<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR753892.5	1	AATAAAACAACAAACGTTTGGCCCTCTCCCTGTTAGCATACTTAATCATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	72852	AATAAAACAACAAACGTTTGGCCCTCTCCCTGTTAGCATACTTAATCATT	72901

CR753892.5	51	TAATACTAAGGAGTAGGTACCGTTATTCTCATCTTATTGACAGAAGCGAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	72902	TAATACTAAGGAGTAGGTACCGTTATTCTCATCTTATTGACAGAAGCGAA	72951

CR753892.5	101	GCAAAGCAACATATCTCAAGCAGTACGGCTGGTGAGGTTACAGCCAGGAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	72952	GCAAAGCAACATATCTCAAGCAGTACGGCTGGTGAGGTTACAGCCAGGAT	73001

CR753892.5	151	GCAAACATCTCTCATTCTCTATTGTATTCTGCCTCCCTGCTCAAAGAATC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73002	GCAAACATCTCTCATTCTCTATTGTATTCTGCCTCCCTGCTCAAAGAATC	73051

CR753892.5	201	TGGTTAGTAAATACACTGCAGGTTACCTTATTGGTTCAAATTCTTGGTGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73052	TGGTTAGTAAATACACTGCAGGTTACCTTATTGGTTCAAATTCTTGGTGA	73101

CR753892.5	251	AGTAAGCTTGTCTTCAGTGACAAATGAAGTAACTAATTCAAGAATGGTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73102	AGTAAGCTTGTCTTCAGTGACAAATGAAGTAACTAATTCAAGAATGGTGT	73151

CR753892.5	301	CATAGAAGGTATTTTCCCAAGTATCATTTAATTTATTCAAAAGTATTTAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73152	CATAGAAGGTATTTTCCCAAGTATCATTTAATTTATTCAAAAGTATTTAT	73201

CR753892.5	351	CAACTGCCTCCCTTGTGCCACATGTTGTCCTAGGATCTGGGGACACAACG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73202	CAACTGCCTCCCTTGTGCCACATGTTGTCCTAGGATCTGGGGACACAACG	73251

CR753892.5	401	GTGAACAGCCCTGTTCTCACAGTGTTTACATTACAGGAAAGAAAACACAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73252	GTGAACAGCCCTGTTCTCACAGTGTTTACATTACAGGAAAGAAAACACAT	73301

CR753892.5	451	AAACACAAATACAATGTCAAGTATCGATAAGTGGTCAGGGTGCAGTGGCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73302	AAACACAAATACAATGTCAAGTATCGATAAGTGGTCAGGGTGCAGTGGCT	73351

CR753892.5	501	CAGGCCTGTAACCCAACCCTTGAGGAAGCCGAGCCCGAAGGATTGCTTGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73352	CAGGCCTGTAACCCAACCCTTGAGGAAGCCGAGCCCGAAGGATTGCTTGA	73401

CR753892.5	551	GCCCAGGAGTTTCAGACCAGCCTGGGCAAGTGAGACCCCATCTCTACAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73402	GCCCAGGAGTTTCAGACCAGCCTGGGCAAGTGAGACCCCATCTCTACAAA	73451

CR753892.5	601	AAATTTTAAAATTAGCAAGGCATAGTGGCACTCGCCCGTAATCCCAGCTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73452	AAATTTTAAAATTAGCAAGGCATAGTGGCACTCGCCCGTAATCCCAGCTA	73501

CR753892.5	651	CTCAGGAGGCTGAAGTGGGAGGATCATTTGAGTCCAGGGGTTCAAGGCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73502	CTCAGGAGGCTGAAGTGGGAGGATCATTTGAGTCCAGGGGTTCAAGGCTG	73551

CR753892.5	701	CCGTGAGCTGGAACTCCAGCCTGGGCAACACAGCAGGACCTTGTCTCAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73552	CCGTGAGCTGGAACTCCAGCCTGGGCAACACAGCAGGACCTTGTCTCAAA	73601

CR753892.5	751	AAACCAGTAGCAGTAAGTGCTATGAAGAAAATGCAAGGTAAAGGGGCAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73602	AAACCAGTAGCAGTAAGTGCTATGAAGAAAATGCAAGGTAAAGGGGCAAA	73651

CR753892.5	801	GAGCACTTGCTCCTACACTCCAGCTTTTCTCTACAGTTGCGATCTATAGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73652	GAGCACTTGCTCCTACACTCCAGCTTTTCTCTACAGTTGCGATCTATAGT	73701

CR753892.5	851	CCTCAGATTCCCAAATGAGGAACCATGTTTCTCACTTTAGAGAAATAATA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73702	CCTCAGATTCCCAAATGAGGAACCATGTTTCTCACTTTAGAGAAATAATA	73751

CR753892.5	901	AAGTACTACTTGTTCTTGTTTCTCCAAGAAGTTTCAAAGGATAGCCATTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73752	AAGTACTACTTGTTCTTGTTTCTCCAAGAAGTTTCAAAGGATAGCCATTT	73801

CR753892.5	951	GGGCTGTTTAGGGAATATGTAAACAAAAAACAAGAAAGTGACTGAAGGCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73802	GGGCTGTTTAGGGAATATGTAAACAAAAAACAAGAAAGTGACTGAAGGCC	73851

CR753892.5	1001	AGGCACAGTGGCTCACACCTCTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73852	AGGCACAGTGGCTCACACCTCTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCA	73901

CR753892.5	1051	GGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGCG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73902	GGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGCG	73951

CR753892.5	1101	AAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATAGCCAGGCGTGGTGGCACA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	73952	AAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATAGCCAGGCGTGGTGGCACA	74001

CR753892.5	1151	CACCCATAATTCCAGCAACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74002	CACCCATAATTCCAGCAACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAA	74051

CR753892.5	1201	CCTGGGAGGCAGAGGTTGCAATGAGCTGAGATCACGCCATTGTATTCCAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74052	CCTGGGAGGCAGAGGTTGCAATGAGCTGAGATCACGCCATTGTATTCCAG	74101

CR753892.5	1251	CCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAACAAAGTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74102	CCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAACAAAGTG	74151

CR753892.5	1301	ACTGAAAATGAGAAATGATGAGGCAAAAGGAGGCTGCTTCAACTCACCAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74152	ACTGAAAATGAGAAATGATGAGGCAAAAGGAGGCTGCTTCAACTCACCAA	74201

CR753892.5	1351	TTTATTTGCCAATAATTATTTTATTGATACTTTTTTTATTGTTACAATGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74202	TTTATTTGCCAATAATTATTTTATTGATACTTTTTTTATTGTTACAATGG	74251

CR753892.5	1401	GAAAGTAAGGTGTCAAGGATATAGAAAGGAAGGGCATGCATATGAGGGAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74252	GAAAGTAAGGTGTCAAGGATATAGAAAGGAAGGGCATGCATATGAGGGAA	74301

CR753892.5	1451	CACAGTATCATTTTAGATCTTAGAAAGCAATGAGCATCTGATAAGTCTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74302	CACAGTATCATTTTAGATCTTAGAAAGCAATGAGCATCTGATAAGTCTTT	74351

CR753892.5	1501	GGGGAAATAGGAAAGGAGGAAAATCTAATAAAGACAAAGATCAGCAAAAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74352	GGGGAAATAGGAAAGGAGGAAAATCTAATAAAGACAAAGATCAGCAAAAG	74401

CR753892.5	1551	AAAAACAAAGAGAGGCTACAAAATGCAGTTATCTACCTGGAATTATAAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74402	AAAAACAAAGAGAGGCTACAAAATGCAGTTATCTACCTGGAATTATAAGA	74451

CR753892.5	1601	GAGGGGCTAAATGTAGTCATCTCCTCTTTTTGGAGATCAGAAGGTCTCTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74452	GAGGGGCTAAATGTAGTCATCTCCTCTTTTTGGAGATCAGAAGGTCTCTG	74501

CR753892.5	1651	GGAAAAGAGAAGAACCAATTTTTCAGAAAATAACTAGGGTCACAGAATGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74502	GGAAAAGAGAAGAACCAATTTTTCAGAAAATAACTAGGGTCACAGAATGA	74551

CR753892.5	1701	ACAAGTGGAATTAGAGAGCCAGTGATGGACGTGAGGAAACAGCTGTGTAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74552	ACAAGTGGAATTAGAGAGCCAGTGATGGACGTGAGGAAACAGCTGTGTAG	74601

CR753892.5	1751	GTTTTGACCAGTGAGCAGGTGGTGGTAATAGTATCACAGGGTTGCTACTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74602	GTTTTGACCAGTGAGCAGGTGGTGGTAATAGTATCACAGGGTTGCTACTT	74651

CR753892.5	1801	ACTGAATCACTGCTACAACATGCAAGGAACTGTGCTAGACTTTACAGAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74652	ACTGAATCACTGCTACAACATGCAAGGAACTGTGCTAGACTTTACAGAAT	74701

CR753892.5	1851	GATTCCTAATCATTGAAGCAACCCTCACAAGGTAGGCATTATTATCATCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74702	GATTCCTAATCATTGAAGCAACCCTCACAAGGTAGGCATTATTATCATCC	74751

CR753892.5	1901	CAGTTTCACAGAGGAGGACATCGAGGCTACCAAGTTAAGTAGCTTGTCCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74752	CAGTTTCACAGAGGAGGACATCGAGGCTACCAAGTTAAGTAGCTTGTCCT	74801

CR753892.5	1951	GGTTTCACAGCCAGCAAGTGACAGGGTCAAGAGAGGGACCCACATCGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753820.15	74802	GGTTTCACAGCCAGCAAGTGACAGGGTCAAGAGAGGGACCCACATCGGCC	74851

Overview

Query
CR753892.5 - 101422 bps
Hit
CR753820.15 - 74851 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link