<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR762479.5	1	AGGAAGAGGCTCTCAGCGACACCCTCAGTGACCAGCTCCCCGTTGCACAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91293	AGGAAGAGGCTCTCAGCGACACCCTCAGTGACCAGCTCCCCGTTGCACAG	91342

CR762479.5	51	CCACGTGACGTTGAGCACTGGTGGGAAGAACTTGTCAATGTGGCAGATGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91343	CCACGTGACGTTGAGCACTGGTGGGAAGAACTTGTCAATGTGGCAGATGA	91392

CR762479.5	101	GGGTGTTGGGCTGGCCCAGCTCCACAGGCTCCTTGGGAAACACGGTCACC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91393	GGGTGTTGGGCTGGCCCAGCTCCACAGGCTCCTTGGGAAACACGGTCACC	91442

CR762479.5	151	TCAGGGGGATCTGGAAGGAGACAGCACCAGGTTAGGCCCCTCTTCTGGGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91443	TCAGGGGGATCTGGAAGGAGACAGCACCAGGTTAGGCCCCTCTTCTGGGA	91492

CR762479.5	201	TGAATCACAAAGGCTCCACCTCTTAGGGGAGGGTGGTCCTCTACCTCAGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91493	TGAATCACAAAGGCTCCACCTCTTAGGGGAGGGTGGTCCTCTACCTCAGC	91542

CR762479.5	251	CTTAGATTTTATGGCAGCTCTGAATCACAGAGAGGGGTATCACACCACTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91543	CTTAGATTTTATGGCAGCTCTGAATCACAGAGAGGGGTATCACACCACTG	91592

CR762479.5	301	ACCAGCCTCACTCTGCTCACCTTTCTCTCTCCTGAGAAGAGAGGATGCAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91593	ACCAGCCTCACTCTGCTCACCTTTCTCTCTCCTGAGAAGAGAGGATGCAA	91642

CR762479.5	351	GCCCTTGCTGTAGTGGGATCAGCCCATGGCCACTAGGGGAAGAGGATCAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91643	GCCCTTGCTGTAGTGGGATCAGCCCATGGCCACTAGGGGAAGAGGATCAC	91692

CR762479.5	401	ACAGCAGGGGGCACTTAGGCTTCCTAGTCTGAGGGTGGCAGAGAGGCCCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91693	ACAGCAGGGGGCACTTAGGCTTCCTAGTCTGAGGGTGGCAGAGAGGCCCT	91742

CR762479.5	451	CTCATCCCTTCCAGTTGGGCTACAGAGGAAGAGGCAAAGATAGGGCGTAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91743	CTCATCCCTTCCAGTTGGGCTACAGAGGAAGAGGCAAAGATAGGGCGTAC	91792

CR762479.5	501	CGTTGGTGGCCTGAGTGTGGTTGGAACGCTGGATCAAGGTATTCAAGTTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91793	CGTTGGTGGCCTGAGTGTGGTTGGAACGCTGGATCAAGGTATTCAAGTTG	91842

CR762479.5	551	TTGTTCAATATAGCAATGTTAGCCAGCCCGCCCTGAGCCTCAAAGGAAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91843	TTGTTCAATATAGCAATGTTAGCCAGCCCGCCCTGAGCCTCAAAGGAAAA	91892

CR762479.5	601	GGCTTGGCCAAACTCCTCCAGATGCCAGACGGTCTCCTTCTTGTCCAGAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91893	GGCTTGGCCAAACTCCTCCAGATGCCAGACGGTCTCCTTCTTGTCCAGAT	91942

CR762479.5	651	CCACATAGAACATCTCATCTTCATCAAATTCAAACATAAACTCCCCTGTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91943	CCACATAGAACATCTCATCTTCATCAAATTCAAACATAAACTCCCCTGTT	91992

CR762479.5	701	GGTCTATGCGTCTGTACAAACGCGGCATAAGTTGACACATGGTCCGCTGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	91993	GGTCTATGCGTCTGTACAAACGCGGCATAAGTTGACACATGGTCCGCTGC	92042

CR762479.5	751	ATAAAGACAGTAGAGAAAAACACGACAAAATGTCAGTTTGAATATGCAAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92043	ATAAAGACAGTAGAGAAAAACACGACAAAATGTCAGTTTGAATATGCAAG	92092

CR762479.5	801	TGGTCAAAGCTAGAGAATGAATAAAGACTTATGAATATAAAAAGGAAGAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92093	TGGTCAAAGCTAGAGAATGAATAAAGACTTATGAATATAAAAAGGAAGAA	92142

CR762479.5	851	GGTAAGAGGTCAAAGGAAGGACATATGGGGAAGAAGAAGGAGCAACACCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92143	GGTAAGAGGTCAAAGGAAGGACATATGGGGAAGAAGAAGGAGCAACACCA	92192

CR762479.5	901	TAAAGGAAATAATACAGAGCAGATGAGCAGTTATAAAAAGAAAGGAGCAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92193	TAAAGGAAATAATACAGAGCAGATGAGCAGTTATAAAAAGAAAGGAGCAA	92242

CR762479.5	951	AGAACAAAATGAAAAGTTTATCACTGATAAGTCAAGCTGCTTCCTGGTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92243	AGAACAAAATGAAAAGTTTATCACTGATAAGTCAAGCTGCTTCCTGGTCT	92292

CR762479.5	1001	TTGAAAGTCTGGGCATCCTGACCCTACACAATAGTAATAGTAACAATGAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92293	TTGAAAGTCTGGGCATCCTGACCCTACACAATAGTAATAGTAACAATGAC	92342

CR762479.5	1051	AGCTAACATTTGTTGAGCACTTACTTGTGCCAGGCATCCTTCTAAATACT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92343	AGCTAACATTTGTTGAGCACTTACTTGTGCCAGGCATCCTTCTAAATACT	92392

CR762479.5	1101	TTACATATTTCACTCGCTGAATTGTCACAATAACCCTATGAAGCAAATAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92393	TTACATATTTCACTCGCTGAATTGTCACAATAACCCTATGAAGCAAATAC	92442

CR762479.5	1151	ATATCATACATTTTACAGGTAAGGAAATGCAGGGAAGTTACATATTAATA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92443	ATATCATACATTTTACAGGTAAGGAAATGCAGGGAAGTTACATATTAATA	92492

CR762479.5	1201	ACTTGCTAAGGTCATACGGCTACTGGCGGAACTAGTAGAGAGGTTTTCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92493	ACTTGCTAAGGTCATACGGCTACTGGCGGAACTAGTAGAGAGGTTTTCTC	92542

CR762479.5	1251	TCCCATTAAGATCTTAATTTTTCTATGACACAGATGTAAAATTGTTTTTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92543	TCCCATTAAGATCTTAATTTTTCTATGACACAGATGTAAAATTGTTTTTA	92592

CR762479.5	1301	GAGTCATGGGGGTGGGGGAATGGACATTTTCTTTTTCTTATTATAGAAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92593	GAGTCATGGGGGTGGGGGAATGGACATTTTCTTTTTCTTATTATAGAAAA	92642

CR762479.5	1351	GGTAGAAAAAAATACAAAATTGAGAGGAAGAAGAAAATATCCTTCAAATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92643	GGTAGAAAAAAATACAAAATTGAGAGGAAGAAGAAAATATCCTTCAAATT	92692

CR762479.5	1401	TTAGGGCTCTTGACAGTTTTAAAGTTTCTGTCTTAGTTTATGAACATGAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92693	TTAGGGCTCTTGACAGTTTTAAAGTTTCTGTCTTAGTTTATGAACATGAA	92742

CR762479.5	1451	ACTGTAGAATGTATAGCTTTGTTGATAATATTTTTCATTTGGGGCATATA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92743	ACTGTAGAATGTATAGCTTTGTTGATAATATTTTTCATTTGGGGCATATA	92792

CR762479.5	1501	AATTCAAAAGTACAGTACAGTTATTTTGGCATTTGTTCCAAACTTTTGTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92793	AATTCAAAAGTACAGTACAGTTATTTTGGCATTTGTTCCAAACTTTTGTT	92842

CR762479.5	1551	TCCTTTTTAAAAATATTTCAACATTTATTTTATGTTCAGGAGTACATGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92843	TCCTTTTTAAAAATATTTCAACATTTATTTTATGTTCAGGAGTACATGTG	92892

CR762479.5	1601	CAGGTTTGTTGTATAGGTAAACTCATGACTTGGGGGTTTAGTGTACAGAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92893	CAGGTTTGTTGTATAGGTAAACTCATGACTTGGGGGTTTAGTGTACAGAT	92942

CR762479.5	1651	TATTTCATCACACAGGTACTAAGCATTCTAAACTTTTCTTACATTTATAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92943	TATTTCATCACACAGGTACTAAGCATTCTAAACTTTTCTTACATTTATAT	92992

CR762479.5	1701	TTTGATTTTTGTTTTAGAGGCCAACTAGAAATTATTGCTGAGTTTGGAAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	92993	TTTGATTTTTGTTTTAGAGGCCAACTAGAAATTATTGCTGAGTTTGGAAC	93042

CR762479.5	1751	ACCTGTAGGATTTAATTTATTTTGTTTCTTAGTCTTTATTAGTTTGTAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	93043	ACCTGTAGGATTTAATTTATTTTGTTTCTTAGTCTTTATTAGTTTGTAAG	93092

CR762479.5	1801	AATTAGCAAAGATAAGAGGATAAAAGCAACTATTATCATGAAAGAAAACG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	93093	AATTAGCAAAGATAAGAGGATAAAAGCAACTATTATCATGAAAGAAAACG	93142

CR762479.5	1851	ATGAATGTGTATGTGAAAGTCTGGGTTTAGAATGATAAATGCATCAGAGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	93143	ATGAATGTGTATGTGAAAGTCTGGGTTTAGAATGATAAATGCATCAGAGT	93192

CR762479.5	1901	GAGAAGGAACTACGGGACTCTTCTGCTCTCACCTCCCAACTCACAGATTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	93193	GAGAAGGAACTACGGGACTCTTCTGCTCTCACCTCCCAACTCACAGATTT	93242

CR762479.5	1951	CCCTGTGAGTTTTCAGCCCTGACATGTGGGGACCCAGTCTGTGCTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759829.6	93243	CCCTGTGAGTTTTCAGCCCTGACATGTGGGGACCCAGTCTGTGCTTGGCC	93292

Overview

Query
CR762479.5 - 35870 bps
Hit
CR759829.6 - 93292 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link