<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR752644.6	1	GGCCAGGCTGGTCTCAAACTTCTGACCTTGTGATCCCCTGGTCTTAGCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	17437	GGCCAGGCTGGTCTCAAACTTCTGACCTTGTGATCCCCTGGTCTTAGCCT	17486

CR752644.6	51	CCCAAAGTGCTGGGATTACTGCACCCAGCCGAAAGCCTGTTATGTTATTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	17487	CCCAAAGTGCTGGGATTACTGCACCCAGCCGAAAGCCTGTTATGTTATTT	17536

CR752644.6	101	AGCAACACTGCTTACATAAGAATGATCCTTGATGTTAGACTGCATCTGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	17537	AGCAACACTGCTTACATAAGAATGATCCTTGATGTTAGACTGCATCTGAA	17586

CR752644.6	151	CTGGGAGAATTGTAAATATGTATTAAGAAGCCATAACTTTGGGCTTCCCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	17587	CTGGGAGAATTGTAAATATGTATTAAGAAGCCATAACTTTGGGCTTCCCT	17636

CR752644.6	201	GAGTGTAGTGACCCATGTATTTGGTCATATTCCTTACGGGATCCCTGCAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	17637	GAGTGTAGTGACCCATGTATTTGGTCATATTCCTTACGGGATCCCTGCAG	17686

CR752644.6	251	GTAATGTGTATGGGGTTCTTATAGGAGATTTTAGTTCCTGGTGGATCTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	17687	GTAATGTGTATGGGGTTCTTATAGGAGATTTTAGTTCCTGGTGGATCTGT	17736

CR752644.6	301	GGGGTTTCTAAGCTAGGTCAGCTCCCAACTCAACTGACAGAAGGCCAAAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	17737	GGGGTTTCTAAGCTAGGTCAGCTCCCAACTCAACTGACAGAAGGCCAAAC	17786

CR752644.6	351	AGAATAGGTCCTAGGTGGCTATGTGGACACCTGCATAGATCATGGCGAGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	17787	AGAATAGGTCCTAGGTGGCTATGTGGACACCTGCATAGATCATGGCGAGT	17836

CR752644.6	401	ACTACTCCCACAGCAGAGGGATAGCTGTTAATGCCCTTGCTGGCAAACTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	17837	ACTACTCCCACAGCAGAGGGATAGCTGTTAATGCCCTTGCTGGCAAACTG	17886

CR752644.6	451	TGCTTCCTCCCTTAGGTCCTACTGAGTAGACTGTTCCCAGATGAGAGCTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	17887	TGCTTCCTCCCTTAGGTCCTACTGAGTAGACTGTTCCCAGATGAGAGCTA	17936

CR752644.6	501	TGGTAATCTTCTAAGTCTGCGTGGTTAGTTGAATCTAAAAAGACCATATC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	17937	TGGTAATCTTCTAAGTCTGCGTGGTTAGTTGAATCTAAAAAGACCATATC	17986

CR752644.6	551	TTCACCCAGTGGGCATTGCAGTTAATAATCCTTCACTTCAGTGTCACTCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	17987	TTCACCCAGTGGGCATTGCAGTTAATAATCCTTCACTTCAGTGTCACTCA	18036

CR752644.6	601	GAATGAGAAATATCCACATTTTGATCAATAATCCTCGAACTTTTAACTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18037	GAATGAGAAATATCCACATTTTGATCAATAATCCTCGAACTTTTAACTCT	18086

CR752644.6	651	GAATTTTTTTTTTCCTGTGTAAAACACCTGGAAGATGGCTTTCCAGATCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18087	GAATTTTTTTTTTCCTGTGTAAAACACCTGGAAGATGGCTTTCCAGATCT	18136

CR752644.6	701	GGATACCCTTGGCTATGAGCAGTAAACCAGTTACACATTTAGATATTATG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18137	GGATACCCTTGGCTATGAGCAGTAAACCAGTTACACATTTAGATATTATG	18186

CR752644.6	751	CTAACTTAATAGTTGCTTTGCCTGTATCTACAAATATGTATCTTTGATTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18187	CTAACTTAATAGTTGCTTTGCCTGTATCTACAAATATGTATCTTTGATTC	18236

CR752644.6	801	TGAAGTAGAAGTCTTATGATACCTGCCCTCTTGACATAAGTTACTAAATC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18237	TGAAGTAGAAGTCTTATGATACCTGCCCTCTTGACATAAGTTACTAAATC	18286

CR752644.6	851	CTTGGATAGGTGATCACTTCAAAATTTTGTTTCTTCAGTTTTTCTATATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18287	CTTGGATAGGTGATCACTTCAAAATTTTGTTTCTTCAGTTTTTCTATATT	18336

CR752644.6	901	TTCTTCCTTCCTTTCCAGTTTCAATTTGTGACTTTTTGTACCTTTATTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18337	TTCTTCCTTCCTTTCCAGTTTCAATTTGTGACTTTTTGTACCTTTATTTT	18386

CR752644.6	951	TATTCTCTTTCTCAACATACTCATTTCCCTTCTTTATTCTCTTATGTGCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18387	TATTCTCTTTCTCAACATACTCATTTCCCTTCTTTATTCTCTTATGTGCC	18436

CR752644.6	1001	AATTCACTTACTCTTTCTGCTTCCAATTTTCTTCCTACTTTTGTTCTTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18437	AATTCACTTACTCTTTCTGCTTCCAATTTTCTTCCTACTTTTGTTCTTTT	18486

CR752644.6	1051	TAAATTTTCTCCTATTTATCTCTCTCTAAACTGCATCTTCATTCTGTATC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18487	TAAATTTTCTCCTATTTATCTCTCTCTAAACTGCATCTTCATTCTGTATC	18536

CR752644.6	1101	TGTTATTATTTGTGTTACTCATTCTCTCACTTTTTCTCCTCTAGGCCTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18537	TGTTATTATTTGTGTTACTCATTCTCTCACTTTTTCTCCTCTAGGCCTTT	18586

CR752644.6	1151	ACTACCCTTTAATCTCAATATTAGAACTTCATTTTATTCATTGTTAATAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18587	ACTACCCTTTAATCTCAATATTAGAACTTCATTTTATTCATTGTTAATAA	18636

CR752644.6	1201	CCTGTTATAACACCCAAAAATGATAGTGGAAAGAATGAAGAGTTAGTAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18637	CCTGTTATAACACCCAAAAATGATAGTGGAAAGAATGAAGAGTTAGTAAA	18686

CR752644.6	1251	ACTTCAGTCTTAATTTTATTAACTAACCCATCCTCTTATTTTTTTGAGAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18687	ACTTCAGTCTTAATTTTATTAACTAACCCATCCTCTTATTTTTTTGAGAA	18736

CR752644.6	1301	ATGACTCCTGACCCTCAGTTTCCTCATCTCTAAATATGGGGATAATAACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18737	ATGACTCCTGACCCTCAGTTTCCTCATCTCTAAATATGGGGATAATAACT	18786

CR752644.6	1351	GCCTTACTCATTGCCATTTGAATGTTGTTTAGATGCAACAAAGTAATGTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18787	GCCTTACTCATTGCCATTTGAATGTTGTTTAGATGCAACAAAGTAATGTA	18836

CR752644.6	1401	CGCGAGGGTTAAAAAAACAGTAGTAAGACATTATAGGGATCACTCAAAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18837	CGCGAGGGTTAAAAAAACAGTAGTAAGACATTATAGGGATCACTCAAAGA	18886

CR752644.6	1451	ATGTGACTAGGTTGCTAAAAGTTGCTGAAAATAGAGCCTAACTCTTCTGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18887	ATGTGACTAGGTTGCTAAAAGTTGCTGAAAATAGAGCCTAACTCTTCTGG	18936

CR752644.6	1501	AGAGAACTTTTCAGGGCAATTAGAAAGGAAAGGAAGGCCAGGCGCAGTGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18937	AGAGAACTTTTCAGGGCAATTAGAAAGGAAAGGAAGGCCAGGCGCAGTGG	18986

CR752644.6	1551	CTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	18987	CTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACG	19036

CR752644.6	1601	AGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACAGAGTGAAACCCCATCTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	19037	AGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACAGAGTGAAACCCCATCTCT	19086

CR752644.6	1651	ACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGGGTGCCTGTAGTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	19087	ACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGGGTGCCTGTAGTC	19136

CR752644.6	1701	CCAGCTACTCGGTAGGCTAAGACAGGAGAACGGCTTGAACCCACGAGGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	19137	CCAGCTACTCGGTAGGCTAAGACAGGAGAACGGCTTGAACCCACGAGGTG	19186

CR752644.6	1751	GAGCTTGCAGTGAGTGGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCCGGATGACA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	19187	GAGCTTGCAGTGAGTGGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCCGGATGACA	19236

CR752644.6	1801	GAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAATAAAGAAAGGAAACTTAAAATTTGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	19237	GAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAATAAAGAAAGGAAACTTAAAATTTGC	19286

CR752644.6	1851	ATTATTTTACAAAGTGAAGATAATCTAATAATGGAAAAATTATTTGCATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	19287	ATTATTTTACAAAGTGAAGATAATCTAATAATGGAAAAATTATTTGCATG	19336

CR752644.6	1901	GAAAGCACAGCAGGAAGTTTAGGTGCTGGGTTCTAAGTCTTTATTAAGTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	19337	GAAAGCACAGCAGGAAGTTTAGGTGCTGGGTTCTAAGTCTTTATTAAGTA	19386

CR752644.6	1951	TTGGCTCTACAGAGCTAGATTATATGCTGAAGTGGAAACAGCTTAGGACC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR751604.3	19387	TTGGCTCTACAGAGCTAGATTATATGCTGAAGTGGAAACAGCTTAGGACC	19436

Overview

Query
CR752644.6 - 67131 bps
Hit
CR751604.3 - 19436 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link