<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR752661.4	1	TGGGGAGCCCAACCTCAGCTCCTAGCCAGAAGCAGAAAGTCAAAATTTGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	37609	TGGGGAGCCCAACCTCAGCTCCTAGCCAGAAGCAGAAAGTCAAAATTTGG	37658

CR752661.4	51	CTGTCTTTCCTCCATAGAGCACTTTTGGTTTCTTTCCCACTTAGGAATTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	37659	CTGTCTTTCCTCCATAGAGCACTTTTGGTTTCTTTCCCACTTAGGAATTA	37708

CR752661.4	101	AATTCCCAGCCAATAATGCCTACTTTCAGGCATAGAAGTCAAGACTTCAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	37709	AATTCCCAGCCAATAATGCCTACTTTCAGGCATAGAAGTCAAGACTTCAG	37758

CR752661.4	151	CCCTACTCACCATATGCATATCTATCTTATTTGAAGTTCTCAGGAAGAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	37759	CCCTACTCACCATATGCATATCTATCTTATTTGAAGTTCTCAGGAAGAAC	37808

CR752661.4	201	TTTTGTATCTACACTCATACTTTTTAATCCTTTTTAGTACATTGCTTCAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	37809	TTTTGTATCTACACTCATACTTTTTAATCCTTTTTAGTACATTGCTTCAT	37858

CR752661.4	251	ATAGCTTTCTTGGTGGTGGTTGTACTTATTACAATATATACATATAACTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	37859	ATAGCTTTCTTGGTGGTGGTTGTACTTATTACAATATATACATATAACTT	37908

CR752661.4	301	ATCACAGTCTACTGGTATTGATGTTTTACCACTTTGAGTGAAGGATACAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	37909	ATCACAGTCTACTGGTATTGATGTTTTACCACTTTGAGTGAAGGATACAG	37958

CR752661.4	351	TCCGTATCTCTAGTACCATTAGCATATTTTACCCTCTCTACTTTTTAAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	37959	TCCGTATCTCTAGTACCATTAGCATATTTTACCCTCTCTACTTTTTAAAT	38008

CR752661.4	401	GCAATTGTATTAAGTATTTCTTCCACATGCATTCCCATCCACAGTTTGGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38009	GCAATTGTATTAAGTATTTCTTCCACATGCATTCCCATCCACAGTTTGGA	38058

CR752661.4	451	TATTTGTCCACTCCAAATCTCATGTTGAAATTTGATCCCCAATGTTGGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38059	TATTTGTCCACTCCAAATCTCATGTTGAAATTTGATCCCCAATGTTGGAG	38108

CR752661.4	501	GCAGGGCCTAATGGGAGATGTTTAGACCATGGGGGCAGATCCCTCATGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38109	GCAGGGCCTAATGGGAGATGTTTAGACCATGGGGGCAGATCCCTCATGAA	38158

CR752661.4	551	TGGCTTTGTGCTAATGTCATGATCCTAATGCTTGTTTTATTCCTCAATGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38159	TGGCTTTGTGCTAATGTCATGATCCTAATGCTTGTTTTATTCCTCAATGT	38208

CR752661.4	601	CATCATTGATTCAACCATAGCTTTTATTTTTAATTTGCTTTTTGTTTGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38209	CATCATTGATTCAACCATAGCTTTTATTTTTAATTTGCTTTTTGTTTGTT	38258

CR752661.4	651	TGTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38259	TGTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTGT	38308

CR752661.4	701	CGCCCAGGCTGGAGCGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38309	CGCCCAGGCTGGAGCGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGC	38358

CR752661.4	751	CTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38359	CTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAC	38408

CR752661.4	801	TACAGGCGGGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38409	TACAGGCGGGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAG	38458

CR752661.4	851	ACGGGGTTTCACTGTGTCAGCCAGGATAGTCTCGATCTCCTGACCTCGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38459	ACGGGGTTTCACTGTGTCAGCCAGGATAGTCTCGATCTCCTGACCTCGTG	38508

CR752661.4	901	ATCCGCCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38509	ATCCGCCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC	38558

CR752661.4	951	CGTGCCCGGCCTGTTTTCTTTTCTTAACTATTATTTTAAGTTCGGGGTAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38559	CGTGCCCGGCCTGTTTTCTTTTCTTAACTATTATTTTAAGTTCGGGGTAC	38608

CR752661.4	1001	ATGTGCAGTTTTGTTACATAGGTAACCTGTGTCATGGAGGTTTGTTGTAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38609	ATGTGCAGTTTTGTTACATAGGTAACCTGTGTCATGGAGGTTTGTTGTAC	38658

CR752661.4	1051	AGATTATTTTGTCAAACAGTTATTAAGCCTAGTACTTATTAGTTATTTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38659	AGATTATTTTGTCAAACAGTTATTAAGCCTAGTACTTATTAGTTATTTTT	38708

CR752661.4	1101	CCTGATCCTCTCCCTCTTCCCACTCTCCACCCTCTGATAGGCCCCAGTGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38709	CCTGATCCTCTCCCTCTTCCCACTCTCCACCCTCTGATAGGCCCCAGTGT	38758

CR752661.4	1151	GTGTTGTTTTCCTTTATGAATTCATGTGTTCTCATAATTTAGCTCCTATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38759	GTGTTGTTTTCCTTTATGAATTCATGTGTTCTCATAATTTAGCTCCTATT	38808

CR752661.4	1201	TATAAGTGAGGACATACAGTATTCAGTTTTCTGTTCCCCCATTAGTTTGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38809	TATAAGTGAGGACATACAGTATTCAGTTTTCTGTTCCCCCATTAGTTTGC	38858

CR752661.4	1251	TAGGGATAATGACTTTCAGCTTCATCCATGTCTCTGCAAAGGACATGATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38859	TAGGGATAATGACTTTCAGCTTCATCCATGTCTCTGCAAAGGACATGATT	38908

CR752661.4	1301	TTGTTTCTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTACCACATTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38909	TTGTTTCTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTACCACATTT	38958

CR752661.4	1351	TATTTATCTAGTCTATCATTGATGGGCATTTAGGTTGATTCCATGTCTTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	38959	TATTTATCTAGTCTATCATTGATGGGCATTTAGGTTGATTCCATGTCTTT	39008

CR752661.4	1401	GCTATTGTGAATATGCTGCAATGAACATATACATGCATGTGCCTTTATAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	39009	GCTATTGTGAATATGCTGCAATGAACATATACATGCATGTGCCTTTATAA	39058

CR752661.4	1451	CAGAAAGATTTATATTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATAAGATTGCTGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	39059	CAGAAAGATTTATATTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATAAGATTGCTGG	39108

CR752661.4	1501	GTTGAATGGTATTTCTGTCTTTAGGTCTTTGAAGAATCTCCACACTGTCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	39109	GTTGAATGGTATTTCTGTCTTTAGGTCTTTGAAGAATCTCCACACTGTCT	39158

CR752661.4	1551	TCCCCAATGATGAACAAAACCTCTGAGAAATATGGGGTTATGTAAAGAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	39159	TCCCCAATGATGAACAAAACCTCTGAGAAATATGGGGTTATGTAAAGAGA	39208

CR752661.4	1601	CCAAATCTATGACTGATTGGTGTCCCTGAAAGAGATGGAGAGAATGGAAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	39209	CCAAATCTATGACTGATTGGTGTCCCTGAAAGAGATGGAGAGAATGGAAC	39258

CR752661.4	1651	CAACTTGGAAAACATAGTTCAGGATATCATCCATGAGAACTTCCCCAATC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	39259	CAACTTGGAAAACATAGTTCAGGATATCATCCATGAGAACTTCCCCAATC	39308

CR752661.4	1701	TAGCTAGAGAGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGTAGAGAACCCCAATA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	39309	TAGCTAGAGAGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGTAGAGAACCCCAATA	39358

CR752661.4	1751	AGATACTTCACAAGACTTTTATCCCCAAGACACACAATTATCAGCTTCCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	39359	AGATACTTCACAAGACTTTTATCCCCAAGACACACAATTATCAGCTTCCC	39408

CR752661.4	1801	CAAGGTCAAAATGAAAGAAAAAATGTTAAAAAATAAAAAATAAAAACAAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	39409	CAAGGTCAAAATGAAAGAAAAAATGTTAAAAAATAAAAAATAAAAACAAC	39458

CR752661.4	1851	TAGAGAGAAAGATCAGGTCACCTACAAAGGGAAGTCCATCAGACTAACAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	39459	TAGAGAGAAAGATCAGGTCACCTACAAAGGGAAGTCCATCAGACTAACAG	39508

CR752661.4	1901	CAGACCTCTCAGCTAAAACCCTACAAGCAGAAGAGATTGGAGGCCAATAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	39509	CAGACCTCTCAGCTAAAACCCTACAAGCAGAAGAGATTGGAGGCCAATAT	39558

CR752661.4	1951	TCAATATTCATAAAGAAAAGAAATTCCAACTCAGAGTTTCATAATTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927160.7	39559	TCAATATTCATAAAGAAAAGAAATTCCAACTCAGAGTTTCATAATTGGCC	39608

Overview

Query
CR752661.4 - 31181 bps
Hit
BX927160.7 - 39608 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link