<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR751604.3	1	TGCGAAATTACTAAAAAATAAGCAAAAAGAAATCCATTTAATTTTTCTCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	81526	TGCGAAATTACTAAAAAATAAGCAAAAAGAAATCCATTTAATTTTTCTCA	81575

CR751604.3	51	AATGGAGAAAACATAGCATTATCTAACATATTTTGTTGGAGTCTGTGAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	81576	AATGGAGAAAACATAGCATTATCTAACATATTTTGTTGGAGTCTGTGAGG	81625

CR751604.3	101	GGAGGACTTGTGTGGGCAAAGAAGGAAGCATTCCAAACCGCCCTATAGAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	81626	GGAGGACTTGTGTGGGCAAAGAAGGAAGCATTCCAAACCGCCCTATAGAT	81675

CR751604.3	151	TAGTTTTAGATTAGTTTTACAATGCAAAACTAGATATAAGATTAGGCAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	81676	TAGTTTTAGATTAGTTTTACAATGCAAAACTAGATATAAGATTAGGCAGT	81725

CR751604.3	201	GATGATGTGATGAAATCAAAGGTAGGGTTTCCTTAAAGGCCCTCTTCATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	81726	GATGATGTGATGAAATCAAAGGTAGGGTTTCCTTAAAGGCCCTCTTCATT	81775

CR751604.3	251	TACTGGACCCAACAGCTTTGGGTATAGTCTCGGGTAGAGACTGCCATATC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	81776	TACTGGACCCAACAGCTTTGGGTATAGTCTCGGGTAGAGACTGCCATATC	81825

CR751604.3	301	TTTCTGTTTCCTTTGAATAGCATTATAATGTTTGAGAGAACACTGAAAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	81826	TTTCTGTTTCCTTTGAATAGCATTATAATGTTTGAGAGAACACTGAAAGC	81875

CR751604.3	351	CTCTCTCCATTTAAACATCATTATGGATTTCATCTCTCAATAATTCTGCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	81876	CTCTCTCCATTTAAACATCATTATGGATTTCATCTCTCAATAATTCTGCT	81925

CR751604.3	401	TACGTGTTATTTCATAATATTGTTCAGTTTATTACTGATGAATCCTAGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	81926	TACGTGTTATTTCATAATATTGTTCAGTTTATTACTGATGAATCCTAGCT	81975

CR751604.3	451	TAGTCCCTCTTTTAATTAGTGTTTAAAAAGATTCTCTGTAATATAGACCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	81976	TAGTCCCTCTTTTAATTAGTGTTTAAAAAGATTCTCTGTAATATAGACCA	82025

CR751604.3	501	TGTAGGGTAATAAGGAAGCAAGGGAATAATGGGAACCACAAATCACTTTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82026	TGTAGGGTAATAAGGAAGCAAGGGAATAATGGGAACCACAAATCACTTTG	82075

CR751604.3	551	ACAGAAGTGAAGTGAAGGGGACCAAAGAGAACCAAAGTAGAAAAAGACAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82076	ACAGAAGTGAAGTGAAGGGGACCAAAGAGAACCAAAGTAGAAAAAGACAT	82125

CR751604.3	601	GTAATACTTACTTATAGGTGCTGCCAGCTGACCTAAAAAAATTAGATATC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82126	GTAATACTTACTTATAGGTGCTGCCAGCTGACCTAAAAAAATTAGATATC	82175

CR751604.3	651	AGTGAAGATTTGTTTGAAAGGAGCAAGTTTCCTTCTAGGGAGAGATATTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82176	AGTGAAGATTTGTTTGAAAGGAGCAAGTTTCCTTCTAGGGAGAGATATTT	82225

CR751604.3	701	GTGTTGGGGAGAATCTTGGTAGTCACACAGCTCTGGATGACAATGGCTAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82226	GTGTTGGGGAGAATCTTGGTAGTCACACAGCTCTGGATGACAATGGCTAA	82275

CR751604.3	751	TTCTCTGTTAAAAGCTCCAATTCTTTATGATTGCATTCTTGGGTAAGTAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82276	TTCTCTGTTAAAAGCTCCAATTCTTTATGATTGCATTCTTGGGTAAGTAT	82325

CR751604.3	801	TTGGGTCAGTTTCTTATCTCTTACAAAGGGGTTAGTGGAGTGATTCTAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82326	TTGGGTCAGTTTCTTATCTCTTACAAAGGGGTTAGTGGAGTGATTCTAAG	82375

CR751604.3	851	GATTAAATGGGATAATGTAATTAAAGCACCTATATAATTCTATAGGAGGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82376	GATTAAATGGGATAATGTAATTAAAGCACCTATATAATTCTATAGGAGGT	82425

CR751604.3	901	GCAAAGTACATATGTGTTTGAAATCATGTAAATGTAAGCTTCCTTCTCAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82426	GCAAAGTACATATGTGTTTGAAATCATGTAAATGTAAGCTTCCTTCTCAG	82475

CR751604.3	951	GGAGAAGCTAGATTAGCAGAGGGCAGAGGAAACTGGGAGCTTTGAGTCAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82476	GGAGAAGCTAGATTAGCAGAGGGCAGAGGAAACTGGGAGCTTTGAGTCAG	82525

CR751604.3	1001	GTAGCTGCACACAGAGTTAGAAATGAGTAGGGTAGGCCAGGCGCCTTGGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82526	GTAGCTGCACACAGAGTTAGAAATGAGTAGGGTAGGCCAGGCGCCTTGGC	82575

CR751604.3	1051	TCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCGAGGCAGGCGGATCACGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82576	TCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCGAGGCAGGCGGATCACGA	82625

CR751604.3	1101	GGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCGAACACTGTGATGTTCTAAAAATA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82626	GGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCGAACACTGTGATGTTCTAAAAATA	82675

CR751604.3	1151	CAAAAAAATTTCTCCTCCCTATTCTGAGTCAGTGTGCCTGAGACTGGCCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82676	CAAAAAAATTTCTCCTCCCTATTCTGAGTCAGTGTGCCTGAGACTGGCCA	82725

CR751604.3	1201	CTAGGAGAGGAGAGGGTTTTAAGAGGGGTTGGCCTGAGTGTTTTTAATAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82726	CTAGGAGAGGAGAGGGTTTTAAGAGGGGTTGGCCTGAGTGTTTTTAATAA	82775

CR751604.3	1251	TTTAACATGATTAGAAAATTATGGTATGCTACCAGGCTACAGTAAGCAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82776	TTTAACATGATTAGAAAATTATGGTATGCTACCAGGCTACAGTAAGCAAA	82825

CR751604.3	1301	ACAGTATGGCACTAGTAGGAAATAGACACATAGATCAATGCAACAGAATA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82826	ACAGTATGGCACTAGTAGGAAATAGACACATAGATCAATGCAACAGAATA	82875

CR751604.3	1351	GAGAGCCCAGAAATAAGGCCACATGACTACAACTATCTGATCTTTAACAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82876	GAGAGCCCAGAAATAAGGCCACATGACTACAACTATCTGATCTTTAACAA	82925

CR751604.3	1401	AGCTGAGAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGGCTTCCTATTCAATAAACGAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82926	AGCTGAGAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGGCTTCCTATTCAATAAACGAT	82975

CR751604.3	1451	ACTGGGATAACTGGCCAGCCATATGCAGAAGATTGAAGCTGGACTCCTTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	82976	ACTGGGATAACTGGCCAGCCATATGCAGAAGATTGAAGCTGGACTCCTTC	83025

CR751604.3	1501	CTTACACCACATACGAAAATTAACTCAAGATGGTTTAAAGATTTAAGTGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	83026	CTTACACCACATACGAAAATTAACTCAAGATGGTTTAAAGATTTAAGTGT	83075

CR751604.3	1551	AAAACCCAAAGCTATAAAAACCCTGGAAGACCACCTAGGCAATACCATTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	83076	AAAACCCAAAGCTATAAAAACCCTGGAAGACCACCTAGGCAATACCATTC	83125

CR751604.3	1601	TGGACATAGGAATGGGCAAAAATTTCATGATGAAGACAACAAAAGCAACT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	83126	TGGACATAGGAATGGGCAAAAATTTCATGATGAAGACAACAAAAGCAACT	83175

CR751604.3	1651	GTAACAAAAGCAAAAATTAACAGATGGGATCTAATTGAACTAAAGAGCTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	83176	GTAACAAAAGCAAAAATTAACAGATGGGATCTAATTGAACTAAAGAGCTT	83225

CR751604.3	1701	CTGCCCAGCAAAAGAAACTGTCAACAGAGTAAATAGGCAACCTACAGAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	83226	CTGCCCAGCAAAAGAAACTGTCAACAGAGTAAATAGGCAACCTACAGAAT	83275

CR751604.3	1751	GGGAGAAAGTTTTTGCAAACTATGCATCTGGCAAAGGTCTAATATCCAGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	83276	GGGAGAAAGTTTTTGCAAACTATGCATCTGGCAAAGGTCTAATATCCAGC	83325

CR751604.3	1801	GCCTGTAAGGAACTTAAACAAATTTACAAGACAAAAACAATCCCATTAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	83326	GCCTGTAAGGAACTTAAACAAATTTACAAGACAAAAACAATCCCATTAAA	83375

CR751604.3	1851	AAGTTGGCAAAAAAAGGGAATAGGCACTTTTCAAAAGAAGACGTACATGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	83376	AAGTTGGCAAAAAAAGGGAATAGGCACTTTTCAAAAGAAGACGTACATGC	83425

CR751604.3	1901	AGCTCACAAACATATGAAGAAAAGCTCAACATCACTGATTGTTAGAGAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	83426	AGCTCACAAACATATGAAGAAAAGCTCAACATCACTGATTGTTAGAGAAA	83475

CR751604.3	1951	TGCAAGTCAAAACCACAATGAGATACCATCTCGCACCAGGCAGAATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759737.4	83476	TGCAAGTCAAAACCACAATGAGATACCATCTCGCACCAGGCAGAATGGCC	83525

Overview

Query
CR751604.3 - 19436 bps
Hit
CR759737.4 - 83525 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link