<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FP236232.9	1	GAAGCCAAATCTGGAGCTTATCTAACAAAATAACTTGCGATAACAGTCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	162388	GAAGCCAAATCTGGAGCTTATCTAACAAAATAACTTGCGATAACAGTCCA	162437

FP236232.9	51	AAAACTAGGACAACCAAATTTATATGTTATAGAAAAAAAATTAAATACAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	162438	AAAACTAGGACAACCAAATTTATATGTTATAGAAAAAAAATTAAATACAA	162487

FP236232.9	101	ATTTGAATGAGGAAAAATCAAGAAAATTTAGTAGAACATTTTTGTTGAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	162488	ATTTGAATGAGGAAAAATCAAGAAAATTTAGTAGAACATTTTTGTTGAAA	162537

FP236232.9	151	ATGTTTACATTGTAATTTTTTTTCGCAATATTTTGCTTGAATTTAATTAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	162538	ATGTTTACATTGTAATTTTTTTTCGCAATATTTTGCTTGAATTTAATTAT	162587

FP236232.9	201	CTTTCAATTTCTAAATATGCTTGGTGACTAAAATATTATTTTAACAAATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	162588	CTTTCAATTTCTAAATATGCTTGGTGACTAAAATATTATTTTAACAAATG	162637

FP236232.9	251	CATCTGTTTAATAAATCTGTTGTTTAAATGCACCAAAATACATATTCATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	162638	CATCTGTTTAATAAATCTGTTGTTTAAATGCACCAAAATACATATTCATT	162687

FP236232.9	301	TTCAAATGGGGTGTACTTAATTATGCACTGTATTTTATATAAAAATGGTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	162688	TTCAAATGGGGTGTACTTAATTATGCACTGTATTTTATATAAAAATGGTA	162737

FP236232.9	351	ATCCGTGAAATAGTAATTTCTAATAAATGCTTAAGAATCATTTAAATTGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	162738	ATCCGTGAAATAGTAATTTCTAATAAATGCTTAAGAATCATTTAAATTGC	162787

FP236232.9	401	CCATATTATGGGTTTCATATTGAAAAAAAAAATATATATATATATTATTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	162788	CCATATTATGGGTTTCATATTGAAAAAAAAAATATATATATATATTATTA	162837

FP236232.9	451	TATTATATTATTATATTATTATATTATATATATTATAATTTTATTTTATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	162838	TATTATATTATTATATTATTATATTATATATATTATAATTTTATTTTATT	162887

FP236232.9	501	TATCCGTGTCAATCAAATGCTTTTGATGATATAAAAAAATCTTATTCATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	162888	TATCCGTGTCAATCAAATGCTTTTGATGATATAAAAAAATCTTATTCATG	162937

FP236232.9	551	CTGAAAACTTAAAGGTGCAGTAGACGATTGTCTTCAGAAACTGTGCTAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	162938	CTGAAAACTTAAAGGTGCAGTAGACGATTGTCTTCAGAAACTGTGCTAGT	162987

FP236232.9	601	TGAAAATCTCTACACATTTCAATAGTATTTATTAAAGTAAATGATCTAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	162988	TGAAAATCTCTACACATTTCAATAGTATTTATTAAAGTAAATGATCTAAA	163037

FP236232.9	651	TGTATTTATTTGTATTTTTATATTCTGGGTAAGCTATAAGACTTAAAAAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163038	TGTATTTATTTGTATTTTTATATTCTGGGTAAGCTATAAGACTTAAAAAT	163087

FP236232.9	701	GTTCATCCAATTAAATTTTGTCGGTACCACAATTCCTATAATGCTGATAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163088	GTTCATCCAATTAAATTTTGTCGGTACCACAATTCCTATAATGCTGATAA	163137

FP236232.9	751	GAAGCCCAAACTGTCTGTCAACAAATGTAGATATGTACATCTGAAGCCGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163138	GAAGCCCAAACTGTCTGTCAACAAATGTAGATATGTACATCTGAAGCCGT	163187

FP236232.9	801	TCACGCAGATCCGCCAATTGCTCGTACATGTACGGTGACCTCTACATGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163188	TCACGCAGATCCGCCAATTGCTCGTACATGTACGGTGACCTCTACATGAG	163237

FP236232.9	851	AAAGAGCAAAACAAATGCTCAATCAAAACTTTTTAAAGTCCTGAATCATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163238	AAAGAGCAAAACAAATGCTCAATCAAAACTTTTTAAAGTCCTGAATCATT	163287

FP236232.9	901	ATTGGAGTTACTTTTGCACGCTGGAGAAAGGATGACACCGTGGCTGAAGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163288	ATTGGAGTTACTTTTGCACGCTGGAGAAAGGATGACACCGTGGCTGAAGT	163337

FP236232.9	951	ATTATTTTTTTTGACCGGTAATATTATGTTTTAAATATTTTAGTCACACA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163338	ATTATTTTTTTTGACCGGTAATATTATGTTTTAAATATTTTAGTCACACA	163387

FP236232.9	1001	AATCGTATGTAGATTGTATTGTTTTACCAAAAGGTTATATGCACAAAAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163388	AATCGTATGTAGATTGTATTGTTTTACCAAAAGGTTATATGCACAAAAGT	163437

FP236232.9	1051	TTTGTTCAGCCACTGATATCTTCCAGCAAACGATTGATGTGACTATTTTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163438	TTTGTTCAGCCACTGATATCTTCCAGCAAACGATTGATGTGACTATTTTG	163487

FP236232.9	1101	AATTTCATAAGGGACCTTTTATAGCATCAGTAATGTAGACTTTTATTTAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163488	AATTTCATAAGGGACCTTTTATAGCATCAGTAATGTAGACTTTTATTTAG	163537

FP236232.9	1151	TTTAACAACAAAACATAAGTAAATAGCACTATTCTGCCAAGCCTGCTTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163538	TTTAACAACAAAACATAAGTAAATAGCACTATTCTGCCAAGCCTGCTTTA	163587

FP236232.9	1201	CTGAGCTGAAGTTTTACATTCAAAATTATTTTTTCTGCCATTTTTAATGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163588	CTGAGCTGAAGTTTTACATTCAAAATTATTTTTTCTGCCATTTTTAATGT	163637

FP236232.9	1251	GCGCTTTTACGATTTCAGGAGGCGTGGCTTTGGATCGCAGGGCAGGGATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163638	GCGCTTTTACGATTTCAGGAGGCGTGGCTTTGGATCGCAGGGCAGGGATT	163687

FP236232.9	1301	GTGTTGCAAAGATATTATGCTCACCGGTTAGCGTTTGGGCAGATCACCTA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163688	GTGTTGCAAAGATATTATGCTCACCGGTTAGCGTTTGGGCAGATCACCTA	163737

FP236232.9	1351	CTGCACCTTTAATTTGTGTTGCATAATATATTTGATTAATAGTAAGTTAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163738	CTGCACCTTTAATTTGTGTTGCATAATATATTTGATTAATAGTAAGTTAC	163787

FP236232.9	1401	AATTAACAGCATTTCTTTATAAAAAAAAAATAAAATTTATATGAAAATAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163788	AATTAACAGCATTTCTTTATAAAAAAAAAATAAAATTTATATGAAAATAT	163837

FP236232.9	1451	TACTTTTTCTAATAGAATGCATCCTTGCTGAATACAATAAATAATCCTAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163838	TACTTTTTCTAATAGAATGCATCCTTGCTGAATACAATAAATAATCCTAA	163887

FP236232.9	1501	TGAGCCCAAACTTTTACAAACAGTTGTTTGTCCATATTATTTGTTATATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163888	TGAGCCCAAACTTTTACAAACAGTTGTTTGTCCATATTATTTGTTATATT	163937

FP236232.9	1551	TAGAGCATATCTTTAACCCTTTATAGGAAACTTACTAAAATACTCATTGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163938	TAGAGCATATCTTTAACCCTTTATAGGAAACTTACTAAAATACTCATTGG	163987

FP236232.9	1601	AAACAAACCTGGAGGGTCCTAGTGGTTTATTACAATACCGTTGAATTTTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	163988	AAACAAACCTGGAGGGTCCTAGTGGTTTATTACAATACCGTTGAATTTTT	164037

FP236232.9	1651	ATCACTTTAAAAAAATATTTTAATCTGTGTCAATATAAAAAAATATGTAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	164038	ATCACTTTAAAAAAATATTTTAATCTGTGTCAATATAAAAAAATATGTAG	164087

FP236232.9	1701	TGCGTAAAGGGTTATTTGAAGCATCTTTTCATCTTTTTCAAGGATGTTTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	164088	TGCGTAAAGGGTTATTTGAAGCATCTTTTCATCTTTTTCAAGGATGTTTC	164137

FP236232.9	1751	ATTTGTTTTCATTGTGCCTCATCTGTTTCCATGTTGTGTCAATAGGGGGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	164138	ATTTGTTTTCATTGTGCCTCATCTGTTTCCATGTTGTGTCAATAGGGGGC	164187

FP236232.9	1801	GGTCTCTCCCGACAGGCCTCACTGCCCGTCCAGAGACATCACATACTGTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	164188	GGTCTCTCCCGACAGGCCTCACTGCCCGTCCAGAGACATCACATACTGTC	164237

FP236232.9	1851	CAGAGCCCTGCCCTCACACAATTCTCATCACACCTCTCACACTGATGACT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	164238	CAGAGCCCTGCCCTCACACAATTCTCATCACACCTCTCACACTGATGACT	164287

FP236232.9	1901	CCTACACCTTATACTCATCCACTCATCCTACCGTGACTCACCACAACAGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	164288	CCTACACCTTATACTCATCCACTCATCCTACCGTGACTCACCACAACAGC	164337

FP236232.9	1951	CTGGATCAGCACTCAGGTAGTGTGTGAATTGAATTTGTAGAGATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383677.15	164338	CTGGATCAGCACTCAGGTAGTGTGTGAATTGAATTTGTAGAGATGAATTC	164387

Overview

Query
FP236232.9 - 65317 bps
Hit
CR383677.15 - 164387 bps
Total alignments
27
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100188820001200011623881643871
292.699011204431564435911231313517-1
395.45297352633286367911211431214941
494.27284349644336478111222841226331
589.09275449636456409311214341218711
687.39186341560375637711223041226331
784.04169401248802528011018861022911
887.09165310554675577611215721218711
989.47155266174761774117641276679-1
1090.16146244250952533817642076666-1
1192.51138187551375532311211471213351
1285.9134234441354436819620696439-1
1384.981342536123761489169780700341
1493.18103132292142934519720197332-1
1592.421001322921429345126132744-1
1694.3510012429498296211114949115072-1
1783.8298204612866148915406454274-1
1881.6377245293782962215405554278-1
1983.86614233400335411104104104243-1
2083.33611324680146932126132744-1
2188591004515545254131735318321
2282.7159133468004693219720197333-1
2390.952132308093094015709357223-1
2493.4450122307933091414554145662-1
2596.67501203521835337145545456641
2696.6750120352183533714554345662-1
2710050955046850562145538456321
Short-link