<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR382333.7	1	CTGAAATAATAGTTTGAATTTTGCTTTTAACATATATGCAAATCCTTTAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	123406	CTGAAATAATAGTTTGAATTTTGCTTTTAACATATATGCAAATCCTTTAA	123455

CR382333.7	51	TACTGCTCCCTTCCAGAGGTGCAGCTTAATTCCCTCTCTTGAGTGTGGCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	123456	TACTGCTCCCTTCCAGAGGTGCAGCTTAATTCCCTCTCTTGAGTGTGGCT	123505

CR382333.7	101	TGGACTTAATGATGCACTTCTGATATGGCCTGGTTCTGTGTTCCCACCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	123506	TGGACTTAATGATGCACTTCTGATATGGCCTGGTTCTGTGTTCCCACCCA	123555

CR382333.7	151	AATCTCATCTTCAATTGTCATGCGAATTGTAATCCCCAGTATTGAAGGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	123556	AATCTCATCTTCAATTGTCATGCGAATTGTAATCCCCAGTATTGAAGGAG	123605

CR382333.7	201	GAACCTCATGGGAGGTGATTGGATCATGCTGTTCTAATGATAGTGAGTGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	123606	GAACCTCATGGGAGGTGATTGGATCATGCTGTTCTAATGATAGTGAGTGA	123655

CR382333.7	251	ATTCTCATGAGATCTGATGGTTTTATAAGGGGCTTTTCCCCGCTTCCCTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	123656	ATTCTCATGAGATCTGATGGTTTTATAAGGGGCTTTTCCCCGCTTCCCTC	123705

CR382333.7	301	TGCATTTCTCTCTCCTGCCACCATGTGAAGAAGGACAGGTTTTCTTCCAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	123706	TGCATTTCTCTCTCCTGCCACCATGTGAAGAAGGACAGGTTTTCTTCCAC	123755

CR382333.7	351	TTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGGGGCGGCCTCCTCAGCCATGCAGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	123756	TTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGGGGCGGCCTCCTCAGCCATGCAGAA	123805

CR382333.7	401	CTGGGAGTCAGTTAAACCTCTTTCCTTTATAAATTACCCAGTCTCAGGTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	123806	CTGGGAGTCAGTTAAACCTCTTTCCTTTATAAATTACCCAGTCTCAGGTA	123855

CR382333.7	451	TTTCTTTATAGCAGTGTGAGAACAGACTAATACAACTTCTAACTGATAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	123856	TTTCTTTATAGCAGTGTGAGAACAGACTAATACAACTTCTAACTGATAGA	123905

CR382333.7	501	GCAATGCCGACGTAACAGCTTGTGACTCTGGGTGTAGAACCTAAAACTCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	123906	GCAATGCCGACGTAACAGCTTGTGACTCTGGGTGTAGAACCTAAAACTCC	123955

CR382333.7	551	CTGTGGCTTCCACCTTCTCTCTCTCTGTCTCTGGGATCATGAGCTCTGGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	123956	CTGTGGCTTCCACCTTCTCTCTCTCTGTCTCTGGGATCATGAGCTCTGGG	124005

CR382333.7	601	GAAAGTCAGCTGCTGTGCCATGAGCAGCCCTGCAGGAAGGTCCATCTGGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124006	GAAAGTCAGCTGCTGTGCCATGAGCAGCCCTGCAGGAAGGTCCATCTGGC	124055

CR382333.7	651	TAAGAACTGAGGCCTTCTGGGACTCAATTACAACGAACTAGGCCTTTTCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124056	TAAGAACTGAGGCCTTCTGGGACTCAATTACAACGAACTAGGCCTTTTCC	124105

CR382333.7	701	AACAGCCATGTGACTGATCCATGTTTCATGTGAATCCTCAGCCCCAGTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124106	AACAGCCATGTGACTGATCCATGTTTCATGTGAATCCTCAGCCCCAGTGA	124155

CR382333.7	751	AGCCCTCAGATGATGCAGGCCTAGACTGACAACTGGACTGCAACCTTGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124156	AGCCCTCAGATGATGCAGGCCTAGACTGACAACTGGACTGCAACCTTGTG	124205

CR382333.7	801	AGAGGCCCTTAGCAAGAAGCACTCAGGGAAACTTCTCCTGGATTCCTGAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124206	AGAGGCCCTTAGCAAGAAGCACTCAGGGAAACTTCTCCTGGATTCCTGAC	124255

CR382333.7	851	AATTGGAAACTGTGGGAGATGATCAATATTTGTTGTTTTGAAATGGTACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124256	AATTGGAAACTGTGGGAGATGATCAATATTTGTTGTTTTGAAATGGTACA	124305

CR382333.7	901	TTTTACATAATTTGTTATGCAATAGTAAATAACTAATACATTTTCACAAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124306	TTTTACATAATTTGTTATGCAATAGTAAATAACTAATACATTTTCACAAG	124355

CR382333.7	951	ACAGGATGTATTATTACATGTTAATTTGCATTTGCTCTAAATTTATCATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124356	ACAGGATGTATTATTACATGTTAATTTGCATTTGCTCTAAATTTATCATC	124405

CR382333.7	1001	ATCATTATTATTATTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124406	ATCATTATTATTATTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGG	124455

CR382333.7	1051	AGTGCAGTGGCATGATCACCATGCACTGCAGTGTAGACCTCCTGGGCTCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124456	AGTGCAGTGGCATGATCACCATGCACTGCAGTGTAGACCTCCTGGGCTCA	124505

CR382333.7	1101	AGGGACCCTCTGACCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGAGTACAATCATGAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124506	AGGGACCCTCTGACCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGAGTACAATCATGAA	124555

CR382333.7	1151	CCACCATGCCTGGCTAATTTTCTAGTTTTTTGTAGAGATGGGGGTTTCAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124556	CCACCATGCCTGGCTAATTTTCTAGTTTTTTGTAGAGATGGGGGTTTCAC	124605

CR382333.7	1201	CATGTTGCCCAGGCTGATCTTGAACTTCTGGAGTCAACAAATCTGCCTTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124606	CATGTTGCCCAGGCTGATCTTGAACTTCTGGAGTCAACAAATCTGCCTTC	124655

CR382333.7	1251	CTCTGCCTTCCACAATGCTAGGATTGCAGGTGCGAGCCACCAAATCTGGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124656	CTCTGCCTTCCACAATGCTAGGATTGCAGGTGCGAGCCACCAAATCTGGC	124705

CR382333.7	1301	CTAAATTAATTAAAAGATATAAATATGTAACTTAGTTTTAAAAGGTAAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124706	CTAAATTAATTAAAAGATATAAATATGTAACTTAGTTTTAAAAGGTAAGG	124755

CR382333.7	1351	AGAATTTCCGTGGCTGAAAAGGATGTATTTTATTACCGTTCACAATGATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124756	AGAATTTCCGTGGCTGAAAAGGATGTATTTTATTACCGTTCACAATGATT	124805

CR382333.7	1401	ACTTTACTTGAACTTCAATTTGCAACTGTGTCCCAAGTGAACACAAAAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124806	ACTTTACTTGAACTTCAATTTGCAACTGTGTCCCAAGTGAACACAAAAAG	124855

CR382333.7	1451	AAGATCCAGCCCTTGCTAGGCTGATTCTATGATGGCCTCAACAACAAGCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124856	AAGATCCAGCCCTTGCTAGGCTGATTCTATGATGGCCTCAACAACAAGCT	124905

CR382333.7	1501	CCTGGTCATTCACCTTCCCCCAGTTATTCAACCAACTCTAATGTAGGTGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124906	CCTGGTCATTCACCTTCCCCCAGTTATTCAACCAACTCTAATGTAGGTGC	124955

CR382333.7	1551	TGCTGTGAAGGGATTTAGCAGATATAATTAAGGGCCTCAATTAGTTGACT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	124956	TGCTGTGAAGGGATTTAGCAGATATAATTAAGGGCCTCAATTAGTTGACT	125005

CR382333.7	1601	TTAGGCTGGGTTTATGCTGCTTGGACTGTCCTAATCAGGTGAGTCCTTGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	125006	TTAGGCTGGGTTTATGCTGCTTGGACTGTCCTAATCAGGTGAGTCCTTGA	125055

CR382333.7	1651	AAGGACTGGGTTCTTCCTGAGCATAGAGATTCACAGTGTGAGAGGGATTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	125056	AAGGACTGGGTTCTTCCTGAGCATAGAGATTCACAGTGTGAGAGGGATTC	125105

CR382333.7	1701	AGCATGAGGGGTTTCCTCCACTGTGGGCTTTGAAAATGAAGGGGCTGTAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	125106	AGCATGAGGGGTTTCCTCCACTGTGGGCTTTGAAAATGAAGGGGCTGTAC	125155

CR382333.7	1751	AGGGAAGAACGCTGGTGGGCATCAGGAATTGAGCGCAGCCCTCCCTGTTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	125156	AGGGAAGAACGCTGGTGGGCATCAGGAATTGAGCGCAGCCCTCCCTGTTC	125205

CR382333.7	1801	TCTACATTGACAGCCAGCAAGGAACGCGGACCTCAGTCTTACAACTGCAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	125206	TCTACATTGACAGCCAGCAAGGAACGCGGACCTCAGTCTTACAACTGCAA	125255

CR382333.7	1851	GAAACTGCATTCTGCCACCTCTGTATAAGCCTGAAGGAGGATTCAAAATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	125256	GAAACTGCATTCTGCCACCTCTGTATAAGCCTGAAGGAGGATTCAAAATG	125305

CR382333.7	1901	AAAACACAGCTTTGGGAATCCCGGAACAGAGATTCCATCCACATCATGCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	125306	AAAACACAGCTTTGGGAATCCCGGAACAGAGATTCCATCCACATCATGCC	125355

CR382333.7	1951	CAGATTTCTGACTAAGGTACTATAAACAGATAAATGGGTGTTGTTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927141.7	125356	CAGATTTCTGACTAAGGTACTATAAACAGATAAATGGGTGTTGTTTGGCC	125405

Overview

Query
CR382333.7 - 52773 bps
Hit
BX927141.7 - 125405 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link