<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

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BX510310.14	17317	GTTAATGTACAATTAAATAGTGATTAATTAGATTAATTAACTGCCACATG	17366
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BX510310.14	17367	TAATTAATTACATTAAAGATTCAAATCGCTTGATAGCCCTGACACAAATA	17416
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BX510310.14	17917	TGTGTTCGTTAAGCAAACAGACCATTGTGGCTTGGTGTCGCTCTCTCATT	17966
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BX927303.11	951	GTTTCTCCAACCTGAAGCGACACGATATTATGATAAGAATACACTGCAAG	1000

BX510310.14	18217	GTTTTTATTAATTAGCAGGATTAATAGTGATAACAAAAAAATAAATAAAT	18266
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BX510310.14	18367	CTCAGCGATCCTGCAGGTGGGCCGTGAGATAGCTTAAAATTAACTTAATT	18416
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BX510310.14	18417	ATTGTACTATATTTATTTGCTTTCATTATTAAATATGTTTTATATAAAAA	18466
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BX510310.14	18467	TGATTGGTGTAATGGCATTTCCTATTTTCTGTTATTGATTACTACGGACT	18516
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BX510310.14	18517	CGGTCTCACTGTAAAATACATACTTAACCGTGGCTGCACTTCCAACCACT	18566
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BX927303.11	1301	CGGTCTCACTGTAAAATACATACTTAACCGTGGCTGCACTTCCAACCACT	1350

BX510310.14	18567	GCACATCAAATAGGACTACATGCTCTGCTGTATTAAGCAAACCCTCACGC	18616
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BX927303.11	1351	GCACATCAAATAGGACTACATGCTCTGCTGTATTAAGCAAACCCTCACGC	1400

BX510310.14	18617	AAATGTTAAGGTAACAATGATAAAAGTTGTTTTGCTCTTGCCTCACATCA	18666
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BX510310.14	18717	CTTGTGTGAAAATATCAGCAAAGTTGTCCAAGTTCATTTTTTTATAACGC	18766
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BX510310.14	18767	GTGTGTGAGTGTTTTATAACGGACGCGCTCCCATATAGGAGGATCTAGCG	18816
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BX510310.14	18817	AAACACCACTGTCAGCAAACTCCAATAATATCTTAAAACCCAACCTCCTT	18866
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BX510310.14	18867	CTGATCGATGTGTTTCAACAGACTTAGATTGTTCTTACTGTATTTTATTT	18916
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BX510310.14	18917	ATTTTTTGTTTACTGTAATGGATACGATCAAAAGATGAATAGTAGTGAGC	18966
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BX510310.14	18967	TCAATTTAAAGCAACAGTTTTTTTAATCTGTTGTCCTGTACAGGTTCATT	19016
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BX927303.11	1751	TCAATTTAAAGCAACAGTTTTTTTAATCTGTTGTCCTGTACAGGTTCATT	1800

BX510310.14	19017	TATTAAAGAAAAGACCCAAATTCTCTGCAGTTGGGAAAAAATCCTGAAGA	19066
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BX927303.11	1801	TATTAAAGAAAAGACCCAAATTCTCTGCAGTTGGGAAAAAATCCTGAAGA	1850

BX510310.14	19067	GTTCAGAAGCTTTGAATATGAATATGTTTGTGTTTTTAAAATAAATTTTA	19116
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BX927303.11	1851	GTTCAGAAGCTTTGAATATGAATATGTTTGTGTTTTTAAAATAAATTTTA	1900

BX510310.14	19117	TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA	19166
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BX927303.11	1901	TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA	1950

BX510310.14	19167	TATATATATATATATATATATATATATATATATA----GCAGTTCTCAAG	19212
			||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||
BX927303.11	1951	TATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGCAGTTCTCAAG	2000

BX510310.14	19213	GCAA	19216
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BX927303.11	2001	GCAA	2004

Compact alignment

skip 1950 bps 100% identity alignment

BX510310.14	19167	TATATATATATATATATATATATATATATATATA----GCAGTTCTCAAG	19212
			||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||
BX927303.11	1951	TATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGCAGTTCTCAAG	2000

skip 4 bps 100% identity alignment

Overview

Query
BX510310.14 - 19216 bps
Hit
BX927303.11 - 163380 bps
Total alignments
30
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

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