<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX908719.9	1	ACCATATCCTCCTACACTCTGAGCAATCTCACGGGGTAGACCGCAGGTTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	108857	ACCATATCCTCCTACACTCTGAGCAATCTCACGGGGTAGACCGCAGGTTA	108906

BX908719.9	51	ACACCTCTCAGACTCCTTGAAAAATAGCTGGTGACGGGTCAGTGCCCAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	108907	ACACCTCTCAGACTCCTTGAAAAATAGCTGGTGACGGGTCAGTGCCCAGA	108956

BX908719.9	101	GCTCACCTGCCTTTCGCCAAACTCTAAACACCCCTGTGTGTTTCCCCTAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	108957	GCTCACCTGCCTTTCGCCAAACTCTAAACACCCCTGTGTGTTTCCCCTAC	109006

BX908719.9	151	TATACCCTGTTCCCTGGGGGCAGGTCCCTGCATTATGAAGCCACTAGGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109007	TATACCCTGTTCCCTGGGGGCAGGTCCCTGCATTATGAAGCCACTAGGAA	109056

BX908719.9	201	AATGAGATAAAGCTTTCCTACTTTTCTTCCCCTGAAAAGACAGATTTTGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109057	AATGAGATAAAGCTTTCCTACTTTTCTTCCCCTGAAAAGACAGATTTTGT	109106

BX908719.9	251	TTTTTATTTTTTGAGAATACCAAGTAAGATTTTATTTTTTATTTATTTTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109107	TTTTTATTTTTTGAGAATACCAAGTAAGATTTTATTTTTTATTTATTTTA	109156

BX908719.9	301	AATTATTTTAACCTTTGTTTTAGGTTCAAGGGTACACATGCAGGTTTGTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109157	AATTATTTTAACCTTTGTTTTAGGTTCAAGGGTACACATGCAGGTTTGTT	109206

BX908719.9	351	ATATAGGTAAATTGTGTGTCATCGGGATTTGGCGTAAAAATTTATTTCAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109207	ATATAGGTAAATTGTGTGTCATCGGGATTTGGCGTAAAAATTTATTTCAT	109256

BX908719.9	401	CACCCAGGTAATAAGTATAGTATCTGATAGGTAGTGTTTTGATCCTCTCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109257	CACCCAGGTAATAAGTATAGTATCTGATAGGTAGTGTTTTGATCCTCTCC	109306

BX908719.9	451	CTCCTCCCATCCTCCACCCTCAAGTAGGGCCCAGTGTCTATTATTCCCTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109307	CTCCTCCCATCCTCCACCCTCAAGTAGGGCCCAGTGTCTATTATTCCCTT	109356

BX908719.9	501	TTTTGTGTCCATGTGTACTCAATGTTTAGCTCCCACTTATAAAAGTGAGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109357	TTTTGTGTCCATGTGTACTCAATGTTTAGCTCCCACTTATAAAAGTGAGA	109406

BX908719.9	551	ACATGCAGTATTTCATTTTCTGCTCCTGTGTTAGTTTGCCTAGGATAACA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109407	ACATGCAGTATTTCATTTTCTGCTCCTGTGTTAGTTTGCCTAGGATAACA	109456

BX908719.9	601	GCCCCCAGCTCCATCCATGATGCTGCAAAAGACGTGATCTCGTCCTTTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109457	GCCCCCAGCTCCATCCATGATGCTGCAAAAGACGTGATCTCGTCCTTTTT	109506

BX908719.9	651	TGTCTGTGGAGTATTCCATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATACAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109507	TGTCTGTGGAGTATTCCATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATACAG	109556

BX908719.9	701	TCTACTGTTGGTGGGCATTTAGGCTGATTCCATGTCTTTGCTATTATGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109557	TCTACTGTTGGTGGGCATTTAGGCTGATTCCATGTCTTTGCTATTATGAA	109606

BX908719.9	751	TACTGCTGCAGTGAGCATTCATGTGCATGTGTCCTTATGGTAGAACAATG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109607	TACTGCTGCAGTGAGCATTCATGTGCATGTGTCCTTATGGTAGAACAATG	109656

BX908719.9	801	TATACTCCTTTGGGTATATGCCTAATAATGGGATTCCTGGGACGAATGGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109657	TATACTCCTTTGGGTATATGCCTAATAATGGGATTCCTGGGACGAATGGT	109706

BX908719.9	851	AGCTCTGTTTTAAGGTTCTTGAGAAATTGCCAAACTGCTTTCCTCAATGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109707	AGCTCTGTTTTAAGGTTCTTGAGAAATTGCCAAACTGCTTTCCTCAATGG	109756

BX908719.9	901	CTGAACTAATTTATGTTCCCACCAGCAGTGTATAAGCCTTCCGTTTTCTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109757	CTGAACTAATTTATGTTCCCACCAGCAGTGTATAAGCCTTCCGTTTTCTC	109806

BX908719.9	951	TGCAACCTCTCCAACATTTGTTATTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109807	TGCAACCTCTCCAACATTTGTTATTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATT	109856

BX908719.9	1001	CTGACTGGTGTGAGACGGTATCTCATTATGATTTTGATTTGCATTTTTCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109857	CTGACTGGTGTGAGACGGTATCTCATTATGATTTTGATTTGCATTTTTCT	109906

BX908719.9	1051	AATCATTAGTAATGTTGAACATTGTTTCATATGCTTCTTGGTCACGTGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109907	AATCATTAGTAATGTTGAACATTGTTTCATATGCTTCTTGGTCACGTGTG	109956

BX908719.9	1101	TGTCTTGAAAAGGCAGATTTTATGTATTTGCGTATTTATTTTTTTCACAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	109957	TGTCTTGAAAAGGCAGATTTTATGTATTTGCGTATTTATTTTTTTCACAG	110006

BX908719.9	1151	GTTTTTTTTTTGAAAGTCTCACTCTGTCGCCTAGGCTGGAGTACAGTGGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110007	GTTTTTTTTTTGAAAGTCTCACTCTGTCGCCTAGGCTGGAGTACAGTGGG	110056

BX908719.9	1201	ATAATCTCGGCTCACTGCAATCTTCGCCTCCTGGGTTCAAATGACTCTCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110057	ATAATCTCGGCTCACTGCAATCTTCGCCTCCTGGGTTCAAATGACTCTCA	110106

BX908719.9	1251	TGCCTCAGCCACTTGAGTAGCTGGGGTTACAGTCATGTGCCACCACTCCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110107	TGCCTCAGCCACTTGAGTAGCTGGGGTTACAGTCATGTGCCACCACTCCT	110156

BX908719.9	1301	GGTTAGTTTTTGTCTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGACAGGGTTTCATCAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110157	GGTTAGTTTTTGTCTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGACAGGGTTTCATCAT	110206

BX908719.9	1351	GTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110207	GTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTC	110256

BX908719.9	1401	AGCCTCCTAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCATCGTGCCTGGCCTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110257	AGCCTCCTAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCATCGTGCCTGGCCTG	110306

BX908719.9	1451	AAAAAGCAGATTTTAAACGGCAATTCATTCTTCTATCCCATTGTGAACTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110307	AAAAAGCAGATTTTAAACGGCAATTCATTCTTCTATCCCATTGTGAACTA	110356

BX908719.9	1501	TACAGTTGATGGATTTTCCATCACTAACTTGAAACTCTAAATTGGCTTCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110357	TACAGTTGATGGATTTTCCATCACTAACTTGAAACTCTAAATTGGCTTCC	110406

BX908719.9	1551	TTCTGCTCCCCAGTAGGTTTCAGGGCTGCCTCTTCACATCTTAGTTTCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110407	TTCTGCTCCCCAGTAGGTTTCAGGGCTGCCTCTTCACATCTTAGTTTCTG	110456

BX908719.9	1601	AGAACTCTTGGATTTTATTAAATAGTGAGCTAAACAAAACAGGATTGTGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110457	AGAACTCTTGGATTTTATTAAATAGTGAGCTAAACAAAACAGGATTGTGG	110506

BX908719.9	1651	AAGGGGCCCCTTGACACCACACTTACCTGCCCTCCCTCAAAGTCCCTGAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110507	AAGGGGCCCCTTGACACCACACTTACCTGCCCTCCCTCAAAGTCCCTGAT	110556

BX908719.9	1701	CTCAGGAAAATCTAACACCTATGAAGAAAATGGGGATAAAAAATGCATAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110557	CTCAGGAAAATCTAACACCTATGAAGAAAATGGGGATAAAAAATGCATAC	110606

BX908719.9	1751	AAAGATTATTACCAAAAACGAAAGATTCGTTGTGTAACTAATTGAGATTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110607	AAAGATTATTACCAAAAACGAAAGATTCGTTGTGTAACTAATTGAGATTA	110656

BX908719.9	1801	ACTGAAGCTCTGCCATAGCTCCCAGCCACTGCCCCCACTCACCTTGCTTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110657	ACTGAAGCTCTGCCATAGCTCCCAGCCACTGCCCCCACTCACCTTGCTTA	110706

BX908719.9	1851	TATACTCTAACTCTGCTAACGAACTGTCAAGTGTGTTGGAATGGGCAGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110707	TATACTCTAACTCTGCTAACGAACTGTCAAGTGTGTTGGAATGGGCAGAA	110756

BX908719.9	1901	TATGGGGTGGGGAGTGCATAATCTGTAGAGCTTCTACAGATACAGTGCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110757	TATGGGGTGGGGAGTGCATAATCTGTAGAGCTTCTACAGATACAGTGCTA	110806

BX908719.9	1951	GGTAGGTCCTTTCTATAATATCTCATCTCATCTTAAAAGACTTGTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927138.5	110807	GGTAGGTCCTTTCTATAATATCTCATCTCATCTTAAAAGACTTGTTGGCC	110856

Overview

Query
BX908719.9 - 36230 bps
Hit
BX927138.5 - 110856 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link