<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR735112.10	1	GAATTCAGCTTGAATCAGAAAGACTCTAATGCTGAGTCATTTTTTCCACT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	23486	GAATTCAGCTTGAATCAGAAAGACTCTAATGCTGAGTCATTTTTTCCACT	23535

CR735112.10	51	TTTTCTTAGCGCACAGACCTCGTTCTCCTCGACAGAATAGCATTGGCGGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	23536	TTTTCTTAGCGCACAGACCTCGTTCTCCTCGACAGAATAGCATTGGCGGT	23585

CR735112.10	101	GAAGCTCCGAGCTCCTCCTGCTTGTCTTCCCCTCAGGCTGGTACAGTGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	23586	GAAGCTCCGAGCTCCTCCTGCTTGTCTTCCCCTCAGGCTGGTACAGTGCC	23635

CR735112.10	151	AGTCGACTCGGTGACCGCTTCAACGACAGCGACATCACCCACAGCTGCCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	23636	AGTCGACTCGGTGACCGCTTCAACGACAGCGACATCACCCACAGCTGCCA	23685

CR735112.10	201	ACCCGGCCACCAACTTGGAAGCATCTCCAATAGAAGAGGGTTAGGATGCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	23686	ACCCGGCCACCAACTTGGAAGCATCTCCAATAGAAGAGGGTTAGGATGCA	23735

CR735112.10	251	ACTCGCATACAGTGCCCAGCATTAATGAGTACACCCTAAGAGATTTCTTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	23736	ACTCGCATACAGTGCCCAGCATTAATGAGTACACCCTAAGAGATTTCTTC	23785

CR735112.10	301	GACAAAAGCACTCATTTTGCTTTTAAATTGGTGCTTTTTATAGGATACAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	23786	GACAAAAGCACTCATTTTGCTTTTAAATTGGTGCTTTTTATAGGATACAA	23835

CR735112.10	351	TGAGGTTCTTGTGCTAATCATGTTTATTGGTTTTGCATTAGATGAGTCAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	23836	TGAGGTTCTTGTGCTAATCATGTTTATTGGTTTTGCATTAGATGAGTCAC	23885

CR735112.10	401	AACCGAAACTGGAACAAAATGACTTAAGATCATTGTGCAAAAATTAGTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	23886	AACCGAAACTGGAACAAAATGACTTAAGATCATTGTGCAAAAATTAGTGA	23935

CR735112.10	451	ACCCAATAAATATGTTAGGAGAAAATATAAAAATTAAATCTTCAATAAAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	23936	ACCCAATAAATATGTTAGGAGAAAATATAAAAATTAAATCTTCAATAAAC	23985

CR735112.10	501	CAGAAAAATCAATGAGGCCATGCAAAATATTATATTTAGTAAACTTTTGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	23986	CAGAAAAATCAATGAGGCCATGCAAAATATTATATTTAGTAAACTTTTGT	24035

CR735112.10	551	AGCTTGTGATTATTTTTTGCATCGTATCATATTTGAATTCAAATCATAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24036	AGCTTGTGATTATTTTTTGCATCGTATCATATTTGAATTCAAATCATAAA	24085

CR735112.10	601	GATATTAGATTGGCAACACTTTCTTTAAAAAGTAAAACTTTTTAATAAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24086	GATATTAGATTGGCAACACTTTCTTTAAAAAGTAAAACTTTTTAATAAAA	24135

CR735112.10	651	CAGTCCTGGTCACACTTTACAATAAAGTTTCATCAGTTAATGTATTTACT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24136	CAGTCCTGGTCACACTTTACAATAAAGTTTCATCAGTTAATGTATTTACT	24185

CR735112.10	701	AACATGAACAACACCTATTCAGCATTCATTAATCATAGTTCAACATTTAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24186	AACATGAACAACACCTATTCAGCATTCATTAATCATAGTTCAACATTTAC	24235

CR735112.10	751	TAATGCATTATTAATATCCAAATTCATGCTTGTTAACATAAGTTTATGCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24236	TAATGCATTATTAATATCCAAATTCATGCTTGTTAACATAAGTTTATGCA	24285

CR735112.10	801	CCATTAGTTAACATGAACTAGCAATGTATATCTGTATTTTCATGAACAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24286	CCATTAGTTAACATGAACTAGCAATGTATATCTGTATTTTCATGAACAAA	24335

CR735112.10	851	TGTTAATCAAACACAAACGAATGCTATAATGTAATTTATTAACTCTGAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24336	TGTTAATCAAACACAAACGAATGCTATAATGTAATTTATTAACTCTGAAA	24385

CR735112.10	901	CTGAATTAATTTATTAATTTATTAACTCTGAAAACAGAACTACTCTGTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24386	CTGAATTAATTTATTAATTTATTAACTCTGAAAACAGAACTACTCTGTTT	24435

CR735112.10	951	CAACTTACTATGATCTTCTATGTGAAGCTGCTTTGACACAATCTACATTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24436	CAACTTACTATGATCTTCTATGTGAAGCTGCTTTGACACAATCTACATTG	24485

CR735112.10	1001	TAAATGCGCAATAGAAATAAAGGTGAATTGAATTGAATTCATTTCTTTAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24486	TAAATGCGCAATAGAAATAAAGGTGAATTGAATTGAATTCATTTCTTTAT	24535

CR735112.10	1051	GTTAGTAAATGCATGAAATAACATTAGCTTACTGTAAAGTGCTACCAGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24536	GTTAGTAAATGCATGAAATAACATTAGCTTACTGTAAAGTGCTACCAGAG	24585

CR735112.10	1101	TCCTGTGAAACTGCACCAATACCTATCGTCCATATATACTGAGAAATTGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24586	TCCTGTGAAACTGCACCAATACCTATCGTCCATATATACTGAGAAATTGA	24635

CR735112.10	1151	TACAATTTTTAATTGTCAAGGGGTGTGCTGGGAACTGTCATGAGGCATTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24636	TACAATTTTTAATTGTCAAGGGGTGTGCTGGGAACTGTCATGAGGCATTT	24685

CR735112.10	1201	TAATGCCCGTTTATGATTTCATCTGTACCATGTCTTGCAACAGCCTAATT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24686	TAATGCCCGTTTATGATTTCATCTGTACCATGTCTTGCAACAGCCTAATT	24735

CR735112.10	1251	TTTTAACTTGTGTTTGTTTTATAGCCAAAGAATCAAGAGTACTAGAGACA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24736	TTTTAACTTGTGTTTGTTTTATAGCCAAAGAATCAAGAGTACTAGAGACA	24785

CR735112.10	1301	AGGCAGAATTCTCCCAATGCCAACAAGGAGAATGTTAAGCCTATTGAAGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24786	AGGCAGAATTCTCCCAATGCCAACAAGGAGAATGTTAAGCCTATTGAAGC	24835

CR735112.10	1351	TTCTCCAGGCATTGCTCGATCCATCGGCAAGGGTGTGTACCTGTGGAGAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24836	TTCTCCAGGCATTGCTCGATCCATCGGCAAGGGTGTGTACCTGTGGAGAT	24885

CR735112.10	1401	GTCATGCTATTTATCATCCATTGCCAGCAGCTTCTAATCTGAATTTTAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24886	GTCATGCTATTTATCATCCATTGCCAGCAGCTTCTAATCTGAATTTTAAA	24935

CR735112.10	1451	GCTTTTGCTAAAGCTGTTTTTTTTTTTTTTTGTGCTGCATTCGATTTTGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24936	GCTTTTGCTAAAGCTGTTTTTTTTTTTTTTTGTGCTGCATTCGATTTTGC	24985

CR735112.10	1501	TGTGTTGACATAAAGCAAGAAGAAAGCAGAAACTGCAGGTTGTCAGTTTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	24986	TGTGTTGACATAAAGCAAGAAGAAAGCAGAAACTGCAGGTTGTCAGTTTG	25035

CR735112.10	1551	AATTAGGGATTTGGCTTCTAAGAATTCATTTTCTTCTGCAAAATTGCTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	25036	AATTAGGGATTTGGCTTCTAAGAATTCATTTTCTTCTGCAAAATTGCTGA	25085

CR735112.10	1601	CACTGAAAATGCAGATAGAGTGAGAAATGACTTTTTCTGTTCATCTTATA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	25086	CACTGAAAATGCAGATAGAGTGAGAAATGACTTTTTCTGTTCATCTTATA	25135

CR735112.10	1651	AATCATGCACAAACCGCAAAACAAGTGTAGGTGGCGTATGCTTCAGATGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	25136	AATCATGCACAAACCGCAAAACAAGTGTAGGTGGCGTATGCTTCAGATGG	25185

CR735112.10	1701	AGTGTTACCATAATTTAATATAATGAAATTATAAAAATATTTTGGGGATA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	25186	AGTGTTACCATAATTTAATATAATGAAATTATAAAAATATTTTGGGGATA	25235

CR735112.10	1751	ATATGTTGGTAAAATGAAGTACAATATTATTGGGATAACTATAGCTATTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	25236	ATATGTTGGTAAAATGAAGTACAATATTATTGGGATAACTATAGCTATTG	25285

CR735112.10	1801	GGATACATAGTTTTTCTAAAATAAGTTAATATTAGTGCTGTCAATCGATT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	25286	GGATACATAGTTTTTCTAAAATAAGTTAATATTAGTGCTGTCAATCGATT	25335

CR735112.10	1851	AAAAAAAATTAACTAATTAATCACACCTTTTTTAAAAAAATTATCGCGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	25336	AAAAAAAATTAACTAATTAATCACACCTTTTTTAAAAAAATTATCGCGAT	25385

CR735112.10	1901	TAATCACATTTAAAATACTGAAACTTGTAATTTTGGCTATTCAGATATAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	25386	TAATCACATTTAAAATACTGAAACTTGTAATTTTGGCTATTCAGATATAA	25435

CR735112.10	1951	AATGAATGTAAACGCAAGACAAACACTATTTAAATTCAATATTACTATAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR391942.8	25436	AATGAATGTAAACGCAAGACAAACACTATTTAAATTCAATATTACTATAT	25485

Overview

Query
CR735112.10 - 156543 bps
Hit
CR391942.8 - 25485 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001917200012000123486254851
Short-link