<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CR382333.7 1 CTGAAATAATAGTTTGAATTTTGCTTTTAACATATATGCAAATCCTTTAA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 123406 CTGAAATAATAGTTTGAATTTTGCTTTTAACATATATGCAAATCCTTTAA 123455 CR382333.7 51 TACTGCTCCCTTCCAGAGGTGCAGCTTAATTCCCTCTCTTGAGTGTGGCT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 123456 TACTGCTCCCTTCCAGAGGTGCAGCTTAATTCCCTCTCTTGAGTGTGGCT 123505 CR382333.7 101 TGGACTTAATGATGCACTTCTGATATGGCCTGGTTCTGTGTTCCCACCCA 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 123506 TGGACTTAATGATGCACTTCTGATATGGCCTGGTTCTGTGTTCCCACCCA 123555 CR382333.7 151 AATCTCATCTTCAATTGTCATGCGAATTGTAATCCCCAGTATTGAAGGAG 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 123556 AATCTCATCTTCAATTGTCATGCGAATTGTAATCCCCAGTATTGAAGGAG 123605 CR382333.7 201 GAACCTCATGGGAGGTGATTGGATCATGCTGTTCTAATGATAGTGAGTGA 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 123606 GAACCTCATGGGAGGTGATTGGATCATGCTGTTCTAATGATAGTGAGTGA 123655 CR382333.7 251 ATTCTCATGAGATCTGATGGTTTTATAAGGGGCTTTTCCCCGCTTCCCTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 123656 ATTCTCATGAGATCTGATGGTTTTATAAGGGGCTTTTCCCCGCTTCCCTC 123705 CR382333.7 301 TGCATTTCTCTCTCCTGCCACCATGTGAAGAAGGACAGGTTTTCTTCCAC 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 123706 TGCATTTCTCTCTCCTGCCACCATGTGAAGAAGGACAGGTTTTCTTCCAC 123755 CR382333.7 351 TTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGGGGCGGCCTCCTCAGCCATGCAGAA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 123756 TTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGGGGCGGCCTCCTCAGCCATGCAGAA 123805 CR382333.7 401 CTGGGAGTCAGTTAAACCTCTTTCCTTTATAAATTACCCAGTCTCAGGTA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 123806 CTGGGAGTCAGTTAAACCTCTTTCCTTTATAAATTACCCAGTCTCAGGTA 123855 CR382333.7 451 TTTCTTTATAGCAGTGTGAGAACAGACTAATACAACTTCTAACTGATAGA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 123856 TTTCTTTATAGCAGTGTGAGAACAGACTAATACAACTTCTAACTGATAGA 123905 CR382333.7 501 GCAATGCCGACGTAACAGCTTGTGACTCTGGGTGTAGAACCTAAAACTCC 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 123906 GCAATGCCGACGTAACAGCTTGTGACTCTGGGTGTAGAACCTAAAACTCC 123955 CR382333.7 551 CTGTGGCTTCCACCTTCTCTCTCTCTGTCTCTGGGATCATGAGCTCTGGG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 123956 CTGTGGCTTCCACCTTCTCTCTCTCTGTCTCTGGGATCATGAGCTCTGGG 124005 CR382333.7 601 GAAAGTCAGCTGCTGTGCCATGAGCAGCCCTGCAGGAAGGTCCATCTGGC 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124006 GAAAGTCAGCTGCTGTGCCATGAGCAGCCCTGCAGGAAGGTCCATCTGGC 124055 CR382333.7 651 TAAGAACTGAGGCCTTCTGGGACTCAATTACAACGAACTAGGCCTTTTCC 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124056 TAAGAACTGAGGCCTTCTGGGACTCAATTACAACGAACTAGGCCTTTTCC 124105 CR382333.7 701 AACAGCCATGTGACTGATCCATGTTTCATGTGAATCCTCAGCCCCAGTGA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124106 AACAGCCATGTGACTGATCCATGTTTCATGTGAATCCTCAGCCCCAGTGA 124155 CR382333.7 751 AGCCCTCAGATGATGCAGGCCTAGACTGACAACTGGACTGCAACCTTGTG 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124156 AGCCCTCAGATGATGCAGGCCTAGACTGACAACTGGACTGCAACCTTGTG 124205 CR382333.7 801 AGAGGCCCTTAGCAAGAAGCACTCAGGGAAACTTCTCCTGGATTCCTGAC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124206 AGAGGCCCTTAGCAAGAAGCACTCAGGGAAACTTCTCCTGGATTCCTGAC 124255 CR382333.7 851 AATTGGAAACTGTGGGAGATGATCAATATTTGTTGTTTTGAAATGGTACA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124256 AATTGGAAACTGTGGGAGATGATCAATATTTGTTGTTTTGAAATGGTACA 124305 CR382333.7 901 TTTTACATAATTTGTTATGCAATAGTAAATAACTAATACATTTTCACAAG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124306 TTTTACATAATTTGTTATGCAATAGTAAATAACTAATACATTTTCACAAG 124355 CR382333.7 951 ACAGGATGTATTATTACATGTTAATTTGCATTTGCTCTAAATTTATCATC 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124356 ACAGGATGTATTATTACATGTTAATTTGCATTTGCTCTAAATTTATCATC 124405 CR382333.7 1001 ATCATTATTATTATTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGG 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124406 ATCATTATTATTATTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGG 124455 CR382333.7 1051 AGTGCAGTGGCATGATCACCATGCACTGCAGTGTAGACCTCCTGGGCTCA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124456 AGTGCAGTGGCATGATCACCATGCACTGCAGTGTAGACCTCCTGGGCTCA 124505 CR382333.7 1101 AGGGACCCTCTGACCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGAGTACAATCATGAA 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124506 AGGGACCCTCTGACCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGAGTACAATCATGAA 124555 CR382333.7 1151 CCACCATGCCTGGCTAATTTTCTAGTTTTTTGTAGAGATGGGGGTTTCAC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124556 CCACCATGCCTGGCTAATTTTCTAGTTTTTTGTAGAGATGGGGGTTTCAC 124605 CR382333.7 1201 CATGTTGCCCAGGCTGATCTTGAACTTCTGGAGTCAACAAATCTGCCTTC 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124606 CATGTTGCCCAGGCTGATCTTGAACTTCTGGAGTCAACAAATCTGCCTTC 124655 CR382333.7 1251 CTCTGCCTTCCACAATGCTAGGATTGCAGGTGCGAGCCACCAAATCTGGC 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124656 CTCTGCCTTCCACAATGCTAGGATTGCAGGTGCGAGCCACCAAATCTGGC 124705 CR382333.7 1301 CTAAATTAATTAAAAGATATAAATATGTAACTTAGTTTTAAAAGGTAAGG 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124706 CTAAATTAATTAAAAGATATAAATATGTAACTTAGTTTTAAAAGGTAAGG 124755 CR382333.7 1351 AGAATTTCCGTGGCTGAAAAGGATGTATTTTATTACCGTTCACAATGATT 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124756 AGAATTTCCGTGGCTGAAAAGGATGTATTTTATTACCGTTCACAATGATT 124805 CR382333.7 1401 ACTTTACTTGAACTTCAATTTGCAACTGTGTCCCAAGTGAACACAAAAAG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124806 ACTTTACTTGAACTTCAATTTGCAACTGTGTCCCAAGTGAACACAAAAAG 124855 CR382333.7 1451 AAGATCCAGCCCTTGCTAGGCTGATTCTATGATGGCCTCAACAACAAGCT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124856 AAGATCCAGCCCTTGCTAGGCTGATTCTATGATGGCCTCAACAACAAGCT 124905 CR382333.7 1501 CCTGGTCATTCACCTTCCCCCAGTTATTCAACCAACTCTAATGTAGGTGC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124906 CCTGGTCATTCACCTTCCCCCAGTTATTCAACCAACTCTAATGTAGGTGC 124955 CR382333.7 1551 TGCTGTGAAGGGATTTAGCAGATATAATTAAGGGCCTCAATTAGTTGACT 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 124956 TGCTGTGAAGGGATTTAGCAGATATAATTAAGGGCCTCAATTAGTTGACT 125005 CR382333.7 1601 TTAGGCTGGGTTTATGCTGCTTGGACTGTCCTAATCAGGTGAGTCCTTGA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 125006 TTAGGCTGGGTTTATGCTGCTTGGACTGTCCTAATCAGGTGAGTCCTTGA 125055 CR382333.7 1651 AAGGACTGGGTTCTTCCTGAGCATAGAGATTCACAGTGTGAGAGGGATTC 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 125056 AAGGACTGGGTTCTTCCTGAGCATAGAGATTCACAGTGTGAGAGGGATTC 125105 CR382333.7 1701 AGCATGAGGGGTTTCCTCCACTGTGGGCTTTGAAAATGAAGGGGCTGTAC 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 125106 AGCATGAGGGGTTTCCTCCACTGTGGGCTTTGAAAATGAAGGGGCTGTAC 125155 CR382333.7 1751 AGGGAAGAACGCTGGTGGGCATCAGGAATTGAGCGCAGCCCTCCCTGTTC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 125156 AGGGAAGAACGCTGGTGGGCATCAGGAATTGAGCGCAGCCCTCCCTGTTC 125205 CR382333.7 1801 TCTACATTGACAGCCAGCAAGGAACGCGGACCTCAGTCTTACAACTGCAA 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 125206 TCTACATTGACAGCCAGCAAGGAACGCGGACCTCAGTCTTACAACTGCAA 125255 CR382333.7 1851 GAAACTGCATTCTGCCACCTCTGTATAAGCCTGAAGGAGGATTCAAAATG 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 125256 GAAACTGCATTCTGCCACCTCTGTATAAGCCTGAAGGAGGATTCAAAATG 125305 CR382333.7 1901 AAAACACAGCTTTGGGAATCCCGGAACAGAGATTCCATCCACATCATGCC 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 125306 AAAACACAGCTTTGGGAATCCCGGAACAGAGATTCCATCCACATCATGCC 125355 CR382333.7 1951 CAGATTTCTGACTAAGGTACTATAAACAGATAAATGGGTGTTGTTTGGCC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX927141.7 125356 CAGATTTCTGACTAAGGTACTATAAACAGATAAATGGGTGTTGTTTGGCC 125405