<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927223.9	1	GGATCAGATGCCCTTCTTCATCCCCACCCTCAGCCTCCCCTGAGCCCTCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	105460	GGATCAGATGCCCTTCTTCATCCCCACCCTCAGCCTCCCCTGAGCCCTCC	105509

BX927223.9	51	AGGAAAGCAGCCTGTGTGGATCCCCTAAACAAGGGCAGGAGCACCAGCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	105510	AGGAAAGCAGCCTGTGTGGATCCCCTAAACAAGGGCAGGAGCACCAGCCC	105559

BX927223.9	101	TACAGAGCAAGCAGCAGCTGGGTGAGGCAGACGGCGGCACAAGGTGGGGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	105560	TACAGAGCAAGCAGCAGCTGGGTGAGGCAGACGGCGGCACAAGGTGGGGA	105609

BX927223.9	151	CCACGGTGTTCCAGGGCCACTTAGGCTCCTAGGAAATTCACCCGCCACCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	105610	CCACGGTGTTCCAGGGCCACTTAGGCTCCTAGGAAATTCACCCGCCACCA	105659

BX927223.9	201	TCCTCAGGGACCTCTTCTTTGAAAAAAAGGGACTTTCTCAGAACATTCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	105660	TCCTCAGGGACCTCTTCTTTGAAAAAAAGGGACTTTCTCAGAACATTCTG	105709

BX927223.9	251	ACAACACGAGTTGTGAATCCCTGGGGCTGTATGGAGAAATGGCCCACGAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	105710	ACAACACGAGTTGTGAATCCCTGGGGCTGTATGGAGAAATGGCCCACGAC	105759

BX927223.9	301	CTTTTTCCATCTCTTCCCCCATCACTGCCCAGCTCTGAGATTGAGCCCCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	105760	CTTTTTCCATCTCTTCCCCCATCACTGCCCAGCTCTGAGATTGAGCCCCT	105809

BX927223.9	351	GGGAAGAGGGCCCGGATCTTTGCCAGAGGCTGCTGGGCATACCTGAGCAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	105810	GGGAAGAGGGCCCGGATCTTTGCCAGAGGCTGCTGGGCATACCTGAGCAC	105859

BX927223.9	401	ACGTGCCATGGGCTGCTTGTGACGGGCTGGAACACCTAGCCCAGGTGTCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	105860	ACGTGCCATGGGCTGCTTGTGACGGGCTGGAACACCTAGCCCAGGTGTCC	105909

BX927223.9	451	CAGAAGCCACCACAGACATCAGCCTATTCCTCCCCTGGTGTTGGTCTTTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	105910	CAGAAGCCACCACAGACATCAGCCTATTCCTCCCCTGGTGTTGGTCTTTG	105959

BX927223.9	501	AAAAGTGAGTCTGGACACCGCAAAACTGGAATCCAGGTTTCCTACTTTCG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	105960	AAAAGTGAGTCTGGACACCGCAAAACTGGAATCCAGGTTTCCTACTTTCG	106009

BX927223.9	551	AGGGGAGGTAGCACCCCATGGCGCAGCTGTGATTCTCAGCCCTCCTCTGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106010	AGGGGAGGTAGCACCCCATGGCGCAGCTGTGATTCTCAGCCCTCCTCTGG	106059

BX927223.9	601	GCCGTGCCCCAGCCGGGATCTGAACATCCACCCTCGGCCCCAGGTGCTGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106060	GCCGTGCCCCAGCCGGGATCTGAACATCCACCCTCGGCCCCAGGTGCTGT	106109

BX927223.9	651	TGCCCCCACACTGAGCCCTCGTACCCCATGCTCCCTGGCCCTCCTGCCAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106110	TGCCCCCACACTGAGCCCTCGTACCCCATGCTCCCTGGCCCTCCTGCCAG	106159

BX927223.9	701	GGCACCCTTTTCACAAAGTGGAGTGGATGAAAAGAACAGGAAAGAGCACC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106160	GGCACCCTTTTCACAAAGTGGAGTGGATGAAAAGAACAGGAAAGAGCACC	106209

BX927223.9	751	AACCCTGCTGCTGTCCCCATATGACAGAGGCTGCTGTGGGGGCATCTGTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106210	AACCCTGCTGCTGTCCCCATATGACAGAGGCTGCTGTGGGGGCATCTGTT	106259

BX927223.9	801	GTACTTGGGTGAGCAGGCCCCTTGGCCTCGAGCTCTACCATGCAGGGGTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106260	GTACTTGGGTGAGCAGGCCCCTTGGCCTCGAGCTCTACCATGCAGGGGTG	106309

BX927223.9	851	CTGCAGACAGAGCCAGGTGATAGGAAAGAGCATGTCTGGGAACCCACCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106310	CTGCAGACAGAGCCAGGTGATAGGAAAGAGCATGTCTGGGAACCCACCTG	106359

BX927223.9	901	ATGACAGCCTCAGCTCAGGATGAGGCAGGAGGCCTCTGGCTAGGCTTAGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106360	ATGACAGCCTCAGCTCAGGATGAGGCAGGAGGCCTCTGGCTAGGCTTAGG	106409

BX927223.9	951	GGAGATGGCTGGAGGAACCTCCTCAGGGTGCCAGTGGACTGGGTAAAGCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106410	GGAGATGGCTGGAGGAACCTCCTCAGGGTGCCAGTGGACTGGGTAAAGCC	106459

BX927223.9	1001	AGCAGGGGGCTTGGAGGTCAGGGAAGCTGTGATTTATCAAGCACTGTGGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106460	AGCAGGGGGCTTGGAGGTCAGGGAAGCTGTGATTTATCAAGCACTGTGGG	106509

BX927223.9	1051	CATTGCAATATTTTCTCTGTTCGGTTCAGTCCAATGGGACATCAGTTCTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106510	CATTGCAATATTTTCTCTGTTCGGTTCAGTCCAATGGGACATCAGTTCTA	106559

BX927223.9	1101	TACATATCTTCCTCTTCCTCTAGCCCTGCTCAGTCCTGGGTGGAGAAGCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106560	TACATATCTTCCTCTTCCTCTAGCCCTGCTCAGTCCTGGGTGGAGAAGCT	106609

BX927223.9	1151	ACCAGAACCACATCTCCTGTCTGTCCCACCATAAGTCTCTGCTTCATTCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106610	ACCAGAACCACATCTCCTGTCTGTCCCACCATAAGTCTCTGCTTCATTCA	106659

BX927223.9	1201	CGCTTTCATGTGTCGTGCATCAAGCAAGCATTTGCCTGTAGGCTTGGGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106660	CGCTTTCATGTGTCGTGCATCAAGCAAGCATTTGCCTGTAGGCTTGGGGA	106709

BX927223.9	1251	GCTCTGAGAGGGGTTGAGAGTGAACAAAATTAATCAAATCGTATAACAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106710	GCTCTGAGAGGGGTTGAGAGTGAACAAAATTAATCAAATCGTATAACAGA	106759

BX927223.9	1301	AGAGGAAGTCCCATCCTGCCGAGGATCCTGGATGTGAGAACCTGCTGCTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106760	AGAGGAAGTCCCATCCTGCCGAGGATCCTGGATGTGAGAACCTGCTGCTG	106809

BX927223.9	1351	GCCTGGTGGGATCGTGGTGCCCCAGGAGCATGAACTGCTCAGGAGCAGAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106810	GCCTGGTGGGATCGTGGTGCCCCAGGAGCATGAACTGCTCAGGAGCAGAC	106859

BX927223.9	1401	CCTGACCAGATCCCCTGCAGGCCTGGAACAGCCTGATCAGCAGCCTCCTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106860	CCTGACCAGATCCCCTGCAGGCCTGGAACAGCCTGATCAGCAGCCTCCTA	106909

BX927223.9	1451	AGCCCCATGGCTGCCACAGTGGGCCTCATTGTCCTTCCCTATCACCTAGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106910	AGCCCCATGGCTGCCACAGTGGGCCTCATTGTCCTTCCCTATCACCTAGC	106959

BX927223.9	1501	CGGGGTGTTCCCAGCTGCCAGACAGTGCCAACTGGTGGTGCCTGCCCATC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	106960	CGGGGTGTTCCCAGCTGCCAGACAGTGCCAACTGGTGGTGCCTGCCCATC	107009

BX927223.9	1551	AGTGCCCCAAGACAGCCACTACTTTTCGAAGAATGAGACCACCAGCTGCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	107010	AGTGCCCCAAGACAGCCACTACTTTTCGAAGAATGAGACCACCAGCTGCT	107059

BX927223.9	1601	TTGTGGCCAGCTCCAGCTTACTGGTGAGTATTTTTAGGTAGAATCTTCCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	107060	TTGTGGCCAGCTCCAGCTTACTGGTGAGTATTTTTAGGTAGAATCTTCCA	107109

BX927223.9	1651	GACTAGTGAAGTCTTTGAGATTTTCTGCTTCTTGTTCACTGCTTCCTTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	107110	GACTAGTGAAGTCTTTGAGATTTTCTGCTTCTTGTTCACTGCTTCCTTCT	107159

BX927223.9	1701	GATGTGGACCATGCGGAAAGAGGCAGAACACAGGAACCCACACATGGGAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	107160	GATGTGGACCATGCGGAAAGAGGCAGAACACAGGAACCCACACATGGGAG	107209

BX927223.9	1751	AATAGCAGGCATTTGACTGGACTGTGCCAAAAGAGTTGTTCAAGTACAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	107210	AATAGCAGGCATTTGACTGGACTGTGCCAAAAGAGTTGTTCAAGTACAAT	107259

BX927223.9	1801	ATCAAGCAAGACTGTAGTTGCAAAAAGACATAACCAACAACTTGGTTTCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	107260	ATCAAGCAAGACTGTAGTTGCAAAAAGACATAACCAACAACTTGGTTTCA	107309

BX927223.9	1851	ATTTGAGCAACTTAATAAACAAACTGATTTAACTGTCATAGTCTCAAGGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	107310	ATTTGAGCAACTTAATAAACAAACTGATTTAACTGTCATAGTCTCAAGGG	107359

BX927223.9	1901	ATGGGTTTTTCCAAGCAAGAACTCTAGGGTCAGGGTAGCGAATTGCTCAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	107360	ATGGGTTTTTCCAAGCAAGAACTCTAGGGTCAGGGTAGCGAATTGCTCAA	107409

BX927223.9	1951	GAAAGGCCAAGAGCTCAGGGAGACATAGGAACCTCATAAACAGGGTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927133.5	107410	GAAAGGCCAAGAGCTCAGGGAGACATAGGAACCTCATAAACAGGGTGGCC	107459

Overview

Query
BX927223.9 - 83649 bps
Hit
BX927133.5 - 107459 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link