<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX936369.5	1	GGCCACACGGGGCCGCTGCCGCTCTACGCTTGGGTTCTGATGAGCTGCTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33249	GGCCACACGGGGCCGCTGCCGCTCTACGCTTGGGTTCTGATGAGCTGCTC	33298

BX936369.5	51	TGGAGAGGACGGGGCGGTGGTCTGAGTAAGACACAGATTGTTGATCCAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33299	TGGAGAGGACGGGGCGGTGGTCTGAGTAAGACACAGATTGTTGATCCAGA	33348

BX936369.5	101	AAGGATGTATCAATGAGGTGGGGCTGGGGTTGTCCAGGGGGTGGAAAGGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33349	AAGGATGTATCAATGAGGTGGGGCTGGGGTTGTCCAGGGGGTGGAAAGGC	33398

BX936369.5	151	CTTCTGAGAAGCCCTGGACTGCGCGGGGTTCCGGCTCTGCGGAACAGAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33399	CTTCTGAGAAGCCCTGGACTGCGCGGGGTTCCGGCTCTGCGGAACAGAGG	33448

BX936369.5	201	AGGGCTCTGGAGCTGCCTGTCTCTGAGGTTTCCAACTCCTCCTTGCAAAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33449	AGGGCTCTGGAGCTGCCTGTCTCTGAGGTTTCCAACTCCTCCTTGCAAAC	33498

BX936369.5	251	CCTCCCTCCAGCCTTTTCATGGCAACACTCCAGGAAAATGGAAAGTTGAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33499	CCTCCCTCCAGCCTTTTCATGGCAACACTCCAGGAAAATGGAAAGTTGAT	33548

BX936369.5	301	CATTTTTTTCTTCCACTCCTTAATCCTTTCGTGACTGCTACTTTTAGATA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33549	CATTTTTTTCTTCCACTCCTTAATCCTTTCGTGACTGCTACTTTTAGATA	33598

BX936369.5	351	ATTTTATTTTAGAAGAGTTTTAAATTTACATAAAAGTTGCAATGGTAGTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33599	ATTTTATTTTAGAAGAGTTTTAAATTTACATAAAAGTTGCAATGGTAGTA	33648

BX936369.5	401	CAGAGTTGCCATCCGCTCCACAGTCAGTTTCCCCTGATGTTAACATCTCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33649	CAGAGTTGCCATCCGCTCCACAGTCAGTTTCCCCTGATGTTAACATCTCT	33698

BX936369.5	451	CATTACTATGGTCCATTTGTCACAGCTAATGAAGCCATTTTCATACCTTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33699	CATTACTATGGTCCATTTGTCACAGCTAATGAAGCCATTTTCATACCTTA	33748

BX936369.5	501	TTATTACTAAACTGCAGACTTTATTTGGAGTTCATTAGCGTTCCCCTAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33749	TTATTACTAAACTGCAGACTTTATTTGGAGTTCATTAGCGTTCCCCTAAT	33798

BX936369.5	551	GTCCTTTCTGTGTTTCAGGATTCCATGGAGAATATCACACTACATTTAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33799	GTCCTTTCTGTGTTTCAGGATTCCATGGAGAATATCACACTACATTTAGT	33848

BX936369.5	601	CTCCGTCGTGCCTCCACGGCATCCTCTGGTCTGTGACAATTCCTGAGATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33849	CTCCGTCGTGCCTCCACGGCATCCTCTGGTCTGTGACAATTCCTGAGATT	33898

BX936369.5	651	TTCCTAATTTTTGATGCCTTTCACAATATCGGGAAGTACTGACCAGATAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33899	TTCCTAATTTTTGATGCCTTTCACAATATCGGGAAGTACTGACCAGATAT	33948

BX936369.5	701	ATTGTAAAATGTCCCTCAAACTGAATTTAGTTGGGGTGTAGATCATGGTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33949	ATTGTAAAATGTCCCTCAAACTGAATTTAGTTGGGGTGTAGATCATGGTT	33998

BX936369.5	751	AGACTATGGTTATGGATGTTTAGATGAGGTGAAGTGCTGTTCTCCAAACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	33999	AGACTATGGTTATGGATGTTTAGATGAGGTGAAGTGCTGTTCTCCAAACA	34048

BX936369.5	801	CATTATCAAGATTATATCAATTTGATGTACCACTGTTGATGTTGAAGTTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34049	CATTATCAAGATTATATCAATTTGATGTACCACTGTTGATGTTGAAGTTG	34098

BX936369.5	851	ACCATCCATATTTTTACTTCCTGTAGCTGCCACAAAAATGCCCTCAAAGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34099	ACCATCCATATTTTTACTTCCTGTAGCTGCCACAAAAATGCCCTCAAAGT	34148

BX936369.5	901	TGGCAACTTACAACAACAGAAAATTATTCTTTCACAGTTCTGGAGGCCCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34149	TGGCAACTTACAACAACAGAAAATTATTCTTTCACAGTTCTGGAGGCCCA	34198

BX936369.5	951	GGGCATTGGTCAGCGTTCTTTGGCTTGTAGCCCCATTGCTCCAGTCTCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34199	GGGCATTGGTCAGCGTTCTTTGGCTTGTAGCCCCATTGCTCCAGTCTCTG	34248

BX936369.5	1001	CCTCCTTCTTCACATTGCCTTCTCCTCTTCTGACTCTCTCTTCTGTGTAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34249	CCTCCTTCTTCACATTGCCTTCTCCTCTTCTGACTCTCTCTTCTGTGTAC	34298

BX936369.5	1051	CTGTTAGGAAGACACTTTTCATTGGATTTAGGGCCCACCTAGGTCATCCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34299	CTGTTAGGAAGACACTTTTCATTGGATTTAGGGCCCACCTAGGTCATCCA	34348

BX936369.5	1101	GGAGGATCTCCTCATTTCAATATCCTCAGCTTAATTACATCTGCAAAGAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34349	GGAGGATCTCCTCATTTCAATATCCTCAGCTTAATTACATCTGCAAAGAC	34398

BX936369.5	1151	CCTTTTTTTCCAAACAACTTGAAATTCACAGCTTCTGGGGACTAGGACAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34399	CCTTTTTTTCCAAACAACTTGAAATTCACAGCTTCTGGGGACTAGGACAG	34448

BX936369.5	1201	AAACATATCTTTGTGGGGACAACCATTCAACCCACTACATCTGGCTAAGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34449	AAACATATCTTTGTGGGGACAACCATTCAACCCACTACATCTGGCTAAGC	34498

BX936369.5	1251	TAATATTTCCCAGAGTGGCAATCCACCAGTGCACCCCAGGTTACAATCCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34499	TAATATTTCCCAGAGTGGCAATCCACCAGTGCACCCCAGGTTACAATCCT	34548

BX936369.5	1301	CATTCTAATTCCCAAATAAACTCAACATATTTGGACATTTCTTTAATGTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34549	CATTCTAATTCCCAAATAAACTCAACATATTTGGACATTTCTTTAATGTC	34598

BX936369.5	1351	TTTTTTTTTTTTAGGTTGAAAAATCTGGTATCAGAAGTGATCCTGAAGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34599	TTTTTTTTTTTTAGGTTGAAAAATCTGGTATCAGAAGTGATCCTGAAGAA	34648

BX936369.5	1401	AGATTACCTTTGGAAGAGACTTATGCTGAGTTCATTGCTTGATTTCTTGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34649	AGATTACCTTTGGAAGAGACTTATGCTGAGTTCATTGCTTGATTTCTTGC	34698

BX936369.5	1451	CTCTGTTTCTGAACATCTTTTGAGAGCAAAATTTACTTTCTAAAAAGATG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34699	CTCTGTTTCTGAACATCTTTTGAGAGCAAAATTTACTTTCTAAAAAGATG	34748

BX936369.5	1501	GGTATGTGTCGACCCTTTAAAAGCTGTTTGGGCTATTGTCGCCATTCAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34749	GGTATGTGTCGACCCTTTAAAAGCTGTTTGGGCTATTGTCGCCATTCAAT	34798

BX936369.5	1551	GAGAAACTTCAGTCTCCCCAAAGAGAAATTATCTGTTGTCAGGATAAACT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34799	GAGAAACTTCAGTCTCCCCAAAGAGAAATTATCTGTTGTCAGGATAAACT	34848

BX936369.5	1601	GGTACATGAATAAACAAAATTGCCATTAGGGGTCGCACCAGTCTCAAGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34849	GGTACATGAATAAACAAAATTGCCATTAGGGGTCGCACCAGTCTCAAGAA	34898

BX936369.5	1651	AAATCTGGAGAAAATGGTCACAGGATGGACAATTAGATCACAGGCTGCCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34899	AAATCTGGAGAAAATGGTCACAGGATGGACAATTAGATCACAGGCTGCCC	34948

BX936369.5	1701	ACTAAGTAAAAACAAAAATCCTATACTAGGCACACTATTAAAAAACAAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34949	ACTAAGTAAAAACAAAAATCCTATACTAGGCACACTATTAAAAAACAAAT	34998

BX936369.5	1751	CGCTCCAGCCTCTACCATTTCCTCACAGGGATTATGGAATTTTTCTTTTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	34999	CGCTCCAGCCTCTACCATTTCCTCACAGGGATTATGGAATTTTTCTTTTG	35048

BX936369.5	1801	CTGTCGAGAAATTAATAAGAGGCAGAACAGGATGCCAAAATTCCAAAGCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	35049	CTGTCGAGAAATTAATAAGAGGCAGAACAGGATGCCAAAATTCCAAAGCA	35098

BX936369.5	1851	TCCAATATAGGCCGTCTTCTGGGACTCCTGTCAGCTATATGGTCAAAATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	35099	TCCAATATAGGCCGTCTTCTGGGACTCCTGTCAGCTATATGGTCAAAATT	35148

BX936369.5	1901	TATGGTCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACCTTGGGAGACCAAGGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	35149	TATGGTCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACCTTGGGAGACCAAGGT	35198

BX936369.5	1951	GGAAGGATCACTTGAGCTCATGAGTTTGAAACCATCCTGGGCAACATAGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX936375.4	35199	GGAAGGATCACTTGAGCTCATGAGTTTGAAACCATCCTGGGCAACATAGC	35248

Overview

Query
BX936369.5 - 24755 bps
Hit
BX936375.4 - 35248 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link