<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927168.11	1	GGCCAACATAGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAGAAATTAGCCGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99065	GGCCAACATAGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAGAAATTAGCCGG	99114

BX927168.11	51	GCATGGTGGCAGGCACCTGCAGTCCCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGCAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99115	GCATGGTGGCAGGCACCTGCAGTCCCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGCAGG	99164

BX927168.11	101	AGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCGAGACCATGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99165	AGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCGAGACCATGC	99214

BX927168.11	151	CATTGTACCTCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTACGTCTCGAAAAATAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99215	CATTGTACCTCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTACGTCTCGAAAAATAA	99264

BX927168.11	201	AGAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAATTCCCATCCCTTTTGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99265	AGAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAATTCCCATCCCTTTTGC	99314

BX927168.11	251	GAATGGCAGACATGCACACACCAGAGAAGATTCCAATTTAGTGTCTTCCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99315	GAATGGCAGACATGCACACACCAGAGAAGATTCCAATTTAGTGTCTTCCC	99364

BX927168.11	301	TCTCTTCATAGAACAATTCCTCAAGTCCACTCTGAGTAGAGGCTGCATCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99365	TCTCTTCATAGAACAATTCCTCAAGTCCACTCTGAGTAGAGGCTGCATCA	99414

BX927168.11	351	CAACAAGGGGATTGCCCTGTCTCCTTCCAGGGCTCTTAATAGAAACTCTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99415	CAACAAGGGGATTGCCCTGTCTCCTTCCAGGGCTCTTAATAGAAACTCTT	99464

BX927168.11	401	CAACTAGTAACTGAGATGTCACCATGGGGGATTTTTCTAATTGGCCAAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99465	CAACTAGTAACTGAGATGTCACCATGGGGGATTTTTCTAATTGGCCAAAA	99514

BX927168.11	451	CCTGACTTGGCAGGGTTTGGTTTGGGTGTCTTCAGATTTCCTTGTCTTGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99515	CCTGACTTGGCAGGGTTTGGTTTGGGTGTCTTCAGATTTCCTTGTCTTGA	99564

BX927168.11	501	GGTCCTCACAATTACTCTACAGCTCAGAACAGCAACTGCTGAGGCTGCCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99565	GGTCCTCACAATTACTCTACAGCTCAGAACAGCAACTGCTGAGGCTGCCT	99614

BX927168.11	551	TGGGAAGAAGATGATCCTAAACAAAGCTCTGATGCTGGGGGCCCTCGCCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99615	TGGGAAGAAGATGATCCTAAACAAAGCTCTGATGCTGGGGGCCCTCGCCC	99664

BX927168.11	601	TGACCACCGTGATGAGCCCTTGTGGAGGTGAAGACATTGTGGGTGAGTGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99665	TGACCACCGTGATGAGCCCTTGTGGAGGTGAAGACATTGTGGGTGAGTGC	99714

BX927168.11	651	GTGAGTGAGGAATGTTCTCTGGAGCTGAAAAACAGTAAATTGAAGGAAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99715	GTGAGTGAGGAATGTTCTCTGGAGCTGAAAAACAGTAAATTGAAGGAAAA	99764

BX927168.11	701	GAGAGAAAGCGATTTGCAGAGAAATTGTAGAGATTTCCTAAGACCCCTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99765	GAGAGAAAGCGATTTGCAGAGAAATTGTAGAGATTTCCTAAGACCCCTTT	99814

BX927168.11	751	CAGTATTAAGAGAATTAAAAATTATAGCTGTTCCTCCTTCAGGAAACCAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99815	CAGTATTAAGAGAATTAAAAATTATAGCTGTTCCTCCTTCAGGAAACCAG	99864

BX927168.11	801	AGCCCCAACCTACTCTTTTTGTTATGTATGCTTTTGTGTTCACTAAGGAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99865	AGCCCCAACCTACTCTTTTTGTTATGTATGCTTTTGTGTTCACTAAGGAT	99914

BX927168.11	851	GCTATTCTGTTTATATTATATTCAGTGACTACAGCCTGGAGGTCTCTATG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99915	GCTATTCTGTTTATATTATATTCAGTGACTACAGCCTGGAGGTCTCTATG	99964

BX927168.11	901	TCATTCCATCATGATTGCCTCAAAAATTAGTGAGGTTTCCATCAGTGGAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	99965	TCATTCCATCATGATTGCCTCAAAAATTAGTGAGGTTTCCATCAGTGGAT	100014

BX927168.11	951	AATTTTTTATTATTAAAAATGTATGAAGTGTCATTCTCAAATTTCCCTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100015	AATTTTTTATTATTAAAAATGTATGAAGTGTCATTCTCAAATTTCCCTGA	100064

BX927168.11	1001	ACAACTTTTGAAGATTTTCGGATGTCTCCTGTAGTAGATCTTGGGGTCGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100065	ACAACTTTTGAAGATTTTCGGATGTCTCCTGTAGTAGATCTTGGGGTCGT	100114

BX927168.11	1051	TCCATCAATTATATACTCTATAGATATTAAAAAAGTTGCCCGTTTCTTTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100115	TCCATCAATTATATACTCTATAGATATTAAAAAAGTTGCCCGTTTCTTTC	100164

BX927168.11	1101	TCTCAGACTTACTCACATTTCCACATGGGAACTGGCACAGGTGGGGAGTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100165	TCTCAGACTTACTCACATTTCCACATGGGAACTGGCACAGGTGGGGAGTA	100214

BX927168.11	1151	GGTAAAGGAGTCCAGCAGGCTGAATGCCTTCAACAATCATTTTACCACAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100215	GGTAAAGGAGTCCAGCAGGCTGAATGCCTTCAACAATCATTTTACCACAT	100264

BX927168.11	1201	GGTCCTCACTTACTCTCAGCTGCCTCATATGTGTCACCTCACAAATAATC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100265	GGTCCTCACTTACTCTCAGCTGCCTCATATGTGTCACCTCACAAATAATC	100314

BX927168.11	1251	AAATAAAATGGGCATGTAGCTAAGCTTTGTAAATAGTGAAAACATGGATG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100315	AAATAAAATGGGCATGTAGCTAAGCTTTGTAAATAGTGAAAACATGGATG	100364

BX927168.11	1301	TCAATTGTTTTTACATATTTCTATTACAGGTATAGCTTCACATTTCTTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100365	TCAATTGTTTTTACATATTTCTATTACAGGTATAGCTTCACATTTCTTTT	100414

BX927168.11	1351	CTTTAGCAAAATAAGGGATCCTTTTAGTTTAAAATTGAGAAGTAGAAAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100415	CTTTAGCAAAATAAGGGATCCTTTTAGTTTAAAATTGAGAAGTAGAAAAA	100464

BX927168.11	1401	ATTGGTAAATTAAATCATTTTATTCTCAAATTATCAACCCAAATTACCTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100465	ATTGGTAAATTAAATCATTTTATTCTCAAATTATCAACCCAAATTACCTG	100514

BX927168.11	1451	TTCTTCACCTCATCTAATAAAGTCCTATAAAAAGAAAAGTGGGCCAGACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100515	TTCTTCACCTCATCTAATAAAGTCCTATAAAAAGAAAAGTGGGCCAGACA	100564

BX927168.11	1501	TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCAGGAGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100565	TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCAGGAGG	100614

BX927168.11	1551	ATCATTTGAGCCTGGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACACAGCAAGACC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100615	ATCATTTGAGCCTGGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACACAGCAAGACC	100664

BX927168.11	1601	TCATCTCTACCAAAAAATAAAATAAAAATTAGCCAGGCATGGTAGTGCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100665	TCATCTCTACCAAAAAATAAAATAAAAATTAGCCAGGCATGGTAGTGCAT	100714

BX927168.11	1651	GCCTGTGGTGCCAGCTACTCAGAAGGCTGCAGTGGGAGGAGCACTTGAGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100715	GCCTGTGGTGCCAGCTACTCAGAAGGCTGCAGTGGGAGGAGCACTTGAGT	100764

BX927168.11	1701	CCAGGAGGTGGAAGCTGCAGTGAGCCATGATGGCACCACTACACTCCAGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100765	CCAGGAGGTGGAAGCTGCAGTGAGCCATGATGGCACCACTACACTCCAGC	100814

BX927168.11	1751	CAGGGCAACAGAGAGAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAGCGGAAAGAAAGAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100815	CAGGGCAACAGAGAGAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAGCGGAAAGAAAGAG	100864

BX927168.11	1801	AGAAAGGAAGGAAAGAAGGAAAGAAGGAAGCAAGGAAGGAGAAAGGGAAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100865	AGAAAGGAAGGAAAGAAGGAAAGAAGGAAGCAAGGAAGGAGAAAGGGAAG	100914

BX927168.11	1851	GGAAGAAAGAAGAAAGAAAGAAAGAAAACAGAAGGAAGGAAGCACAGATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100915	GGAAGAAAGAAGAAAGAAAGAAAGAAAACAGAAGGAAGGAAGCACAGATT	100964

BX927168.11	1901	AATTATTTGGTCTCTTAGTCTCCTCTGCCTTTGTCGTCCATCTCTTCCCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	100965	AATTATTTGGTCTCTTAGTCTCCTCTGCCTTTGTCGTCCATCTCTTCCCA	101014

BX927168.11	1951	CCTCTCTTCATGCATTCCTTTCTCCCTCTTCCCTTTCAGGATCCATCTCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753835.3	101015	CCTCTCTTCATGCATTCCTTTCTCCCTCTTCCCTTTCAGGATCCATCTCT	101064

Overview

Query
BX927168.11 - 109326 bps
Hit
CR753835.3 - 101064 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link