<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  BX000986.4	151501	GAATTCATTGGTAGATATTTGTTGTTGTTTTTAACATATAGATGCTTTTA	151452
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71297	GAATTCATTGGTAGATATTTGTTGTTGTTTTTAACATATAGATGCTTTTA	71346

C  BX000986.4	151451	TTTCATTCATTTTACAGAAAATTTGTGTTCTTGTTTTGCTTTCAAAGTAA	151402
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71347	TTTCATTCATTTTACAGAAAATTTGTGTTCTTGTTTTGCTTTCAAAGTAA	71396

C  BX000986.4	151401	AAGTATATTAATGTAAGGATTTGTAGACATTTGGAAAACACAAGAATAGA	151352
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71397	AAGTATATTAATGTAAGGATTTGTAGACATTTGGAAAACACAAGAATAGA	71446

C  BX000986.4	151351	ACATGTTACTGTAATACTGTTTTAATTTTAAATCTGATGTAAATCATCAC	151302
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71447	ACATGTTACTGTAATACTGTTTTAATTTTAAATCTGATGTAAATCATCAC	71496

C  BX000986.4	151301	TGAAGTCTTAAGTGTTAGATGATGCTTCATAAATTATGTTTATATGATTA	151252
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71497	TGAAGTCTTAAGTGTTAGATGATGCTTCATAAATTATGTTTATATGATTA	71546

C  BX000986.4	151251	TTTCTGTCCTTTTGTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATGAATGAAAGTT	151202
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71547	TTTCTGTCCTTTTGTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATGAATGAAAGTT	71596

C  BX000986.4	151201	TAAAAGAACATCATTTACTTGAAATCTTTGTAACGTAATTTCTTAACTGA	151152
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71597	TAAAAGAACATCATTTACTTGAAATCTTTGTAACGTAATTTCTTAACTGA	71646

C  BX000986.4	151151	GACTTCATCTATCCGTGCTGAAAAACAAAATAAAAAAAAAATCTTTCAGA	151102
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71647	GACTTCATCTATCCGTGCTGAAAAACAAAATAAAAAAAAAATCTTTCAGA	71696

C  BX000986.4	151101	CCTCATACTTTTTAATACAAAAGTTAATACAAAAATACAAAGAGTATTTT	151052
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71697	CCTCATACTTTTTAATACAAAAGTTAATACAAAAATACAAAGAGTATTTT	71746

C  BX000986.4	151051	ACAGTACGTTGATTTACTGTAATTGATAAAGGTAGGGTTTTAAATTGAAT	151002
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71747	ACAGTACGTTGATTTACTGTAATTGATAAAGGTAGGGTTTTAAATTGAAT	71796

C  BX000986.4	151001	CTCTTATGTAGGTGTATGATATGGGTGAAAGGGCATAACGTTAGACATGG	150952
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71797	CTCTTATGTAGGTGTATGATATGGGTGAAAGGGCATAACGTTAGACATGG	71846

C  BX000986.4	150951	CGGACAGCTTAGGAACGTTACTTAATAGGTTTTGACTGTGACAAATGTGA	150902
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71847	CGGACAGCTTAGGAACGTTACTTAATAGGTTTTGACTGTGACAAATGTGA	71896

C  BX000986.4	150901	GGGCGTTTTCAACAGGGCATTAGCGTTATGCTTGGCTGGCTTGCGTGGTA	150852
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71897	GGGCGTTTTCAACAGGGCATTAGCGTTATGCTTGGCTGGCTTGCGTGGTA	71946

C  BX000986.4	150851	GGTGTGACTGGCTCTTCAAATGTGAGATCTCACAGGAAGACACTCAACAT	150802
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71947	GGTGTGACTGGCTCTTCAAATGTGAGATCTCACAGGAAGACACTCAACAT	71996

C  BX000986.4	150801	GCTCTTTTACTGTGTGCTATAATCAGATTATGTAGCCAGCAGCGAGGCAA	150752
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	71997	GCTCTTTTACTGTGTGCTATAATCAGATTATGTAGCCAGCAGCGAGGCAA	72046

C  BX000986.4	150751	GGGAACTCATTTACATAATAGTAGGTATAAGTGTACATATTTCTGTATGT	150702
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72047	GGGAACTCATTTACATAATAGTAGGTATAAGTGTACATATTTCTGTATGT	72096

C  BX000986.4	150701	GACCACCTGCTTCGTTATCAGAGGGATAAAAACCAGGGATTGACTCAAAA	150652
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72097	GACCACCTGCTTCGTTATCAGAGGGATAAAAACCAGGGATTGACTCAAAA	72146

C  BX000986.4	150651	ACATTTAACATTAGACACTACAGTCATGCATTTTTATGTAACTGTGTCAA	150602
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72147	ACATTTAACATTAGACACTACAGTCATGCATTTTTATGTAACTGTGTCAA	72196

C  BX000986.4	150601	TTTTGAGATTTTGGGCATTCCGGCGTTTCATTTTTATTTATTTTTTCAGT	150552
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72197	TTTTGAGATTTTGGGCATTCCGGCGTTTCATTTTTATTTATTTTTTCAGT	72246

C  BX000986.4	150551	CTAATGGAAAGAAAGAATCCAAAATACCATTTTAAAAGGATTATAGTGCC	150502
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72247	CTAATGGAAAGAAAGAATCCAAAATACCATTTTAAAAGGATTATAGTGCC	72296

C  BX000986.4	150501	CAAACTTTAAATGTACTCACTATTTACTCACCTTTAATTGGTTCCAAACC	150452
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72297	CAAACTTTAAATGTACTCACTATTTACTCACCTTTAATTGGTTCCAAACC	72346

C  BX000986.4	150451	ATTGAGTTTTATCTTCTGTTGTGCACGAAATAACATATTTTGAAGAAAGC	150402
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72347	ATTGAGTTTTATCTTCTGTTGTGCACGAAATAACATATTTTGAAGAAAGC	72396

C  BX000986.4	150401	TGAGGTACGGTGGCTGTGTGGTTAGCACTCCTGCCTCACAACAAGAAGGT	150352
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72397	TGAGGTACGGTGGCTGTGTGGTTAGCACTCCTGCCTCACAACAAGAAGGT	72446

C  BX000986.4	150351	CACTGGTTCGACGCCCGGCTGGGTCAGTTGGCATTTCTGTGTGGAGTTTG	150302
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72447	CACTGGTTCGACGCCCGGCTGGGTCAGTTGGCATTTCTGTGTGGAGTTTG	72496

C  BX000986.4	150301	CATGTTCTCTCCATGTTCACGTGGGTTTCCTCCGAGAGCTCCGGTTTCCC	150252
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72497	CATGTTCTCTCCATGTTCACGTGGGTTTCCTCCGAGAGCTCCGGTTTCCC	72546

C  BX000986.4	150251	CCATAGTACAAAGATATTCATTCATTAATTTATTAATTTCTTTTGTTAAT	150202
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72547	CCATAGTACAAAGATATTCATTCATTAATTTATTAATTTCTTTTGTTAAT	72596

C  BX000986.4	150201	CTCGGGTCGCTACAGTGGAATGAACCGCCAACTTATCCAGCATATGTTTT	150152
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72597	CTCGGGTCGCTACAGTGGAATGAACCGCCAACTTATCCAGCATATGTTTT	72646

C  BX000986.4	150151	ACGCAGTGGATACCCTTCCAGCTGAAACCCATCACTGGGAAACACACACA	150102
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72647	ACGCAGTGGATACCCTTCCAGCTGAAACCCATCACTGGGAAACACACACA	72696

C  BX000986.4	150101	CTCATTCACACACTTGTACACTTCGGTCAATTTTAGCTTACCCAATTCAC	150052
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72697	CTCATTCACACACTTGTACACTTCGGTCAATTTTAGCTTACCCAATTCAC	72746

C  BX000986.4	150051	CTGTACCACATGTCTCTGGACTGTGGGGGGAAAACAGAGCACCCGGAGGA	150002
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72747	CTGTACCACATGTCTCTGGACTGTGGGGGGAAAACAGAGCACCCGGAGGA	72796

C  BX000986.4	150001	AACCCACGCTAACACAGGGAGAACATGCAAACTCCACACAGAAACGCCAA	149952
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72797	AACCCACGCTAACACAGGGAGAACATGCAAACTCCACACAGAAACGCCAA	72846

C  BX000986.4	149951	CCGACCCAGCCGAGGCTCAAACCAGCAACCTTCTTGCTGAGGCGAACATG	149902
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72847	CCGACCCAGCCGAGGCTCAAACCAGCAACCTTCTTGCTGAGGCGAACATG	72896

C  BX000986.4	149901	CTACCCACTGCGCCACCGTGTCACCTCCAAAGACATGCAGTATAGGTTAA	149852
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72897	CTACCCACTGCGCCACCGTGTCACCTCCAAAGACATGCAGTATAGGTTAA	72946

C  BX000986.4	149851	TTGAATGAACTAAATTGCCCGTAGTGTTTGAGTGTGTGTGTGAATGAGTG	149802
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72947	TTGAATGAACTAAATTGCCCGTAGTGTTTGAGTGTGTGTGTGAATGAGTG	72996

C  BX000986.4	149801	TGCATGGGTGTTTCCCAATACTGGGTTGCAGTTGGAAGGTCATCCGCTGT	149752
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	72997	TGCATGGGTGTTTCCCAATACTGGGTTGCAGTTGGAAGGTCATCCGCTGT	73046

C  BX000986.4	149751	GTAAAACATATGCTGGAATAGTTGGTGGTTTATTCTGCTGTGGTGACTTC	149702
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	73047	GTAAAACATATGCTGGAATAGTTGGTGGTTTATTCTGCTGTGGTGACTTC	73096

C  BX000986.4	149701	TGAAATAGAGACTAACCTGAAGGAAAATACATGTAGAAAGCTGAAAAAAA	149652
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	73097	TGAAATAGAGACTAACCTGAAGGAAAATACATGTAGAAAGCTGAAAAAAA	73146

C  BX000986.4	149651	AATTCTTCAGCTCTGAGCAATAAATCTCCACTCTAGCAGCACGTACATAC	149602
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	73147	AATTCTTCAGCTCTGAGCAATAAATCTCCACTCTAGCAGCACGTACATAC	73196

C  BX000986.4	149601	ACTGAATTTTAGTTTTCATATTTGTATTCTGATGGTCTTTGCAGGGAGAT	149552
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	73197	ACTGAATTTTAGTTTTCATATTTGTATTCTGATGGTCTTTGCAGGGAGAT	73246

C  BX000986.4	149551	TTGTTCATGCATAATTAATTTATTCTGGATTTTCACAGTATCACAGTATT	149502
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX957237.11	73247	TTGTTCATGCATAATTAATTTATTCTGGATTTTCACAGTATCACAGTATT	73296

Overview

Query
BX000986.4 - 151501 bps
Hit
BX957237.11 - 73296 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110019512000149502151501-171297732961
291.926098135340135437-1407841761
383.193811452095322-139301394131
487.747515652745429-139311394651
597.73618853415428-139604396911
697.78314552095253-139617396611
787.08183325144329144653-141224415481
883.7260129150256150384-141772419001
980.721223387717677513141775421061
1079.31892768938889663-141788420531
1180.016821867306947-144355445841
1285.72179359144351144709-148578489201
13925477139435139511148860489341
1488.1756947644876541151433515251
1588.546096150238150333151435515301
1696.9160193110817111009-156095562881
1792.115176101496101571-157015570901
1891.3239333122980123312-165978663221
1981.93681568953289687-172406725601
2084.09621287718877315172429725601
Short-link