<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR762381.8	1	TGGCTGTGCTGGAGACTCTGAACATTGCTGGAGGCCTGTTTCAAAGTCTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210087	TGGCTGTGCTGGAGACTCTGAACATTGCTGGAGGCCTGTTTCAAAGTCTG	210136

CR762381.8	51	CTGTCTGAAGCGTGACAGGATAAAGAACAGCCCCAAAATGGCTTTCAGGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210137	CTGTCTGAAGCGTGACAGGATAAAGAACAGCCCCAAAATGGCTTTCAGGT	210186

CR762381.8	101	TCCCATTGCGGATCTCTGTGGATGAGTAGAGAGGTAAATACAGAATGTAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210187	TCCCATTGCGGATCTCTGTGGATGAGTAGAGAGGTAAATACAGAATGTAG	210236

CR762381.8	151	CTGACATTTGGATTCAAATATTTATATTAGTTAAAAGATTTGTTCATCAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210237	CTGACATTTGGATTCAAATATTTATATTAGTTAAAAGATTTGTTCATCAC	210286

CR762381.8	201	AAAATTCAAATTCCAAATCCTTTAGAAATGTGTGCATCTTTAGAGCACAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210287	AAAATTCAAATTCCAAATCCTTTAGAAATGTGTGCATCTTTAGAGCACAA	210336

CR762381.8	251	ACGATGATATTGTTAAAGAAATTTGAGATCGAGAGTCGTTTCACCTAAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210337	ACGATGATATTGTTAAAGAAATTTGAGATCGAGAGTCGTTTCACCTAAAA	210386

CR762381.8	301	CATTTGAGCTTCAGTGACAACCAATGAGATTTATTGTTGTACGTCAAAGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210387	CATTTGAGCTTCAGTGACAACCAATGAGATTTATTGTTGTACGTCAAAGT	210436

CR762381.8	351	GATTGTTTCTGCTTCTAAAAAAAAAACAATGAGATTCTTTCTTGTGTGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210437	GATTGTTTCTGCTTCTAAAAAAAAAACAATGAGATTCTTTCTTGTGTGTT	210486

CR762381.8	401	ACAATCAAGCGGCAACCTCCCGCTCTCCCTCGTGAAGCAAATAGAGAAGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210487	ACAATCAAGCGGCAACCTCCCGCTCTCCCTCGTGAAGCAAATAGAGAAGT	210536

CR762381.8	451	AACTGAAACTGCAATTTAATGAAATTCCCTTAGTTCTGGCTCCATATAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210537	AACTGAAACTGCAATTTAATGAAATTCCCTTAGTTCTGGCTCCATATAGA	210586

CR762381.8	501	GCAAATTTCTATTGAGCCCACTGTTAAAATGGCCAACTTTACAGCAATAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210587	GCAAATTTCTATTGAGCCCACTGTTAAAATGGCCAACTTTACAGCAATAA	210636

CR762381.8	551	AAAAAGGTGTTTACAGCCTGGTACAAAAAACAATTTTTGTTCATACAGCG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210637	AAAAAGGTGTTTACAGCCTGGTACAAAAAACAATTTTTGTTCATACAGCG	210686

CR762381.8	601	AATATTACCCTTCATGACAACTGTAAGGGGGTGATTTTTTTTATAACTCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210687	AATATTACCCTTCATGACAACTGTAAGGGGGTGATTTTTTTTATAACTCA	210736

CR762381.8	651	TCTGTTTCCTTTATATTACATTATATTAAGTCTGCATAATTAAGGGCGTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210737	TCTGTTTCCTTTATATTACATTATATTAAGTCTGCATAATTAAGGGCGTT	210786

CR762381.8	701	GCCATTTGAGTGACAGCTAGGTCTCGCTGGTCGCCATCACTTCCACTCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210787	GCCATTTGAGTGACAGCTAGGTCTCGCTGGTCGCCATCACTTCCACTCTG	210836

CR762381.8	751	ATTAGCCGCTGAACTCGGCATATACATCGTAATTTTGTTTTGTTTTATGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210837	ATTAGCCGCTGAACTCGGCATATACATCGTAATTTTGTTTTGTTTTATGT	210886

CR762381.8	801	GGCTTTACACAGTCAGTCGCCTTTTGGAATTATTTCTTACTATTATCAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210887	GGCTTTACACAGTCAGTCGCCTTTTGGAATTATTTCTTACTATTATCAGA	210936

CR762381.8	851	CGATATGGCATGCTGTGAGCATTTAATTGTGCTCGCAAACCATTCACGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210937	CGATATGGCATGCTGTGAGCATTTAATTGTGCTCGCAAACCATTCACGTG	210986

CR762381.8	901	GCCTCCATTTCCCAGGTGAGTGAATTTATAAACTTATATACCATCTCTAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	210987	GCCTCCATTTCCCAGGTGAGTGAATTTATAAACTTATATACCATCTCTAT	211036

CR762381.8	951	AAATGTATTTGTTTTACTTAAGATCATTTATCATGTATATTTTTCTTTAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211037	AAATGTATTTGTTTTACTTAAGATCATTTATCATGTATATTTTTCTTTAG	211086

CR762381.8	1001	ACTAGTAATGTACTCTAGAATCTGACAGATTGATTAGCTGTAGGCTCATC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211087	ACTAGTAATGTACTCTAGAATCTGACAGATTGATTAGCTGTAGGCTCATC	211136

CR762381.8	1051	TGAAATGTTGGCATGCAGTGTTATTCCTGGATTTCATCAATAGCCTTGCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211137	TGAAATGTTGGCATGCAGTGTTATTCCTGGATTTCATCAATAGCCTTGCA	211186

CR762381.8	1101	TTTACCTACACAGACTATATCTGAAGTATTTGGAATTAATTTGCGTTTTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211187	TTTACCTACACAGACTATATCTGAAGTATTTGGAATTAATTTGCGTTTTC	211236

CR762381.8	1151	CTCCTGTAGAAAAACGTCATGACAACAGTGTTAAGAGGCTTGAAGTATTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211237	CTCCTGTAGAAAAACGTCATGACAACAGTGTTAAGAGGCTTGAAGTATTA	211286

CR762381.8	1201	CAGCAGTGTTTTTAAAAAACTAAACACTTTATTGATATAGCACACAACCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211287	CAGCAGTGTTTTTAAAAAACTAAACACTTTATTGATATAGCACACAACCA	211336

CR762381.8	1251	AGCACATGTGGTCAGAAGACAAACGAGTCGCAGGTAAATAAGCATTTCTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211337	AGCACATGTGGTCAGAAGACAAACGAGTCGCAGGTAAATAAGCATTTCTC	211386

CR762381.8	1301	CCATAGAAAAGCCTGTCTAATCAAAATGATAGCAGGCGTTTGTAGCTCCG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211387	CCATAGAAAAGCCTGTCTAATCAAAATGATAGCAGGCGTTTGTAGCTCCG	211436

CR762381.8	1351	CCTCTTTGCCCTTGTTTGGTATTCCCCAGTTTGTGTGATGACGCGCCAAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211437	CCTCTTTGCCCTTGTTTGGTATTCCCCAGTTTGTGTGATGACGCGCCAAC	211486

CR762381.8	1401	GAAATGGCAATGGGTGGCCACGCCAACTGGTAGCTTCTTTTGGGTTCTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211487	GAAATGGCAATGGGTGGCCACGCCAACTGGTAGCTTCTTTTGGGTTCTTT	211536

CR762381.8	1451	AGAAACCTATAGGTGACATCACGGATACTACGTCCATATCTTTTACAGTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211537	AGAAACCTATAGGTGACATCACGGATACTACGTCCATATCTTTTACAGTC	211586

CR762381.8	1501	TATGATCACAATGCATGTTTAGGCTTTGGTTAGAATCAATAGGATTCATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211587	TATGATCACAATGCATGTTTAGGCTTTGGTTAGAATCAATAGGATTCATT	211636

CR762381.8	1551	CTTGCATGTCACAGTGCATGTTTGAGCTTGGATGAGAACCAATGAGATTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211637	CTTGCATGTCACAGTGCATGTTTGAGCTTGGATGAGAACCAATGAGATTC	211686

CR762381.8	1601	ATTCTTGCATGTCACATGGCACATTTGATCTTCGACAAAAACCAATGAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211687	ATTCTTGCATGTCACATGGCACATTTGATCTTCGACAAAAACCAATGAGA	211736

CR762381.8	1651	ATCATTCTTCAATATCACATGTTACATTTGAGCCTTTGCAAGAACCAATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211737	ATCATTCTTCAATATCACATGTTACATTTGAGCCTTTGCAAGAACCAATG	211786

CR762381.8	1701	AGATTCATTCTAGTGTGTCACGGTACACTTTCAGCTTAAATAAGAATCAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211787	AGATTCATTCTAGTGTGTCACGGTACACTTTCAGCTTAAATAAGAATCAA	211836

CR762381.8	1751	TGAGATTCATTCTTCTCTGTCACATGTTACATTTGAGCTTTCGCAAGACC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211837	TGAGATTCATTCTTCTCTGTCACATGTTACATTTGAGCTTTCGCAAGACC	211886

CR762381.8	1801	CAATAAGATTAATTCTTGTGTTTCATAGTGCACGTTTGAACTTTGACGAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211887	CAATAAGATTAATTCTTGTGTTTCATAGTGCACGTTTGAACTTTGACGAG	211936

CR762381.8	1851	AACCAATGAGATTAATTCTAGAGGGTCACGGTGCACATTTAAACTTCAAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211937	AACCAATGAGATTAATTCTAGAGGGTCACGGTGCACATTTAAACTTCAAT	211986

CR762381.8	1901	AAAAACCAATGAGTCATTCTTCTCTGCCACATGGCACATTTGAGCTTTCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	211987	AAAAACCAATGAGTCATTCTTCTCTGCCACATGGCACATTTGAGCTTTCA	212036

CR762381.8	1951	CAAGAACCATTGAGATTCATTCTTGCATGTCACAGTCCATGTTTAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR383674.8	212037	CAAGAACCATTGAGATTCATTCTTGCATGTCACAGTCCATGTTTAAGCTT	212086

Overview

Query
CR762381.8 - 124425 bps
Hit
CR383674.8 - 212086 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100195420001200012100872120861
282.221333148358783900111461117751
384.751753705553255901111462118151
483.91693728708687457111462118151
589.4112218531183302111622118101
680.871152955553055824116746170431
785.362054276490265328135264357141
884.791823628708387444-137318376721
985.711673178358483900-137345376731
1086.781923445553655879-141711420581
1188.831111793406634244141866420531
1291.612944203055630975-143920443361
1387.582134333462235054-197973984071
1483.241333549527595628198027983721
1580.42190557655876614311230061235361
1688.2539164310069310133511700271706731
1793.5311013912026812040611950031951411
1891.971021373412434260-11950051951411
1994.1211013612027112040612063722065071
2087.391122002919311812063742065871
2191.08148211870838729312063752065871
2290.56141208555305573712063762065871
Short-link