<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX679671.7	1	GGCCACCGGCGCCCCTCCACGCCGCCAACGAGTCCCCGGGCGTGCGTGCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	8389	GGCCACCGGCGCCCCTCCACGCCGCCAACGAGTCCCCGGGCGTGCGTGCC	8438

BX679671.7	51	CTTGGAGGGAGCCAATCCGCGGCCGGCGTGGGGCCCGGCCTGGCGGAGGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	8439	CTTGGAGGGAGCCAATCCGCGGCCGGCGTGGGGCCCGGCCTGGCGGAGGT	8488

BX679671.7	101	GATGCTGGTATGTGCGTCGCCACCGCCCCTCCCAGCACTGACGGGCCTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	8489	GATGCTGGTATGTGCGTCGCCACCGCCCCTCCCAGCACTGACGGGCCTGA	8538

BX679671.7	151	GGGACGACAAGTTGACGCTCCTTTCGTCATCACCTGGTCTAGGAGGGACG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	8539	GGGACGACAAGTTGACGCTCCTTTCGTCATCACCTGGTCTAGGAGGGACG	8588

BX679671.7	201	CCCGGGGAGACCGTACGTCACTGCTCTGCGCCGGAAGACCCTATTTTCAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	8589	CCCGGGGAGACCGTACGTCACTGCTCTGCGCCGGAAGACCCTATTTTCAG	8638

BX679671.7	251	GTTCTCTTCCCTCCATTCCTACCCCTTCCCCGGTACCATAAAATCCCGGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	8639	GTTCTCTTCCCTCCATTCCTACCCCTTCCCCGGTACCATAAAATCCCGGG	8688

BX679671.7	301	ATATGAGCTGGAAGAGGCATCACCTGATCCCGGAGACCTTTGGAGTTAAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	8689	ATATGAGCTGGAAGAGGCATCACCTGATCCCGGAGACCTTTGGAGTTAAG	8738

BX679671.7	351	AGGCGGCGGAAGCGAGGGCCTGTGGAGTCGGATCCTCTTCGGGGTGAGCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	8739	AGGCGGCGGAAGCGAGGGCCTGTGGAGTCGGATCCTCTTCGGGGTGAGCC	8788

BX679671.7	401	AGGTAACCATGGCAACCCCGGGGGTGGGGCCTCGCTTCCGGTAGCCGAGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	8789	AGGTAACCATGGCAACCCCGGGGGTGGGGCCTCGCTTCCGGTAGCCGAGA	8838

BX679671.7	451	GTTTTGTTAGAACCGCGTCCCCGCCCCAGTTCCCTGTCCGTGAGCCGATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	8839	GTTTTGTTAGAACCGCGTCCCCGCCCCAGTTCCCTGTCCGTGAGCCGATT	8888

BX679671.7	501	TATCTGCCCAGGGTCGGCGCGCGCGGCTGTCTCAGAACTCATGCAGCTGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	8889	TATCTGCCCAGGGTCGGCGCGCGCGGCTGTCTCAGAACTCATGCAGCTGT	8938

BX679671.7	551	TCCCGCGAGGCCTGTTTGAGGACGCGCTGCCGCCCATCGTGCTGAGGAGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	8939	TCCCGCGAGGCCTGTTTGAGGACGCGCTGCCGCCCATCGTGCTGAGGAGC	8988

BX679671.7	601	CAGGTGTACAGCCTTGTGCCTGACAGGACCGTGGCCGACCGGCAGCTGGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	8989	CAGGTGTACAGCCTTGTGCCTGACAGGACCGTGGCCGACCGGCAGCTGGT	9038

BX679671.7	651	GAGGGGCGTCGGTGCGACCGCCGGAAGCCCCTTTCCTAACTCCTGGAATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9039	GAGGGGCGTCGGTGCGACCGCCGGAAGCCCCTTTCCTAACTCCTGGAATT	9088

BX679671.7	701	CCCTGTCACTCAGTCACTCCGCCAGCCGTTCAGCAAGCATTAGGCCTTTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9089	CCCTGTCACTCAGTCACTCCGCCAGCCGTTCAGCAAGCATTAGGCCTTTC	9138

BX679671.7	751	AGGCGAGGGCACTGTGCCAGGCACTGGGGTGCCACAGAGACCCTGTTAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9139	AGGCGAGGGCACTGTGCCAGGCACTGGGGTGCCACAGAGACCCTGTTAAA	9188

BX679671.7	801	AGTCCCGCAGGTAGTACAGGGCATTTCAAATCATGGAGGTAGAAGAACGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9189	AGTCCCGCAGGTAGTACAGGGCATTTCAAATCATGGAGGTAGAAGAACGA	9238

BX679671.7	851	GGCTTTTGGGGAAACCGAGTCATGGGGCATGGTTCGAACATACAGCGCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9239	GGCTTTTGGGGAAACCGAGTCATGGGGCATGGTTCGAACATACAGCGCTG	9288

BX679671.7	901	GGAGTGCAGTCAGACGTCAGATCATGACAGGCCTTGTACATCAGTGTTGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9289	GGAGTGCAGTCAGACGTCAGATCATGACAGGCCTTGTACATCAGTGTTGT	9338

BX679671.7	951	TTCCATCTTACACTGAGGCGATGGGCTGGTAGAGAATATCATAGAGAGAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9339	TTCCATCTTACACTGAGGCGATGGGCTGGTAGAGAATATCATAGAGAGAG	9388

BX679671.7	1001	GGAATGGTGTATTGGAGATAGTGGATGAGGCAGGGAGGTCAGCTAAGAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9389	GGAATGGTGTATTGGAGATAGTGGATGAGGCAGGGAGGTCAGCTAAGAAG	9438

BX679671.7	1051	ATACTGCATCTGAGAAGTGGTGAAGGCCTAAATTAGGTCAGTGCAGTAGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9439	ATACTGCATCTGAGAAGTGGTGAAGGCCTAAATTAGGTCAGTGCAGTAGG	9488

BX679671.7	1101	GAGGGAGAGGAGAGTGAGGAAGAGGGAGGAGTCCAGGACAACTCAGACTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9489	GAGGGAGAGGAGAGTGAGGAAGAGGGAGGAGTCCAGGACAACTCAGACTT	9538

BX679671.7	1151	TCCAGATGACTGCGTGGCTGGTGGTATTAGGAGCACATTTAGTTGTTGGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9539	TCCAGATGACTGCGTGGCTGGTGGTATTAGGAGCACATTTAGTTGTTGGA	9588

BX679671.7	1201	CTACAGATAATGTGTTTAATTTTATACAAGTTGAGTTGATGGTGCATGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9589	CTACAGATAATGTGTTTAATTTTATACAAGTTGAGTTGATGGTGCATGTG	9638

BX679671.7	1251	GAGCATCCAAAGACAAAGGTATTAGACAGTTGGATATGAGAGTTGGAGAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9639	GAGCATCCAAAGACAAAGGTATTAGACAGTTGGATATGAGAGTTGGAGAG	9688

BX679671.7	1301	AATTCTGGGCCAGTGATAATAGAATTACAAGTCATGGAGGTGTGAATAGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9689	AATTCTGGGCCAGTGATAATAGAATTACAAGTCATGGAGGTGTGAATAGC	9738

BX679671.7	1351	AAGTGGTTAATTCTGTGATGTGGTGAGATCCAGTAGGAAGAGTGGGTAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9739	AAGTGGTTAATTCTGTGATGTGGTGAGATCCAGTAGGAAGAGTGGGTAGA	9788

BX679671.7	1401	GGAGTGATTTCTAACCTTTTTGTAATCTTTAGAAGGTGATAAAAGCTATG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9789	GGAGTGATTTCTAACCTTTTTGTAATCTTTAGAAGGTGATAAAAGCTATG	9838

BX679671.7	1451	GCTATCTCTCTCCAGAAAAATGCACGTTTGCCACATATACATAGGGTGTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9839	GCTATCTCTCTCCAGAAAAATGCACGTTTGCCACATATACATAGGGTGTA	9888

BX679671.7	1501	TGTATAGTTAGGGGGGAAATATTTTACTAATCCTGCGAGGTCCGTGGTTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9889	TGTATAGTTAGGGGGGAAATATTTTACTAATCCTGCGAGGTCCGTGGTTA	9938

BX679671.7	1551	AGGACTCCAGGTTTAGAGTGGAAGTTAATAGGGTCAAATCCACAATGCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9939	AGGACTCCAGGTTTAGAGTGGAAGTTAATAGGGTCAAATCCACAATGCTG	9988

BX679671.7	1601	GGAAACACCATCATTTAAGGCAGTGTTACTGAATATATGAGCTGAGTTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	9989	GGAAACACCATCATTTAAGGCAGTGTTACTGAATATATGAGCTGAGTTAT	10038

BX679671.7	1651	TATGCCTGTGTCAAAATTACGTGGGCTGCTTGTTAAAAAAAATACAGGTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	10039	TATGCCTGTGTCAAAATTACGTGGGCTGCTTGTTAAAAAAAATACAGGTT	10088

BX679671.7	1701	CCTGGGACTCATCCAAGGTTAATGAATTACGCTCTCTTGGGGCGGGATTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	10089	CCTGGGACTCATCCAAGGTTAATGAATTACGCTCTCTTGGGGCGGGATTT	10138

BX679671.7	1751	GGGACTCTACATTTTTGAACTGCCTCAAGTGCTTTTTAAGTGTGCCTTAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	10139	GGGACTCTACATTTTTGAACTGCCTCAAGTGCTTTTTAAGTGTGCCTTAA	10188

BX679671.7	1801	AATTTGAGATCCACTGACATAAAGGGAAAGCAGAAGAAGAGGAATCTGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	10189	AATTTGAGATCCACTGACATAAAGGGAAAGCAGAAGAAGAGGAATCTGTG	10238

BX679671.7	1851	ACAGAGGCAGAGAGGGACTTGCCTGAGTTAAGAGGAACCCAGAGGCCGGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	10239	ACAGAGGCAGAGAGGGACTTGCCTGAGTTAAGAGGAACCCAGAGGCCGGC	10288

BX679671.7	1901	GCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	10289	GCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTG	10338

BX679671.7	1951	GATCTCTTGAGCTCATGAGTTTGATACCAGCATGGGCAACATGACATAAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753822.3	10339	GATCTCTTGAGCTCATGAGTTTGATACCAGCATGGGCAACATGACATAAC	10388

Overview

Query
BX679671.7 - 96335 bps
Hit
CR753822.3 - 10388 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link