<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR293510.8	1	GAATTCCTCAGTGAAGTACTCTGGAGAAAGTCCTAAATGTGGGCTATCGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21312	GAATTCCTCAGTGAAGTACTCTGGAGAAAGTCCTAAATGTGGGCTATCGT	21361

CR293510.8	51	TAATCAGTTTTCTGGGCGAACACTTGATGTCGCTGTTGTTTAAGTTTTGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21362	TAATCAGTTTTCTGGGCGAACACTTGATGTCGCTGTTGTTTAAGTTTTGG	21411

CR293510.8	101	CAACTGCGACGTGCTTCTTTTGTTCCCACAGCTGGGAAATGGAGTAATCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21412	CAACTGCGACGTGCTTCTTTTGTTCCCACAGCTGGGAAATGGAGTAATCT	21461

CR293510.8	151	GCTGGCCAAATGTGAATTTCACTTCCAACTACACTTTATTCTGTGGTCAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21462	GCTGGCCAAATGTGAATTTCACTTCCAACTACACTTTATTCTGTGGTCAC	21511

CR293510.8	201	TGATGCAGAAGGGAGCTTTGATGGCATTAATTATGTTTATTTTAGAATTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21512	TGATGCAGAAGGGAGCTTTGATGGCATTAATTATGTTTATTTTAGAATTA	21561

CR293510.8	251	GATGTGCATAGTTTTGTTCAACACTAATCTACATCACATAGCATTAAAGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21562	GATGTGCATAGTTTTGTTCAACACTAATCTACATCACATAGCATTAAAGG	21611

CR293510.8	301	CTTGGGCAAGTGAAAACACATGCTGCAAAAATGGCGTAAATCTATTTTTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21612	CTTGGGCAAGTGAAAACACATGCTGCAAAAATGGCGTAAATCTATTTTTA	21661

CR293510.8	351	TTGATGACCAATAGGACAGAGGAAACATCAGAATCCACAGTACATTGGAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21662	TTGATGACCAATAGGACAGAGGAAACATCAGAATCCACAGTACATTGGAT	21711

CR293510.8	401	ACAGCAGCTTGTAACAATGTCACTTTTGCTCGTCGTCTTCACTATGAGGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21712	ACAGCAGCTTGTAACAATGTCACTTTTGCTCGTCGTCTTCACTATGAGGC	21761

CR293510.8	451	TACACAGTTTAAAGTGCTAAAAAATAACAGTACCATTTTAATAGGTCATA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21762	TACACAGTTTAAAGTGCTAAAAAATAACAGTACCATTTTAATAGGTCATA	21811

CR293510.8	501	GAATATTACAAGTTACAGGTAACTAAAATGATAGACTGAGGTACTTGCAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21812	GAATATTACAAGTTACAGGTAACTAAAATGATAGACTGAGGTACTTGCAT	21861

CR293510.8	551	GTCTTTCTTGTTCAAGATGTATTTAGTAACAGCACAATATTTAGTTTCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21862	GTCTTTCTTGTTCAAGATGTATTTAGTAACAGCACAATATTTAGTTTCAA	21911

CR293510.8	601	AATAATTTTTGCCAATAAACCTAAAACATCAGCTTGTTAAAACTGTGCAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21912	AATAATTTTTGCCAATAAACCTAAAACATCAGCTTGTTAAAACTGTGCAA	21961

CR293510.8	651	AAAGGTGAAATGCACAAAAAAAGGCAAAGTAAGAAATTCAGAAAAGCAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	21962	AAAGGTGAAATGCACAAAAAAAGGCAAAGTAAGAAATTCAGAAAAGCAAA	22011

CR293510.8	701	ATCCAAACATGGTTCCAATAACAGGTTTTCACTTATTTACAATTTTAGTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22012	ATCCAAACATGGTTCCAATAACAGGTTTTCACTTATTTACAATTTTAGTG	22061

CR293510.8	751	CATTTTTCCTATTTTCGACAAGCTTTTGACTGTTGTGACAAAAATGTGGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22062	CATTTTTCCTATTTTCGACAAGCTTTTGACTGTTGTGACAAAAATGTGGT	22111

CR293510.8	801	GACCATTACCAAATGCTTGATGAGAGAAGTAAATGGTGTTTTTCTGTGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22112	GACCATTACCAAATGCTTGATGAGAGAAGTAAATGGTGTTTTTCTGTGCA	22161

CR293510.8	851	TATATAGTGTAAATGGACAGATCGCTGTGCTCTTGTCTAAAGATCAAGAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22162	TATATAGTGTAAATGGACAGATCGCTGTGCTCTTGTCTAAAGATCAAGAT	22211

CR293510.8	901	TTTACTATATAGTCTATTAACATCACTATAGTAGGATTTTGGATTCGTAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22212	TTTACTATATAGTCTATTAACATCACTATAGTAGGATTTTGGATTCGTAA	22261

CR293510.8	951	ACAAGGCTGACTAGATGGTTAAACAAGCTCTCAAATGTGTAAACAAAATG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22262	ACAAGGCTGACTAGATGGTTAAACAAGCTCTCAAATGTGTAAACAAAATG	22311

CR293510.8	1001	ACATGTAATATATGGCTATACAATAAAATGGCAGCTTAAATATATCATCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22312	ACATGTAATATATGGCTATACAATAAAATGGCAGCTTAAATATATCATCT	22361

CR293510.8	1051	AAAACCAACAAGTGTAAATACAAACAATGATAACAACATCAACTGTAACT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22362	AAAACCAACAAGTGTAAATACAAACAATGATAACAACATCAACTGTAACT	22411

CR293510.8	1101	GTCTCCACTCTTTTCACTCATGTAAATCCGATAGAAAATGATGTCCTAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22412	GTCTCCACTCTTTTCACTCATGTAAATCCGATAGAAAATGATGTCCTAAT	22461

CR293510.8	1151	TTGACCAACAAAAGTGCCCCTCTGAATCTTTGGTAAGGACAGAATCACAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22462	TTGACCAACAAAAGTGCCCCTCTGAATCTTTGGTAAGGACAGAATCACAA	22511

CR293510.8	1201	TTTTAAAGGGCACAATAAATCGGTATTACTTAAAATTCTAATGCATTTGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22512	TTTTAAAGGGCACAATAAATCGGTATTACTTAAAATTCTAATGCATTTGC	22561

CR293510.8	1251	ATGGTTTGATGCAACATAAATAAGCTTCTGCTGGTTGTTGTTCTCAGCTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22562	ATGGTTTGATGCAACATAAATAAGCTTCTGCTGGTTGTTGTTCTCAGCTC	22611

CR293510.8	1301	ATTTTGCCTCAAAAAGATAGTTCACCCAAATATGAAAATTTTGTCCACAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22612	ATTTTGCCTCAAAAAGATAGTTCACCCAAATATGAAAATTTTGTCCACAT	22661

CR293510.8	1351	GCAGGACCTCTTCAGTAGAACATAAAAGAAAAGTTTTTAGCTGACACCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22662	GCAGGACCTCTTCAGTAGAACATAAAAGAAAAGTTTTTAGCTGACACCAA	22711

CR293510.8	1401	GGTCTTTGGTATTCCAAAATATGCAAGCTAACTTTAAAAGTCAAAAGGCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22712	GGTCTTTGGTATTCCAAAATATGCAAGCTAACTTTAAAAGTCAAAAGGCA	22761

CR293510.8	1451	ACATACAGGCTACACCACAACAACTTAAATGATGAACTTAAAACTATTGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22762	ACATACAGGCTACACCACAACAACTTAAATGATGAACTTAAAACTATTGT	22811

CR293510.8	1501	CTTGTTTTAAGAAATAATGTCAAAATGAAGTGAGTTTTTCCCTAAAAGAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22812	CTTGTTTTAAGAAATAATGTCAAAATGAAGTGAGTTTTTCCCTAAAAGAA	22861

CR293510.8	1551	GCTAAATAGTCTTATGTCTGAATAAAAACAAGATTATTTTGCTTACTCTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22862	GCTAAATAGTCTTATGTCTGAATAAAAACAAGATTATTTTGCTTACTCTA	22911

CR293510.8	1601	TTGGCCGATTATTTTTCCTGCTTTAAGGAACAACTCACTTAATTTTGACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22912	TTGGCCGATTATTTTTCCTGCTTTAAGGAACAACTCACTTAATTTTGACA	22961

CR293510.8	1651	TATTAGTTCTTAAAAAAGACAACATTCTTTGATTAACTAAAAAATGCTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	22962	TATTAGTTCTTAAAAAAGACAACATTCTTTGATTAACTAAAAAATGCTTT	23011

CR293510.8	1701	TTTATTTCAGAATTTCTAGATATATGTACTAGAAACAAGACAAATCTAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	23012	TTTATTTCAGAATTTCTAGATATATGTACTAGAAACAAGACAAATCTAAG	23061

CR293510.8	1751	TAGGAAAAGCATTTTTTGCAGTGTAATGATATAATACAATTATTTTATGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	23062	TAGGAAAAGCATTTTTTGCAGTGTAATGATATAATACAATTATTTTATGC	23111

CR293510.8	1801	AATTGGTAATCGATTTGTATACATTGGGTGTGTTTACATGAACACCAATG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	23112	AATTGGTAATCGATTTGTATACATTGGGTGTGTTTACATGAACACCAATG	23161

CR293510.8	1851	ATTCTATTGTGATTAAGACAATACTTTGATTAAGAGTCTACCATGTAATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	23162	ATTCTATTGTGATTAAGACAATACTTTGATTAAGAGTCTACCATGTAATT	23211

CR293510.8	1901	AGCAATTTTTGATTAATTTAATCCAACTAAAGTCATAAACGAACTAAACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	23212	AGCAATTTTTGATTAATTTAATCCAACTAAAGTCATAAACGAACTAAACA	23261

CR293510.8	1951	GAAATTGGATTAAGACATGCAGAGTATGCCGATTTTAGTTGCATTATTAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957358.5	23262	GAAATTGGATTAAGACATGCAGAGTATGCCGATTTTAGTTGCATTATTAA	23311

Overview

Query
CR293510.8 - 112503 bps
Hit
BX957358.5 - 23311 bps
Total alignments
7
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001908200012000121312233111
293.517510955715679-1543055371
388.66599563586636801921093061
487.58100171101787101957119073192411
585.131392622173821999-119391196591
694.746176102403102478119693197681
788.261322134391544127-119894201061
Short-link