATTCTATTTTCTGTAACAATCAGTATTGGCTGTACTAGTGCACA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69718	ATAACCATTCTATTTTCTGTAACAATCAGTATTGGCTGTACTAGTGCACA	69767

CR388372.6	1351	CTGGCTGGATGCCAGTGTGTAAGACAATGCCATAAAGGGCTATATGAGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69768	CTGGCTGGATGCCAGTGTGTAAGACAATGCCATAAAGGGCTATATGAGCA	69817

CR388372.6	1401	TTAGCTACTATGCTATGACTTTTAACATTGAGTTGATTAGGTTCAAGGGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69818	TTAGCTACTATGCTATGACTTTTAACATTGAGTTGATTAGGTTCAAGGGT	69867

CR388372.6	1451	CAGGTGGGGCACTTTTAGAAATTACAGTAACAGAGGCCCTCAGGAGGTAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69868	CAGGTGGGGCACTTTTAGAAATTACAGTAACAGAGGCCCTCAGGAGGTAG	69917

CR388372.6	1501	GATTCCCTTTTCTTTTTGGAGACAGAGTCTTACGCTGTCACCCAGGCTGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69918	GATTCCCTTTTCTTTTTGGAGACAGAGTCTTACGCTGTCACCCAGGCTGG	69967

CR388372.6	1551	AGTGCAATGGCGGGATATCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAAGTTCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	69968	AGTGCAATGGCGGGATATCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAAGTTCA	70017

CR388372.6	1601	AGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCTTGAGTAGCAGGGATTACAGGCATCTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	70018	AGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCTTGAGTAGCAGGGATTACAGGCATCTG	70067

CR388372.6	1651	CCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTATTTTTATTTTTGTTTTGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	70068	CCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTATTTTTATTTTTGTTTTGAG	70117

CR388372.6	1701	ATGGAGTTTCATTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCGCAATCTTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	70118	ATGGAGTTTCATTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCGCAATCTTG	70167

CR388372.6	1751	GTTCACCGCAACCTCCACCTCCGAGGTTCAAGCAATTCCTGCCTCAGCCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	70168	GTTCACCGCAACCTCCACCTCCGAGGTTCAAGCAATTCCTGCCTCAGCCT	70217

CR388372.6	1801	CCTAGGTAGCTGGGATTACAGGGATGTGCCACCACACCTCGCTAATTTTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	70218	CCTAGGTAGCTGGGATTACAGGGATGTGCCACCACACCTCGCTAATTTTG	70267

CR388372.6	1851	TATTTTTAGTAGAGACGGGTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	70268	TATTTTTAGTAGAGACGGGTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGGG	70317

CR388372.6	1901	ATGGAGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	70318	ATGGAGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGT	70367

CR388372.6	1951	GAGGATGGCTCACTGCAAACTCCATCACCCGGGTTCAAGGGATTCTTCTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762481.6	70368	GAGGATGGCTCACTGCAAACTCCATCACCCGGGTTCAAGGGATTCTTCTG	70417

Overview

Query
CR388372.6 - 70448 bps
Hit
CR762481.6 - 70417 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link