<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927143.4	1	TTCAGAACATAGGCATGGGCAAAGATTTCATGATGAAGACTCCAAAAGCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	111691	TTCAGAACATAGGCATGGGCAAAGATTTCATGATGAAGACTCCAAAAGCA	111740

BX927143.4	51	ATTGCAACAAAAGCAAAAATTGACTAATGGAATTAATTAAACTAAAGAGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	111741	ATTGCAACAAAAGCAAAAATTGACTAATGGAATTAATTAAACTAAAGAGC	111790

BX927143.4	101	TTCTGCACAGCAAAGGAAACTATCAGCAGAGTGAATAGACAACCTGCAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	111791	TTCTGCACAGCAAAGGAAACTATCAGCAGAGTGAATAGACAACCTGCAGA	111840

BX927143.4	151	ATAGGAGAAGATTTTTGCAATCTATACATCTGACAAAGGTCTAATATCCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	111841	ATAGGAGAAGATTTTTGCAATCTATACATCTGACAAAGGTCTAATATCCA	111890

BX927143.4	201	GAGTTTACAAGGAGCTTCAGCAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	111891	GAGTTTACAAGGAGCTTCAGCAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCCC	111940

BX927143.4	251	ATTAAAAAGTAGGCAAAGGACATGAGCAGACACCTCTCAAAAAAAGACAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	111941	ATTAAAAAGTAGGCAAAGGACATGAGCAGACACCTCTCAAAAAAAGACAT	111990

BX927143.4	301	ACATGCAGCCAACAAACATATGAGAAAAGTTGAACATCACTGATAATTAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	111991	ACATGCAGCCAACAAACATATGAGAAAAGTTGAACATCACTGATAATTAG	112040

BX927143.4	351	AGAAATGCAAATAAAAACCACAATGAGATACCAGAGTGGCTATTAATAAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112041	AGAAATGCAAATAAAAACCACAATGAGATACCAGAGTGGCTATTAATAAG	112090

BX927143.4	401	TCAAAAAACAAGAGATGCTGGTGAAGTCACAGAGAAAAAGCAATGCTTTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112091	TCAAAAAACAAGAGATGCTGGTGAAGTCACAGAGAAAAAGCAATGCTTTC	112140

BX927143.4	451	ACACTGTTGGTGGAAATGTAAATTCGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112141	ACACTGTTGGTGGAAATGTAAATTCGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGT	112190

BX927143.4	501	GGTGATTCCTCAAAAACCTAGAGGCAGAAATTGACCTAGCAATCTCATTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112191	GGTGATTCCTCAAAAACCTAGAGGCAGAAATTGACCTAGCAATCTCATTA	112240

BX927143.4	551	CTGGATACATACCCAAAGGAATATAAATCATTCTATTATAAAGATATATA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112241	CTGGATACATACCCAAAGGAATATAAATCATTCTATTATAAAGATATATA	112290

BX927143.4	601	CACGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATGGAATC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112291	CACGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATGGAATC	112340

BX927143.4	651	AACATAAATGCCCATCAATGATAGACTGGATAAAGAAAATGTGGTACATA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112341	AACATAAATGCCCATCAATGATAGACTGGATAAAGAAAATGTGGTACATA	112390

BX927143.4	701	TACAACATGGAATGCGATGCAGCCACATAAAGGAATAAGACCATGTCCTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112391	TACAACATGGAATGCGATGCAGCCACATAAAGGAATAAGACCATGTCCTT	112440

BX927143.4	751	TGCAGGGACATGAATGGAGTGGGAAGCCATTATCCTCAGCAAACTGACCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112441	TGCAGGGACATGAATGGAGTGGGAAGCCATTATCCTCAGCAAACTGACCC	112490

BX927143.4	801	AGGAACAGAAAACAAAACACCATGTGTTCTCACTTATAAGTGGGAGCTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112491	AGGAACAGAAAACAAAACACCATGTGTTCTCACTTATAAGTGGGAGCTGA	112540

BX927143.4	851	ATGATGACAACACATGGATACATGGGGGAGAACAACACACACTGGGGTCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112541	ATGATGACAACACATGGATACATGGGGGAGAACAACACACACTGGGGTCT	112590

BX927143.4	901	GTTAGAGGGCATGGGGCTGGGGGAGGGAAGCACCAGGAAGAATAGCCAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112591	GTTAGAGGGCATGGGGCTGGGGGAGGGAAGCACCAGGAAGAATAGCCAAT	112640

BX927143.4	951	GGATGTTGGCCTTAATACCTAGGTGATGGGACGATCTCTGCAGCAAACCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112641	GGATGTTGGCCTTAATACCTAGGTGATGGGACGATCTCTGCAGCAAACCA	112690

BX927143.4	1001	CCATGGCACACATTTACCTACGTAACAAACCTGCACATTCTGTACATGTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112691	CCATGGCACACATTTACCTACGTAACAAACCTGCACATTCTGTACATGTA	112740

BX927143.4	1051	CCCCTGAACTTAAAAAAAGGGTGGAGAAAAAAAGATTAAAAAGTTACAGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112741	CCCCTGAACTTAAAAAAAGGGTGGAGAAAAAAAGATTAAAAAGTTACAGT	112790

BX927143.4	1101	AAGCTAAGATTAATTTATTATTAAAGAAAGAAAATGATTTTTAAAATTAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112791	AAGCTAAGATTAATTTATTATTAAAGAAAGAAAATGATTTTTAAAATTAA	112840

BX927143.4	1151	TTTAGTGTAGCCTAAATGTACAGTGTTTATAAAGTCTAAGTAGTGTATAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112841	TTTAGTGTAGCCTAAATGTACAGTGTTTATAAAGTCTAAGTAGTGTATAG	112890

BX927143.4	1201	TAATGCCCTAGACTTCACATTCACTCGCCACTCACTGACACCCAGAGCAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112891	TAATGCCCTAGACTTCACATTCACTCGCCACTCACTGACACCCAGAGCAA	112940

BX927143.4	1251	TTTCCAGTCCTGTAAGCTCCATTCATGGTAAGTGCTCTAGACAAATGTGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112941	TTTCCAGTCCTGTAAGCTCCATTCATGGTAAGTGCTCTAGACAAATGTGC	112990

BX927143.4	1301	CAGTTTTTAAAAAATCTTTTAACCACATTTTTGTGGCAAAATTTTGTGGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	112991	CAGTTTTTAAAAAATCTTTTAACCACATTTTTGTGGCAAAATTTTGTGGG	113040

BX927143.4	1351	AAAATTCAAAGTCTTTTTTCTACTGTTCTTACACCCCAACAACTATCAAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	113041	AAAATTCAAAGTCTTTTTTCTACTGTTCTTACACCCCAACAACTATCAAC	113090

BX927143.4	1401	ACAGAAGGCTTCTGCGATGAAATGTAGGGGATTTCTCCCCAAAAACAAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	113091	ACAGAAGGCTTCTGCGATGAAATGTAGGGGATTTCTCCCCAAAAACAAGC	113140

BX927143.4	1451	AAACAATTGGTTCTGTTATGGACGCCAGCTGGGTATCCTCTAACTCAATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	113141	AAACAATTGGTTCTGTTATGGACGCCAGCTGGGTATCCTCTAACTCAATT	113190

BX927143.4	1501	CTGACACTATCTCCCTGGAGATAATTTTAGATCCCGCAAGTTGATGGCTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	113191	CTGACACTATCTCCCTGGAGATAATTTTAGATCCCGCAAGTTGATGGCTC	113240

BX927143.4	1551	AGTCCTCACGACTGTCACCCTCTCACTTCTGATGACAATCTCAAGCCCCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	113241	AGTCCTCACGACTGTCACCCTCTCACTTCTGATGACAATCTCAAGCCCCA	113290

BX927143.4	1601	GATTATTTTGCCTGTGTTGCTAACTCACTGACTATAAATCAGGGTTCCCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	113291	GATTATTTTGCCTGTGTTGCTAACTCACTGACTATAAATCAGGGTTCCCA	113340

BX927143.4	1651	AAACCCACCCTCAGGTTTGATTGATTTGCTAGAATGGCTCATAGCATGCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	113341	AAACCCACCCTCAGGTTTGATTGATTTGCTAGAATGGCTCATAGCATGCC	113390

BX927143.4	1701	AGGAAACACTTACATACATTAACCAGTTTATTTAAAAGGATATTTTAAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	113391	AGGAAACACTTACATACATTAACCAGTTTATTTAAAAGGATATTTTAAAG	113440

BX927143.4	1751	GATAAAGAGCCACATGAAGAGATAAGAGCCACATGAAGAGATACATAGGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	113441	GATAAAGAGCCACATGAAGAGATAAGAGCCACATGAAGAGATACATAGGG	113490

BX927143.4	1801	TGAGGTCTGAAAGGGTCTTGAGTGCAGGAGCTTCTGCCCCATGTGTTTGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	113491	TGAGGTCTGAAAGGGTCTTGAGTGCAGGAGCTTCTGCCCCATGTGTTTGG	113540

BX927143.4	1851	GAAGTGCTACCCTCCCTGGCACATGTCTGAGTTATTGTTCACCTTCCTAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	113541	GAAGTGCTACCCTCCCTGGCACATGTCTGAGTTATTGTTCACCTTCCTAT	113590

BX927143.4	1901	AAGCCTCCCTGTGTTCAGCCATACAGAAGCTCTCTGACTCTTCCCTTTTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	113591	AAGCCTCCCTGTGTTCAGCCATACAGAAGCTCTCTGACTCTTCCCTTTTG	113640

BX927143.4	1951	GGTTTTGATGGAAGCCATATTTCTTAGGCATGATTCATTACATCATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927214.4	113641	GGTTTTGATGGAAGCCATATTTCTTAGGCATGATTCATTACATCATGGCC	113690

Overview

Query
BX927143.4 - 59608 bps
Hit
BX927214.4 - 113690 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link