<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX957239.7	1	AAGCTTCGAGGGTCTATTAGTCACGACTTTGGACAAGAAGCAGCCGCAAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	73966	AAGCTTCGAGGGTCTATTAGTCACGACTTTGGACAAGAAGCAGCCGCAAC	74015

BX957239.7	51	TTTAAATACCACAAAATAATTACAGTAACTTTCTTCTGGCAGGGACGGTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74016	TTTAAATACCACAAAATAATTACAGTAACTTTCTTCTGGCAGGGACGGTC	74065

BX957239.7	101	AGTTTAGACAAACAAGGAAAAACTTCTGGATAGTTTGCTTTGGTTTCTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74066	AGTTTAGACAAACAAGGAAAAACTTCTGGATAGTTTGCTTTGGTTTCTTT	74115

BX957239.7	151	TGTAGTTTTCAGCCCCAGAATAGTTGATCAATCCCTCATGCCAAAAGTAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74116	TGTAGTTTTCAGCCCCAGAATAGTTGATCAATCCCTCATGCCAAAAGTAA	74165

BX957239.7	201	GATGAGGATTAGCTTTAGTGTGTTGTGTAAAGTGTATCCAACATGTCAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74166	GATGAGGATTAGCTTTAGTGTGTTGTGTAAAGTGTATCCAACATGTCAAA	74215

BX957239.7	251	ATCAATATATAGAGCCTTGCAAGGAATGGTTTTTATAGAGTTCTCTAGAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74216	ATCAATATATAGAGCCTTGCAAGGAATGGTTTTTATAGAGTTCTCTAGAA	74265

BX957239.7	301	GACCAGTAGATCCCAAGAGCTGAGAGTGTATTGAATGAAATCGAATGAGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74266	GACCAGTAGATCCCAAGAGCTGAGAGTGTATTGAATGAAATCGAATGAGT	74315

BX957239.7	351	GGTGAAATAATCACCCATGTACTCAAACAGGATTTTTTAAGATCAGAAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74316	GGTGAAATAATCACCCATGTACTCAAACAGGATTTTTTAAGATCAGAAAT	74365

BX957239.7	401	TGGTCCAACTTGTTGAGAATAGACATATGCAGATAATCAGTAATTCAATA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74366	TGGTCCAACTTGTTGAGAATAGACATATGCAGATAATCAGTAATTCAATA	74415

BX957239.7	451	TGTCTTGATAATGAGCATGTACAATCTTGGGTACTTCAAAATACTATGAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74416	TGTCTTGATAATGAGCATGTACAATCTTGGGTACTTCAAAATACTATGAA	74465

BX957239.7	501	TAATTTAGTTTTATTTAATCTTTTAGATTGCCTTTTAAGAATATTCAGAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74466	TAATTTAGTTTTATTTAATCTTTTAGATTGCCTTTTAAGAATATTCAGAT	74515

BX957239.7	551	TGTTGTATTAGCAGTGGTGTTCATCAGCGACAAATGCTTAAAGACTTTAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74516	TGTTGTATTAGCAGTGGTGTTCATCAGCGACAAATGCTTAAAGACTTTAT	74565

BX957239.7	601	TTTAATGAAATTTATTTTTCATTCATTTATTTTCAAACATTAACGTTTTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74566	TTTAATGAAATTTATTTTTCATTCATTTATTTTCAAACATTAACGTTTTC	74615

BX957239.7	651	ATGTGTTAATTTGGCCTACAACATTATTATTAACTTCTTAACTATAGTAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74616	ATGTGTTAATTTGGCCTACAACATTATTATTAACTTCTTAACTATAGTAA	74665

BX957239.7	701	GGTTCCAGTAAGGAACCAGTAAGGTTCAGTTTGTTAACAGATAATTAAAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74666	GGTTCCAGTAAGGAACCAGTAAGGTTCAGTTTGTTAACAGATAATTAAAC	74715

BX957239.7	751	CAAAGTAAATGTAATACTACAAAAGCATCTATATACGCTGAAAAAAAGGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74716	CAAAGTAAATGTAATACTACAAAAGCATCTATATACGCTGAAAAAAAGGA	74765

BX957239.7	801	TTTTTGCAGCTTGTTAAAACTGCTTATTTAAAATGAGCTGAAACAACACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74766	TTTTTGCAGCTTGTTAAAACTGCTTATTTAAAATGAGCTGAAACAACACA	74815

BX957239.7	851	ATTCTTGAGATTTTTTCAGGGGAAACTTAATAGTTTTAAGTTCAGCACAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74816	ATTCTTGAGATTTTTTCAGGGGAAACTTAATAGTTTTAAGTTCAGCACAC	74865

BX957239.7	901	TTAAATTTGTTATGTCAACTTAATCAATTTGTGTTGGGTCAACATAAACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74866	TTAAATTTGTTATGTCAACTTAATCAATTTGTGTTGGGTCAACATAAACT	74915

BX957239.7	951	GTAGGTGATGTTAATCTCCTTTTAAGAAAGTCATAATCGATAAATTATCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74916	GTAGGTGATGTTAATCTCCTTTTAAGAAAGTCATAATCGATAAATTATCA	74965

BX957239.7	1001	AATGTTTCCTAATGAGACTTTATTGTAAAGTGTTATACTTTATCATCCTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	74966	AATGTTTCCTAATGAGACTTTATTGTAAAGTGTTATACTTTATCATCCTT	75015

BX957239.7	1051	TTGCTGTGTGATTTGTTTAAAGCATTTATTAACTTTGAACATAAACACAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75016	TTGCTGTGTGATTTGTTTAAAGCATTTATTAACTTTGAACATAAACACAA	75065

BX957239.7	1101	GTATTTTTGATTAATTACACCTGTTAAATTAACCTTTTTTGCAACTTGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75066	GTATTTTTGATTAATTACACCTGTTAAATTAACCTTTTTTGCAACTTGGG	75115

BX957239.7	1151	TCAAAACCTTGATAAAACTGTATACTGAGATATTACTTTAGCAATTAATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75116	TCAAAACCTTGATAAAACTGTATACTGAGATATTACTTTAGCAATTAATT	75165

BX957239.7	1201	GTAGGAATAGAGAAGGAACCTAAAACACCTAAAAATACTTCACCACTTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75166	GTAGGAATAGAGAAGGAACCTAAAACACCTAAAAATACTTCACCACTTGG	75215

BX957239.7	1251	TATCTTCAGTCCGTAAAGCCTGGTTTATACTTCTGCGTTGAGTGATCGGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75216	TATCTTCAGTCCGTAAAGCCTGGTTTATACTTCTGCGTTGAGTGATCGGC	75265

BX957239.7	1301	ATGACCCACGGAGCATGCCTTGCGCGTTGTCGTGCATTTATACTTCTGCG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75266	ATGACCCACGGAGCATGCCTTGCGCGTTGTCGTGCATTTATACTTCTGCG	75315

BX957239.7	1351	CACAGTTTGTGATCATCTGCAATAACACTTCCGAAATGCTTGCTGGCAGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75316	CACAGTTTGTGATCATCTGCAATAACACTTCCGAAATGCTTGCTGGCAGT	75365

BX957239.7	1401	GAGGTGCTTATGTTCCTCTGTGTCGAGTTTCTTGCTGGTATTTAGTTTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75366	GAGGTGCTTATGTTCCTCTGTGTCGAGTTTCTTGCTGGTATTTAGTTTTT	75415

BX957239.7	1451	TTTTAACGCTTCCTTAATGTACAAGTGGATCAAACTCGCTCATTTTGAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75416	TTTTAACGCTTCCTTAATGTACAAGTGGATCAAACTCGCTCATTTTGAGG	75465

BX957239.7	1501	CAGGAACCGGCGGACAAGCAACAACTTTAACCATGAGGTAAACATAAAAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75466	CAGGAACCGGCGGACAAGCAACAACTTTAACCATGAGGTAAACATAAAAC	75515

BX957239.7	1551	AAAACTTTTCATCCAGAGCTCCTTTACGGGACTTGACACTTGTAAACACT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75516	AAAACTTTTCATCCAGAGCTCCTTTACGGGACTTGACACTTGTAAACACT	75565

BX957239.7	1601	TCTCCAACGGACTCGCACGGCTCTCAGCACCACCCACACTCATCAGCGCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75566	TCTCCAACGGACTCGCACGGCTCTCAGCACCACCCACACTCATCAGCGCT	75615

BX957239.7	1651	ACTAAGCTGACCAATCACAGAGCTTGCGCAACACATCGTCACAATGTGTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75616	ACTAAGCTGACCAATCACAGAGCTTGCGCAACACATCGTCACAATGTGTA	75665

BX957239.7	1701	GTTACATTTTTTGAGAGGTGTGCGTTAGCGATGCCGATGGCCACAGCGAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75666	GTTACATTTTTTGAGAGGTGTGCGTTAGCGATGCCGATGGCCACAGCGAG	75715

BX957239.7	1751	GGCTATGCGTCTACGTATAGATCAGCTTTAAACGTCTTTTAAGTGTTGTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75716	GGCTATGCGTCTACGTATAGATCAGCTTTAAACGTCTTTTAAGTGTTGTG	75765

BX957239.7	1801	GAAAAAAAATGGCAACATTACAAAGTGGTAAGTACTTTAATGTTTCAACT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75766	GAAAAAAAATGGCAACATTACAAAGTGGTAAGTACTTTAATGTTTCAACT	75815

BX957239.7	1851	TTTTTTAAAATGTGTTGCAAGAACCAAAATTGAAATACGTGTTTAATTAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75816	TTTTTTAAAATGTGTTGCAAGAACCAAAATTGAAATACGTGTTTAATTAA	75865

BX957239.7	1901	AAAGAAAAAATCATGAGGAAGAAATTAAATAATGTTCATTGTATTGTCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75866	AAAGAAAAAATCATGAGGAAGAAATTAAATAATGTTCATTGTATTGTCTG	75915

BX957239.7	1951	AAATGAATTTCAAAGTAAATTTTTAAATCACTTCTTTCTTTTTTATTTGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318609.7	75916	AAATGAATTTCAAAGTAAATTTTTAAATCACTTCTTTCTTTTTTATTTGT	75965

Overview

Query
BX957239.7 - 182432 bps
Hit
CR318609.7 - 75965 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001926200012000173966759651
282.55219479122298122776-110283107691
381.9580197122009122205-110865110691
485.63971762610826283111091112641
587.61124211120591120801117095173121
686.72222438177650178087117474179101
789.56154228121453121680118066182951
886.93101179178240178418118117182921
987.37941696108561253-122772229531
1090.72951394559145729122849229881
1187.671633136638866700124303246021
1283.452025373039930935-124981255001
1386.361032173604536261-124987252061
1489.22117205175731175935124987251901
1581.78752162340023615127258274711
1685.771432694559145859-141849421221
1787.831021776108561261142018422061
1882.43279648122224122871151533521811
1992.11811522788828039168050682011
2080.41964963823938734-175229757231
Short-link