<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR847993.4	1	TAAGTCTGATCAAATCAATAAAGCAAATTTTATCTGTTTTTGTCTGGGAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	32494	TAAGTCTGATCAAATCAATAAAGCAAATTTTATCTGTTTTTGTCTGGGAC	32543

CR847993.4	51	ATATCTCTACATTCATTCATTTAACCAAAAAAAAAAAAAATGTTTTTTTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	32544	ATATCTCTACATTCATTCATTTAACCAAAAAAAAAAAAAATGTTTTTTTT	32593

CR847993.4	101	GAGACGAAGTTTTGCTCTTTTGCCCCGGCTGGAGTGAAGTGGCGCGATCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	32594	GAGACGAAGTTTTGCTCTTTTGCCCCGGCTGGAGTGAAGTGGCGCGATCT	32643

CR847993.4	151	CAGCTCACTGCAACCTCTGCCCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	32644	CAGCTCACTGCAACCTCTGCCCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCA	32693

CR847993.4	201	GCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCTGGCTAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	32694	GCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCTGGCTAAT	32743

CR847993.4	251	TTTTGTATTTATAGTAGAGACAAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	32744	TTTTGTATTTATAGTAGAGACAAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGT	32793

CR847993.4	301	CCCGAACTCTTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	32794	CCCGAACTCTTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGC	32843

CR847993.4	351	TAGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTTAACAAAATATTTATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	32844	TAGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTTAACAAAATATTTATT	32893

CR847993.4	401	CAGTGCCTAGCATGAGCTCAACACTCTACGTCTCCCAGTCTGTCTATCTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	32894	CAGTGCCTAGCATGAGCTCAACACTCTACGTCTCCCAGTCTGTCTATCTC	32943

CR847993.4	451	AGTCTACCTGTAAGCTGAAGGATACAACTTATCTCTTAAGAGGACTATGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	32944	AGTCTACCTGTAAGCTGAAGGATACAACTTATCTCTTAAGAGGACTATGC	32993

CR847993.4	501	CCGCGTTCTCCTACCACCCAGGCCAAAGGGTCACATTTACAGGATGTAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	32994	CCGCGTTCTCCTACCACCCAGGCCAAAGGGTCACATTTACAGGATGTAGT	33043

CR847993.4	551	CAACTGGTCATTCAGCAAGTATGTATGAGCACCTGTGTGGGACTGGCCAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33044	CAACTGGTCATTCAGCAAGTATGTATGAGCACCTGTGTGGGACTGGCCAC	33093

CR847993.4	601	CGTAGCAAATAAATGAGTCTCATCTTAGTCAATCGCGGTGTGAAATGAGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33094	CGTAGCAAATAAATGAGTCTCATCTTAGTCAATCGCGGTGTGAAATGAGG	33143

CR847993.4	651	ACACGAAGTCCAGACCTAACCTCTAAGAGAAAAGCCCTGCCTGATAGAAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33144	ACACGAAGTCCAGACCTAACCTCTAAGAGAAAAGCCCTGCCTGATAGAAG	33193

CR847993.4	701	AAGAGATTTGTCCTTACTTAATGCAAATGCACCATATTCATGCACCTATG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33194	AAGAGATTTGTCCTTACTTAATGCAAATGCACCATATTCATGCACCTATG	33243

CR847993.4	751	AATGATGGCTAAGACCACAGACAAGGCCGGGGCATTGGATATAACAGCTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33244	AATGATGGCTAAGACCACAGACAAGGCCGGGGCATTGGATATAACAGCTC	33293

CR847993.4	801	TGTGAGGAGCTCAGGACAAAAACCAAAGAATCAAAGATATGTGAAGACAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33294	TGTGAGGAGCTCAGGACAAAAACCAAAGAATCAAAGATATGTGAAGACAG	33343

CR847993.4	851	TTGATTATTGTTTGCTCACTACTGATGCCACTATGAGCAGCATCACCACC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33344	TTGATTATTGTTTGCTCACTACTGATGCCACTATGAGCAGCATCACCACC	33393

CR847993.4	901	AGTGTTAAATAATGGAATTGTAGTATTATGATACAGAGTCGGAAACACGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33394	AGTGTTAAATAATGGAATTGTAGTATTATGATACAGAGTCGGAAACACGG	33443

CR847993.4	951	AATAATAAATTAAAATACTAAAGTGAAAAAATTGGATTGATTAAATAAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33444	AATAATAAATTAAAATACTAAAGTGAAAAAATTGGATTGATTAAATAAAT	33493

CR847993.4	1001	ATTAAACCAATATTTCTCAGACTTATGTGATAAACACCTTTAAAGGAAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33494	ATTAAACCAATATTTCTCAGACTTATGTGATAAACACCTTTAAAGGAAAA	33543

CR847993.4	1051	GATACATATATATTTTTGAGACAGAGTCTCATTCTGTTGCCCAGGTTGGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33544	GATACATATATATTTTTGAGACAGAGTCTCATTCTGTTGCCCAGGTTGGA	33593

CR847993.4	1101	GTCCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACTTCCTGGGTTCAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33594	GTCCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACTTCCTGGGTTCAA	33643

CR847993.4	1151	GCGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCACC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33644	GCGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCACC	33693

CR847993.4	1201	ACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33694	ACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCAT	33743

CR847993.4	1251	GTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33744	GTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTT	33793

CR847993.4	1301	GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTGTGGGCCACCGTGCCTGGCTGGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33794	GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTGTGGGCCACCGTGCCTGGCTGGA	33843

CR847993.4	1351	AAAGAGATTTTTTGAGAACTCGCCATGTTGGCTTAAACGTAAATATATAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33844	AAAGAGATTTTTTGAGAACTCGCCATGTTGGCTTAAACGTAAATATATAT	33893

CR847993.4	1401	GAAACAGAAAATGAAGTATAAACTCCTTATGCTTATAGCTCTACTGTTCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33894	GAAACAGAAAATGAAGTATAAACTCCTTATGCTTATAGCTCTACTGTTCC	33943

CR847993.4	1451	AATAACGTTAGAAGTAACAGCAGTAGTTTAATGTAATGCATGATATTTCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33944	AATAACGTTAGAAGTAACAGCAGTAGTTTAATGTAATGCATGATATTTCT	33993

CR847993.4	1501	TTACTGAAGAATTCTTCGCTCCAACATTAATATTGTAGTGATTGCTACAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	33994	TTACTGAAGAATTCTTCGCTCCAACATTAATATTGTAGTGATTGCTACAG	34043

CR847993.4	1551	CCTAGTTTCTCAAATCTCATTTGCCACTTGATGTTTTCCTTCTTTCATGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	34044	CCTAGTTTCTCAAATCTCATTTGCCACTTGATGTTTTCCTTCTTTCATGG	34093

CR847993.4	1601	ATCGTCTCTGTACAAGCTCTCTCAAGACCTTCAGTCTCTCAGTCAGCTGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	34094	ATCGTCTCTGTACAAGCTCTCTCAAGACCTTCAGTCTCTCAGTCAGCTGC	34143

CR847993.4	1651	GGGATTATTGGGCCCTTAATGCAAATGCACCGTTTAAATTTTAAGACAGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	34144	GGGATTATTGGGCCCTTAATGCAAATGCACCGTTTAAATTTTAAGACAGT	34193

CR847993.4	1701	TCTCGTTCTACTCTTGTTAGGCTGTGCAATTGTAAAGACTAATCATTTCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	34194	TCTCGTTCTACTCTTGTTAGGCTGTGCAATTGTAAAGACTAATCATTTCT	34243

CR847993.4	1751	ATTAGCTTTATGTTGGTTTTATATTGGTCATCAATAGAATCCAGGAAATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	34244	ATTAGCTTTATGTTGGTTTTATATTGGTCATCAATAGAATCCAGGAAATG	34293

CR847993.4	1801	CTTATATTATGGGGATTTTCAAGATTATTACCTGAAGGAAAACGTGACAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	34294	CTTATATTATGGGGATTTTCAAGATTATTACCTGAAGGAAAACGTGACAG	34343

CR847993.4	1851	AAACAGCTCTAGTCTCCCCTTCCCTTACACTTGGAGAACCTGAGTTTTGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	34344	AAACAGCTCTAGTCTCCCCTTCCCTTACACTTGGAGAACCTGAGTTTTGG	34393

CR847993.4	1901	GGGTGATGGTAATGTGCCCAGCTGAAGAAAACCATTTCCCAAATCCCCAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	34394	GGGTGATGGTAATGTGCCCAGCTGAAGAAAACCATTTCCCAAATCCCCAA	34443

CR847993.4	1951	TTTCCCGGTCCCCCTTGCAGCCAGTGCAGTGAGGAGATACAGCTCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753812.3	34444	TTTCCCGGTCCCCCTTGCAGCCAGTGCAGTGAGGAGATACAGCTCTGGCC	34493

Overview

Query
CR847993.4 - 20924 bps
Hit
CR753812.3 - 34493 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link