<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR753842.3	1	AGTATGGTAGGTATTTAACAGAGTCAGGCAGCACAACTTACCTACCTCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	99423	AGTATGGTAGGTATTTAACAGAGTCAGGCAGCACAACTTACCTACCTCTT	99472

CR753842.3	51	CCTCTGAACAGGTTGTCAGAAAGCAGTGACACTAATTACTATACTTTCTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	99473	CCTCTGAACAGGTTGTCAGAAAGCAGTGACACTAATTACTATACTTTCTT	99522

CR753842.3	101	TTTCTAAACCTCATTTTCTTCATCTTTAAAATGAAAGGTTCAGAGTCAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	99523	TTTCTAAACCTCATTTTCTTCATCTTTAAAATGAAAGGTTCAGAGTCAAT	99572

CR753842.3	151	GAATTCCCAGGGCCCCTTCCCCTAACATGTCACTAGGGGCTCTTACCCAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	99573	GAATTCCCAGGGCCCCTTCCCCTAACATGTCACTAGGGGCTCTTACCCAG	99622

CR753842.3	201	TGGTTATGTAATGGCAAGAAGGTACCACTGCCTGGCTGGGCCGGGGGACA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	99623	TGGTTATGTAATGGCAAGAAGGTACCACTGCCTGGCTGGGCCGGGGGACA	99672

CR753842.3	251	GGAAGATGAGGTGAATGGCAAGCCAGCCACTCACCTGCAAGAAGTCAGTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	99673	GGAAGATGAGGTGAATGGCAAGCCAGCCACTCACCTGCAAGAAGTCAGTC	99722

CR753842.3	301	ATGCCTTGGAGAAAGGCAGGGACACCAGGCATCGCCACAGTGATGGTGGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	99723	ATGCCTTGGAGAAAGGCAGGGACACCAGGCATCGCCACAGTGATGGTGGG	99772

CR753842.3	351	AGAAGCCACACCAGGCCCTCCAGCCCCTGGCCCTGCAGGCCCTAGCAGGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	99773	AGAAGCCACACCAGGCCCTCCAGCCCCTGGCCCTGCAGGCCCTAGCAGGT	99822

CR753842.3	401	TCCCCAGAAGCTGAGAGAACTGAAGATCAGCCATGGAGGGTTGAGGGGTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	99823	TCCCCAGAAGCTGAGAGAACTGAAGATCAGCCATGGAGGGTTGAGGGGTG	99872

CR753842.3	451	GGTGGAGGCTGGGCAGGCCCCCCAGGAGCGGGGCCAGCTGTGGTAGCTGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	99873	GGTGGAGGCTGGGCAGGCCCCCCAGGAGCGGGGCCAGCTGTGGTAGCTGT	99922

CR753842.3	501	GTTGGTGGTGCCAGCACTGGCAGAAGCAGTGGCAGGGGCTGGCGGTGGAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	99923	GTTGGTGGTGCCAGCACTGGCAGAAGCAGTGGCAGGGGCTGGCGGTGGAG	99972

CR753842.3	551	CCATACCTGGGGTCCCCTGAGCTGTAAGAAACCAAAAAAAGAAAGCTGGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	99973	CCATACCTGGGGTCCCCTGAGCTGTAAGAAACCAAAAAAAGAAAGCTGGG	100022

CR753842.3	601	CTGAGCATGGTGGCTCTTGGCTGTAATCCTAGCAACTTTGGGAGGCCAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100023	CTGAGCATGGTGGCTCTTGGCTGTAATCCTAGCAACTTTGGGAGGCCAAG	100072

CR753842.3	651	GCATGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTAGGCCACATAGCAAGACCCCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100073	GCATGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTAGGCCACATAGCAAGACCCCA	100122

CR753842.3	701	TCTCTACCAGAAAAAAAAAAAGACAATTACTAGCCAGGAGATAGTACTGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100123	TCTCTACCAGAAAAAAAAAAAGACAATTACTAGCCAGGAGATAGTACTGC	100172

CR753842.3	751	TAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGAACTGTTTGAGCCCAGGAGTTCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100173	TAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGAACTGTTTGAGCCCAGGAGTTCA	100222

CR753842.3	801	AGGTTACAGTGAGCTTTAACTCACTGGATTGCACCACTGCACTCCAGTCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100223	AGGTTACAGTGAGCTTTAACTCACTGGATTGCACCACTGCACTCCAGTCT	100272

CR753842.3	851	GGGTGACAGAGCAAGACTCTGTAACTTAAAAAAAAAAGAAAAAAGCTGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100273	GGGTGACAGAGCAAGACTCTGTAACTTAAAAAAAAAAGAAAAAAGCTGGC	100322

CR753842.3	901	CGGGCACGATGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100323	CGGGCACGATGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGT	100372

CR753842.3	951	GGGTGGATCACAAGGTCAAGAGTTCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100373	GGGTGGATCACAAGGTCAAGAGTTCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGA	100422

CR753842.3	1001	AACCCCCTTCTCTACTAAAAACATAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100423	AACCCCCTTCTCTACTAAAAACATAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGT	100472

CR753842.3	1051	GCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100473	GCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGA	100522

CR753842.3	1101	ACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTACACTGCACTCCAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100523	ACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTACACTGCACTCCAG	100572

CR753842.3	1151	CCTAGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100573	CCTAGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	100622

CR753842.3	1201	AAAAAAAAAGCTGAAACCTGAAGACACAAGACACTACAGCAGCCCCATTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100623	AAAAAAAAAGCTGAAACCTGAAGACACAAGACACTACAGCAGCCCCATTC	100672

CR753842.3	1251	CAGGAAAGCAGGAACCAAGAAAATATGGAAAGAACTGGAAAGTGCCAGTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100673	CAGGAAAGCAGGAACCAAGAAAATATGGAAAGAACTGGAAAGTGCCAGTG	100722

CR753842.3	1301	AGCAGACTAGGAAAGGAGTTTAAACTCTGAGTGGGGAAGAATGAAAACTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100723	AGCAGACTAGGAAAGGAGTTTAAACTCTGAGTGGGGAAGAATGAAAACTC	100772

CR753842.3	1351	ACCCACAAGGACTGGCTGCATAAGAAGCTGCCCCACAAGGCCGCTCACCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100773	ACCCACAAGGACTGGCTGCATAAGAAGCTGCCCCACAAGGCCGCTCACCA	100822

CR753842.3	1401	TCTGGGCCAACGAGGCATTGGTACCCAGACCGGCGCCCTGCTGGATAGAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100823	TCTGGGCCAACGAGGCATTGGTACCCAGACCGGCGCCCTGCTGGATAGAG	100872

CR753842.3	1451	AGCAAGGGAGAACTTCAGACCTGCCCTTCCATGCACCACCACAGGAGTCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100873	AGCAAGGGAGAACTTCAGACCTGCCCTTCCATGCACCACCACAGGAGTCT	100922

CR753842.3	1501	CTCCCTAGACTGTTACGCACTAGAACTCCCCGACCCTTGCTCACCAGTGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100923	CTCCCTAGACTGTTACGCACTAGAACTCCCCGACCCTTGCTCACCAGTGT	100972

CR753842.3	1551	CCCAGAGACTGGGGGCCCTCCAGGATGGGAAGGCCGAGCCTGTGGAGGAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	100973	CCCAGAGACTGGGGGCCCTCCAGGATGGGAAGGCCGAGCCTGTGGAGGAG	101022

CR753842.3	1601	TGGGCCGGGCAATCACCACCCGGGTTGGAGCTGTTGGGAAGCCTGGCACC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	101023	TGGGCCGGGCAATCACCACCCGGGTTGGAGCTGTTGGGAAGCCTGGCACC	101072

CR753842.3	1651	TGCTGTCCTGTGGGTGGCAGAAGAGACAGACCGAAGAGGGCTGAGGGCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	101073	TGCTGTCCTGTGGGTGGCAGAAGAGACAGACCGAAGAGGGCTGAGGGCCA	101122

CR753842.3	1701	GGCCCTTGCCAGCCAGCTGCCACCATGGACTGTGCCCTACCTCCCAAGCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	101123	GGCCCTTGCCAGCCAGCTGCCACCATGGACTGTGCCCTACCTCCCAAGCC	101172

CR753842.3	1751	TCCCCTTCCAGGTCATTACCTGCGGCCGCGGAGGCAACAGCTGCCACCAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	101173	TCCCCTTCCAGGTCATTACCTGCGGCCGCGGAGGCAACAGCTGCCACCAT	101222

CR753842.3	1801	GGCCTGATGAGTGATCTGGTGGGCGACGGCGTGCATGAACTCAGGGGGCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	101223	GGCCTGATGAGTGATCTGGTGGGCGACGGCGTGCATGAACTCAGGGGGCA	101272

CR753842.3	1851	GGGAGGGCAGCTGGATGAGGGTGGAGCCTGGGGGGCGGGTCTGATGTAAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	101273	GGGAGGGCAGCTGGATGAGGGTGGAGCCTGGGGGGCGGGTCTGATGTAAC	101322

CR753842.3	1901	CTTGAACCTGGACCCCTTCAACCCACCCACTCAGCCCTTCCCTTTCTCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	101323	CTTGAACCTGGACCCCTTCAACCCACCCACTCAGCCCTTCCCTTTCTCTA	101372

CR753842.3	1951	CCCAGAGCTCAGCCTGCCCTGATGCCCTCACTCTTACCCAGGGTTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753892.5	101373	CCCAGAGCTCAGCCTGCCCTGATGCCCTCACTCTTACCCAGGGTTTGGCC	101422

Overview

Query
CR753842.3 - 69013 bps
Hit
CR753892.5 - 101422 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link