<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX649553.6	1	GATCTATCTATTAGACAGATGGGTTGGTGGATGGATGGGGGCATGAATGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	31658	GATCTATCTATTAGACAGATGGGTTGGTGGATGGATGGGGGCATGAATGG	31707

BX649553.6	51	ATGGATGGATTGAGGAATGGGTGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	31708	ATGGATGGATTGAGGAATGGGTGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGAT	31757

BX649553.6	101	GGATGGATGGATACATGAGAGGATGGGTGAGTGGATGGGTGGGTGGATGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	31758	GGATGGATGGATACATGAGAGGATGGGTGAGTGGATGGGTGGGTGGATGG	31807

BX649553.6	151	ATGGATGGATACATGAGAGGATGGGTGAGTGGATGGATGGGTGGATGGAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	31808	ATGGATGGATACATGAGAGGATGGGTGAGTGGATGGATGGGTGGATGGAT	31857

BX649553.6	201	GGATTGAGGAATGGGTGGATGGGTGGGTGGACAGATGAATAGATAGGTGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	31858	GGATTGAGGAATGGGTGGATGGGTGGGTGGACAGATGAATAGATAGGTGA	31907

BX649553.6	251	GTGGGTGGGTAAATGGATGGATGGATGGATAGATGGATGGATGGGTGGAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	31908	GTGGGTGGGTAAATGGATGGATGGATGGATAGATGGATGGATGGGTGGAT	31957

BX649553.6	301	AGATTAGTTGGTAGATAAATAGATGAGTTGGTGGATGGATGGGGGTATGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	31958	AGATTAGTTGGTAGATAAATAGATGAGTTGGTGGATGGATGGGGGTATGG	32007

BX649553.6	351	ATGGATTGGATGGATGGACGGATGGACTGAGGAATGGGTGGATGGATGGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32008	ATGGATTGGATGGATGGACGGATGGACTGAGGAATGGGTGGATGGATGGA	32057

BX649553.6	401	TGGATGGATAGATGGATGGATGGATGGATACATGAGAGGATGGGTGAGCG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32058	TGGATGGATAGATGGATGGATGGATGGATACATGAGAGGATGGGTGAGCG	32107

BX649553.6	451	GATGGGTAGGTGGATGGATAGATGGATGGATGGATGGATACATGAGAGGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32108	GATGGGTAGGTGGATGGATAGATGGATGGATGGATGGATACATGAGAGGA	32157

BX649553.6	501	TGGATGGGTGGATGGGTGGATGAGTGGATGGATGGAAGGATGGATGGATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32158	TGGATGGGTGGATGGGTGGATGAGTGGATGGATGGAAGGATGGATGGATG	32207

BX649553.6	551	GATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATACATGAGAGGATGGGTGAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32208	GATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATACATGAGAGGATGGGTGAG	32257

BX649553.6	601	TGGATGGGTAGGCGGATGGATGGATTGAGGAATGGGTGGATGAGTGGGTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32258	TGGATGGGTAGGCGGATGGATGGATTGAGGAATGGGTGGATGAGTGGGTG	32307

BX649553.6	651	AATGTGTAGATGGGATGGGTGAGTCCACAAGTCTTGCTCACCTCCCAGCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32308	AATGTGTAGATGGGATGGGTGAGTCCACAAGTCTTGCTCACCTCCCAGCT	32357

BX649553.6	701	GAGAATATGTGTCCTACTTTATTTGGTCTATAGACAATGCTTAATTCTTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32358	GAGAATATGTGTCCTACTTTATTTGGTCTATAGACAATGCTTAATTCTTG	32407

BX649553.6	751	GACCCACAGAAGAGTGTCTTGCCAACACTCCCCCATCTCATGCCATCCAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32408	GACCCACAGAAGAGTGTCTTGCCAACACTCCCCCATCTCATGCCATCCAT	32457

BX649553.6	801	AGGTGAGATATCCTCTGGCCACTGAAGGGGCCTCTGACATCTATATTTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32458	AGGTGAGATATCCTCTGGCCACTGAAGGGGCCTCTGACATCTATATTTTT	32507

BX649553.6	851	TTTCCAGAAGCTCAGATCCGTTCCCAGACAAAATCATAAAACTCTTAACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32508	TTTCCAGAAGCTCAGATCCGTTCCCAGACAAAATCATAAAACTCTTAACA	32557

BX649553.6	901	AACATTATAATGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32558	AACATTATAATGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGAT	32607

BX649553.6	951	GGATGAATGAATGAATGGGTGGATGGATGGATAGATGGGTGAGTGAGTGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32608	GGATGAATGAATGAATGGGTGGATGGATGGATAGATGGGTGAGTGAGTGG	32657

BX649553.6	1001	GTGGGTTGATGGATGGATGGATATTACTATTATTTTATTTATTTATTTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32658	GTGGGTTGATGGATGGATGGATATTACTATTATTTTATTTATTTATTTTT	32707

BX649553.6	1051	TTGAATTGGAGTCTCACTCCATTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32708	TTGAATTGGAGTCTCACTCCATTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGAT	32757

BX649553.6	1101	CTCGGCTCACTGCAACTTCCACCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCTCCCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32758	CTCGGCTCACTGCAACTTCCACCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCTCCCT	32807

BX649553.6	1151	CAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCAGGCCCGGCTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32808	CAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCAGGCCCGGCTA	32857

BX649553.6	1201	ATTTTTTTTATTTTTGGTAGGGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32858	ATTTTTTTTATTTTTGGTAGGGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG	32907

BX649553.6	1251	GTCTCGAATTCCCGACCTCAGATGATCCACCCAACTCGGCCTCCCGAAGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32908	GTCTCGAATTCCCGACCTCAGATGATCCACCCAACTCGGCCTCCCGAAGT	32957

BX649553.6	1301	GTTGGGATTACAGGCATAAGCCACTGCGCCCGGCCCTATTCCTTTATTGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	32958	GTTGGGATTACAGGCATAAGCCACTGCGCCCGGCCCTATTCCTTTATTGT	33007

BX649553.6	1351	TATAAAATAATAATAATAATGTAATTAAGTAAATGGTCCTTCACCTCTCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	33008	TATAAAATAATAATAATAATGTAATTAAGTAAATGGTCCTTCACCTCTCT	33057

BX649553.6	1401	GTTCAACCATTTTCCTACCCTTGATTTACCATCAACTGCCTTTTTTTTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	33058	GTTCAACCATTTTCCTACCCTTGATTTACCATCAACTGCCTTTTTTTTTT	33107

BX649553.6	1451	TTTTTTTTGGAAAAGTGTGGAGTTATTCCAAAGAAAACCTCCTATAGGTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	33108	TTTTTTTTGGAAAAGTGTGGAGTTATTCCAAAGAAAACCTCCTATAGGTA	33157

BX649553.6	1501	ATGTGTAAACATCGTGACCAGAAATCCTGGAGATCCACGAAGGCAACTAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	33158	ATGTGTAAACATCGTGACCAGAAATCCTGGAGATCCACGAAGGCAACTAC	33207

BX649553.6	1551	AAAGACTATGAAGGGAAACTACAGAAGTGGTTTTCTTAAAAAAATATACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	33208	AAAGACTATGAAGGGAAACTACAGAAGTGGTTTTCTTAAAAAAATATACA	33257

BX649553.6	1601	GGCTATTTTTAGAGTGTTTTTAGGTTTAGAGCAAAATTTGCAGAAAGTAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	33258	GGCTATTTTTAGAGTGTTTTTAGGTTTAGAGCAAAATTTGCAGAAAGTAC	33307

BX649553.6	1651	AGAAAGTTCTTATATATCCTCTCCCCAGCTCACAGCTTCGTCTATGGTGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	33308	AGAAAGTTCTTATATATCCTCTCCCCAGCTCACAGCTTCGTCTATGGTGA	33357

BX649553.6	1701	ACACCCTGCCTCAGCTTGGTGTGTTTGTTACAATCCATGAACTAATACTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	33358	ACACCCTGCCTCAGCTTGGTGTGTTTGTTACAATCCATGAACTAATACTG	33407

BX649553.6	1751	ATATATTATGAACAGAATAGTCAATAACAGTTCACATTAGAGTTCTTTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	33408	ATATATTATGAACAGAATAGTCAATAACAGTTCACATTAGAGTTCTTTTT	33457

BX649553.6	1801	TTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	33458	TTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGA	33507

BX649553.6	1851	TCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	33508	TCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCC	33557

BX649553.6	1901	TCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCTCCACCACGCCCGGCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	33558	TCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCTCCACCACGCCCGGCT	33607

BX649553.6	1951	AATTTTTGTATTTTTACTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908382.8	33608	AATTTTTGTATTTTTACTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTG	33657

Overview

Query
BX649553.6 - 86882 bps
Hit
BX908382.8 - 33657 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link