<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX957365.5	1	TTCATCCGCAATAATTTCTTCATGGGGCGGCACGGTGGCTCAGTGGTTAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	108533	TTCATCCGCAATAATTTCTTCATGGGGCGGCACGGTGGCTCAGTGGTTAG	108582

BX957365.5	51	CACTGTCAACTCACATCAAGAAGGTTGCTGTTTTGAGTCCTGGCTGGCTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	108583	CACTGTCAACTCACATCAAGAAGGTTGCTGTTTTGAGTCCTGGCTGGCTC	108632

BX957365.5	101	CTGGCTGTAGCCTTTACTGTGTGGAGTTTGCATGTGTTCCCCGTGTTTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	108633	CTGGCTGTAGCCTTTACTGTGTGGAGTTTGCATGTGTTCCCCGTGTTTTT	108682

BX957365.5	151	GTAGATTTCCTCCTCGTGGGTTTACCTCATACTCTAAAGACATGCGCTAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	108683	GTAGATTTCCTCCTCGTGGGTTTACCTCATACTCTAAAGACATGCGCTAT	108732

BX957365.5	201	AAGTGAATTGAATTAACAACATTTTTTGTGTAGTGTATGAGTATGTCTGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	108733	AAGTGAATTGAATTAACAACATTTTTTGTGTAGTGTATGAGTATGTCTGT	108782

BX957365.5	251	AAATGCGAGAGTGTGTGGGTGTTTCCCAGTTCTGGGTTGCGGCTGGAAGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	108783	AAATGCGAGAGTGTGTGGGTGTTTCCCAGTTCTGGGTTGCGGCTGGAAGG	108832

BX957365.5	301	GCATCTGCTATATATGCTGGAATACATATGCTGGAATAGTTGGTGGTTCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	108833	GCATCTGCTATATATGCTGGAATACATATGCTGGAATAGTTGGTGGTTCA	108882

BX957365.5	351	TTCCCCTGTGACGACCTCTGAAAGAGTGACTAAGCCAAAGGAAAATGAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	108883	TTCCCCTGTGACGACCTCTGAAAGAGTGACTAAGCCAAAGGAAAATGAAT	108932

BX957365.5	401	GAATTTCATCTTCCGCCAAACATTTCTTTGTCTGGTTGTGGTCAATATGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	108933	GAATTTCATCTTCCGCCAAACATTTCTTTGTCTGGTTGTGGTCAATATGC	108982

BX957365.5	451	TCCTGTGAATTTCTGTTTGTGATATTTTCTCAGAATGAAACTGTGAGTCG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	108983	TCCTGTGAATTTCTGTTTGTGATATTTTCTCAGAATGAAACTGTGAGTCG	109032

BX957365.5	501	CTCGTTAACTGACTCATTAAGTGCTGCTCTGGAGATGAATTTCATGTGTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109033	CTCGTTAACTGACTCATTAAGTGCTGCTCTGGAGATGAATTTCATGTGTT	109082

BX957365.5	551	CGTGTACTTATTGTGAGACGGTAGATGTTCAAAACACAATTAGAGACAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109083	CGTGTACTTATTGTGAGACGGTAGATGTTCAAAACACAATTAGAGACAGA	109132

BX957365.5	601	CGTCAGACTGTTTTTCCTAGTAAACGAAACTACGTCATTCACCTAGACAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109133	CGTCAGACTGTTTTTCCTAGTAAACGAAACTACGTCATTCACCTAGACAA	109182

BX957365.5	651	GCATATAATGCAGTAACATTGAAATATTTAAATAGTCTTTTTGTGGTTTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109183	GCATATAATGCAGTAACATTGAAATATTTAAATAGTCTTTTTGTGGTTTA	109232

BX957365.5	701	ATATTCACTGACACTAGTACATATTAGTATTTGATTGGGTCTACATTTGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109233	ATATTCACTGACACTAGTACATATTAGTATTTGATTGGGTCTACATTTGC	109282

BX957365.5	751	GTTTATTCATCCAAAATTTGCAAAACTCATTGACTTTTTGTATTATGACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109283	GTTTATTCATCCAAAATTTGCAAAACTCATTGACTTTTTGTATTATGACA	109332

BX957365.5	801	GATTTCCGTTTTCTTCATCATGGAAATCATACAGCCCATACAAATACGAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109333	GATTTCCGTTTTCTTCATCATGGAAATCATACAGCCCATACAAATACGAC	109382

BX957365.5	851	AATTCTATCTCAGGTGAACTTGCAAACTGTAAGTGAAGTATTTGAAGATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109383	AATTCTATCTCAGGTGAACTTGCAAACTGTAAGTGAAGTATTTGAAGATT	109432

BX957365.5	901	GATATACTTCTGAAAAACTTTATATTTATTTGCACAAACTATTTTCTAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109433	GATATACTTCTGAAAAACTTTATATTTATTTGCACAAACTATTTTCTAAA	109482

BX957365.5	951	AATTTTAACATGTGGATTACCTTTGCCATTTTTAGCCCTCACGTAAAGAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109483	AATTTTAACATGTGGATTACCTTTGCCATTTTTAGCCCTCACGTAAAGAT	109532

BX957365.5	1001	GATCTTTAAAAACAGTTTAGTAATAAAAAAAGCCTTAAGTAAATTGAAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109533	GATCTTTAAAAACAGTTTAGTAATAAAAAAAGCCTTAAGTAAATTGAAAA	109582

BX957365.5	1051	CATAAATAGCTTCTTTTTTTTTAACCCATATATAATTCACATAAAACATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109583	CATAAATAGCTTCTTTTTTTTTAACCCATATATAATTCACATAAAACATG	109632

BX957365.5	1101	TAAGTGCATATTCATATCTCAGTATCTTTGATCGTACCTATATACAGTAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109633	TAAGTGCATATTCATATCTCAGTATCTTTGATCGTACCTATATACAGTAC	109682

BX957365.5	1151	ACCAGTTTTGTGGTATTGAGGCTTGTTAAGTTGTCTACATTACTCCTTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109683	ACCAGTTTTGTGGTATTGAGGCTTGTTAAGTTGTCTACATTACTCCTTGG	109732

BX957365.5	1201	TCACACTAATGCTAATGGCACATTTTACCATAAAAACAAGTAATTTTGTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109733	TCACACTAATGCTAATGGCACATTTTACCATAAAAACAAGTAATTTTGTA	109782

BX957365.5	1251	TTTAAAGTGTTGCATGTAATATTGTTATGTATTTATTTTTATATTGCTGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109783	TTTAAAGTGTTGCATGTAATATTGTTATGTATTTATTTTTATATTGCTGA	109832

BX957365.5	1301	TTACAGAATATGACTAGTTTGACCAAAACACTGTCATGTTTAATGAGTCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109833	TTACAGAATATGACTAGTTTGACCAAAACACTGTCATGTTTAATGAGTCT	109882

BX957365.5	1351	GATTGCTTCTTTTCAACACTAAAAGATACTTCTCCCTTTTGCAGATAAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109883	GATTGCTTCTTTTCAACACTAAAAGATACTTCTCCCTTTTGCAGATAAAA	109932

BX957365.5	1401	AAAGCCTGTTTGTGTTGCTGTCCTAACTATGCACTATTATATGCTTTGTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109933	AAAGCCTGTTTGTGTTGCTGTCCTAACTATGCACTATTATATGCTTTGTT	109982

BX957365.5	1451	GCAGCTAATAATTAGCATTTTTTTCTGCCCTGTCAGAATAAACTTGCAAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	109983	GCAGCTAATAATTAGCATTTTTTTCTGCCCTGTCAGAATAAACTTGCAAC	110032

BX957365.5	1501	TTTTCTTTTGGGCTGTCACTTTGCAAAGGATGAGTTGCACCAGGTGAACT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	110033	TTTTCTTTTGGGCTGTCACTTTGCAAAGGATGAGTTGCACCAGGTGAACT	110082

BX957365.5	1551	TTTGCTACAGAGCATGATTGTAAACACATGCATTAACGTCAGTAGCAAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	110083	TTTGCTACAGAGCATGATTGTAAACACATGCATTAACGTCAGTAGCAAAA	110132

BX957365.5	1601	GGTATGGGAAATGTTTTATCCTCTCTTTCGTCAGGTCTCAACCAACCAGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	110133	GGTATGGGAAATGTTTTATCCTCTCTTTCGTCAGGTCTCAACCAACCAGT	110182

BX957365.5	1651	TGAAAACCACCTATATTATACAGTACTCACTGTCTGCAGATGCCCTTTTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	110183	TGAAAACCACCTATATTATACAGTACTCACTGTCTGCAGATGCCCTTTTG	110232

BX957365.5	1701	AAATTTGAACATGAACGCAAAGAATTTTTACATTTACACATAACAATACG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	110233	AAATTTGAACATGAACGCAAAGAATTTTTACATTTACACATAACAATACG	110282

BX957365.5	1751	CTCATTTAAAGAGCTCGATAGAAATAATTTTGATAATGTGCACTCCACTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	110283	CTCATTTAAAGAGCTCGATAGAAATAATTTTGATAATGTGCACTCCACTG	110332

BX957365.5	1801	TGCAATTGTTTTTGTTTTGATTTGATACTGTAATGTGCAGACGAGGCTCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	110333	TGCAATTGTTTTTGTTTTGATTTGATACTGTAATGTGCAGACGAGGCTCC	110382

BX957365.5	1851	ACACTTTCATTTCCTGAGTGAGTGATTAAGGAAGTGACCACCTACCTGTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	110383	ACACTTTCATTTCCTGAGTGAGTGATTAAGGAAGTGACCACCTACCTGTT	110432

BX957365.5	1901	ATTGTGTTCAAATGGGACAAATAAATGAACAGGGAGAACACATTGTTACT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	110433	ATTGTGTTCAAATGGGACAAATAAATGAACAGGGAGAACACATTGTTACT	110482

BX957365.5	1951	CAGGGGGGTTCCCAAACATTAGGAGCAGCAGTTAATGTCCTTTAAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957303.8	110483	CAGGGGGGTTCCCAAACATTAGGAGCAGCAGTTAATGTCCTTTAAAGCTT	110532

Overview

Query
BX957365.5 - 18148 bps
Hit
BX957303.8 - 110532 bps
Total alignments
15
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100193720001200011085331105321
287.4181139584659841365037921
396.04349948764974130256303561
4100357248774948-132245323161
5100367348794951132245323171
682.1621591618616344163903640641
787.1812723157535983164724649571
884.33671341429614429172363724961
9100367548764950-174719747931
10100387848764953174720747971
1197.78358848754962185589856781
1297.8358948744962-185591856811
1378.764418946494837-188460886521
1497.67398648714956-199102991871
15100377648744949199109991841
Short-link