<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759827.2	1	ATCAACCTGCAAGTAGGTCTTGACCATAGAGAAACATTAGGAAAAGCAAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	73399	ATCAACCTGCAAGTAGGTCTTGACCATAGAGAAACATTAGGAAAAGCAAC	73448

CR759827.2	51	CGGATAATTCAGAATCAGAATTGAACAAAATTTCCCAGTATTACCTGAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	73449	CGGATAATTCAGAATCAGAATTGAACAAAATTTCCCAGTATTACCTGAAG	73498

CR759827.2	101	ACTCAGATAATCAAAAAGATTATCTAAACCATTGGGACTGCATCCAATTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	73499	ACTCAGATAATCAAAAAGATTATCTAAACCATTGGGACTGCATCCAATTA	73548

CR759827.2	151	ACTTTACTAGAGTACAGTGTCATAGAAAATGCCAGCCTAGAATTAGACCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	73549	ACTTTACTAGAGTACAGTGTCATAGAAAATGCCAGCCTAGAATTAGACCA	73598

CR759827.2	201	TACCCTAATATTTCACTAGGGCAGGTTTAGTAGATGTAAAAGTTATTTAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	73599	TACCCTAATATTTCACTAGGGCAGGTTTAGTAGATGTAAAAGTTATTTAA	73648

CR759827.2	251	TATGAAGGAAAACTATAGGACAAAGAAATAAGAAAATGTATTTTCATATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	73649	TATGAAGGAAAACTATAGGACAAAGAAATAAGAAAATGTATTTTCATATT	73698

CR759827.2	301	TTTTTGGTTGTGAATGTATTATAATATAAAATTTACTCTTAAATAATGTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	73699	TTTTTGGTTGTGAATGTATTATAATATAAAATTTACTCTTAAATAATGTA	73748

CR759827.2	351	GATTTCCAACACTACAATTATACTTAGCTACAGAAAAATCTTACCATTCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	73749	GATTTCCAACACTACAATTATACTTAGCTACAGAAAAATCTTACCATTCA	73798

CR759827.2	401	AAGCACAAATATTGATTGTGGAACTAAACTTGCTCTGAGCAGATATCATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	73799	AAGCACAAATATTGATTGTGGAACTAAACTTGCTCTGAGCAGATATCATT	73848

CR759827.2	451	TAAATGAGGTACCTCTAGTGGTTATCTCTGATACCCATGGTCAGAACAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	73849	TAAATGAGGTACCTCTAGTGGTTATCTCTGATACCCATGGTCAGAACAGT	73898

CR759827.2	501	TGTATTTGAAAGAGATGTTTAATCCCCAAAGCTCTAAACAGTAAGACCAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	73899	TGTATTTGAAAGAGATGTTTAATCCCCAAAGCTCTAAACAGTAAGACCAG	73948

CR759827.2	551	AATCATAAGATTTACATTTTTTCTCAGTTGTTTTGGTGACCATGAGGGAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	73949	AATCATAAGATTTACATTTTTTCTCAGTTGTTTTGGTGACCATGAGGGAT	73998

CR759827.2	601	GATTCAAATACTTCATTGTCTACGACAATTAGTTTTGTTATTGTCTCAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	73999	GATTCAAATACTTCATTGTCTACGACAATTAGTTTTGTTATTGTCTCAGA	74048

CR759827.2	651	GGTCACTATTTACACATTAAATTCTAGAGTAAGTATATACTATGAAAATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74049	GGTCACTATTTACACATTAAATTCTAGAGTAAGTATATACTATGAAAATT	74098

CR759827.2	701	TTTGTGAGTTGGCTTATAATCATAGGTTTTAACAGCTTCCTTAAATTAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74099	TTTGTGAGTTGGCTTATAATCATAGGTTTTAACAGCTTCCTTAAATTAAA	74148

CR759827.2	751	ATTACATATCAGTAATAATTGGTTTTAATAAAATACATAAGCACGAATTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74149	ATTACATATCAGTAATAATTGGTTTTAATAAAATACATAAGCACGAATTG	74198

CR759827.2	801	GCTGCCTCATGATACATGTTCAAATGTGGATGACATTACTGATCAATAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74199	GCTGCCTCATGATACATGTTCAAATGTGGATGACATTACTGATCAATAAA	74248

CR759827.2	851	ATAATTTTAACTATCTGCTTCTGTACGATAATCAATATATTTTACACTTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74249	ATAATTTTAACTATCTGCTTCTGTACGATAATCAATATATTTTACACTTG	74298

CR759827.2	901	AGATATAGTATAGTGTAATGGTTAGATGGATAGATTGTGGAGCCAGACTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74299	AGATATAGTATAGTGTAATGGTTAGATGGATAGATTGTGGAGCCAGACTT	74348

CR759827.2	951	TCTGGGCTGAAATCCTGGTGGCTACAGTTACCAGATGTGTGAACTTGGGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74349	TCTGGGCTGAAATCCTGGTGGCTACAGTTACCAGATGTGTGAACTTGGGA	74398

CR759827.2	1001	AAATTACTTAACCTTCATTGCCTCCGATTTCTTATCTATAATAGGGGATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74399	AAATTACTTAACCTTCATTGCCTCCGATTTCTTATCTATAATAGGGGATA	74448

CR759827.2	1051	TTATAATACATAATTTAAAGGGCGAATGTAAGGATTCAATAAGTTTAACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74449	TTATAATACATAATTTAAAGGGCGAATGTAAGGATTCAATAAGTTTAACA	74498

CR759827.2	1101	TATGTAAATACTACAGTACTGGTTGGCACACAGCATCCAAATAAGTATTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74499	TATGTAAATACTACAGTACTGGTTGGCACACAGCATCCAAATAAGTATTA	74548

CR759827.2	1151	ACTGTTACAATTTCAATCAGTTCAGGGTGTCTGTGTGCTGCAGAAATATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74549	ACTGTTACAATTTCAATCAGTTCAGGGTGTCTGTGTGCTGCAGAAATATT	74598

CR759827.2	1201	TGGGGAAAGTTTATGCTGATATTTGATAAAACATCTGGAAAATACTCTCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74599	TGGGGAAAGTTTATGCTGATATTTGATAAAACATCTGGAAAATACTCTCC	74648

CR759827.2	1251	TTATAAGCACTTCCTTTAGGATTTTATATATAATACACACATATATGAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74649	TTATAAGCACTTCCTTTAGGATTTTATATATAATACACACATATATGAAA	74698

CR759827.2	1301	TATATATACTATATACATAGTATATACATATGTATGTGTATGTATTCTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74699	TATATATACTATATACATAGTATATACATATGTATGTGTATGTATTCTTT	74748

CR759827.2	1351	ATAAATGCTATAATAATGATGATAAAAAGAAACATAACATCTACTAATGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74749	ATAAATGCTATAATAATGATGATAAAAAGAAACATAACATCTACTAATGG	74798

CR759827.2	1401	TACATTTTTGTCTATCAAGATTCTAAACATCTGAATACTTGAAACTGTTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74799	TACATTTTTGTCTATCAAGATTCTAAACATCTGAATACTTGAAACTGTTC	74848

CR759827.2	1451	ACTTTGACTGGAGATCTCAGTTTCACTTATGTATTTTTCTCTTCCCCTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74849	ACTTTGACTGGAGATCTCAGTTTCACTTATGTATTTTTCTCTTCCCCTTT	74898

CR759827.2	1501	AGTCAAATTTTCTACAGTTCTCCTTTTTCTTTTAAAAACCACTTTAAAGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74899	AGTCAAATTTTCTACAGTTCTCCTTTTTCTTTTAAAAACCACTTTAAAGT	74948

CR759827.2	1551	TATAATTGAATTTCACAATTTCAATTCAACCATAGCAAATATTCAATTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74949	TATAATTGAATTTCACAATTTCAATTCAACCATAGCAAATATTCAATTTT	74998

CR759827.2	1601	CATTTGAAAAACAAAAATGTATATAAATTGTCATGCCCACCCATGTTTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	74999	CATTTGAAAAACAAAAATGTATATAAATTGTCATGCCCACCCATGTTTCT	75048

CR759827.2	1651	GGTTTAAATACATTCCTACACAGTGACTTTTCTAGTCCCTTGCTCCTTAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	75049	GGTTTAAATACATTCCTACACAGTGACTTTTCTAGTCCCTTGCTCCTTAT	75098

CR759827.2	1701	TCTGTGATTAAAATCCATGGGTTTGTTACTCTGGAGAAATTATAGAGAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	75099	TCTGTGATTAAAATCCATGGGTTTGTTACTCTGGAGAAATTATAGAGAAA	75148

CR759827.2	1751	TCCTTTGGATTTTTGAATTAATTTTTAAAAAGGTTTTCATTTGTTATCAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	75149	TCCTTTGGATTTTTGAATTAATTTTTAAAAAGGTTTTCATTTGTTATCAA	75198

CR759827.2	1801	AAAATGGATATACCCAGCTTGTAAAGCAGATGCCCTTGCCTTAAACTTTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	75199	AAAATGGATATACCCAGCTTGTAAAGCAGATGCCCTTGCCTTAAACTTTA	75248

CR759827.2	1851	ATATAAGACCTTTCCATACCCCTTTGAATAAATCAAGACATGTTTTCCTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	75249	ATATAAGACCTTTCCATACCCCTTTGAATAAATCAAGACATGTTTTCCTG	75298

CR759827.2	1901	TTTCCTTTTTATTTAACAATTTTTTCCCTTGCTTACTTTAGCCCTTAACT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	75299	TTTCCTTTTTATTTAACAATTTTTTCCCTTGCTTACTTTAGCCCTTAACT	75348

CR759827.2	1951	TATGGAAACCATTTAAAGTGAAGTTATTAGCAGTGCTTCCACAACTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759835.5	75349	TATGGAAACCATTTAAAGTGAAGTTATTAGCAGTGCTTCCACAACTGGCC	75398

Overview

Query
CR759827.2 - 4348 bps
Hit
CR759835.5 - 75398 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link