<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR753651.10	1	GGCCAACATGATGAAACCTCGTCTCTACTAAAAAAACACAAAAATTAGCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	303	GGCCAACATGATGAAACCTCGTCTCTACTAAAAAAACACAAAAATTAGCC	352

CR753651.10	51	GGGCGTGATGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	353	GGGCGTGATGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA	402

CR753651.10	101	GGAGAATCGCTTTACCCGGAGAGGCGGAGTTTTCAGTGAGCCGAGATCGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	403	GGAGAATCGCTTTACCCGGAGAGGCGGAGTTTTCAGTGAGCCGAGATCGT	452

CR753651.10	151	GCCACTGCACTCCTGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	453	GCCACTGCACTCCTGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAA	502

CR753651.10	201	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGGGTGATTTTGTGTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	503	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGGGTGATTTTGTGTTG	552

CR753651.10	251	TGTTTGTTAAATTCATGAAACAAGTAGGACAAGACCATAAATTGAAAAAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	553	TGTTTGTTAAATTCATGAAACAAGTAGGACAAGACCATAAATTGAAAAAC	602

CR753651.10	301	CAAGCCCATTCCAAATTACGAATGCCTCCGGTAGTACCTATGCCAGGGAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	603	CAAGCCCATTCCAAATTACGAATGCCTCCGGTAGTACCTATGCCAGGGAC	652

CR753651.10	351	AAAGTGCACTTTAATAGTCAATACACAGGTTGCTTACCGGGTTCTTGTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	653	AAAGTGCACTTTAATAGTCAATACACAGGTTGCTTACCGGGTTCTTGTTT	702

CR753651.10	401	TTTTTGTCAATAGTCTTCTTTCATTTCAAGTTCCCAAAGTCTTGGGAACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	703	TTTTTGTCAATAGTCTTCTTTCATTTCAAGTTCCCAAAGTCTTGGGAACA	752

CR753651.10	451	AGCCGGTTTTTTTTTTTTTAACTGGCTTGCAGAAAGCTCAAGGAGATGTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	753	AGCCGGTTTTTTTTTTTTTAACTGGCTTGCAGAAAGCTCAAGGAGATGTG	802

CR753651.10	501	CAGAAAGTAAAGATATTTCCTGACAATAGTAAGAACACGACCACGAAGGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	803	CAGAAAGTAAAGATATTTCCTGACAATAGTAAGAACACGACCACGAAGGG	852

CR753651.10	551	ACTCGAACCCTCAATCTTCTGATCCGGAATCAGACGCCTTATCCATTAGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	853	ACTCGAACCCTCAATCTTCTGATCCGGAATCAGACGCCTTATCCATTAGG	902

CR753651.10	601	CCACGCGGCCGCACGCGGGTGCTAATTTGCACACATCAAGACTGAAGTGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	903	CCACGCGGCCGCACGCGGGTGCTAATTTGCACACATCAAGACTGAAGTGT	952

CR753651.10	651	AGTGAGGAAACGTTGAGTTTCTGTTTTCAAACCTTTAACTTCGTAATTAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	953	AGTGAGGAAACGTTGAGTTTCTGTTTTCAAACCTTTAACTTCGTAATTAG	1002

CR753651.10	701	AGATTTAACAACTTGAAGGGGGGCGGGGAGAGGCGGGGGAGGAGGTGGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1003	AGATTTAACAACTTGAAGGGGGGCGGGGAGAGGCGGGGGAGGAGGTGGGC	1052

CR753651.10	751	AGAAGGAATAAAACTCCATCTAAAATTCCTAATAGCAATTCCTTAGAATT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1053	AGAAGGAATAAAACTCCATCTAAAATTCCTAATAGCAATTCCTTAGAATT	1102

CR753651.10	801	ATAAACTGCGAGATGATCAGAAGTGACATCTTTGCCTTCTTTGAAGGCTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1103	ATAAACTGCGAGATGATCAGAAGTGACATCTTTGCCTTCTTTGAAGGCTC	1152

CR753651.10	851	TCTTCTCTAAGTTACTAATAATGATAATGCACGTTCGGGTACAGAAATAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1153	TCTTCTCTAAGTTACTAATAATGATAATGCACGTTCGGGTACAGAAATAT	1202

CR753651.10	901	GAGCCAAGAACTCAAGTCTGCAATGAAGGAGTGGACATGACAGCGTAAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1203	GAGCCAAGAACTCAAGTCTGCAATGAAGGAGTGGACATGACAGCGTAAGA	1252

CR753651.10	951	GGGAGCATCATTGTTTGATCTATTTTAACCTTTTCCGTCTCAAAGATACG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1253	GGGAGCATCATTGTTTGATCTATTTTAACCTTTTCCGTCTCAAAGATACG	1302

CR753651.10	1001	ATGGTGCTTCCTCCAGGAAGAAAAGCCTGTAAGCTCAAACAAGAGCTCCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1303	ATGGTGCTTCCTCCAGGAAGAAAAGCCTGTAAGCTCAAACAAGAGCTCCC	1352

CR753651.10	1051	CTGGAACAGAAGACACTGGAGACCGTAAGAGGTGGGAGGTTGGAAGGGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1353	CTGGAACAGAAGACACTGGAGACCGTAAGAGGTGGGAGGTTGGAAGGGGG	1402

CR753651.10	1101	AAAAGGATAGAAAAACTGCCTGTTGGGTATTATGCTCACCACATGGGTGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1403	AAAAGGATAGAAAAACTGCCTGTTGGGTATTATGCTCACCACATGGGTGA	1452

CR753651.10	1151	CGGGTTCAATCGTACTCCAGACATCAGCAACACGCAATACACCCTTGTCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1453	CGGGTTCAATCGTACTCCAGACATCAGCAACACGCAATACACCCTTGTCC	1502

CR753651.10	1201	CAAACCTGCACTGTACTCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATTAAAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1503	CAAACCTGCACTGTACTCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATTAAAAA	1552

CR753651.10	1251	AAAAAAAAAAGCTCCCCCTTGTCAGAAAAGCCCCAAGTATTTTGCCTAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1553	AAAAAAAAAAGCTCCCCCTTGTCAGAAAAGCCCCAAGTATTTTGCCTAAA	1602

CR753651.10	1301	GGTTGATTGCTCTAAGCTCACCTTTGGATTGATCCAGAAAACAGTCTGGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1603	GGTTGATTGCTCTAAGCTCACCTTTGGATTGATCCAGAAAACAGTCTGGG	1652

CR753651.10	1351	GCGATTTTTTGTTACCCTTTCCCCAGCTATGTCCCCTATGTTGATAGGGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1653	GCGATTTTTTGTTACCCTTTCCCCAGCTATGTCCCCTATGTTGATAGGGT	1702

CR753651.10	1401	AGGAAAGATTAAAAAAAAAAACAACAACCAAGTTTGTAAAGTAAACCAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1703	AGGAAAGATTAAAAAAAAAAACAACAACCAAGTTTGTAAAGTAAACCAAT	1752

CR753651.10	1451	CACAGATTCCCTCAGTTTTCGCATCGTCTTGGCTTCATGGAAATGACGAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1753	CACAGATTCCCTCAGTTTTCGCATCGTCTTGGCTTCATGGAAATGACGAG	1802

CR753651.10	1501	TTACTGGGAAGAAACTATTTCATTTTTCCAGTGCCCAGTCCTATCTCCTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1803	TTACTGGGAAGAAACTATTTCATTTTTCCAGTGCCCAGTCCTATCTCCTT	1852

CR753651.10	1551	TCCCCAGAGAGATGCATCTCTCAGCCCTAAACTTTTCCTGGATCCCTTGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1853	TCCCCAGAGAGATGCATCTCTCAGCCCTAAACTTTTCCTGGATCCCTTGT	1902

CR753651.10	1601	ACACCATTTTCTCCAGGTTTCTCCAGTCAAAACTCAAGAATTGTTTTAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1903	ACACCATTTTCTCCAGGTTTCTCCAGTCAAAACTCAAGAATTGTTTTAGG	1952

CR753651.10	1651	CCATATTTTGGATGGTGTATCCTATGTACACTAATTTATTAAGTAATGAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	1953	CCATATTTTGGATGGTGTATCCTATGTACACTAATTTATTAAGTAATGAC	2002

CR753651.10	1701	CCATGTTTGAGACCACGGAACGCTAGTTCTGGGGCCGGACTAGATGAGTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	2003	CCATGTTTGAGACCACGGAACGCTAGTTCTGGGGCCGGACTAGATGAGTC	2052

CR753651.10	1751	TGGGTAGACAAAAGAAAGGTCTTCTGCTGTTCCCTATGAAACTGATTTAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	2053	TGGGTAGACAAAAGAAAGGTCTTCTGCTGTTCCCTATGAAACTGATTTAG	2102

CR753651.10	1801	TTAAGTCCCTTTCTTTCTCAGAAAGCGTCCTATGAGGAGCATTAGATTGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	2103	TTAAGTCCCTTTCTTTCTCAGAAAGCGTCCTATGAGGAGCATTAGATTGA	2152

CR753651.10	1851	ATAAGGGTTTCTGGTGTGATCCAGTTTGGGGAGGCTACTTGCTCTAGTCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	2153	ATAAGGGTTTCTGGTGTGATCCAGTTTGGGGAGGCTACTTGCTCTAGTCA	2202

CR753651.10	1901	GTGCTGAAGAATCCATCTCCATTTTGGGCAAGATGCACTACCATGACTTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	2203	GTGCTGAAGAATCCATCTCCATTTTGGGCAAGATGCACTACCATGACTTA	2252

CR753651.10	1951	TGTTTCAACAGACTCAAACTTATTCACATGTTTTGAAATTGTTCTCAGTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753905.3	2253	TGTTTCAACAGACTCAAACTTATTCACATGTTTTGAAATTGTTCTCAGTT	2302

Overview

Query
CR753651.10 - 124464 bps
Hit
CR753905.3 - 2302 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link