<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR762434.7	1	AAATTAGCCAGTCATGGTGGCAGGCATTTGTAATCCCAGCTATTCAGGAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102206	AAATTAGCCAGTCATGGTGGCAGGCATTTGTAATCCCAGCTATTCAGGAG	102255

CR762434.7	51	GCTGAGGCAAGAGAATCACTTGAACCCTGGAGGCAGAGCTTGCAGTAAAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102256	GCTGAGGCAAGAGAATCACTTGAACCCTGGAGGCAGAGCTTGCAGTAAAC	102305

CR762434.7	101	CGAGATCACGCCACTGCACTCTAGCCTAGGTGACACAGCGAGACCCTGTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102306	CGAGATCACGCCACTGCACTCTAGCCTAGGTGACACAGCGAGACCCTGTC	102355

CR762434.7	151	TTAAAAAAAAGAGGCCCAAAGGAGCTTGTTTGCCCCTTCCACCCGTGAAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102356	TTAAAAAAAAGAGGCCCAAAGGAGCTTGTTTGCCCCTTCCACCCGTGAAG	102405

CR762434.7	201	ATGCAGCAAGAAGGCGCCATCTATGAAGCAAAGTGTGCCCTCACTGGCTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102406	ATGCAGCAAGAAGGCGCCATCTATGAAGCAAAGTGTGCCCTCACTGGCTA	102455

CR762434.7	251	CCAAATCTGCTGGCACCACCTGCTTGGACATTCTAGCCTCCAGAACTGTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102456	CCAAATCTGCTGGCACCACCTGCTTGGACATTCTAGCCTCCAGAACTGTA	102505

CR762434.7	301	AGCAGTGTTTATTATTTATAAATTGCTCAGTGTAAGGTATTTTGTTATAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102506	AGCAGTGTTTATTATTTATAAATTGCTCAGTGTAAGGTATTTTGTTATAG	102555

CR762434.7	351	CAGTCTGAATGGACTAAGACAGATAGTTTTATAAAAATTAAACTACAGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102556	CAGTCTGAATGGACTAAGACAGATAGTTTTATAAAAATTAAACTACAGTT	102605

CR762434.7	401	GGCATTTTGTATCTGTAGGTCCACACCTATGGATTCAACCAACTGAAGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102606	GGCATTTTGTATCTGTAGGTCCACACCTATGGATTCAACCAACTGAAGAA	102655

CR762434.7	451	TAAAAATATTTTTAAAATATATATGGCCAGTCCGGGCGCGGTGGCTCACG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102656	TAAAAATATTTTTAAAATATATATGGCCAGTCCGGGCGCGGTGGCTCACG	102705

CR762434.7	501	CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCGGGTGGATCACAAAGTCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102706	CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCGGGTGGATCACAAAGTCA	102755

CR762434.7	551	GGAGATCAAGACCATCCTAGCTAACGCGGTGAAACCCCATCTCTACTAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102756	GGAGATCAAGACCATCCTAGCTAACGCGGTGAAACCCCATCTCTACTAAA	102805

CR762434.7	601	AATGCAAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102806	AATGCAAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCT	102855

CR762434.7	651	ACTTGGAAGGCTGAGGTAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCAGAGTTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102856	ACTTGGAAGGCTGAGGTAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCAGAGTTT	102905

CR762434.7	701	GCAGTGAGCTGATATCCTGCCATAGCACTCCAGCCTGGGTGACACAGCAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102906	GCAGTGAGCTGATATCCTGCCATAGCACTCCAGCCTGGGTGACACAGCAA	102955

CR762434.7	751	GACTGTCAGAAAGAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	102956	GACTGTCAGAAAGAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGG	103005

CR762434.7	801	AAGGAAGGGAAGGGAAGGAAGGAAGGAAAGAAAGAAAAAATAATACAAAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103006	AAGGAAGGGAAGGGAAGGAAGGAAGGAAAGAAAGAAAAAATAATACAAAT	103055

CR762434.7	851	AAAAAATACAGTATAACATATATTTATACAGCATTTACATTGCGATAGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103056	AAAAAATACAGTATAACATATATTTATACAGCATTTACATTGCGATAGGC	103105

CR762434.7	901	ACCATAGATAACCTAGGGATGATTTAAAGTATGTGGAAGAATGTGCATAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103106	ACCATAGATAACCTAGGGATGATTTAAAGTATGTGGAAGAATGTGCATAG	103155

CR762434.7	951	GTTATATGCAAATACTATGCCATGTTATACAAGGGGTTTGAACATCAGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103156	GTTATATGCAAATACTATGCCATGTTATACAAGGGGTTTGAACATCAGTG	103205

CR762434.7	1001	GGGGTTTTGGAATCAATCCCTGGTGAATACTGAGGATGATTGTATTCATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103206	GGGGTTTTGGAATCAATCCCTGGTGAATACTGAGGATGATTGTATTCATA	103255

CR762434.7	1051	ATCTCGTATTCAATGTCCATCTATTACAACATAGAGAATCAATATCATAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103256	ATCTCGTATTCAATGTCCATCTATTACAACATAGAGAATCAATATCATAC	103305

CR762434.7	1101	TTCACAAGAGTTATATCTAGACCTACATGTATTCAATTTTTTTTTCAATA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103306	TTCACAAGAGTTATATCTAGACCTACATGTATTCAATTTTTTTTTCAATA	103355

CR762434.7	1151	GGCTTTTGGGGAACAGGTGGTGTTCAGTTACATGAATAAGTTATTTAGTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103356	GGCTTTTGGGGAACAGGTGGTGTTCAGTTACATGAATAAGTTATTTAGTG	103405

CR762434.7	1201	GTGATTTCTGAGATTTTGGTGCCCCCATCACAGGAGGAGTGTACACTGTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103406	GTGATTTCTGAGATTTTGGTGCCCCCATCACAGGAGGAGTGTACACTGTA	103455

CR762434.7	1251	AATGTGTAGTTTTTTATCCCTCACCACCCCTCCCACCACATGCATATAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103456	AATGTGTAGTTTTTTATCCCTCACCACCCCTCCCACCACATGCATATAAA	103505

CR762434.7	1301	TTTAACAGTAATAAGGATTGTTTAATACAGCAACATGTTCCTCAGCTATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103506	TTTAACAGTAATAAGGATTGTTTAATACAGCAACATGTTCCTCAGCTATC	103555

CR762434.7	1351	CTTTGCAACTGTTGTAAATGCAGCACAACATACATCCATACCTCTAAAAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103556	CTTTGCAACTGTTGTAAATGCAGCACAACATACATCCATACCTCTAAAAC	103605

CR762434.7	1401	AAAGAGAAACAAGAAAAACCACACTCAACACTATTGGGAAATGATACTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103606	AAAGAGAAACAAGAAAAACCACACTCAACACTATTGGGAAATGATACTTT	103655

CR762434.7	1451	GTCATGCTATTTGAGAGGTAATATTTAACAAGCTGGTTAAAGTGATTTCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103656	GTCATGCTATTTGAGAGGTAATATTTAACAAGCTGGTTAAAGTGATTTCA	103705

CR762434.7	1501	CTTACATGTTTCCACTGCTTAAATCCTCCCTACACTCCAAAGCAGTACAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103706	CTTACATGTTTCCACTGCTTAAATCCTCCCTACACTCCAAAGCAGTACAT	103755

CR762434.7	1551	GCTTCAGAATCCAGGCAGAGGCACAACCTCAGATTTTCACAGAATTGGCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103756	GCTTCAGAATCCAGGCAGAGGCACAACCTCAGATTTTCACAGAATTGGCT	103805

CR762434.7	1601	ATAGTCATCTTTTGTTTCCAGGATACAGGGCAAGAGATTACAGAAGTCAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103806	ATAGTCATCTTTTGTTTCCAGGATACAGGGCAAGAGATTACAGAAGTCAC	103855

CR762434.7	1651	CATTCCCCAGGGCTTGAACGGCGTTGATTACAAGAGCAGATGTGTAAGAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103856	CATTCCCCAGGGCTTGAACGGCGTTGATTACAAGAGCAGATGTGTAAGAT	103905

CR762434.7	1701	TTCAGGTTGTGCTGTTCCAGCACTGACAGCAGATCAGTGACAGAGGTGCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103906	TTCAGGTTGTGCTGTTCCAGCACTGACAGCAGATCAGTGACAGAGGTGCC	103955

CR762434.7	1751	CAGGTGTCATGTAATAAATGTGTGTGATAAGTTGTTTGTGATAGGTGAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	103956	CAGGTGTCATGTAATAAATGTGTGTGATAAGTTGTTTGTGATAGGTGAAT	104005

CR762434.7	1801	CCCCCTAAAGTATGTGGGCCAGGGCAGGGCCCCTGTGGTTCAGATCTGAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	104006	CCCCCTAAAGTATGTGGGCCAGGGCAGGGCCCCTGTGGTTCAGATCTGAG	104055

CR762434.7	1851	GATGATACTGCTTCTGTGGGAAGATCATGACTTCTGTTTCAAATATGCTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	104056	GATGATACTGCTTCTGTGGGAAGATCATGACTTCTGTTTCAAATATGCTA	104105

CR762434.7	1901	AGTTAAGCTGGGCACCGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	104106	AGTTAAGCTGGGCACCGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAA	104155

CR762434.7	1951	GCTGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759733.4	104156	GCTGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCC	104205

Overview

Query
CR762434.7 - 24495 bps
Hit
CR759733.4 - 104205 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link