<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845284.4	1	AAGCTTTATTCTGTAAAAACAAGCTGGTTGTTGTGTTAAAATAATTATTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	119657	AAGCTTTATTCTGTAAAAACAAGCTGGTTGTTGTGTTAAAATAATTATTT	119706

AL845284.4	51	AAAGGATACATTTTTCAGGAATATTATCTATTTTATGTAGTTTCATATTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	119707	AAAGGATACATTTTTCAGGAATATTATCTATTTTATGTAGTTTCATATTC	119756

AL845284.4	101	CAGTAAAATCTCAGTTATTCATATAATTGAAATTTCTAAATAATTATGTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	119757	CAGTAAAATCTCAGTTATTCATATAATTGAAATTTCTAAATAATTATGTA	119806

AL845284.4	151	TGTTCTAAAACTACATATAAAGATAAATTATTGTGATTATTAATGTTATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	119807	TGTTCTAAAACTACATATAAAGATAAATTATTGTGATTATTAATGTTATT	119856

AL845284.4	201	ACTTGTATAATAAGCAAATAATTTAGCTAAATGTTTATTTAATAGGTAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	119857	ACTTGTATAATAAGCAAATAATTTAGCTAAATGTTTATTTAATAGGTAAT	119906

AL845284.4	251	TACTTTTAATACCTACAAAGATCTTTATAAAATATGGTTGCCAGCAGTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	119907	TACTTTTAATACCTACAAAGATCTTTATAAAATATGGTTGCCAGCAGTGT	119956

AL845284.4	301	AAGTTTTGATAACTTTCCTAATCAACAACAAAAATTATGATTATATTAAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	119957	AAGTTTTGATAACTTTCCTAATCAACAACAAAAATTATGATTATATTAAT	120006

AL845284.4	351	AATAATAATAATTTTGTTGCTTCAGTACTTACACAGGCTTGAAATATACT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120007	AATAATAATAATTTTGTTGCTTCAGTACTTACACAGGCTTGAAATATACT	120056

AL845284.4	401	TGTGGTGGTAGCCAGATTGAAACACACCTTTTATCCACAGCACATGGTTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120057	TGTGGTGGTAGCCAGATTGAAACACACCTTTTATCCACAGCACATGGTTA	120106

AL845284.4	451	ACTATGTGACAAAAAAAGTTTTTTAACAATATTTTTTTACATTATGACAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120107	ACTATGTGACAAAAAAAGTTTTTTAACAATATTTTTTTACATTATGACAT	120156

AL845284.4	501	GGTTTTTCACTTTTTCTTTTCAATGGGTTGAAGTTATCAAAGAAAGAAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120157	GGTTTTTCACTTTTTCTTTTCAATGGGTTGAAGTTATCAAAGAAAGAAAT	120206

AL845284.4	551	TTACTAATTGTTTTACTTTTATTCTGTTCAGGTGCAGCCAGGTAAAATCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120207	TTACTAATTGTTTTACTTTTATTCTGTTCAGGTGCAGCCAGGTAAAATCT	120256

AL845284.4	601	GCTGCTGATATTTTGTACAGTATTGCCAAAGCATGTTAGATATCTATGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120257	GCTGCTGATATTTTGTACAGTATTGCCAAAGCATGTTAGATATCTATGAA	120306

AL845284.4	651	ATATGTAATTTATCAATATCATCAAATTAGAAAAATATACAGCAAATGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120307	ATATGTAATTTATCAATATCATCAAATTAGAAAAATATACAGCAAATGAG	120356

AL845284.4	701	AAATAAATGACACAAAGAAATAAAAACAGACCATTTCTAATGGTGTACAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120357	AAATAAATGACACAAAGAAATAAAAACAGACCATTTCTAATGGTGTACAG	120406

AL845284.4	751	ATATTTTGCAACCAGTTTAAAAGTAATTTTGTCCTCTCTGCATTTATAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120407	ATATTTTGCAACCAGTTTAAAAGTAATTTTGTCCTCTCTGCATTTATAGA	120456

AL845284.4	801	TACGTTTATCCGAGACAGTTAGATCAAAGAATGAATTGTTTAATGTTTCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120457	TACGTTTATCCGAGACAGTTAGATCAAAGAATGAATTGTTTAATGTTTCT	120506

AL845284.4	851	CTCGCTCTTGCGTGCTATCAACTGCGAAACCAAGTGAAAGTAAATCAGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120507	CTCGCTCTTGCGTGCTATCAACTGCGAAACCAAGTGAAAGTAAATCAGGC	120556

AL845284.4	901	TTAAAATAAAAATGTAAAGCAAAAACACATAATTAACGATGACTTTAGAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120557	TTAAAATAAAAATGTAAAGCAAAAACACATAATTAACGATGACTTTAGAA	120606

AL845284.4	951	AGCGAAAACAAAAGCTGAATAAATGAGCTTGTAAATGAGTCTGTATTGAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120607	AGCGAAAACAAAAGCTGAATAAATGAGCTTGTAAATGAGTCTGTATTGAT	120656

AL845284.4	1001	GTTTCTCAGTGATGGGTCGCAGGTGGAAGGGCATGCGCTGCGTAAAACAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120657	GTTTCTCAGTGATGGGTCGCAGGTGGAAGGGCATGCGCTGCGTAAAACAT	120706

AL845284.4	1051	ATGCTGGAAAAGTTGGTGGTTCATTCCGCTACGGTTACCCCAGGTCAATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120707	ATGCTGGAAAAGTTGGTGGTTCATTCCGCTACGGTTACCCCAGGTCAATA	120756

AL845284.4	1101	AAGGGACTAAGCCGAAAAGAAAATTAATGAATGAAATATACTTCGGTGGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120757	AAGGGACTAAGCCGAAAAGAAAATTAATGAATGAAATATACTTCGGTGGC	120806

AL845284.4	1151	CCGCCCAAGTAAAATCTATGTGTGGGAAGCACTCTGTTCTTATTAAATTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120807	CCGCCCAAGTAAAATCTATGTGTGGGAAGCACTCTGTTCTTATTAAATTG	120856

AL845284.4	1201	TATTAATAATACTGTACATATTAAAATACAATTGTAATGTATTTTTCATC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120857	TATTAATAATACTGTACATATTAAAATACAATTGTAATGTATTTTTCATC	120906

AL845284.4	1251	TAAATACCTCCATAGATCTTTATGAAGTACGGTCGTCAGCGCTGGAAGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120907	TAAATACCTCCATAGATCTTTATGAAGTACGGTCGTCAGCGCTGGAAGCT	120956

AL845284.4	1301	GCGGGGTCGGATTGAAATCAATGGCAAGCAAGTGTGGGACAGTGAGGAGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	120957	GCGGGGTCGGATTGAAATCAATGGCAAGCAAGTGTGGGACAGTGAGGAGA	121006

AL845284.4	1351	TGGTCTTCCTCCCGCTCATCACAGAGTTCCTGTCCATAAAGGTAGTTTTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	121007	TGGTCTTCCTCCCGCTCATCACAGAGTTCCTGTCCATAAAGGTAGTTTTA	121056

AL845284.4	1401	ATCTGAATACACAGTTACTTTCACACCAAAACTGTCTGTTTTTTTTTCTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	121057	ATCTGAATACACAGTTACTTTCACACCAAAACTGTCTGTTTTTTTTTCTC	121106

AL845284.4	1451	TCTTTCTCTTTTTTTCACACTGAGTCACACATACTATCAATCTCTTGTCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	121107	TCTTTCTCTTTTTTTCACACTGAGTCACACATACTATCAATCTCTTGTCT	121156

AL845284.4	1501	CTCCTTCCTGTCACGTTGACATTCACATCACGGTCCCATCAATCTGTGAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	121157	CTCCTTCCTGTCACGTTGACATTCACATCACGGTCCCATCAATCTGTGAG	121206

AL845284.4	1551	ACATTAATGCACATAACAGCACAGCAGCTGGACTTTGACTTGTTTTTCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	121207	ACATTAATGCACATAACAGCACAGCAGCTGGACTTTGACTTGTTTTTCTC	121256

AL845284.4	1601	TCCCAATGGTTCCATGACACATCACTACAGATGAGGGGATGGGAACAGGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	121257	TCCCAATGGTTCCATGACACATCACTACAGATGAGGGGATGGGAACAGGG	121306

AL845284.4	1651	ACAGAGAGGAGGGAAGACAGCACAGGATAGAGAATAGGAAGTTTACACAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	121307	ACAGAGAGGAGGGAAGACAGCACAGGATAGAGAATAGGAAGTTTACACAA	121356

AL845284.4	1701	GACAGAGATATTAAAACAGAGAGACTCCAGGGGAAGAACGAAGAGAATGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	121357	GACAGAGATATTAAAACAGAGAGACTCCAGGGGAAGAACGAAGAGAATGC	121406

AL845284.4	1751	AGCTGATGTCTGGCAAAATGTTTCAGATGGGCTTGACCAATGTAAAATGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	121407	AGCTGATGTCTGGCAAAATGTTTCAGATGGGCTTGACCAATGTAAAATGG	121456

AL845284.4	1801	GATGTTGCGATTGATTTGTAGCGCCATGTGACTCCATGACTTATTTACAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	121457	GATGTTGCGATTGATTTGTAGCGCCATGTGACTCCATGACTTATTTACAG	121506

AL845284.4	1851	CATTATTTGAAGAGTGTGTAATCAAAAATGACCCTTTGCATAACCATGTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	121507	CATTATTTGAAGAGTGTGTAATCAAAAATGACCCTTTGCATAACCATGTC	121556

AL845284.4	1901	TGTGTCCAAAAGCATAGGCAGCTGACTTGCTTCCTCGCTGCCCTATTAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	121557	TGTGTCCAAAAGCATAGGCAGCTGACTTGCTTCCTCGCTGCCCTATTAAG	121606

AL845284.4	1951	CAATGACTTTGCAGAGTTTGTGGATACAGGCACTGTACAAAACGGATTTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927127.9	121607	CAATGACTTTGCAGAGTTTGTGGATACAGGCACTGTACAAAACGGATTTT	121656

Overview

Query
AL845284.4 - 226168 bps
Hit
BX927127.9 - 121656 bps
Total alignments
23
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100192520001200011196571216561
287.86216406109445109850-125977263881
381.92188438218534218971-135310357351
483.49203436215445215880135417358581
581.813237757003270806135571363401
686.09192338115618115955-135601359381
787.5189324198903199226-135603359381
882.32291665175293175957135717363891
985.53226098358384191-135808364141
1085.64190435132275132709-138201386181
1186.33197370213494213863140603409901
1290.48216315160409160723152238525521
1382.98216576132215132790160249608181
1485.14211468109383109850160270607331
1584.872905718349284062198554991151
1684.76296573115033115605198554991241
1782.21248596217780218375198554991661
1882.53270609149491150099-198555991721
1983.6290601175470176070-198557991721
2084.643196167634776962-198561991721
2186.652464367037170806-198726991521
2282.7419455113222513277511061441066881
2385.420246810938310985011061551066201
Short-link