<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927232.4	1	GGCCAGGCTGGTTTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	92878	GGCCAGGCTGGTTTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGC	92927

BX927232.4	51	CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCGTGCTCAGCCATGAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	92928	CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCGTGCTCAGCCATGAG	92977

BX927232.4	101	GGGCAATTCTAATGGGAGGACTTCCAGACAGGAGGGATAGTGTGATTTAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	92978	GGGCAATTCTAATGGGAGGACTTCCAGACAGGAGGGATAGTGTGATTTAA	93027

BX927232.4	151	GAAAAGAAACACAGCATGGTGATACAACCTGATTGATTTATTAAGAGTAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93028	GAAAAGAAACACAGCATGGTGATACAACCTGATTGATTTATTAAGAGTAA	93077

BX927232.4	201	TTAAGTCAGTCGCCATTATTAGACATGGAGATTGGCATGGGGTTAGAGAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93078	TTAAGTCAGTCGCCATTATTAGACATGGAGATTGGCATGGGGTTAGAGAA	93127

BX927232.4	251	GTCACAATGATAGATAATACTGGAATGGCAGTCAGGAAGCATTGTAAAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93128	GTCACAATGATAGATAATACTGGAATGGCAGTCAGGAAGCATTGTAAAGA	93177

BX927232.4	301	TATTGTTTGCCATCCTAAGCTTTTTGGGCATCATTGCATAATCAAGTCAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93178	TATTGTTTGCCATCCTAAGCTTTTTGGGCATCATTGCATAATCAAGTCAA	93227

BX927232.4	351	TAAAGAGCTAAAAGCTAAATTAATGTTACAAGATGTGATCTGCATCACCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93228	TAAAGAGCTAAAAGCTAAATTAATGTTACAAGATGTGATCTGCATCACCA	93277

BX927232.4	401	TTTGTCCTGGCAACAGCATTGAAGTTGGATTAGAAATACATAAAACTGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93278	TTTGTCCTGGCAACAGCATTGAAGTTGGATTAGAAATACATAAAACTGAA	93327

BX927232.4	451	GAATAAAATATTGCCAGAGATAATGAAGGTTTGAACTAATCTGTACGTGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93328	GAATAAAATATTGCCAGAGATAATGAAGGTTTGAACTAATCTGTACGTGT	93377

BX927232.4	501	GACAGCAAGATGTAATAACTACAACAGATAGTAAGCAAATAAAATTTTGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93378	GACAGCAAGATGTAATAACTACAACAGATAGTAAGCAAATAAAATTTTGG	93427

BX927232.4	551	TGTTTGATTGGATATACAGATTAAAGCAAAGTTGTGCCATTCTTTGAAAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93428	TGTTTGATTGGATATACAGATTAAAGCAAAGTTGTGCCATTCTTTGAAAT	93477

BX927232.4	601	AGGTCACAGTGACAGGGAGATGTCTGGGAGAAGAGATGAGTCCTTATGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93478	AGGTCACAGTGACAGGGAGATGTCTGGGAGAAGAGATGAGTCCTTATGGG	93527

BX927232.4	651	AAAGACCCATTCAGGGACAGTGATGTGCCAACCGTGAAGCAGGATATGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93528	AAAGACCCATTCAGGGACAGTGATGTGCCAACCGTGAAGCAGGATATGAG	93577

BX927232.4	701	GACCTGCAACCCAGGGGACCTGCAACCCAGAAGACCTATGGTAGTGCTCG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93578	GACCTGCAACCCAGGGGACCTGCAACCCAGAAGACCTATGGTAGTGCTCG	93627

BX927232.4	751	AAACAGCAGACTATTATTTTCTATTGTGTAGGAAAATAGTTAATCTGTCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93628	AAACAGCAGACTATTATTTTCTATTGTGTAGGAAAATAGTTAATCTGTCT	93677

BX927232.4	801	TCTTTAAAAGGCACAGGAATATTTTTGAGTAAACAAAAGTACAGAAAGAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93678	TCTTTAAAAGGCACAGGAATATTTTTGAGTAAACAAAAGTACAGAAAGAA	93727

BX927232.4	851	AGTGTCAGGACAAATTTTTGGAAACCATCAAATTTCAATAAATGTTAAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93728	AGTGTCAGGACAAATTTTTGGAAACCATCAAATTTCAATAAATGTTAAAA	93777

BX927232.4	901	GAAGACCCAGATAACGAGACTAAGAAAAAATATTCAGAGAGGAAATAGAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93778	GAAGACCCAGATAACGAGACTAAGAAAAAATATTCAGAGAGGAAATAGAA	93827

BX927232.4	951	AACCAGAACTAAGTGGCATAGAGCCAATGGAAGTCAGCTGTTTTAGAAGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93828	AACCAGAACTAAGTGGCATAGAGCCAATGGAAGTCAGCTGTTTTAGAAGA	93877

BX927232.4	1001	AAGAACTGTATAATAGTGTCATATATTTGAGAAACAAAATTTAAAATAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93878	AAGAACTGTATAATAGTGTCATATATTTGAGAAACAAAATTTAAAATAAA	93927

BX927232.4	1051	AACAAAATAGAAAGAGTGCATTGAATTTACCGTTGTGATAGTTATTTGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93928	AACAAAATAGAAAGAGTGCATTGAATTTACCGTTGTGATAGTTATTTGTG	93977

BX927232.4	1101	GATTTGCTGGAGCTGTTTGTGAGGACTCATGAAGCAAGAATGATTAACAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	93978	GATTTGCTGGAGCTGTTTGTGAGGACTCATGAAGCAAGAATGATTAACAT	94027

BX927232.4	1151	GGTTCAAGAATTGAACCAAATGTGCCAGGGCACAGAATGATACCCTATTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94028	GGTTCAAGAATTGAACCAAATGTGCCAGGGCACAGAATGATACCCTATTC	94077

BX927232.4	1201	TGCTCATAAAGCATGGCTGTAAAGAGAAGGGACATTATAAGTAAGTCCTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94078	TGCTCATAAAGCATGGCTGTAAAGAGAAGGGACATTATAAGTAAGTCCTA	94127

BX927232.4	1251	AGTGTGGAGTGAAGACTTTTCTTTTTCTTTAAAATGGATGAGTCTTAAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94128	AGTGTGGAGTGAAGACTTTTCTTTTTCTTTAAAATGGATGAGTCTTAAGA	94177

BX927232.4	1301	TTATCTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94178	TTATCTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATC	94227

BX927232.4	1351	TATCTATCTCTAATCTATCATCTATCAACAGAGCATAGTGAAACAATCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94228	TATCTATCTCTAATCTATCATCTATCAACAGAGCATAGTGAAACAATCTG	94277

BX927232.4	1401	GTTCATTAAGAGTAATCTCAGTAAATCAACATTATTAGAATTTTTAGACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94278	GTTCATTAAGAGTAATCTCAGTAAATCAACATTATTAGAATTTTTAGACA	94327

BX927232.4	1451	TGGAGTTTGTGTTGATTTTATACACACACATATACAGACACACACACACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94328	TGGAGTTTGTGTTGATTTTATACACACACATATACAGACACACACACACA	94377

BX927232.4	1501	CATAAAATGTGCACTATTATGAAAGAGAGAGAGAGAGCAAGTGCATACTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94378	CATAAAATGTGCACTATTATGAAAGAGAGAGAGAGAGCAAGTGCATACTG	94427

BX927232.4	1551	TGGCAAAGATGCCCTTTGCGATAGAGCAAGGTTGAGTATAGGGTTGGTCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94428	TGGCAAAGATGCCCTTTGCGATAGAGCAAGGTTGAGTATAGGGTTGGTCA	94477

BX927232.4	1601	CTGACTTGGAAAGGAAAAAAGAGCTCTTTCTCTGCCTTTGAAACCCTAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94478	CTGACTTGGAAAGGAAAAAAGAGCTCTTTCTCTGCCTTTGAAACCCTAGA	94527

BX927232.4	1651	GTGGGTGGAATTAAATCATGTTAGAGATCATTTCGTTTATATACAGGTAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94528	GTGGGTGGAATTAAATCATGTTAGAGATCATTTCGTTTATATACAGGTAG	94577

BX927232.4	1701	GAAACTGAGGGGCTTAACATATAATTACCTATGTTTTCTCATTGAAGTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94578	GAAACTGAGGGGCTTAACATATAATTACCTATGTTTTCTCATTGAAGTTA	94627

BX927232.4	1751	TTGGCAATGCTACCTCCCAGGAAATAGAGGAAAATAGTGAAGAAGAGACA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94628	TTGGCAATGCTACCTCCCAGGAAATAGAGGAAAATAGTGAAGAAGAGACA	94677

BX927232.4	1801	CAGGATGCTAACTCTTTAGAGCAGCTACTGGAATGAATTAGAGTTTACCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94678	CAGGATGCTAACTCTTTAGAGCAGCTACTGGAATGAATTAGAGTTTACCT	94727

BX927232.4	1851	ACATAACATATTTGCACATGTACCACTGAACCTAAAAGAGAACTACTTTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94728	ACATAACATATTTGCACATGTACCACTGAACCTAAAAGAGAACTACTTTC	94777

BX927232.4	1901	AAAAAAATTGAGGGTTTCAACATATGAGAGGTAAAAAACGGAAAAGTTTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94778	AAAAAAATTGAGGGTTTCAACATATGAGAGGTAAAAAACGGAAAAGTTTA	94827

BX927232.4	1951	GAAATGTTTTGTAGGATAAAATTTGCATACAAGTGGTTAGTGAAGACAGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908738.4	94828	GAAATGTTTTGTAGGATAAAATTTGCATACAAGTGGTTAGTGAAGACAGA	94877

Overview

Query
BX927232.4 - 99722 bps
Hit
BX908738.4 - 94877 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link